检索结果-内蒙古大学图书馆

中国病原生物学杂志 2024年第8期19卷 917-922页

作者：代禹美杜文雅乐林芝马涛王国富吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

目的应用生物信息学方法分析预测结核分枝杆菌Rv0592基因编码蛋白Mce2D的结构和功能。方法从NCBI网站查询Rv0592基因及其编码蛋白的基本信息,通过Uniprot数据库获取Mce2D蛋白的氨基酸序列。运用ORF Finder、Protpatam、SOPMA、SWISS-M... 详细信息

目的应用生物信息学方法分析预测结核分枝杆菌Rv0592基因编码蛋白Mce2D的结构和功能。方法从NCBI网站查询Rv0592基因及其编码蛋白的基本信息,通过Uniprot数据库获取Mce2D蛋白的氨基酸序列。运用ORF Finder、Protpatam、SOPMA、SWISS-MODEL、ProtScale、Signal IP 4.1 Server、TMHMM、ProtComp、SYFPEITHI、IEDB等生物信息学软件分别对Mce2D蛋白的开放阅读框架、理化性质、二级结构、三级结构、亲疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、T细胞表位和B细胞表位等生物特征进行预测。结果 Rv0592基因全长1 527 bp,共有8个开放阅读框架,编码蛋白的氨基酸数为508个。Mce2D蛋白的等电点为5.06,总平均亲水性为-0.109,为亲水蛋白。蛋白的二级结构中无规卷曲占42.52%、α-螺旋占41.54%,含有多个T细胞表位和B细胞表位。该蛋白有一个信号肽、跨膜螺旋数为一、亚细胞定位于细胞膜。结论生物信息学预测Mce2D蛋白为含多个的B细胞和T细胞表位,可作为结核病诊断和治疗的有效靶点。

关键词：结核分枝杆菌结核免疫逃逸 Rv0592 Mce2D蛋白生物信息学分析

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表皮葡萄球菌ΔvraSR-lrgAB突变株的构建和生物学特性

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微生物学报 2025年第2期65卷 629-643页

作者：尚爽婕陈卫国张晓奎朱健鹏白松陈晓婷武有聪大理大学基础医学院病原生物学综合实验室云南大理大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室云南大理

【目的】探究VraSR通过CidA-LrgAB系统调控表皮葡萄球菌的生物学功能。【方法】构建重组质粒pKOR1-ΔlrgAB,并将其转化至表皮葡萄球菌SE1457ΔvraSR突变株中。通过同源重组技术,在ΔvraSR突变株上进一步敲除lrgAB基因。利用PCR、RT-PCR... 详细信息

【目的】探究VraSR通过CidA-LrgAB系统调控表皮葡萄球菌的生物学功能。【方法】构建重组质粒pKOR1-ΔlrgAB,并将其转化至表皮葡萄球菌SE1457ΔvraSR突变株中。通过同源重组技术,在ΔvraSR突变株上进一步敲除lrgAB基因。利用PCR、RT-PCR和测序技术鉴定表皮葡萄球菌ΔvraSR-lrgAB疑似突变株,并检测其生长特性、药物敏感性、自溶能力以及生物被膜形成能力。【结果】成功构建了表皮葡萄球菌ΔvraSR-lrgAB突变株。与表皮葡萄球菌SE1457、ΔvraSR和ΔlrgAB菌株相比,ΔvraSR-lrgAB突变株生长迟缓,特别是在25℃和40℃下尤为明显(P<0.001)。该突变株的药物敏感性增强(P<0.01),自溶能力显著增强(P<0.001),生物被膜形成能力降低(P<0.01)。【结论】VraSR可能部分通过LrgAB调控表皮葡萄球菌的生长、药物敏感性、自溶能力和生物被膜的形成。

