检索结果-内蒙古大学图书馆

医学与哲学（A） 2017年第5期38卷 5-7页

作者：焦飞谢书阳李有杰阎云飞许森滨州医学院生物化学教研室山东烟台264003

精准医学体现了生物医学与数据科学的深入融合,为医学发展勾勒出美好蓝图。当今时代,计算概念已渗透到生命科学的各个领域,计算主义生命观试图从数据和计算的角度理解生命现象,其观念和方法既具合理性,又有明显的局限性。作为精准医学... 详细信息

精准医学体现了生物医学与数据科学的深入融合,为医学发展勾勒出美好蓝图。当今时代,计算概念已渗透到生命科学的各个领域,计算主义生命观试图从数据和计算的角度理解生命现象,其观念和方法既具合理性,又有明显的局限性。作为精准医学的两个基本要素,数据和计算同样与精准医学密切相关。精准医学的发展现状表明,其认识论层面存在某些逻辑缺陷,方法论层面亦存在一定不足。只有深刻把握医学数据的内在特征,辩证地理解计算主义生命观,才能为包括精准医学在内的医学实践提供科学指导。

关键词：精准医学计算主义算法数据

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精准医学与不确定性

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医学与哲学（A） 2016年第1期37卷 27-29页

作者：焦飞谢书阳李有杰李尊岭阎云飞滨州医学院生物化学教研室山东烟台264003

精准医学有其深刻的思想基础和完备的技术支撑,对医学发展现状的深刻反思是其思想基础,生物技术及信息技术的迅猛发展是其技术支撑。精准医学为人类健康水平的提升勾勒出了美好蓝图,为未来医学的发展指明了方向。不确定性具有一定的客观... 详细信息

精准医学有其深刻的思想基础和完备的技术支撑,对医学发展现状的深刻反思是其思想基础,生物技术及信息技术的迅猛发展是其技术支撑。精准医学为人类健康水平的提升勾勒出了美好蓝图,为未来医学的发展指明了方向。不确定性具有一定的客观性,根植于事物本身,人类实践的具体过程实质是通过消除不确定性而达到相对的确定性。作为一种新型的医学实践模式,精准医学同样体现了确定性与不确定性的辩证统一,是一个有着丰富内涵的复杂概念,需要对其进行认真地思考和谨慎地解读。

关键词：精准医学确定性不确定性复杂性

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Elf-1与survivin在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

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肿瘤防治研究 2009年第4期36卷 306-309页

作者：孔丽君胡金霞杨东霞张菡菡于媛滨州医学院生物化学与分子生物学教研室山东烟台264003 滨州医学院病理学教研室山东烟台264003

目的探讨转录因子Elf-1与凋亡抑制因子survivin在非小细胞肺癌中的表达及它们与临床病理因素之间的关系。方法收集72例非小细胞肺癌组织,应用组织芯片仪制备组织芯片,采用免疫组化PowerVisionTM-9000(PV-9000)法检测Elf-1、survivin的... 详细信息

目的探讨转录因子Elf-1与凋亡抑制因子survivin在非小细胞肺癌中的表达及它们与临床病理因素之间的关系。方法收集72例非小细胞肺癌组织,应用组织芯片仪制备组织芯片,采用免疫组化PowerVisionTM-9000(PV-9000)法检测Elf-1、survivin的表达。结果在72例非小细胞肺癌组织中,Elf-1阳性染色定位于肺癌细胞核及胞质,阳性表达53例(73.61%),其表达强度与非小细胞肺癌的分化程度有关(χ2=14.849,P=0.021)。不同临床分期的非小细胞肺癌组织中Elf-1表达强度差异有统计学意义(χ2=24.127,P=0.000),Elf-1表达强度在淋巴结有转移组显著高于淋巴结无转移组(χ2=18.342,P=0.000);survivin阳性染色定位于肺癌细胞核及胞质,阳性表达44例(61.11%),其表达强度与非小细胞肺癌的分化程度有关(χ2=16.251,P=0.012),不同临床分期的非小细胞肺癌组织中sur-vivin表达强度差异有统计学意义(χ2=20.570,P=0.000),survivin表达强度在淋巴结有转移组显著高于淋巴结无转移组(χ2=8.723,P=0.033);非小细胞肺癌组织中Elf-1与survivin的表达强度呈极显著性正相关(τ=0.255,P<0.05)。结论Elf-1的表达强度与survivin的表达程度密切相关,均与肺癌细胞分化程度、临床分期及淋巴结转移有关,提示两者均可成为评估非小细胞肺癌生物学行为的重要指标。

