检索结果-内蒙古大学图书馆

中国感染与化疗杂志 2022年第6期22卷 725-731页

作者：师志云马苗尹晓丽王良方侯晓慧张玉英李刚王文陶佳李莎莎贾伟宁夏医科大学总医院医学实验中心银川750004 宁夏临床病原微生物重点实验室宁夏医科大学临床医学院.

目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表... 详细信息

目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表型,PCR分子生物学技术检测碳青霉烯酶等耐药基因以及荚膜血清型、毒力基因,多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对碳青霉烯类耐药高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)进行同源性分析。结果103株CRKP对临床常见抗菌药物表现为不同程度的耐药,mCIM联合eCIM试验结果显示94株CRKP产碳青霉烯酶,其中67.0%产金属酶,33.0%产丝氨酸碳青霉烯酶。耐药基因检出率依次为blaNDM 50.5%(52/103)、bla_(KPC)33.0%(34/103)、bla_(OXA-48)22.3%(23/103)、bla_(IMP)10.7%(11/103)。18种ST型中以ST11型35.3%(36/102)及ST76型22.5%(23/102)为主。CR-hvKP 10株,其中仅4株为荚膜血清K1型、10株均为菌毛黏附基因fim-H和铁载体相关基因ent-B携带者。10株CRhvKP菌株PFGE同源性分析显示以D族群居多,亲缘性接近;未发现同一病区同一时间段的暴发流行。结论该院CRKP菌株以产NDM-5型碳青霉烯酶为主,ST11型为优势流行株。已发现9.7%的CRKP为CR-hvKP菌株,应当引起临床和院感相关部门的重视,防止暴发流行。

关键词：碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌耐药机制多位点序列分型脉冲场凝胶电泳毒力特征

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犬咬伤后罕见病原菌致伤口感染1例

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中国感染与化疗杂志 2020年第1期20卷 89-91页

作者：郭睿周晓燕赵梅殷国民贾伟李刚宁夏医科大学临床医学院银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心宁夏病原微生物重点实验室

犬咬伤可导致软组织损伤,由于犬口腔内细菌含量较高,咬伤后易引起伤口化脓性感染,形成蜂窝织炎,致皮下、筋膜下和肌间等处的疏松结缔组织的弥漫性化脓性炎症,严重者可危及生命[1]。本院微生物实验室于2019年2月6日从犬咬伤患者伤口分泌... 详细信息

犬咬伤可导致软组织损伤,由于犬口腔内细菌含量较高,咬伤后易引起伤口化脓性感染,形成蜂窝织炎,致皮下、筋膜下和肌间等处的疏松结缔组织的弥漫性化脓性炎症,严重者可危及生命[1]。本院微生物实验室于2019年2月6日从犬咬伤患者伤口分泌物中同时分离出动物溃疡伯杰菌、羊链球菌和口腔巴斯德菌3种临床罕见菌株,并对目前国内外以上3种菌株感染案例报道进行汇总,以提高对3种菌株及其感染特征的认识,为临床诊断及治疗提供参考。

关键词：犬动物咬伤动物溃疡伯杰菌口腔巴斯德菌羊链球菌

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刚地弓形虫ROP16蛋白对MH-S细胞极化和凋亡的影响及其相关机制

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2022年第5期40卷 579-586页

作者：李佳铭王艺璇杨宁爱马慧慧兰敏刘春兰赵志军宁夏医科大学临床医学院银川750004 宁夏病原微生物重点实验室银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心银川750004

目的探究刚地弓形虫棒状体蛋白16 (ROP16)在小鼠肺泡巨噬细胞(MH-S细胞)中的表达及其对细胞极化和凋亡的影响和相关机制。方法利用携带绿色荧光标签的ROP16过表达慢病毒转染MH-S细胞,构建稳定表达ROP16的ROP16-MH-S细胞株(过表达组),... 详细信息