关键词： VraSR LrgAB 同源重组表皮葡萄球菌

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结核分枝杆菌致病相关蛋白Rv2387的生物信息学分析

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第11期40卷 983-989页

作者：乐林芝马涛代禹美杜文雅王国富吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

目的通过生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌(Mtb)Rv2387基因编码蛋白的结构和功能。方法从美国国家生物信息(NCBI)数据库中获取Rv2387基因及其编码蛋白的基本信息。利用ProtParam和ProtScale工具对蛋白质进行理化性质及亲/疏水性的预... 详细信息

目的通过生物信息学方法预测分析结核分枝杆菌(Mtb)Rv2387基因编码蛋白的结构和功能。方法从美国国家生物信息(NCBI)数据库中获取Rv2387基因及其编码蛋白的基本信息。利用ProtParam和ProtScale工具对蛋白质进行理化性质及亲/疏水性的预测;通过TMHMM-2.0、SignalP-6.0、ProtCompB分析蛋白的跨膜区域、信号肽和亚细胞定位;运用NetPhos-3.1、NetNGlyc-1.0、YinOYang-1.2预测蛋白的磷酸化位点、N-糖基化位点和O-糖基化位点;选择SOPMA、SWISS-MODEL预测蛋白二、三级结构;使用IEDB数据库和SYFPEITHI预测蛋白的B细胞优势表位和T细胞优势表位;通过NCBI中自带的Blast工具对Rv2387氨基酸序列进行比对,运用MEGA 11软件构建进化树;采用STRING数据库预测分析蛋白质相互作用。结果Rv2387基因全长1254 bp,共编码417个氨基酸。预测结果显示该蛋白有8个开放阅读框。Rv2387蛋白是一种稳定的亲水性跨膜蛋白,其等电点为5.39,不含信号肽,且亚细胞定位显示在细胞膜上。该蛋白经预测具有27个氨基酸磷酸化位点,3个N-糖基化位点和41个O-糖基化位点。二级结构中α-螺旋占比为47.96%,β-转角占比为4.80%,无规则卷曲占比为35.25%,延伸链占比为11.99%;存在多个抗原表位,与Rv2423、Rv2067c、eccD2、Rv3899c和glnB多个蛋白质有相互作用。结论生物信息学预测出Rv2387为亲水性蛋白,存在多个磷酸化位点并能够与多种蛋白相互作用,该蛋白存在多个T、B细胞抗原表位,可作为Mtb的疫苗候选抗原,为Mtb治疗提供新思路。

关键词：结核分枝杆菌(Mtb) Rv2387 抗原表位生物信息学

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铁死亡在感染性疾病中的作用研究进展

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中国比较医学杂志 2024年第7期34卷 175-180页

作者：乐林芝马涛代禹美杜文雅王国富吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

铁死亡是一种新发现的程序性细胞死亡方式,主要以细胞内铁依赖的脂质过氧化累积为主要特征。目前对铁死亡的研究主要集中在癌症领域,但越来越多的证据表明铁死亡与感染性疾病的发生有关,在新型冠状病毒肺炎、结核病及隐球菌性脑膜炎等... 详细信息

铁死亡是一种新发现的程序性细胞死亡方式,主要以细胞内铁依赖的脂质过氧化累积为主要特征。目前对铁死亡的研究主要集中在癌症领域,但越来越多的证据表明铁死亡与感染性疾病的发生有关,在新型冠状病毒肺炎、结核病及隐球菌性脑膜炎等疾病中均发现铁死亡参与。本文就铁死亡在感染性疾病中的作用作一综述,以期为铁死亡相关感染性疾病的防治提供新思路。

关键词：铁死亡病毒细菌真菌

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间充质干细胞来源外泌体在肺部疾病治疗中的研究进展

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细胞与分子免疫学杂志 2025年第3期41卷 278-282页

作者：马涛乐林芝代禹美杜文雅吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

肺部疾病作为一类呼吸系统常见疾病,已然成为全球公共卫生的主要问题。由于环境的污染以及职业因素的影响,肺部疾病的发病率正在逐年上升,严重影响了人类的健康和生活质量。间充质干细胞(MSC)具有参与免疫调节、抗菌、抗凋亡的作用,来源... 详细信息

