本文研究了不同品种绵羊肌肉组织环状RNA的表达情况,旨在筛选影响绵羊肉质的关键circRNAs,为分子辅助育种提高绵羊肉质提供理论依据。本文基于前期研究选择肉质指标存在差异的滩羊(Tan Sheep,T)、杜泊羊(Dorper Sheep,D)和小尾寒羊(Small-tailed Han Sheep,STH)各3只,对其背最长肌进行转录组测序,通过生物信息学分析和功能预测筛选绵羊肉质相关的差异表达circRNAs(Differentially Expressed circRNAs,DECs),并随机选择8个DECs进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组数据的可靠性。结果表明,测序质量良好,共鉴定到7584个circRNAs。3组共获得199个DECs杜泊羊;D vs T组获得49个DECs;STH vs D组获得95个DECs;STH vs T组获得DECs 84个(P≤0.05且|log2|≥1)。同时,对获得的DECs进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,GO功能富集发现DECs主要富集在生物学过程条目,细胞组分和分子功能富集的条目较少;KEGG信号通路分析发现DECs主要富集在胰岛素信号通路、MAPK信号通路、FoxO信号通路、AMPK信号通路等;多个通路在3组中均有富集,如:AMPK信号通路、嘌呤代谢通路、肌动蛋白细胞骨架的调节通路等。根据GO和KEGG的功能描述筛选出90个可能调控肉质相关肌肉生长、脂肪沉积、肌苷酸沉积的DECs。随机选择的8个DECs的qRT-PCR结果与转录组测序结果趋势一致。本研究探究了不同品种绵羊肌肉组织中circRNA的表达谱差异,初步筛选到90个circRNA可以作为影响绵羊肉质的候选调控因子,这些circRNA可能在绵羊脂肪沉积、肌肉生长发育过程发挥重要作用。本研究结果为绵羊肉质性状的分子育种提供了遗传资源。
暂无评论