目的探究刚地弓形虫棒状体蛋白16 (ROP16)在小鼠肺泡巨噬细胞(MH-S细胞)中的表达及其对细胞极化和凋亡的影响和相关机制。方法利用携带绿色荧光标签的ROP16过表达慢病毒转染MH-S细胞,构建稳定表达ROP16的ROP16-MH-S细胞株(过表达组),同时设空载体慢病毒转染对照组(空载体组)和无转染对照组(对照组)。转染72 h后免疫荧光法检测ROP16-MH-S中ROP16的表达及其在细胞中的定位。以甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)基因的转录水平为内参照,RT-qPCR检测ROP16-MH-S细胞中促炎(M1)因子白细胞介素-1β (IL-1β)、肿瘤坏死因子(TNF-α)、 IL-18、 IL-6、 IL-12和抗炎(M2)因子IL-10、转化生长因子-β(TGF-β),以及抑凋亡基因B细胞淋巴瘤/白血病-2 (Bcl-2)和促凋亡基因Bcl-2相关X蛋白(Bax)、半胱氨酸蛋白酶3 (Caspase 3)、 Caspase 9等mRNA的相对转录水平;Western blotting检测ROP16-MH-S细胞中极化蛋白精氨酸酶1 (Arg-1)、信号转导和转录激活因子3 (STAT3)、 705位点磷酸化(pTyr705)-STAT3、 STAT6、 pTyr641-STAT6和凋亡蛋白Caspase 9、 Caspase 3、 Bcl-2、 Bax蛋白的相对表达水平;流式细胞术检测ROP16-MH-S细胞的凋亡情况。组间比较采用单因素方差分析。结果转染后72 h,空载体组和过表达组90%以上的细胞可见较强的绿色荧光,过表达组细胞中可见明显红色荧光聚集在ROP16-MH-S细胞核及其周围。RT-qPCR结果显示,过表达组ROP16 mRNA的相对转录水平为8 023.459±39.325,高于空载体组(5.540±0.001)(F=83 188, P <0.01);Western blotting检测结果显示,过表达组ROP16蛋白的相对表达水平为16.349±0.746,高于空载体组(1.291±0.333)(F=831.7, P <0.01)。RT-qPCR结果显示,过表达组促炎(M1)因子IL-1β、 TNF-α、 IL-18、IL-6、 IL-12 m RNA的相对转录水平分别为0.495±0.002、 0.337±0.007、 0.378±0.014、 0.474±0.035和0.730±0.021,均低于空载体组(0.994±0.043、 1.165±0.034、 0.943±0.005、 1.153±0.028、 0.926±0.031)(F=261.7、 536.5、 1 682.0、 225.0、 78.5, P <0.01);抗炎(M2)因子IL-10、 TGF-β mRNA的相对转录水平分别为7.013±0.032和1.608±0.024,均高于空载体组(0.790±0.031、 1.091±0.027)(F=23 835.0、 200.1, P <0.01)。Western blotting检测结果显示,过表达组Arg-1、 pTyr705-STAT3、 pTyr641-STAT6蛋白相对表达水平分别为2.337±0.089、 3.471±0.046、 3.905±0.045,均高于空载体组(0.871±0.014、 1.482±0.071、 1.514±0.050)(F=640.8、 1 608.0、 3 528.0, P <0.01)。流式细胞术检测结果显示,过表达组细胞凋亡率为(2.990±0.042)%,低于对照组(6.480±0.071)%和空载体组(5.655±0.290)%(F=219.7, P <0.01)。Western blotting检测结果显示,过表达组促凋亡蛋白Bax、 Caspase 3、 Caspase 9的相对表达水平分别为0.558±0.005、 0.640±0.011、0.593±0.026, Bax/Bcl-2为0.453±0.011,均低于空载体组(0.991±0.010、 0.926±0.006、 0.963±0.012、0.834±0.008)(F=2 850.0、 1 200.0、 359.3、 2 337.0, P <0.01)。RT-qPCR检测结果显示,过表达组促凋亡基因Bax、 Caspase 3、 Caspase 9 mRNA的相对转录水平分别为0.588±0.086、 0.563±0.025和0.403±0.014, Bax/Bcl-2为0.158±0.008,均低于空载体组(0.924±0.016、 0.937±0.041、 0.807±0.032、 0.779±0.014)(F=24.7、 78.6、 154.9、 26

