检索结果-内蒙古大学图书馆

药学学报 2016年第5期51卷 690-697页

作者：陈敏宋江波李知泉唐冬梅童晓玲代方银西南大学生物技术学院家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室重庆400716

家蚕(Bombyx mori)具有饲养容易、子代多、生命周期短、大小适中易于实验操作、遗传背景清楚、突变资源丰富等优点,长期被用作实验遗传学材料,被确定为鳞翅目昆虫的研究模式。家蚕也逐渐成为人类疾病模型和药物筛选的新型实验动物。近... 详细信息

家蚕(Bombyx mori)具有饲养容易、子代多、生命周期短、大小适中易于实验操作、遗传背景清楚、突变资源丰富等优点,长期被用作实验遗传学材料,被确定为鳞翅目昆虫的研究模式。家蚕也逐渐成为人类疾病模型和药物筛选的新型实验动物。近期的相关研究表明,在家蚕丰富的遗传资源中,存在着诸多人类遗传疾病模型,如苯丙酮尿症模型、帕金森病模型和海-普综合征模型等。家蚕在人类病原微生物致病机制探究方面也做出了重要贡献。此外,家蚕能够用于药代动力学研究及系统地评价药效及药物安全性,并且能够实现高通量药物筛选,可大大缩短新型药物的研发周期。本文综述了家蚕作为疾病模型及用于药物筛选的研究进展,分析了其开发前景,以期能够帮助人们全面地了解家蚕在新药研发中的作用,为大规模开展基于家蚕人类疾病模型的药物筛选提供参考。

关键词：家蚕实验动物疾病模型药物筛选药物评价

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家蚕sirtuin家族基因的鉴定及系统发生与表达芯片分析

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中国农业科学 2014年第13期47卷 2659-2670页

作者：陈聪宋江波孟刚童晓玲代方银鲁成西南大学生物技术学院/家蚕基因组生物学国家重点实验室/农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室

【目的】鉴于sirtuin家族基因重要而多样性的功能,从家蚕全基因组中鉴定sirtuin家族基因,并进行基因结构、蛋白结构及其理化性质、基因进化、组织表达芯片分析及在不同组织中的定量表达情况分析,为研究家蚕sirtuin家族基因的功能和推动... 详细信息

【目的】鉴于sirtuin家族基因重要而多样性的功能,从家蚕全基因组中鉴定sirtuin家族基因,并进行基因结构、蛋白结构及其理化性质、基因进化、组织表达芯片分析及在不同组织中的定量表达情况分析,为研究家蚕sirtuin家族基因的功能和推动家蚕模式生物系统化的研究奠定基础。【方法】基于家蚕基因组数据库,通过生物信息学手段,利用比较基因组学方法,鉴定家蚕sirtuin家族成员;开放阅读框（ORF）的预测用ORFfinder进行;使用SIM4进行ORF的内含子和外显子的预测;用GSDS和ExPaSy在线工具分别进行基因结构图和蛋白序列理化性质的预测;用CLUSTAL;软件进行多序列联配及对其二级结构进行分析,并用ESpript进行二级结构作图;使用SMART在线软件进行蛋白功能域预测;MEGA5.0软件用于系统发生树分析;利用已有的家蚕幼虫5龄第3天的芯片数据进行组织表达分析;利用荧光定量PCR技术检测家蚕sirtuin家族基因在5龄第3天幼虫不同组织中的表达情况。【结果】系统分析鉴定了家蚕中存在的5个sirtuin家族基因（Bmsirt2、Bmsirt4、Bmsirt5、Bmsirt6、Bmsirt7）,共分为4类（I、II、III、IV）。5个基因分布在家蚕5条染色体上,均为单拷贝基因。基因结构分析显示5个基因均为多外显子基因。同源比对和系统进化分析发现家蚕的sirtuin家族基因与类群中其他昆虫的同源基因形成明显的直系同源关系且高度同源,同样不含有sirt3。蛋白结构预测发现家蚕的sirt6与其他物种的sirt6蛋白一样含有两个sir2结构域聚在一起。组织表达芯片分析发现,sirtuin家族基因在多个组织中具有转录活性。荧光定量PCR检测结果显示家蚕的Bmsirt4在脂肪体、丝腺中低表达;Bmsirt5在精巢、中肠中高量表达,在脂肪体、血液、丝腺中低量表达,与芯片数据基本一致。【结论】通过全基因组分析,家蚕共有5个sirtuin家族成员,进化上分为4类,且与其他昆虫高度同源,芯片数据和实时荧光定量PCR结果基本一致,分析表明组织表达模式具有多样性。

