检索结果-内蒙古大学图书馆

解放军医学杂志 2024年第3期49卷 302-307页

作者：石丽娟李丽石福艳周希彬吴志鸿潍坊医学院临床医学院眼科学教研室山东潍坊261053 解放军总医院第三医学中心眼科医学部北京100039 潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的评估手术、化疗及手术联合化疗3种治疗方式对视网膜母细胞瘤(RB)的疗效,分析RB患者的预后影响因素。方法选取2000年1月1日-2019年12月31日美国监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库登记的RB患者1188例临床资料进行回顾性分析。采... 详细信息

目的评估手术、化疗及手术联合化疗3种治疗方式对视网膜母细胞瘤(RB)的疗效,分析RB患者的预后影响因素。方法选取2000年1月1日-2019年12月31日美国监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库登记的RB患者1188例临床资料进行回顾性分析。采用倾向性评分逆概率加权法(IPTW)对接受手术、化疗或手术联合化疗治疗的3组患者基线特征进行平衡。采用Log-rank检验比较3组患者的生存概率,采用Cox回归模型分析RB患者预后影响因素。结果共纳入RB1188例,其中手术组426例,化疗组200例,手术联合化疗组562例。经IPTW加权后,患者的年龄、性别、种族等基线资料均达到平衡(P>0.05)。Log-rank检验结果显示,加权前后3组生存曲线比较差异均有统计学意义(P<0.05);加权后,手术组患者生存情况明显优于化疗组和手术联合化疗组(P<0.05),化疗组与手术联合化疗组比较差异无统计学意义(P>0.05)。加权后患者1年、3年和5年的生存概率为:手术组99.7%、98.9%和98.6%;化疗组97.4%、95.8%和95.8%;手术联合化疗组97.9%、95.8%和95.0%。Cox回归分析结果显示,与手术组比较,化疗组患者特异性死亡风险比为1.367(95%CI 1.100~1.700),手术联合化疗组特异性死亡风险比为1.132(95%CI0.963~1.330);与RB病灶为1个的患者比较,RB病灶数≥2个的患者特异性死亡风险比为0.399(95%CI0.268~0.594)。结论RB患者接受治疗后生存概率较高;在控制年龄、性别等因素的影响后,3种治疗方式中手术的疗效更好;多灶性可能是RB患者预后的独立影响因素。

关键词：视网膜母细胞瘤逆概率加权疗效生存分析

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基于竞争风险模型的早发性结直肠癌患者预后影响因素分析

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中国医科大学学报 2023年第3期52卷 199-205页

作者：王廉源杨毅丛慧文石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的探讨竞争风险时早发性结直肠癌患者的预后影响因素。方法选取美国SEER数据库中2011年至2015年早发性结直肠癌患者4 226例。在考虑竞争风险的前提下,分别采用Gray检验和Fine-Gray模型进行单因素及多因素分析。结果 Gray检验结果显... 详细信息

目的探讨竞争风险时早发性结直肠癌患者的预后影响因素。方法选取美国SEER数据库中2011年至2015年早发性结直肠癌患者4 226例。在考虑竞争风险的前提下,分别采用Gray检验和Fine-Gray模型进行单因素及多因素分析。结果 Gray检验结果显示,婚姻状况、参保情况、发病位置、肿瘤大小、组织学分级、T分期、N分期和M分期对早发性结直肠癌患者的预后有影响(均P <0.001),种族对早发性结直肠癌患者的预后也有影响(均P=0.001)。多因素竞争风险模型结果显示,组织学分级、婚姻状况、参保情况、T分期、N分期和M分期是影响早发性结直肠癌患者预后的重要因素。结论竞争风险模型下,未参保,组织学分级越高,T分期、N分期和M分期高的早发性结直肠癌患者的预后更差。

关键词：竞争风险模型早发性结直肠癌危险因素列线图

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不同MMSE评分下阿尔兹海默病发病风险因素的贝叶斯分位数回归联合模型分析

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吉林大学学报（医学版） 2023年第2期49卷 395-401页

