检索结果-内蒙古大学图书馆

江苏医药 2005年第9期31卷 680-682页

作者：祁震宇惠国桢李瑶顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科 215006 上海复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的报道一条脑胶质瘤相关的全长新基因的生物信息学分析及其研究的结果。方法对507E08克隆子进行了测序,生物信息学分析和Northern blot分析。结果507E08基因为全长基因,长度为2002bp,共编码203个氨基酸,命名为人核糖体蛋白L14·2... 详细信息

目的报道一条脑胶质瘤相关的全长新基因的生物信息学分析及其研究的结果。方法对507E08克隆子进行了测序,生物信息学分析和Northern blot分析。结果507E08基因为全长基因,长度为2002bp,共编码203个氨基酸,命名为人核糖体蛋白L14·22。经Northern blot证实507E08基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。结论生物信息学是一种有效分析未知基因的工具。507E08基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：生物信息学基因脑胶质瘤生物信息学分析人脑胶质瘤全长基因 Northern 507E08基因全长新基因 blot

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碱性蛋白酶基因在Bacillus licheniformis 2709中的整合和扩增

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工业微生物 1998年第2期28卷 4-9页

作者：王磊马平唐上华任大明复旦大学遗传学研究所复旦大学遗传工程国家重点开放实验室上海市工业微生物研究所

将含有去掉启动子的枯草杆菌碱性蛋白酶基因和Ｃｍ抗性基因的整合质粒ｐＭＰ以原生质体ＰＥＧ法转化Ｂ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ２７０９，在１０ｕ／ｍｌＣｍ平板上筛选整合子，并通过不断提高整合子的抗氯霉素能力来扩增染色体碱... 详细信息

将含有去掉启动子的枯草杆菌碱性蛋白酶基因和Ｃｍ抗性基因的整合质粒ｐＭＰ以原生质体ＰＥＧ法转化Ｂ．ｌｉｃｈｅｎｉｆｏｒｍｉｓ２７０９，在１０ｕ／ｍｌＣｍ平板上筛选整合子，并通过不断提高整合子的抗氯霉素能力来扩增染色体碱性蛋白酶基因，最终选到一株产酶比生产菌２７０９提高６０％的高表达整合菌ＢＬ－２０３，该菌在无选择压力下遗传性状相当稳定。

关键词：整合扩增碱性蛋白酶基因

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亚洲一型口蹄疫病毒YNAs1.1株结构蛋白VP1基因的核苷酸序列分析

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复旦学报（自然科学版） 2001年第5期40卷 549-552,557页

作者：张震宇杨永钦张青李乐严维耀蒋文俊信爱国郑兆鑫复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室上海200433 云南省热带亚热带动物病毒病重点开放实验室云南昆明650224

提取ＢＨＫ２１细胞增殖的亚洲一型口蹄疫病毒（ｆｏｏｔ－ａｎｄ－ｍｏｕｔｈ　ｄｉｓｅａｓｅ　ｖｉｒｕｓ　Ｓｅｒｏｔｙｐｅ　Ａｓｉａ１）强毒株ＹＮＡｓ１．１的ＲＮＡ，用一对引物Ｐ＿７，Ｐ＿（１３）经反转录　（ＲＴ）－ＰＣ... 详细信息

提取ＢＨＫ２１细胞增殖的亚洲一型口蹄疫病毒（ｆｏｏｔ－ａｎｄ－ｍｏｕｔｈ　ｄｉｓｅａｓｅ　ｖｉｒｕｓ　Ｓｅｒｏｔｙｐｅ　Ａｓｉａ１）强毒株ＹＮＡｓ１．１的ＲＮＡ，用一对引物Ｐ＿７，Ｐ＿（１３）经反转录　（ＲＴ）－ＰＣＲ法扩增了约６７４　ｂｐ的ＤＮＡ片段．克隆目的基因后，采用双脱氧ＤＮＡ链末端终止法测　得了ＹＮＡｓ１．１的ＶＰ１基因３６～６３３核苷酸序列．分析表明，病毒ＶＰ１基因的核苷酸序列与以色　列以及印度已报道的Ａｓｉａ１型ＦＭＤＶ的同源性分别为８２．１１％与８８．０７％，对应的氨基酸序列同源　性为８７．９４％与９３．４７％．该序列在ＧｅｎｅＢａｎｋ登陆号为ＡＦ２４１５６６．