关键词： sirtuin 生物信息学表达特征家蚕

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昆虫腹肢发育相关基因的研究进展

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昆虫学报 2014年第8期57卷 962-968页

作者：付明月陈鹏代方银鲁成童晓玲家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室西南大学生物技术学院重庆400716

昆虫躯干外着生有一系列附属器官,主要包括背侧附器和腹侧附器,其中腹肢的多样性表现尤为突出。腹肢的发育过程受到多种调控因子的作用。本文就腹肢发育相关基因的表达、功能及调控因子间的相互作用等方面进行简要的综述。一方面,腹肢... 详细信息

昆虫躯干外着生有一系列附属器官,主要包括背侧附器和腹侧附器,其中腹肢的多样性表现尤为突出。腹肢的发育过程受到多种调控因子的作用。本文就腹肢发育相关基因的表达、功能及调控因子间的相互作用等方面进行简要的综述。一方面,腹肢作为整体受Hox基因和成形素基因(Dpp/Wg)的调控,Hox基因直接决定腹肢的有无,Dpp/Wg通过其表达产物形成浓度梯度调控整个腹肢的发育,两者在腹肢整体发育中的作用不可取代。另一方面,腹肢基部、中部及远端部位分别受到各自特异的调控因子的作用。其中hth,tsh及al等均主要调节腹肢基部的发育,dac通过与Dll和Dpp/Wg相互作用从而调节腹肢中部的发育,bab,Dll及Lim1等对腹肢远端发育发挥重要作用。关节的形成对腹肢分节的形成至关重要,Notch信号通路相关因子如配体基因Dl和Ser,修饰物基因fng及下游靶基因odd,sob,drm和bowl等调节该过程。因此,研究昆虫腹肢发育相关基因,对于深入揭示腹肢的发育及其在进化过程中多样性形成的分子机制具有至关重要的作用。

关键词：昆虫发育附器腹肢基因表达基因调控

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压力应答延长寿命的遗传机制

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中华医学杂志 2013年第36期93卷 2925-2927页

作者：宋江波陈聪童晓玲代方银鲁成家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室西南大学生物技术学院重庆400716

寿命是指一个生物体从诞生到死亡所经历的时间。过去的20年中，影响寿命的经典信号通路的研究已经表明在很多物种中这些信号通路都能够影响生物体的寿命”J。压力，在广义上通常被理解为有害的因子，微弱但无害的压力能够活化细胞内在... 详细信息

寿命是指一个生物体从诞生到死亡所经历的时间。过去的20年中，影响寿命的经典信号通路的研究已经表明在很多物种中这些信号通路都能够影响生物体的寿命”J。压力，在广义上通常被理解为有害的因子，微弱但无害的压力能够活化细胞内在的动力学机制，使生物体更好地应对强烈的压力刺激，进而促进寿命的延长，这被称为毒物刺激作用。越来越多的研究表明，有机体抵抗内在和外在压力的能力在很大程度上能决定其寿命的长短。而压力感受器介导的寿命延长主要发生于有机体应答不同的环境和生理信号刺激时。现从营养压力、氧化压力和其他压力应答来介绍与之相关的寿命通路或因子对寿命的影响，以期对之后的寿命研究有所帮助。

关键词：寿命延长压力刺激遗传机制应答信号通路动力学机制压力感受器生物体

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家蚕全基因组启动子预测及基于芯片表达谱的精巢偏向表达启动子顺式元件分析

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蚕业科学 2014年第2期40卷 216-222页

作者：查幸福殷志明周春燕李俊龙张李颖向仲怀夏庆友家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室西南大学生物技术学院重庆400715

启动子是基因的重要组成部分,决定mRNA的转录,从而实现生物的有序发育过程。基于家蚕基因组和全长cDNA序列数据,鉴定了1 341条家蚕启动子序列。序列分析显示,在启动子-500~200 bp区间的GC、AT含量分别出现了1次和2次高峰值。TATA框(TATA... 详细信息

启动子是基因的重要组成部分,决定mRNA的转录,从而实现生物的有序发育过程。基于家蚕基因组和全长cDNA序列数据,鉴定了1 341条家蚕启动子序列。序列分析显示,在启动子-500~200 bp区间的GC、AT含量分别出现了1次和2次高峰值。TATA框(TATA-box)、起始子(Inr)、CAAT框(CAAT-box)和GC框(GC-box)等元件分别在256、453、200、334个启动子中被鉴定出,前3种元件集中分布于启动子-500~200 bp区间,第4种元件主要分布在-1 600^-300 bp上游较远处。进一步利用家蚕芯片表达谱数据发现23个启动子为精巢偏向表达基因的启动子。顺式元件分析这些精巢偏向表达启动子中含有6个高频率基序(motif),其中3个motif在精巢偏向表达启动子中的出现频率显著高于对照组,暗示这3个motif在精巢偏向表达基因的转录调控中可能起着重要作用。