关键词：刚地弓形虫棒状体蛋白16 小鼠肺泡巨噬细胞凋亡信号转导和转录激活因子3/6

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一株杀白细胞素基因阳性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分子分型及肠毒素检测

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中国病原生物学杂志 2022年第6期17卷 649-653,659页

作者：苏雅静乔霞康宇婷汪澎涛杨宁爱贾伟赵志军宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室宁夏银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心

目的对宁夏某医院临床分离的1株杀白细胞素基因阳性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(PVL^(+) MRSA)菌株进行分子分型和肠毒素检测分析,以了解该菌株的遗传学特征。方法按AxyPrep质粒小量制备试剂盒说明书提取细菌DNA,利用葡萄球菌染色体基因... 详细信息

目的对宁夏某医院临床分离的1株杀白细胞素基因阳性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(PVL^(+) MRSA)菌株进行分子分型和肠毒素检测分析,以了解该菌株的遗传学特征。方法按AxyPrep质粒小量制备试剂盒说明书提取细菌DNA,利用葡萄球菌染色体基因盒mec(staphylococcal cassette chromosome mec,SCCmec)分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)以及金黄色葡萄球菌表面蛋白A基因多态性分型(staphylococcus protein A,Spa)技术对PVL^(+) MRSA分离株进行分子分型。采用PCR法检测金黄色葡萄球菌7个管家基因(arcC,aroE,tpi,pta,glpF,gmk和yqiL),将测序结果与MLST数据库进行比对。采用微孔板酶联免疫法(ELISA)检测PVL^(+) MRSA分离株中5种传统肠毒素(staphylococcal enterotoxins A-E,SEA-SEE)的表达情况。结果对PVL^(+) MRSA分离株进行SCCmec基因的多重PCR扩增,扩增产物经测序比对分析,确定该菌株为SCCmecⅣa型。PCR扩增金黄色葡萄球菌7个管家基因后测序比对,获得PVL^(+) MRSA分离株的序列型(sequence types,STs)为ST 3191。PCR扩增spa基因并测序,测序结果与Spa Serve数据库比对,未检出PVL^(+) MRSA分离株的Spa型别(non-typeable,NT)。ELISA检测PVL^(+) MRSA分离株产B和C混合型葡萄球菌肠毒素。结论 PVL^(+) MRSA分离株的分子型为ST 3191-MRSA-SCCmecⅣa型,且产B和C混合型葡萄球菌肠毒素,属于社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)。

关键词：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子分型 PCR 肠毒素

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短链脂肪酸对NR8383肺泡巨噬细胞炎性反应的影响

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中国病原生物学杂志 2019年第6期14卷 691-696页

作者：康宇婷赵志军安童童刘学雷杨宁爱贾伟宁夏医科大学临床医学院宁夏银川750004 宁夏医科大学总医院宁夏病原微生物重点实验室

目的探讨短链脂肪酸(SCFAs)在大鼠肺泡巨噬细胞系NR8383细胞中的抗炎作用。方法将3种短链脂肪酸(乙酸盐、丙酸盐及丁酸盐)与NR8383细胞共孵育,然后分别用LPS刺激及肺炎克雷伯杆菌感染NR8383细胞,采用Western blot检测炎性相关蛋白的表达... 详细信息