作者：王廉源杨毅丛慧文王浩桦包绮晗李承圣周立雯丁子琛李艳丽石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院图书馆山东潍坊261053

目的:探讨校正简易精神状态检查(MMSE)评分轨迹后的阿尔兹海默病(AD)发病风险影响因素,阐明不同MMSE评分人群AD发病的风险因素。方法:基于AD神经成像计划数据库收集2005—2016年的随访数据,经筛选后最终纳入425名随访者的随访数据,采用L... 详细信息

目的:探讨校正简易精神状态检查(MMSE)评分轨迹后的阿尔兹海默病(AD)发病风险影响因素,阐明不同MMSE评分人群AD发病的风险因素。方法:基于AD神经成像计划数据库收集2005—2016年的随访数据,经筛选后最终纳入425名随访者的随访数据,采用LASSO方法对变量进行筛选;采用贝叶斯分位数回归模型分析MMSE评分在不同分位数上的影响因素,采用Cox模型和贝叶斯分位数回归联合模型方法分析影响AD发病的主要风险因素。结果:经筛选后,纳入的变量包括白蛋白、总胆固醇和血糖浓度等10个变量。贝叶斯分位数回归联合模型的纵向子模型分析,在MMSE评分的不同分位数处,影响MMSE评分轨迹变化的因素相同,均为白蛋白、血糖浓度、年龄、性别、载脂蛋白E4 (APOE4)基因、种族和教育评分。联合模型的Cox回归子模型分析,种族和APOE4基因在所有分位数上均对AD发病有影响,其中APOE4基因在4个分位数上的风险比分别为2.188 (95%CI:1.775,2.620)、1.751 (95%CI:1.422,2.042)、1.706 (95%CI:1.391,2.102)和2.056 (95%CI:1.439,3.206)。总胆固醇水平和家族史仅在部分分位数上对AD发病有影响。结论:不同MMSE评分分布的人群,AD发病的风险因素不同,影响程度也有差异。有APOE4基因和白种人在不同分位数上均是AD发病的风险因素,总胆固醇水平和家族史仅在部分分位数上是AD发病的风险因素。

关键词：贝叶斯分位数回归联合模型分位数回归模型 Cox模型阿尔兹海默病简易精神状态检查量表风险因素

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乙型肝炎病毒相关肝细胞癌关键基因筛选及其与预后关系的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2023年第5期49卷 1243-1252页

作者：徐雅琪王艳玉张文婧韩梅穆华夏杨希卜伟晓陶子琨孔雨佳石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的:采用生物信息学方法识别与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)的早期诊断和不良预后相关的关键基因,阐明HBV-HCC发生发展的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索“hepatitis Binduced HCC”,下载基因数据集GSE1212... 详细信息

目的:采用生物信息学方法识别与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)的早期诊断和不良预后相关的关键基因,阐明HBV-HCC发生发展的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索“hepatitis Binduced HCC”,下载基因数据集GSE121248,通过R软件中的“limma”数据包筛选差异表达基因(DEGs),采用“clusterProfiler”数据包对DEGs进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用STRING数据库和Cytoscape软件建立蛋白-蛋白互作(PPI)网络并筛选关键基因。采用基因表达水平值的交互式分析(GEPIA)、Kaplan Meier-Plotter和人类蛋白质图谱(HPA)数据库验证关键基因及其蛋白质表达水平,采用“CIBERSORT”数据包分析免疫细胞的浸润情况。结果:共筛选出574个DEGs,其中上调基因173个,下调基因401个。GO功能富集分析,DEGs主要富集于小分子代谢、信号转导、免疫应答和炎症反应等生物学过程;KEGG通路富集分析,DEGs主要富集于视黄醇代谢、细胞色素P450对外源药物代谢通路和化学致癌作用等。筛选PPI网络中的细胞分裂周期20(CDC20)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白A2(CCNA2)、纺锤体检测点蛋白(BUB1B)、拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)、Discs大同源相关蛋白5(DLGAP5)、异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(ASPM)、中心体蛋白55(CEP55)、驱动蛋白超家族11(KIF11)和驱动蛋白超家族20A(KIF20A)为HBV-HCC的关键基因。GEPIA数据库分析,上述10种关键基因在HCC患者中均呈高表达。Kaplan-Meier生存曲线分析,关键基因高表达的HCC患者总生存期短于低表达患者。结论:细胞周期与病毒致癌作用相关基因(CDC20、CDK1、CCNA2和BUB1B)与HBV-HCC患者的发生发展及不良预后有密切关联,可能成为诊断标志物和治疗新靶点。