关键词：家蚕基因组启动子结构特征精巢偏向表达顺式元件

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家蚕着色模式相关的分子遗传学研究

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蚕业科学 2016年第3期42卷 373-385页

作者：彭晨星吴松原代方银家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室西南大学生物技术学院重庆400715

体色与斑纹是昆虫重要的形态特征,对于昆虫捕食、避敌、寻偶、免疫和调节体温等具有重要的意义,其丰富着色模式形成的分子机制一直是昆虫学研究的热点。家蚕作为中国重要的农业经济昆虫,具有5 000多年的驯养历史,不仅成就了灿烂的丝绸文... 详细信息

体色与斑纹是昆虫重要的形态特征,对于昆虫捕食、避敌、寻偶、免疫和调节体温等具有重要的意义,其丰富着色模式形成的分子机制一直是昆虫学研究的热点。家蚕作为中国重要的农业经济昆虫,具有5 000多年的驯养历史,不仅成就了灿烂的丝绸文化,而且带来了巨大的经济效益。家蚕亦是鳞翅目的模式昆虫,拥有的超过200余个与着色相关的突变体是昆虫着色研究的重要实验材料。近年来,结合家蚕的经典遗传连锁图谱、家蚕基因组数据,运用高通量测序手段、定位克隆策略等分离鉴定家蚕着色相关突变体的关键基因,是探索着色模式形成的分子基础的主体。目前已在分子水平解析了家蚕30余种着色相关突变的产生机制,显著推动了家蚕着色机制的研究,对于丰富昆虫着色相关理论和基础知识具有重要贡献。本文总结了家蚕着色模式研究的最新成果,并结合其它昆虫着色相关研究的成果进行分析比较,这对于今后系统开展昆虫着色机制及其演化的研究,以及对着色相关基因的利用,均具有重要参考价值。

关键词：家蚕着色模式突变机制基因调控代谢通路

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WW结构域与Hippo信号通路

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蚕业科学 2013年第6期39卷 1177-1185页

作者：丁鑫孟刚童晓玲代方银鲁成家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室西南大学生物技术学院重庆400716

后生动物中存在多个调控器官发育大小的信号转导通路,其中Hippo信号通路在组织器官的发育过程中形成了一个极为保守和复杂的信号调控网络。构成Hippo通路的各个蛋白质组分均包含多个结构模块,而WW结构域在该通路的核心组分、上游调控因... 详细信息

后生动物中存在多个调控器官发育大小的信号转导通路,其中Hippo信号通路在组织器官的发育过程中形成了一个极为保守和复杂的信号调控网络。构成Hippo通路的各个蛋白质组分均包含多个结构模块,而WW结构域在该通路的核心组分、上游调控因子以及通路末端效应因子等各个层次上广泛分布。基于WW结构域及其偶联配体PPxY基序在Hippo通路中的广泛分布,将有助于研究Hippo通路在器官发育及肿瘤发生中的分子机制和发现新的通路组成成分。本文综述Hippo通路与WW结构域的关系以及在果蝇和高等动物中的研究现状,为深入解析Hippo通路在昆虫和高等动物中的作用与调控机制提供有参考价值的信息。

关键词： Hippo信号通路 WW结构域 PPxY基序

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家蚕性染色体的分子生物学研究进展

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蚕业科学 2013年第6期39卷 1172-1176页

作者：查幸福郭慧珍李俊龙向仲怀夏庆友家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点实验室西南大学生物技术学院重庆400715

性染色体在家蚕性别决定和雌雄个体性状差异方面发挥着关键作用。本文总结近几年关于家蚕Z染色体基因组序列、功能基因和剂量补偿研究以及W染色体序列结构特征和性别决定初始信号候选基因研究的重要进展。基于上述研究过程中出现的趋势... 详细信息

性染色体在家蚕性别决定和雌雄个体性状差异方面发挥着关键作用。本文总结近几年关于家蚕Z染色体基因组序列、功能基因和剂量补偿研究以及W染色体序列结构特征和性别决定初始信号候选基因研究的重要进展。基于上述研究过程中出现的趋势,认为深入开展家蚕性染色体研究,解析W染色体基因组序列,将是今后阐明家蚕性别决定机制的一个挑战,并可能由此取得突破。

关键词：家蚕性染色体性别决定分子生物学

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结合形态标记和分子标记对家蚕从性黑蛾(sml)的连锁分析