关键词：非小细胞肺癌膜附着型本体A2 蛋白质阵列分析免疫组织化学

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柔红霉素对人晶体上皮细胞生长抑制和角膜内皮细胞毒性试验研究

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中国实用眼科杂志 2001年第5期19卷 371-373页

作者：王强闫洪禄单长民张晶雷宁玉山东省滨州医学院附属医院眼科 256603 山东青岛市立医院眼科滨州医学院细胞生物学教研室

目的 :研究柔红霉素对体外培养人晶体上皮细胞增殖的抑制作用和对角膜内皮细胞的毒性 ,探索使用柔红霉素预防后发障的适宜浓度。方法 :第三代人晶体上皮细胞接种于 2 4孔培养板内 ,2 4h后加入不同浓度柔红霉素作用 10 min后 ,吸出药物... 详细信息

目的 :研究柔红霉素对体外培养人晶体上皮细胞增殖的抑制作用和对角膜内皮细胞的毒性 ,探索使用柔红霉素预防后发障的适宜浓度。方法 :第三代人晶体上皮细胞接种于 2 4孔培养板内 ,2 4h后加入不同浓度柔红霉素作用 10 min后 ,吸出药物并冲洗后再培养 48h,细胞计数。原代培养人角膜内皮细胞 ,加入不同浓度柔红霉素作用 10 min,观察细胞生长形态学变化。结果 :柔红霉素依浓度梯度抑制晶体上皮细胞增殖 ,其 L D5 0 为 4.9μg/ ml;10 μg/ ml以下浓度对角膜内皮细胞无损害。结论 :柔红霉素有可能作为预防后发障的辅助药物之一。

关键词：柔红霉素晶体上皮细胞角膜内皮细胞细胞毒性生长抑制后发性白内障

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幽门螺杆菌定植因子HpPrtC胶原蛋白酶的异源表达及其功能活性研究

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中国病原生物学杂志 2018年第9期13卷 958-962页

作者：赵慧琳吴玉龙荣倩玉徐正丁雲飞张玉梅乔媛媛李波清季晓飞滨州医学院病原生物学教研室山东烟台264003

目的异源表达幽门螺杆菌HpPrtC胶原蛋白酶,并检测其对胶原蛋白的降解活性。方法根据幽门螺杆菌基因组信息中编号hp0169基因的序列设计引物,PCR扩增HpPrtC基因的核苷酸序列,经NdeI和XhoI酶切后构建原核表达载体pET-22b(+)-HpPrtC,转化至*... 详细信息

目的异源表达幽门螺杆菌HpPrtC胶原蛋白酶,并检测其对胶原蛋白的降解活性。方法根据幽门螺杆菌基因组信息中编号hp0169基因的序列设计引物,PCR扩增HpPrtC基因的核苷酸序列,经NdeI和XhoI酶切后构建原核表达载体pET-22b(+)-HpPrtC,转化至*** BL21(DE3),经IPTG诱导表达后采用亲和层析法纯化重组蛋白,通过检测重组酶处理胶原蛋白后L-亮氨酸的产生量表征其胶原蛋白降解活性。结果 HpPrtC基因编码422个氨基酸,与已知PrtC家族蛋白酶氨基酸序列比对最高相似性<40%。克隆HpPrtC基因连接入表达质粒pET-22b(+),将测序正确的表达质粒pET-22b(+)-HpPrtC转化至感受态细胞BL21(DE3),经IPTG诱导表达相对分子质量约为47×103的可溶性蛋白,与预期相符。经亲和层析纯化后的重组蛋白酶降解热变性I型胶原蛋白(可溶、不可溶)和天然I型胶原蛋白的活性分别为922.2±36.2、1168.8±65.6和674.0±13.4,与幽门螺杆菌培养液中胶原蛋白酶对可溶热变性I型胶原蛋白、不可溶热变性I型胶原蛋白和天然I型胶原蛋白活性分别为205.6±21.5、228.4±19.3和123.2±14.5一致。结论幽门螺杆菌定植因子HpPrtC为胶原蛋白酶。通过大肠埃希菌异源表达的重组HpPrtC蛋白具有胶原蛋白酶解活性,为探索该酶在幽门螺杆菌感染定植中的作用机制奠定了基础。

关键词：幽门螺杆菌胶原蛋白酶异源表达胶原蛋白

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基因敲除质粒载体的构建及其在幽门螺杆菌基因敲除中的应用

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中国病原生物学杂志 2016年第12期11卷 1066-1069,1073页