关键词：肝细胞肿瘤乙型肝炎病毒生物信息学免疫浸润预后

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基于心脑血管疾病发病风险预测的CatBoost算法和贝叶斯网络模型分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第4期50卷 1044-1054页

作者：王爱民王凤琳黄一铭徐雅琪张文婧丛显铸苏维强王素珍高梦瑶李爽孔雨佳石福艳陶恩学山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 山东第二医科大学基础医学院山东潍坊261053

目的:筛选影响心脑血管疾病发病的主要特征变量,基于排序前10位的特征变量构建心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型,为心脑血管疾病发病风险预测提供参考。方法:从英国生物样本(UK Biobank)数据库中纳入315896例参与者和相关变量,通过... 详细信息

目的:筛选影响心脑血管疾病发病的主要特征变量,基于排序前10位的特征变量构建心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型,为心脑血管疾病发病风险预测提供参考。方法:从英国生物样本(UK Biobank)数据库中纳入315896例参与者和相关变量,通过类别型特征提升(CatBoost)算法进行特征选择,将所有参与者按7∶3比例随机分为训练集和测试集,并基于最大最小爬山(MMHC)算法构建贝叶斯网络模型。结果:本研究中人群心脑血管疾病患病率为28.8%。CatBoost算法筛选的排名前10位变量分别为年龄、体质量指数(BMI)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、总胆固醇(TC)、甘油三酯-葡萄糖(TyG)指数、家族史、载脂蛋白A/B比值、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、吸烟状态和性别。CatBoost训练集模型受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)为0.770,模型准确性为0.764;验证集模型AUC为0.759,模型准确性为0.763。临床效能分析,训练集阈值范围为0.06~0.85,验证集阈值范围为0.09~0.81。心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型分析,年龄、性别、吸烟状态、家族史、BMI和载脂蛋白A/B比值与心脑血管疾病直接相关,是心脑血管疾病发生的重要风险因素,TyG指数、HDL-C、LDL-C和TC通过影响BMI和载脂蛋白A/B比值间接影响心脑血管疾病的发生风险。结论:控制BMI、载脂蛋白A/B比值和吸烟行为,可以降低心脑血管疾病的发病风险。贝叶斯网络模型可用于预测心脑血管疾病发病风险。

关键词：心脑血管疾病 CatBoost算法贝叶斯网络风险推理

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基于共享随机效应模型的纵向认知标志物对轻度认知障碍逆转的预测性能比较

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中国卫生统计 2024年第3期41卷 370-375页

作者：秦瑶韩红娟刘龙陈杜荣马艺菲崔靖白文琳张荣余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的将共享随机效应模型(shared random-effect model,SREM)应用于轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)向认知正常(normal cognition,NC)逆转的研究,比较不同纵向认知标志物对MCI逆转的预测性能,并评价影响因素的协变量效应。... 详细信息