目的探讨短链脂肪酸(SCFAs)在大鼠肺泡巨噬细胞系NR8383细胞中的抗炎作用。方法将3种短链脂肪酸(乙酸盐、丙酸盐及丁酸盐)与NR8383细胞共孵育,然后分别用LPS刺激及肺炎克雷伯杆菌感染NR8383细胞,采用Western blot检测炎性相关蛋白的表达,q-PCR检测炎性相关蛋白mRNA的表达。结果 LPS刺激组丁酸盐预孵育可显著增加NR8383细胞抗炎因子IL-10在3 h及6 h的表达量,以及12 h的TGF-β的表达量,丙酸盐可降低3 h、12 h的iNOS和NF-κB的表达,同时促炎因子TNF-的表达量在LPS刺激6 h后显著降低;q-PCR检测显示,丁酸盐和丙酸盐分别可增加3 h、6 h IL-10 mRNA的表达量(t=4.912,P<0.05),且丁酸盐组表达量>丙酸盐组。与其他两种短链脂肪酸相比丙酸盐降低TNF-mRNA表达的作用更显著(t=13.26,P<0.05)。Kpn刺激组中,与对照组相比丙酸盐可显著增加6 h时抗炎因子IL-10及TGF-β的表达量;丁酸盐可降低3 h和6 h时NF-κB蛋白表达;同时3种短链脂肪酸都可降低6 h的TNF-的表达,以丁酸盐的效应显著;q-PCR检测显示,丁酸盐可显著增加3 h和6 h时IL-10 mRNA的表达量(t=4.41,P<0.05),丙酸盐可显著增加6 h时IL-10 mRNA的表达量(t=5.616,P<0.05)。3种短链脂肪酸都可降低TNF-mRNA的表达,以丁酸盐的效果更显著(t=100.3,P<0.05)。结论短链脂肪酸在NR8383细胞中发挥一定的抗炎效应,尤以丙酸盐和丁酸盐的抗炎效应更显著。

关键词：短链脂肪酸 NR8383 抗炎效应

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鲍曼不动杆菌ATCC17978中第二信使c-di-GMP相关代谢蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2020年第9期15卷 1005-1009,1014页

作者：乔霞苏雅静魏军贾伟赵志军宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室宁夏银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心宁夏银川750004

目的采用生物信息学方法分析鲍曼不动杆菌ATCC17978中第二信使环鸟苷-磷酸(c-di-GMP)相关代谢蛋白,预测其性质和编码功能。方法通过在线数据库NCBI查找鲍曼不动杆菌基因组,从中筛选出含有GGDEF/EAL结构域的蛋白,通过MEGA4.0软件构建进... 详细信息

目的采用生物信息学方法分析鲍曼不动杆菌ATCC17978中第二信使环鸟苷-磷酸(c-di-GMP)相关代谢蛋白,预测其性质和编码功能。方法通过在线数据库NCBI查找鲍曼不动杆菌基因组,从中筛选出含有GGDEF/EAL结构域的蛋白,通过MEGA4.0软件构建进化树进行分析,利用Swiss-Model软件分析该蛋白的三级结构。结果Blast比对显示ATCC17978中含有GGDEF/EAL结构域和c-di-GMP代谢相关的候选蛋白12个,其中含有GGDEF结构域的蛋白10个,含有EAL结构域的蛋白5个,同时含有GGDEF结构域和EAL结构域的蛋白3个。蛋白序列分析含有GGDEF/EAL结构域的蛋白可以分为两类,其中5个蛋白质含有I位点。结构预测分析7个蛋白中含有1个或多个跨膜结构域,其中3个蛋白无跨膜结构域。三级结构预测出9个可信度较高的蛋白。结论鲍曼不动杆菌ATCC17978含有12个与c-di-GMP代谢相关GGDEF/EAL结构域蛋白,为探索c-di-GMP代谢网络奠定了基础。

关键词：鲍曼不动杆菌环鸟苷二磷酸 GGDEF结构域 EAL结构域

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弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白激活STAT3磷酸化调节THP-1细胞周期、增殖及凋亡

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中国人兽共患病学报 2024年第12期40卷 1115-1121,1127页

作者：殷荷马磊党甜甜李佳铭田婷婷马珊妮赵志军宁夏医科大学总医院银川750004 宁夏临床病原微生物重点实验室银川750004 宁夏医科大学检验学院银川750004

目的探讨弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白通过激活STAT3磷酸化对THP-1细胞周期、增殖及凋亡的影响。方法将ROP16空载体及重组慢病毒过表达载体分别转染至THP-1细胞,观察细胞荧光表达强度并验证过表达效果;通过Western blotting检测过表达ROP16Ⅰ/... 详细信息