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蚕业科学 2013年第3期39卷 442-447页

作者：代方银胡海何松真鲁成家蚕基因组生物学国家重点实验室农业部蚕桑功能基因组与生物技术重点开放实验室西南大学生物技术学院重庆400716

家蚕从性黑蛾(sex-controlled melanism,sml)发现于西南大学家蚕基因资源库,其雄蛾为灰黑色,雌蛾为白色或略带灰色,是一种典型的从性遗传突变。利用家蚕连锁群(染色体)的形态标记和简单序列重复(SSR)分子标记对sml进行连锁分析的结果是:... 详细信息

家蚕从性黑蛾(sex-controlled melanism,sml)发现于西南大学家蚕基因资源库,其雄蛾为灰黑色,雌蛾为白色或略带灰色,是一种典型的从性遗传突变。利用家蚕连锁群(染色体)的形态标记和简单序列重复(SSR)分子标记对sml进行连锁分析的结果是:sml基因与第17连锁群(对应于第17染色体)的分子标记连锁,而与其它连锁群的形态或分子标记均为独立遗传。由此判断sml突变基因位于家蚕第17染色体。研究结果有助于对sml基因的进一步定位、克隆以及突变机制的研究。

关键词：家蚕从性黑蛾(sml) 形态标记简单序列重复连锁分析

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添食法制备改性蚕丝的研究进展

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材料导报 2020年第23期34卷 23190-23198页

作者：蔡海华程岚李智陈李童晓玲代方银西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室西南大学生物技术学院农业部蚕桑生物学与遗传育种重点实验室西南大学纺织服装学院重庆市生物质纤维材料与现代纺织工程技术研究中心

蚕丝是优异的天然蛋白质纤维,被广泛地应用在纺织、服装、生物医学等领域。蚕丝的形成需经历一个复杂的过程:家蚕首先在后部丝腺合成丝素蛋白,丝素蛋白液经过中部丝腺,与其合成分泌的丝胶液一起,通过腺腔内的压力进入到前部丝腺、吐丝管... 详细信息

蚕丝是优异的天然蛋白质纤维,被广泛地应用在纺织、服装、生物医学等领域。蚕丝的形成需经历一个复杂的过程:家蚕首先在后部丝腺合成丝素蛋白,丝素蛋白液经过中部丝腺,与其合成分泌的丝胶液一起,通过腺腔内的压力进入到前部丝腺、吐丝管,再通过榨丝区的肌肉活动对丝蛋白受到的剪切力进行调节,使其二级结构改变,最后在家蚕头部的牵伸摆动下,迅速固化,形成蚕丝。蚕丝虽然具有优异的性能,但仍存在抗菌性能及抗紫外性能差等缺陷,这在一定程度上限制了蚕丝的应用及蚕丝产业的进一步发展。通过对蚕丝进行改性并赋予其新的功能可拓展蚕丝的应用领域,促进蚕丝产业的发展。添食法具有简单、高效、环保及有利于规模化生产等优点,可在源头改性蚕丝的性能,是大量制备改性蚕丝的最有效方法。添食物质的选择至关重要。首先,添食物质不能有毒性;添食后,不能影响家蚕正常的生理及生命活动。其次,要注意添食物质颗粒的尺寸。此外,选择的添食物质需要有突出的性能。综合以上因素,纳米颗粒成为添食家蚕的首选物质。研究者们选择不同种类的纳米颗粒进行添食,取得了一定的成果。在保证蚕丝质地柔软光滑本质的同时,能大幅提升蚕丝的力学性能,且改善蚕丝的热稳定性能。目前,通过添食纳米颗粒制备的蚕丝的力学性能最高可提高111.25%。荧光蚕丝在生物医药工程、光学和光电子领域都具有巨大的应用价值。近年来,有多种方法已应用于制备荧光蚕丝,但大都不够环保且难以大规模持续生产。研究人员通过给五龄时期的家蚕添食具有荧光效应的染料或稀土荧光粉的方法可获得彩色荧光蚕丝。通过此方法所得的荧光蚕丝不仅具有良好的荧光性能,而且具有优异的荧光稳定性。但添食荧光材料会对家蚕的生理和生命活动造成一定影响,并使蚕丝的力学性能有所降低。为了制备具有不同功能的蚕丝,研究人员拓展了添食物质的种类,利用含氮物质、超细羽绒粉体、色素等进行添食,得到了质量突出的蚕茧及力学性能优异的改性蚕丝。本文以添食物质、添食后制备的改性蚕丝的结构及性能为重点,综述了近年来利用纳米物质、荧光物质及其他物质添食制备改性蚕丝的研究进展,客观分析了不同添食物质对蚕丝结构、力学性能及热性能等的影响,展望了添食法未来的研究及发展方向。

关键词：蚕丝改性添食法纳米颗粒荧光材料

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