目的将共享随机效应模型(shared random-effect model,SREM)应用于轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)向认知正常(normal cognition,NC)逆转的研究,比较不同纵向认知标志物对MCI逆转的预测性能,并评价影响因素的协变量效应。方法SREM模型包括两个子模型,其中纵向子模型采用线性混合效应模型对纵向认知标志物的变化轨迹建模,生存子模型采用比例风险模型对生存过程建模。基于对数似然函数值和信息准则进行模型拟合优度检验,采用ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)评价不同纵向认知标志物(MMSE、CDRSB、FAQ、ADAS11、ADAS13和ADASQ4)对MCI逆转的预测性能;同时进行纵向子模型和生存子模型的影响因素分析。结果843名MCI患者中72名(8.54%)在随访结束后逆转为NC。以spline-PH-GH参数分布为基准风险函数的SREM模型对数似然函数值最大,AIC和BIC最小;以CDRSB为纵向认知标志物建立的SREM模型拟合最好,在不同时间的AUC值均表现良好,范围为0.797~0.852,且预测误差最小,范围为0.0427~0.0429;年龄、性别、受教育程度、婚姻状况和APOEε4基因均会影响MCI患者的认知功能和日常活动功能,六种纵向认知标志物均会影响MCI患者的逆转。结论CDR评分对MCI患者的认知功能和逆转预测性能最佳;认知功能和日常活动功能可作为MCI逆转的动态监测指标。

关键词：共享随机效应模型联合模型纵向数据生存数据轻度认知障碍逆转

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多状态Markov模型在阿尔茨海默病自然史中的应用

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中国卫生统计 2024年第2期41卷 227-230,234页

作者：秦瑶韩红娟刘龙陈杜荣王浩基崔靖白文琳余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的将多状态Markov模型应用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)自然史研究,为慢性病自然史研究提供方法学借鉴。方法基于美国公共数据库ADNI,构建正常认知(normal cognition,NC)-轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)... 详细信息

目的将多状态Markov模型应用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)自然史研究,为慢性病自然史研究提供方法学借鉴。方法基于美国公共数据库ADNI,构建正常认知(normal cognition,NC)-轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)-AD多状态Markov模型,估计不同状态间的转移强度、转移概率、影响因素和各状态的逗留时间,绘制生存曲线,并进行模型拟合优度评价。结果性别、年龄、FAQ、MMSE、CDRSB、ADAS13、TMT-B-Time是AD自然史中重要的影响因素;NC与MCI状态的平均逗留时间分别为7.502年,11.621年。多状态Markov模型拟合结果较好。结论多状态Markov模型在AD等多状态慢性病转归研究中具有很好的应用价值。

关键词：多状态Markov模型阿尔茨海默病慢性病自然史

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多元纵向测量的潜在过程模型在轻度认知障碍逆转研究中的应用

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中国卫生统计 2024年第1期41卷 64-67,71页

目的将多元纵向测量的潜在过程模型应用于轻度认知障碍向认知正常逆转的研究,为慢性病纵向研究提供方法学借鉴。方法基于多个纵向认知标记物共同代表同一个潜在认知过程的假设,构建多元纵向测量的潜在过程模型,捕捉潜在认知过程随时... 详细信息

目的将多元纵向测量的潜在过程模型应用于轻度认知障碍向认知正常逆转的研究,为慢性病纵向研究提供方法学借鉴。方法基于多个纵向认知标记物共同代表同一个潜在认知过程的假设,构建多元纵向测量的潜在过程模型,捕捉潜在认知过程随时间的变化轨迹,量化不同纵向认知标记物解释潜在认知过程的贡献,讨论不同认知标记物用以衡量认知功能的敏感性,及其协变量效应。参数估计采用极大似然法,采用残差分析和不同纵向认知标记物解释潜在认知过程所占百分比进行拟合优度评价。结果性别(P=0.004),受教育年限(P=0.002),随访时间(P<0.001)和随访时间的二次方(P<0.001)与潜在认知过程显著相关。性别(P=0.048)与受教育年限(P=0.013)的不同纵向认知标记物之间有统计学差异。残差分析和潜在过程解释纵向测量变异的比例说明模型拟合良好。结论多元纵向数据潜在过程模型在痴呆等慢性病研究中具有很好的应用价值。

关键词：潜在过程纵向数据轻度认知障碍逆转

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基于随机森林算法的胰腺癌术后预测模型构建

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吉林大学学报（医学版） 2022年第2期48卷 426-435页