肺部疾病作为一类呼吸系统常见疾病,已然成为全球公共卫生的主要问题。由于环境的污染以及职业因素的影响,肺部疾病的发病率正在逐年上升,严重影响了人类的健康和生活质量。间充质干细胞(MSC)具有参与免疫调节、抗菌、抗凋亡的作用,来源于MSC的外泌体携带蛋白质、脂质、核酸等物质在肺部疾病的治疗中展现出良好的效果,受到了医学界的广泛关注。本文综述了不同来源的MSC外泌体在肺部疾病中的作用,为临床诊治应用提供依据。

关键词：间充质干细胞(MSC) 外泌体肺部疾病治疗综述

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外泌体miRNA在感染性疾病治疗中的应用研究进展

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中国病原生物学杂志 2023年第8期18卷 987-990页

作者：代禹美杜文雅马枫茜陈瑞枫吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

外泌体是直径为30~150 nm的细胞外囊泡,由各种细胞类型分泌,包括病原体感染的细胞,其内部富含母细胞来源的蛋白质、mRNA、miRNA、lncRNA等物质,并且具有向受体细胞递送信号的关键作用。外泌体中的miRNA是当前研究的热点之一,miRNA被外... 详细信息

外泌体是直径为30~150 nm的细胞外囊泡,由各种细胞类型分泌,包括病原体感染的细胞,其内部富含母细胞来源的蛋白质、mRNA、miRNA、lncRNA等物质,并且具有向受体细胞递送信号的关键作用。外泌体中的miRNA是当前研究的热点之一,miRNA被外泌体包裹而免受降解,可以随外泌体转运到机体各个部位与靶细胞相互作用,调节靶细胞的生物学过程。外泌体miRNA在感染性疾病的发展过程中扮演重要角色,可以促进宿主细胞对病原体的免疫应答,增强免疫细胞的功能,具有抗感染作用。本文就外泌体miRNA在感染性疾病中作为治疗剂和治疗靶点的潜在应用做一综述,为外泌体miRNA的临床应用提供理论依据。

关键词：外泌体miRNA 病毒细菌真菌治疗综述

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外泌体来源microRNA在微生物感染中的作用研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第6期19卷 729-732页

作者：杜文雅马枫茜代禹美陈瑞枫王国富吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

外泌体包含母细胞来源的蛋白质、脂质和核酸等多种成分,其中核酸中的miRNA起到越来越重要的作用,miRNA通过靶向mRNA 3′端非翻译区结合导致mRNA降解或翻译抑制。许多疾病的发生都伴随着miRNA表达失调,这对宿主基因调控和某些分子机制产... 详细信息

外泌体包含母细胞来源的蛋白质、脂质和核酸等多种成分,其中核酸中的miRNA起到越来越重要的作用,miRNA通过靶向mRNA 3′端非翻译区结合导致mRNA降解或翻译抑制。许多疾病的发生都伴随着miRNA表达失调,这对宿主基因调控和某些分子机制产生影响。越来越多研究证明miRNA可以作为疾病的潜在生物标志物、治疗靶点,参与炎症反应的过程等。本文就外泌体中的miRNA在病毒,细菌等微生物导致的感染性疾病,如流感病毒、肝炎病毒、HIV、结核分枝杆菌、梅毒螺旋体和支原体中的作用进行综述。

关键词：外泌体 miRNA 微生物感染性疾病综述

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细胞与分子免疫学杂志 2025年第2期41卷 97-104页

作者：杜文雅代禹美乐林芝马涛吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

目的miR-207被发现在自然杀伤(NK)细胞外泌体中表达,参与疾病进展,但暂无与结核病(TB)有关的研究。方法生物信息学方法预测并用双荧光素酶报告实验检测溶酶体关联膜蛋白2(LAMP2)是否与miR-207有靶向关系。使用脂质体转染法将实验分为四... 详细信息