目的探讨弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白通过激活STAT3磷酸化对THP-1细胞周期、增殖及凋亡的影响。方法将ROP16空载体及重组慢病毒过表达载体分别转染至THP-1细胞,观察细胞荧光表达强度并验证过表达效果;通过Western blotting检测过表达ROP16Ⅰ/Ⅲ的THP-1细胞中STAT3及P-STAT3蛋白的表达;利用STAT3磷酸化抑制剂-Stattic干预细胞,分为THP-1组、THP-1+Stattic组、THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组及THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ+Stattic组;通过流式细胞术和CCK-8法检测各组细胞周期、增殖曲线以及凋亡率的改变;Western blotting检测细胞凋亡相关蛋白Bax、Cleaved Caspase3、Caspase9及Bcl-2蛋白表达水平。结果ROP16重组慢病毒过表达载体转染THP-1细胞后观察到强荧光信号,ROP16 mRNA及蛋白表达水平均显著升高(FmRNA=314.1,F蛋白=758.7,均P<0.001),表明细胞稳转株构建成功,且THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组细胞中P-STAT3蛋白的表达水平较THP-1组升高(F=606.1,P<0.001)。流式细胞术和CCK-8结果显示,与THP-1组比较,THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组细胞周期被阻滞在G1期,细胞增殖能力降低(tⅠ组=19.2,tⅢ组=24.0,均P<0.01)、凋亡率增加(tⅠ组=175.1,tⅢ组=205.2,均P<0.001)。Western blotting结果显示,与THP-1组比较,THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ组细胞内促凋亡蛋白Bax、Cleaved Caspases3、Caspase9的表达均显著升高(tBaxⅠ组=15.8,tBaxⅢ组=11.1,tCaspase9Ⅰ组=9.1,tCaspase9Ⅲ组=10.2,tCleaved Caspase3Ⅰ组=16.5,tCleaved Caspase3Ⅲ组=12.9,均P<0.001),抗凋亡蛋白Bcl-2表达明显降低(tⅠ组=18.4,tⅢ组=26.2,均P<0.001)。但在Stattic干预后,THP-1-ROP16Ⅰ/Ⅲ+Stattic组细胞周期、增殖能力、凋亡率及凋亡相关蛋白的表达均恢复至接近原水平。结论弓形虫ROP16Ⅰ/Ⅲ蛋白通过激活STAT3磷酸化进而将THP-1细胞周期阻滞在G1期、抑制细胞增殖并促进细胞凋亡。

关键词： ROP16蛋白 THP-1细胞细胞周期细胞增殖细胞凋亡

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弓形虫ROP16_Ⅱ效应分子对宿主A549细胞基因表达谱的影响

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中国人兽共患病学报 2018年第4期34卷 323-329页

作者：苏雅静董辉乔霞王云杰刘学雷杨宁爱赵志军宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心银川750004 宁夏医科大学银川750004

目的 ROPl6在弓形虫入侵宿主细胞的过程中发挥着关键作用。为了提高ROP16对宿主细胞的分子功能的认识,本研究分析了ROP16_Ⅱ基因转染的A549细胞株的表达谱,筛选了新的候选基因,为揭示Ⅱ型弓形虫病的发病机制提供了依据。方法通过表达谱... 详细信息

目的 ROPl6在弓形虫入侵宿主细胞的过程中发挥着关键作用。为了提高ROP16对宿主细胞的分子功能的认识,本研究分析了ROP16_Ⅱ基因转染的A549细胞株的表达谱,筛选了新的候选基因,为揭示Ⅱ型弓形虫病的发病机制提供了依据。方法通过表达谱芯片技术对过表达ROP16_Ⅱ的A549细胞株的表达谱进行研究,并从中筛选差异表达基因。利用ToppGene从差异表达基因中筛选候选基因,并通过RT-qPCR对获得的基因进行验证。结果共获得了9 994个差异表达基因,其中上调的基因有4 293个,下调的基因有5 701个。将这些差异表达基因进行GO功能富集分类,主要涉及多种生物学过程,包括发育过程、生物调控、免疫应答和信号传导等过程。采用ToppGene筛选得到4个疾病候选基因,其中上调表达的有IL4R和STAT1;下调表达的有IL12RB1和IL2RG。RT-qPCR结果与表达谱芯片数据一致。结论 ROP16_Ⅱ入侵宿主细胞后影响宿主细胞基因表达谱,了解ROP16_Ⅱ的作用机制,对于更加全面地揭示Ⅱ型弓形虫病的发病机制具有重要意义。