作者：季晓飞赵慧琳张莹柏雪莲张艳丽荣倩玉李波清滨州医学院病原生物学教研室山东烟台264003

目的构建用于幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)同源重组双交换基因敲除的质粒载体,实现Hp内基因的快速敲除。方法以质粒pLYL03为骨架,重新排列质粒上的基因元件以减少冗余序列,用卡那霉素抗性基因(aphA)替换原质粒上的红霉素抗性基... 详细信息

目的构建用于幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)同源重组双交换基因敲除的质粒载体,实现Hp内基因的快速敲除。方法以质粒pLYL03为骨架,重新排列质粒上的基因元件以减少冗余序列,用卡那霉素抗性基因(aphA)替换原质粒上的红霉素抗性基因作为抗性筛选标记,在抗性筛选标记两端构建多克隆位点用于同源重组同源臂的插入,由此构建用于Hp同源重组双交换基因敲除的质粒载体pSJHK。以质粒pSJHK为载体构建hp0169基因的同源重组双交换敲除质粒pSJHK-0169,通过电击转化方法将敲除质粒pSJHK-0169转入Hp中,用卡那霉素筛选转化子。结果以质粒pLYL03为基础构建用于Hp同源重组双交换基因敲除的质粒载体pSJHK,大小4 371bp。以基因hp0169作为目标基因构建同源重组双交换敲除质粒pSJHK-0169,经电击转化Hp中,获得卡那霉素抗性阳性转化子,测序确证基因敲除成功。结论构建的基因敲除质粒载体pSJHK实现了对Hp中目标基因的敲除,为Hp新基因功能研究和致病因子的发掘提供了有效的基因操作工具。

关键词：幽门螺杆菌基因敲除质粒同源重组

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幽门螺杆菌在两种液体培养基中生长规律的探讨

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中国病原生物学杂志 2017年第8期12卷 738-740页

作者：荣倩玉李娇娇季晓飞张莹耿丽李波清滨州医学院病原生物学教研室山东烟台264003

目的分别用血清脑心浸液和β-环糊精脑心浸液两种培养基培养幽门螺杆菌,观察幽门螺杆菌在两种培养基中的生长规律。方法将幽门螺杆菌分别接种于血清脑心浸液和β-环糊精脑心浸液中,置37℃微需氧环境以120r/min震摇培养,于不同时间点以... 详细信息

目的分别用血清脑心浸液和β-环糊精脑心浸液两种培养基培养幽门螺杆菌,观察幽门螺杆菌在两种培养基中的生长规律。方法将幽门螺杆菌分别接种于血清脑心浸液和β-环糊精脑心浸液中,置37℃微需氧环境以120r/min震摇培养,于不同时间点以稀释平板计数法计数活菌数量,制作生长曲线。结果幽门螺杆菌在血清脑心浸液和β-环糊精脑心浸液中的迟缓期均为10h,对数期分别为45h和40h,对数中期时比生长速率分别为0.058/h和0.043/h,稳定期分别为15h和20h,最高浓度分别为2.067×10~8 CFU/ml和1.378×10~8 CFU/ml。结论幽门螺杆菌在血清脑心浸液和β-环糊精脑心浸液中均生长良好,其中在血清脑心浸液中最高生长密度更大,对数期维持时间较长。

关键词：幽门螺杆菌 β-环糊精血清脑心浸液

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橡胶树产量性状相关基因连锁标记的初步研究

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热带农业科学 2006年第3期26卷 1-4页

作者：姚庆收滨州医学院生物技术教研室山东滨州256603

以干胶产量为依据,分别选取RRIM600×PR107(HG1)、热研88-13×热研217(HG2)、热研88-13×IAN873(HG3)三个组合不同产量等级的杂交后代,以及9个不同亲本的高产品种为材料,用BSA法和RAPD技术对巴西橡胶树[Heveabrasiliensis(*... 详细信息

以干胶产量为依据,分别选取RRIM600×PR107(HG1)、热研88-13×热研217(HG2)、热研88-13×IAN873(HG3)三个组合不同产量等级的杂交后代,以及9个不同亲本的高产品种为材料,用BSA法和RAPD技术对巴西橡胶树[Heveabrasiliensis(***)Mueller-Argoviensis]产量性状相关基因的连锁标记进行了初步研究。经过引物筛选和单株验证,初步断定S8、S309,AI17和AG19分别是HG1、HG2、HG3的F1代的产量性状相关基因连锁标记引物,但尚未找到与参试的3个亲本组合F1代共同的产量性状相关基因。

关键词：巴西橡胶树 BSA RAPD 干胶产量连锁标记

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幽门螺杆菌hp0788基因对GES-1细胞功能影响的初步研究

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中国病原生物学杂志 2017年第7期12卷 614-618页