关键词：亚洲一型口蹄疫病毒病毒结构蛋白VP1 核苷酸序列基因序列分析偶蹄动物传染病 RT-PCR法

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利用PCR-DGGE法分析暗纹东方鲀的弧菌菌落组成

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上海水产大学学报 2006年第3期15卷 257-263页

作者：杨桂梅唐文乔李会荣黄路标任大明鲍宝龙上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海200090 中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室上海200136 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室上海200433

采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方的表皮、性腺和肠道中,以弧菌为主的细菌群落的组成。结果表明:(1)共鉴定出暗纹东方体内18种微生物,均归属于变形细菌的gamma亚群,其中13种为弧菌科细菌,3种为肠杆菌科细... 详细信息

采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方的表皮、性腺和肠道中,以弧菌为主的细菌群落的组成。结果表明:(1)共鉴定出暗纹东方体内18种微生物,均归属于变形细菌的gamma亚群,其中13种为弧菌科细菌,3种为肠杆菌科细菌,2种为气单胞菌属细菌;(2)投喂鲜活鱼虾的与投喂人工配合饲料的暗纹东方肠道和性腺中的细菌组成是不同的,在性腺中分离到的所有12种细菌中,只有2种细菌是相同的,约占17%;在肠道中分离到的所有13种细菌中,有4种是相同的,约占31%。而在表皮上所分离到的11种细菌中,有7种细菌是相同的,约占64%;(3)DGGE特征条带V1、V13、V18、V14和V17所代表的细菌只在表皮组织被分离到,V6所代表的细菌仅出现在以鲜活鱼虾作为饵料的暗纹东方性腺中,V5所代表的细菌仅出现在以鲜活鱼虾作为饵料的暗纹东方肠道中;(4)DGGE特征条带V5、V8、V13、V18、V6、V14和V17所代表的细菌不能在TCBS培养基上培养,占18种被鉴定的细菌总数的39%。

关键词：暗纹东方鲀弧菌 16S rDNA 变性梯度凝胶电泳细菌群落

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暗纹东方鲀几种组织中可培养细菌的组成分析(英文)

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上海水产大学学报 2008年第1期17卷 12-21页

作者：杨桂梅鲍宝龙李会荣唐文乔任大明上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海200090 中国极地研究中心国家海洋局极地科学重点实验室上海200136 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室上海200433

采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方鲀的表皮、肠道和河鲀毒素累积组织(肝和卵巢)中可培养细菌的群落组成。根据分子系统发育分析,共鉴定出45种可培养细菌,在这些细菌中,以变形细菌的gamm a亚群占多数,其它... 详细信息

采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方鲀的表皮、肠道和河鲀毒素累积组织(肝和卵巢)中可培养细菌的群落组成。根据分子系统发育分析,共鉴定出45种可培养细菌,在这些细菌中,以变形细菌的gamm a亚群占多数,其它分别隶属于低GC含量革兰氏阳性菌和高GC含量革兰氏阳性菌。摄食不同饵料的暗纹东方鲀,其肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中的细菌菌落组成是不同的,但不管是摄食人工配合饲料或天然饵料,在暗纹东方鲀的肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中,均发现已有报道的可产河鲀毒素的细菌类群,表明饵料来源对暗纹东方鲀的河鲀毒素产生不是必需的。

关键词：暗纹东方鲀 16S rDNA 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 细菌组成产TTX细菌

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脑胶质瘤相关的全长新基因PPIL-3的克隆和蛋白质特性的研究

脑胶质瘤相关的全长新基因PPIL-3的克隆和蛋白质特性的研究

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中国医师协会神经外科医师分会第六届全国代表大会

作者：祁震宇惠国桢李瑶顾少华谢毅苏州大学附属第一医院神经外科复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