作者：李承圣包绮晗郝晓燕潘庆忠王素珍石福艳潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院护理学院内外科教研室山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的:通过随机森林算法构建胰腺癌患者术后5年生存情况预测模型,为胰腺癌患者术后预后评估提供指导。方法:利用美国国立癌症研究所监测、流行病学和结果数据库(SEER)收集符合本研究要求的42618条胰腺癌患者及其预后数据,经过数据筛选最... 详细信息

目的:通过随机森林算法构建胰腺癌患者术后5年生存情况预测模型,为胰腺癌患者术后预后评估提供指导。方法:利用美国国立癌症研究所监测、流行病学和结果数据库(SEER)收集符合本研究要求的42618条胰腺癌患者及其预后数据,经过数据筛选最终纳入4020条患者信息。将研究对象随机分为训练集和测试集,采用χ2检验、多因素Logistic回归分析和随机森林变量重要性排名进行特征变量选择;利用合成少数样本过采样技术(SMOTE)将训练集调整为平衡数据集;基于平衡后数据集利用随机森林算法构建预测模型;利用测试集,基于G-mean指数、灵敏度、特异度和受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)4个评价指标,分别与Logistic回归分析、支持向量机、决策树和人工神经网络算法进行比较,对预测模型做出评价。结果:原始训练集中包含2814个样本,其中生存时间≥5年的患者有196例,占比约1/13,是不平衡数据集,经过SMOTE方法调整后获得平衡数据集,二分类样本数量基本达到平衡。最终纳入模型的变量有年龄、种族、肿瘤原发部位、肿瘤分化程度、是否放疗、T分期、N分期、婚姻状况、肿瘤大小和淋巴结阳性比率。基于随机森林算法构建的胰腺癌患者术后预测模型G-mean指数为0.830,AUC为0.833[P<0.05,95%置信区间(CI)(0.784,0.876)],优于Logistic回归分析、支持向量机、决策树和人工神经网络。结论:基于随机森林算法构建的胰腺癌术后预测模型对胰腺癌患者术后5年生存情况的预测性能优于其他常见机器学习方法,能够为临床医生改善胰腺癌患者的预后和生存状况提供依据。

关键词：胰腺肿瘤随机森林算法预测模型预后模型比较

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基于孟德尔随机化法的BMI与2型糖尿病因果关系研究

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郑州大学学报（医学版） 2022年第5期57卷 645-649页

作者：包绮晗李承圣王浩桦丁子琛周立雯丛慧文王廉源杨毅石福艳潘庆忠王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学系山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的:采用孟德尔随机化法,以单核苷酸多态性(SNP)为工具变量,探究BMI与2型糖尿病(T2DM)的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project网站获得近3 a、样本量最大的BMI(ieu-b-40)及T2DM(ebi-a-GCST006867)的GWAS数据。从ieu-b-40中筛选与BMI高度相关的SNP(以P<5×10^(-8)为筛选条件,连锁不平衡系数r^(2)为0.001,连锁不平衡区域宽度为10000 kb)。从ebi-a-GCST006867中提取BMI有关的SNP(最小r^(2)>0.8,缺失的SNP用与其具有高度连锁性的SNP代替,删除无替代位点的SNP)。汇总上述两个数据集,剔除与T2DM直接相关的SNP,最终纳入包括rs8047395、rs13021737、rs663128等451个SNP作为工具变量。采用MR-Egger回归、加权中位数法(WME)、随机效应逆方差加权法(IVW)、加权模型4种回归模型分析BMI与T2DM的因果关系。结果:GWAS数据均来源于欧洲人群,男女不限。MR-Egger回归截距项为0.0003(P=0.8261),即筛选出的SNP不存在基因多效性。MR-Egger回归、WME、IVW、加权模型的OR(95%CI)分别为2.906(2.347~3.598)、2.938(2.676~3.226)、2.842(2.619~3.085)、2.980(2.440~3.638);由于存在异质性(Q=1289.365,P<0.001),故关注随机效应IVW的结果。结论:BMI是T2DM的危险因素。

关键词： BMI 2型糖尿病孟德尔随机化

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