目的miR-207被发现在自然杀伤(NK)细胞外泌体中表达,参与疾病进展,但暂无与结核病(TB)有关的研究。方法生物信息学方法预测并用双荧光素酶报告实验检测溶酶体关联膜蛋白2(LAMP2)是否与miR-207有靶向关系。使用脂质体转染法将实验分为四组(OP-LAMP2组:共转染miR-207 mimics和LAMP2过表达质粒;EP组:共转染mimics NC和空载质粒;siLAMP2组:转染siLAMP2;siLAMP2-NC组:转染siLAMP2-NC)。使用H37Ra感染Ana-1细胞建立结核感染模型。结核菌落形成单位计数评估LAMP2对胞内分枝杆菌负荷的影响以及对胞外残留分枝杆菌的清除作用。流式细胞术检测细胞总凋亡率。实时荧光定量PCR检测LAMP2、细胞凋亡基因、焦亡基因及自噬基因相对表达量。Western blot法检测LAMP2蛋白、细胞凋亡、焦亡、自噬蛋白的相对表达量。结果双荧光素酶报告实验检测显示miR-207与LAMP2存在靶向关系,实时荧光定量PCR、Western blot结果统计分析和显微镜下观察证明成功建立感染模型。菌落形成单位计数发现OP-LAMP2组的菌落数低于EP组,siLAMP2组高于siLAMP2-NC组。流式细胞术检测发现OP-LAMP2组总凋亡率低于EP组,siLAMP2组高于siLAMP2-NC组。实时荧光定量PCR及Western blot法检测发现对照组凋亡、焦亡相关蛋白和基因相对表达量趋势为OP-LAMP2低于EP组,siLAMP2组高于siLAMP2-NC组。实时荧光定量PCR检测自噬正调节基因微管相关蛋白1轻链3(LC3)和重组人自噬效应蛋白(Beclin1)在OP-LAMP2组相对表达量高于EP组,siLAMP2组低于siLAMP2-NC组,负调节自噬基因相对表达量与自噬正调节基因趋势相反。自噬相关蛋白相对表达量与自噬基因趋势一致。结论miR-207通过靶向自噬相关蛋白LAMP2促进巨噬细胞凋亡、细胞焦亡、抑制自噬,促进结核分枝杆菌(Mtb)的存活,为TB提供新的治疗方向。

关键词：结核分枝杆菌(Mtb) miR-207 LAMP2 自噬凋亡焦亡

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44株HIV/MAV双重感染者MAV基因分型和药敏结果分析

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中国感染控制杂志 2023年第3期22卷 275-279页

作者：李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的了解云南省西南地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/鸟结核分枝杆菌(MAV)双重感染者MAV的基因型和耐药情况。方法选取12个可变数目串联重复序列(VNTR)特异性位点,采用分枝杆菌串联重复序列(MATR-VNTR)基因分型法对MAV进行基因分型;采用聚... 详细信息

目的了解云南省西南地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/鸟结核分枝杆菌(MAV)双重感染者MAV的基因型和耐药情况。方法选取12个可变数目串联重复序列(VNTR)特异性位点,采用分枝杆菌串联重复序列(MATR-VNTR)基因分型法对MAV进行基因分型;采用聚合酶链反应(PCR)扩增菌株DNA后进行琼脂糖凝胶电泳,获得MAV的DNA指纹图谱,再应用Quantity One和BioNumerics 6.7软件对电泳图进行数字化处理并通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。采用比例法测试44株MAV对10种不同抗菌药物的敏感性。结果各位点VNTR基因分型的Hunter-Gaston指数(HGDI)存在差异,其中MATR-5最高,为0.68,MATR-1、2、3、4、6、7、9、13、15位点的HGDI值均≥0.5;通过聚类分析,44株MAV分为6个集群。药敏试验结果显示,利福布丁对MAV的体外抗菌活性最好(耐药率为0),其次是乙胺丁醇(耐药率86.4%,38/44),所有菌株对其余8种药物均耐药。结论选取的12个位点VNTR基因分型法在云南省西南地区具有较高分辨率,来自云南省不同地区的MAV分离株耐药情况严峻。