我们运用基因芯片筛选出与胶质瘤相关的新基因。通过大规模cDNA测序,从人胎脑cDNA文库中克隆到两条新的cDNA序列,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现是同一个基因(命名为peptidylproly isomerase(cycl... 详细信息

我们运用基因芯片筛选出与胶质瘤相关的新基因。通过大规模cDNA测序,从人胎脑cDNA文库中克隆到两条新的cDNA序列,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现是同一个基因(命名为peptidylproly isomerase(cyclophilin)-like 3(简称PPIL3))的两个

关键词：胶质瘤新基因 PPIL-3 细胞凋亡过程星形细胞瘤核酸酶编码蛋白基因芯片技术

来源：评论

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采用基因芯片技术获取人脑胶质瘤差异表达的基因及一条全长新基因的研究

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中华神经外科杂志 2001年第4期17卷 231-231页

作者：祁震宇惠国桢李瑶唐榕周宗祥夏放顾少华应康谢毅苏州大学附一院神经外科 215006 复旦大学遗传工程国家重点开放实验室

目的　运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因 ,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法　抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针 ,经杂交、洗涤后 ,通过计算机观察二者表达谱的差异情况 ,... 详细信息

目的　运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因 ,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法　抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针 ,经杂交、洗涤后 ,通过计算机观察二者表达谱的差异情况 ,对 436F11克隆子进行了northernblot,原位杂交和生物信息学分析。结果　通过四次基因芯片筛选 ,获得 15条与胶质瘤相关的新基因 ,经northernblot证实 436F11基因在人正常脑组织中高表达 ,而在人脑胶质瘤中低表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLASTx分析显示 ,436F11基因为全长新基因 ,共编码 78个氨基酸 ,其理论分子量为 86 48Da ,等电点为 4 6 9,与鼠PKIβ 6 9%同源 ,命名为人PKIβ。结论　基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少、高质量、高速度、高敏感等特性。人PKIβ可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

关键词：基因芯片脑胶质瘤差异表达全长基因

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九种鲱科鱼类线粒体DNA细胞色素b基因相对速率测试及分歧时间估计(英文)

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海洋渔业 2006年第1期28卷 5-12页

作者：程起群卢大儒中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室上海200090 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室上海200433

对鲱科9种鱼类的线粒体细胞色素b(cytb)基因序列进行综合分析。结果表明:(1)用Ne ighbour-Join ing(NJ)法构建的分子系统树显示盖纹沙丁鱼属的3种鱼类形成一个单系类群,鲱属2种鱼类形成一个单系类群,它们的bootstrap支持率均为100%。金... 详细信息

对鲱科9种鱼类的线粒体细胞色素b(cytb)基因序列进行综合分析。结果表明:(1)用Ne ighbour-Join ing(NJ)法构建的分子系统树显示盖纹沙丁鱼属的3种鱼类形成一个单系类群,鲱属2种鱼类形成一个单系类群,它们的bootstrap支持率均为100%。金色小沙丁鱼和短体小沙丁鱼形成一个单系类群,在NJ树中的支持率达到或超过50%。欧洲黍鲱与太平洋鲱和大西洋鲱是单系起源,其bootstrap支持率高达100%。系统发育结果还支持沙丁鱼属鱼类与盖纹沙丁鱼属鱼类是单系类群,支持率分别为87%和95%。但单系类群I(包括大西洋鲱、太平洋鲱、欧洲黍鲱)和单系类群Ⅱ(包括欧洲沙丁鱼、加州沙丁鱼、南美拟沙丁鱼、斑点盖纹沙丁鱼)之间的系统发育关系尚不明确,因为它们之间的支持率很低。(2)dN/dS的比值显著的小于1(Z-test),提示由于功能限制,cytb基因受到强烈的负选择作用。(3)基于Tajim a的1D和2D相对速率测试表明,分子钟假说在鲱科鱼类中是成立的;鲱科鱼类的分歧时间是0.12至13.45百万年间。

关键词：鲱科鱼类 cytb 系统发育自然选择相对速率测试分歧时间

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