作者：李娇娇荣倩玉季晓飞张莹赵慧琳周秀芝李波清滨州医学院病原生物学教研室山东烟台264003

目的构建幽门螺杆菌ATCC26695hp0788基因敲除突变菌株(ATCC26695△0788km),观察hp0788基因对GES-1细胞功能的影响。方法以基因敲除质粒载体pSJHK构建基因敲除质粒,在hp0788基因的上下游分别扩增800~1100bp的基因片段作为同源臂,经限制... 详细信息

目的构建幽门螺杆菌ATCC26695hp0788基因敲除突变菌株(ATCC26695△0788km),观察hp0788基因对GES-1细胞功能的影响。方法以基因敲除质粒载体pSJHK构建基因敲除质粒,在hp0788基因的上下游分别扩增800~1100bp的基因片段作为同源臂,经限制性内切酶酶切后与质粒载体连接构建基因敲除质粒pSJHK-0788,通过电击转化构建hp0788基因敲除突变菌株,以FITC标记法检测其对GES-1细胞黏附能力的影响;以感染复数(MOI)为200:1构建幽门螺杆菌与GES-1细胞共培养体系,比较ATCC26695和ATCC26695△0788km对GES-1细胞凋亡及活性的影响。结果构建了hp0788基因双交换敲除质粒,电击转化获得hp0788基因敲除突变菌株。FITC标记ATCC26695和幽门螺杆菌ATCC26695△0788km与GES-1细胞混匀后采用流式细胞术检测FITC的荧光强度,ATCC26695组的黏附率记为100%,ATCC26695△0788km组黏附率为90.40%,差异均有统计学意义(t=2.80,P<0.05);ATCC26695与ATCC26695△0788km分别与GES-1细胞共培养8h和16h,流式细胞术检测细胞凋亡率分别为(15.73±7.84)%、(25.26±5.81)%和(12.46±12.30)%、(21.13±10.09)%,细胞增殖-毒性检测试剂盒检测细胞活力分别为53%、40%和66%、50%,差异均有统计学意义(t值分别为3.30,2.80,-2.93,-2.76,P<0.05)。结论hp0788基因敲除幽门螺杆菌ATCC26695对GES-1细胞的黏附率下降,并使GES-1凋亡率下降,而细胞活力增高。表明hp0788基因是影响幽门螺杆菌ATCC26695感染GES-1细胞后引起细胞凋亡和活性变化的重要基因。

关键词：幽门螺杆菌基因敲除黏附细胞凋亡细胞活力

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分子伴侣幽门螺杆菌Hsp60与UreB的相互作用分析

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中国病原生物学杂志 2016年第11期11卷 977-981页

作者：赵慧琳季晓飞张艳丽柏雪莲李娇娇陈醒醒张玉梅李波清滨州医学院病原生物学教研室山东烟台264003

目的检测并分析幽门螺杆菌(Hp)尿素酶β亚基(UreB)与Hsp60之间的相互作用。方法克隆Hp 26695的尿素酶β亚基基因(UreB)融合GST标签和Hsp60基因融合His标签,分别在大肠埃希菌中进行异源表达。提取两种蛋白,采用pull-down方法检测两者间... 详细信息

目的检测并分析幽门螺杆菌(Hp)尿素酶β亚基(UreB)与Hsp60之间的相互作用。方法克隆Hp 26695的尿素酶β亚基基因(UreB)融合GST标签和Hsp60基因融合His标签,分别在大肠埃希菌中进行异源表达。提取两种蛋白,采用pull-down方法检测两者间的相互作用。利用Modeller 9v2软件,以***的GroEL为基础模建Hp Hsp60的三维结构,再与已知的UreB结构利用AutoDock 4.2软件进行分子共模拟,分析二者的相互作用面和关键氨基酸。结果构建了Hp Hsp60和尿素酶β亚基(UreB)的大肠埃希菌异源表达体系并获得纯化蛋白;Pull-down试验显示部分未融合GST标签的Hsp60出现在GST-UreB的洗脱液中,表明Hsp60与GST-UreB之间存在相互作用;以***的GroEL为基础模建了Hp Hsp60的三维结构,利用docking技术构建UreB与Hp Hsp60的相互作用模型,发现其主要的相互作用面位于Hsp60的α9与UreB的α2之间,其可能形成氢键的关键位点为UreB的α2上的T147氨基酸与Hsp60的α9上的E237、K238。结论 Hp Hsp60能直接与尿素酶β亚基(UreB)相互作用,Hsp60可能通过这种相互作用在UreB成熟过程中发挥分子伴侣功能。这为阐明Hp尿素酶的组装与成熟机制奠定了基础。

关键词：幽门螺杆菌尿素酶 Hsp60 分子伴侣相互作用

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