关键词：鸟结核分枝杆菌基因分型 VNTR 药敏试验 HIV

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miR-207调控结核分枝杆菌在巨噬细胞内存活的机制研究

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中国比较医学杂志 2024年第12期34卷 41-49页

作者：杜文雅代禹美乐林芝马涛吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

目的miR-207在许多疾病中存在差异性表达,探究miR-207过表达对调控结核分枝杆菌(H37Ra)在巨噬细胞内存活的机制研究,为结核病的靶向治疗提供理论基础。方法将实验分为4组:空白组(Ana-1细胞)、对照组(感染H37Ra的细胞)、mi组(感染H37Ra... 详细信息

目的miR-207在许多疾病中存在差异性表达,探究miR-207过表达对调控结核分枝杆菌(H37Ra)在巨噬细胞内存活的机制研究,为结核病的靶向治疗提供理论基础。方法将实验分为4组:空白组(Ana-1细胞)、对照组(感染H37Ra的细胞)、mi组(感染H37Ra并转染miRNA-207 mimics)和mi-NC组(感染H37Ra并转染mimics NC)。使用H37Ra感染Ana-1细胞建立结核感染模型,使用脂质体转染法将miRNA-207 mimics和mimics NC转入Ana-1细胞。结核菌落形成单位计数评估miR-207对胞内分枝杆菌负荷的影响以及对胞外残留分枝杆菌的清除作用。采用流式细胞术检测细胞总凋亡率。实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测miR-207、细胞凋亡基因、焦亡基因、炎症基因及自噬基因相对表达量。Western blot检测细胞凋亡蛋白、焦亡蛋白、自噬蛋白的相对表达量。采用荧光显微镜及多功能酶标仪检测细胞内ROS的荧光强度,以及检测细胞内LDH的含量。结果显微镜下观察成功建立感染模型,qPCR检测发现对照组miR-207表达量低于空白组(P<0.01),表明miR-207在空白组和对照组中差异性表达,mi组miR-207表达量显著高于mi-NC组(P<0.0001),表明成功建立转染模型。菌落形成单位计数发现mi组的菌落数高于mi-NC组和对照组(P<0.001)。流式细胞术检测发现mi组总凋亡高于mi-NC组和对照组(P<0.05)。qPCR及Western blot检测发现对照组凋亡基因和凋亡蛋白相对表达量高于空白组(P<0.05),mi组高于mi-NC组(P<0.05)。对照组炎症基因相对表达量高于空白组(P<0.001),mi组高于mi-NC组(P<0.05),对照组焦亡基因和焦亡蛋白相对表达量高于空白组(P<0.01),mi组高于mi-NC组(P<0.05)。自噬正调节基因LC3和Beclin1在对照组的相对表达量高于空白组(P<0.0001),mi组低于mi-NC组(P<0.05)。负调节自噬基因相对表达量与自噬正调节基因趋势相反。自噬相关蛋白相对表达量与自噬基因趋势一致。ROS荧光强度检测发现对照组的荧光强度高于空白组(P<0.05),mi组高于mi-NC组(P<0.001)。LDH检测发现对照组细胞内LDH含量高于空白组(P<0.01),mi组与mi-NC组含量无统计学意义(P>0.05)。结论miR-207过表达促进细胞凋亡、细胞焦亡及炎症、抑制自噬,有利于H37Ra的存活,为结核病的治疗提供新的方向。

关键词：结核分枝杆菌 H37Ra miR-207 自噬巨噬细胞凋亡焦亡

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