关键词： ToppGene ROP16 表达谱弓形虫

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基于生物信息学探讨弓形虫ROP16_Ⅰ对A549细胞表达谱的影响

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中国人兽共患病学报 2019年第10期35卷 957-963,972页

作者：苏雅静乔霞刘学雷杨宁爱贾伟赵志军宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心银川750004 宁夏医科大学银川750004

目的采用生物信息学对ROP16 Ⅰ基因转染的A549细胞株的表达谱芯片结果进行数据挖掘,寻找影响Ⅰ型弓形虫疾病的差异表达基因,为揭示Ⅰ型弓形虫疾病的发病机制提供依据。方法通过生物信息学方法对过表达ROP16 Ⅰ的A549细胞株的表达谱进行... 详细信息

目的采用生物信息学对ROP16 Ⅰ基因转染的A549细胞株的表达谱芯片结果进行数据挖掘,寻找影响Ⅰ型弓形虫疾病的差异表达基因,为揭示Ⅰ型弓形虫疾病的发病机制提供依据。方法通过生物信息学方法对过表达ROP16 Ⅰ的A549细胞株的表达谱进行研究,从中筛选差异表达基因。将得到的数据导入在线分析工具ToppGene和STRING中对差异表达基因进行筛选,同时进行GO 分析及KEGG分析。结果本研究共获得了483个差异表达基因,其中上调的基因共有252个,下调的基因共有231个。ToppGene最终筛选得到CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等14个Ι型弓形虫相关的基因。GO分析和KEGG分析发现,这些候选基因与白介素IL-10、IL-4、IL-13信号通路,细胞因子-细胞因子受体相互作用通路及Toll样受体信号通路等相关。在蛋白-蛋白互作网络中,这14个候选基因恰好处于网络的最核心位置。结论Ι型弓形虫疾病的发生可能与CCL8、CXCL11、PIAS1及EIF2AK2等基因密切相关。

关键词： ROP16 弓形虫表达谱生物信息

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弓形虫多态性ROP16效应分子诱导宿主A549细胞基因表达谱的差异研究

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中国人兽共患病学报 2018年第3期34卷 200-206页

作者：苏雅静董辉王云杰刘学雷赵志军宁夏医科大学总医院宁夏临床病原微生物重点实验室银川750004 宁夏医科大学总医院医学实验中心银川750004 宁夏医科大学银川750004

目的探讨弓形虫Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型ROP16对宿主基因表达谱的影响及其意义。方法以A549细胞株为研究模型,建立弓形虫Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型ROP16稳定转染的A549细胞株,通过表达谱芯片技术筛选差异表达基因,并对差异基因进行GO分析和Pathway通路分析。结... 详细信息

目的探讨弓形虫Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型ROP16对宿主基因表达谱的影响及其意义。方法以A549细胞株为研究模型,建立弓形虫Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型ROP16稳定转染的A549细胞株,通过表达谱芯片技术筛选差异表达基因,并对差异基因进行GO分析和Pathway通路分析。结果对差异基因进行聚类,发现ROP16I转染组776个基因表达上调,494个基因表达下调;ROP16Ⅲ转染组842个基因表达上调,520个基因表达下调;而ROP16Ⅱ转染组5 063个基因表达上调,5 989个基因表达下调。另外,ROP16Ⅰ/Ⅲ转染组基因表达谱相似。而ROP16Ⅱ转染组则不同,表达谱差异显著。对ROP16Ⅱ转染组差异基因进行Pathway通路分析发现,显著改变的通路共有74条,其中ROP16Ⅱ单独调控的信号通路有19条,主要与NF-κB、Toll样受体,趋化因子等信号通路、炎症反应及免疫调节和代谢等相关。结论 ROP16入侵宿主细胞核后影响宿主细胞基因表达谱。同Ⅰ、Ⅲ型弓形虫相比,Ⅱ型弓形虫在基因组上的差异导致其具有独特的差异基因表达谱和信号通路,了解其单独调控的信号通路对于Ⅱ型弓形虫的防治具有重要意义。

关键词：弓形虫 ROP16 表达谱差异

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