近年来,众多研究小组开展了大量的全基因组关联研究(Genome-wide association studies,GWAS),发现并鉴定了许多与复杂疾病/性状相关联的遗传变异,为复杂疾病发病机制的研究提供了重要线索。由于GWAS的结果存在假阳性、假阴性、检测到的...
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近年来,众多研究小组开展了大量的全基因组关联研究(Genome-wide association studies,GWAS),发现并鉴定了许多与复杂疾病/性状相关联的遗传变异,为复杂疾病发病机制的研究提供了重要线索。由于GWAS的结果存在假阳性、假阴性、检测到的单核苷酸多态性很少位于功能区以及对稀有变异和结构变异不敏感等问题,导致了其应用的局限性。而新一代测序技术的进步,促进了全基因组测序和全基因组外显子测序的快速发展,为解决上述问题提供了契机。全基因组外显子测序是利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。由于其具有对常见和罕见变异高灵敏度,能发现外显子区绝大部分疾病相关变异以及仅需要对约1%的基因组进行测序等优点,促使全基因组外显子测序成为鉴定孟德尔疾病的致病基因最有效的策略,也被运用于复杂疾病易感基因的研究和临床诊断中。
目的搜寻和鉴定银屑病发病过程中IL23/Th17信号通路基因交互作用模型,为汉族人银屑病的发病机制、诊断和预测提供重要理论依据。方法本研究从IL23/Th17通路中选出与汉族人银屑病发病相关的11个基因,选取的11个基因在1139银屑病病例和1694个对照样本中进行分型分析,通过多因子降维分析法（MDR）和logistic regression algorithms等方法,找出IL23/Th17信号通路相关基因在银屑病发病中的交互作用。结果我们发现IL21,CCR4和TNF(χ=5.02（1）,P=0.025)三个基因在银屑病发病中有显著的基因交互作用;IL12RB1和CCR4(χ=11.66（4）,P=0.0201)、IL22和CCR4(χ=11.97（4）,P=0.0176)、IL12RB1 and IL6(χ=7.31（1）,P=0.0069)在银屑病的发病中都有显著的交互作用。结论本研究证实了IL23/Th17信号通路中相关基因的交互作用在银屑病发病中起着重要作用。
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