检索结果-内蒙古大学图书馆

中华疾病控制杂志 2024年第6期28卷 664-671页

作者：张文婧徐雅琪黄一铭王凤琳王爱民王清华石福艳潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室潍坊261053

目的基于基因组学数据,探索缺血性脑卒中免疫相关分子标志物,为缺血性脑卒中的预防和临床治疗提供理论依据。方法选取基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中GSE16561和GSE58294两个数据,对缺血性脑卒中相关免疫分子标志物... 详细信息

目的基于基因组学数据,探索缺血性脑卒中免疫相关分子标志物,为缺血性脑卒中的预防和临床治疗提供理论依据。方法选取基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中GSE16561和GSE58294两个数据,对缺血性脑卒中相关免疫分子标志物进行分析和探索。基于免疫学数据库和分析网站(the immunology database and analysis portal,ImmPort)数据库,获取免疫相关的基因,分析其在缺血性脑卒中组和正常对照组中的差异表达,鉴定差异表达免疫基因(differentially expressed immune genes,DEIGs),并利用蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI)鉴定免疫相关的关键基因。基于DEIGs进行通路富集分析,发现缺血性脑卒中可能富集的分子信号通路。最后,基于CIBERSORT算法评估22种免疫细胞的浸润丰度,并计算其在缺血性脑卒中组和正常对照组中的差异,以此推断缺血性脑卒中相关的免疫细胞。结果差异分析结果表明37个DEIGs在两组间差异均有统计学意义(均P<0.05),包含缺血性脑卒中样本上调基因31个,下调基因6个。通路分析结果表明鉴定的DEIGs主要富集于免疫相关分子通路上。PPI的分析结果显示,TLR4、TLR2、MMP-9、CCR7、STAT3、TNFSF13B、S100A12、CD19、CAMP和SLC11A1是缺血性脑卒中密切相关的关键免疫基因。CIBERSORT结果表明,与正常对照样本相比较,缺血性脑卒中样本免疫回应细胞的富集水平较低(均P<0.05),而免疫抑制细胞的水平较高(均P<0.05)。结论研究基于转录组表达数据鉴定了缺血性脑卒中相关的免疫基因、免疫信号通路和免疫细胞,从3个分子水平上揭示了与缺血性脑卒中相关的免疫分子标志物,对缺血性脑卒中的有效防控和治疗策略的制定具有重要意义。

关键词：缺血性脑卒中免疫基因信号通路免疫细胞分子标志物组学数据

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基于倾向指数匹配法的肝癌病人疗效评价

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南方医科大学学报 2012年第9期32卷 1234-1237页

作者：王素珍孟维静安洪庆赵晓蒙吕军城石福艳潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的根据临床观测所得数据,采用倾向指数匹配法均衡介入治疗(TACE)和介入联合射频消融术治疗(TACE+RFA)两组之间的混杂因素,评价肝癌病人的疗效。方法以分组变量为因变量,以协变量为自变量建立Logistic回归模型并计算肝癌病人的倾向指数... 详细信息

目的根据临床观测所得数据,采用倾向指数匹配法均衡介入治疗(TACE)和介入联合射频消融术治疗(TACE+RFA)两组之间的混杂因素,评价肝癌病人的疗效。方法以分组变量为因变量,以协变量为自变量建立Logistic回归模型并计算肝癌病人的倾向指数,用倾向指数卡钳匹配法均衡组间的协变量,对匹配后的数据进行生存分析。结果匹配前两组间不均衡的协变量在匹配以后达到了均衡。匹配之前,TACE组和TACE+RFA组的1年生存率分别为52.07%、59.08%,2年生存率分别为32.24%、36.43%,3年生存率分别为16.54%、19.39%;两组中位生存期分别为1.20和1.40年;Logrank检验结果表明两组生存曲线间无统计学差异(P>0.05);匹配之后,TACE组和TACE+RFA组的1年生存率分别为54.39%、62.28%,2年生存率分别为23.15%、40.08%,3年生存率分别为10.20%、18.52%,两组中位生存时间分别为1.10和1.50年;Logrank检验结果表明两组生存曲线之间差别有统计学意义(P=0.0033),说明联合治疗组的生存率高于TACE组。结论采用倾向指数匹配法能有效降低混杂偏倚,对肝癌病人的治疗效果做出正确评价。

关键词：倾向指数匹配法肝癌生存分析

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基于年龄-时期-队列模型的中国男性人群食管癌发病与死亡趋势分析

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郑州大学学报（医学版） 2021年第2期56卷 164-169页

作者：乔晓伟朱高培王喆邹广顺王素珍潘庆忠潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的:探讨我国男性人群食管癌发病及死亡随年龄、时期、出生队列三因素的变化趋势。方法:采用年龄-时期-队列模型(APC模型)和IE算法计算食管癌发病率及死亡率的年龄效应、时期效应和出生队列效应。结果:1990~2017年中国男性食管癌标化... 详细信息

目的:探讨我国男性人群食管癌发病及死亡随年龄、时期、出生队列三因素的变化趋势。方法:采用年龄-时期-队列模型(APC模型)和IE算法计算食管癌发病率及死亡率的年龄效应、时期效应和出生队列效应。结果:1990~2017年中国男性食管癌标化发病率[(25.99~17.4)/10万]与标化死亡率[(27.53~16.84)/10万]均呈下降趋势。APC模型分析结果显示,在所有年龄段中,年龄效应都随着年龄增长而增加[系数:-2.977304~1.966794(发病);-3.045193~2.202024(死亡)],队列效应总体上有所降低[0.99至-1.75(发病);1.08至-1.94(死亡)],未发现明显的时期效应。结论:中国男性人群食管癌发病与死亡风险受年龄与出生队列影响较大,改善饮食结构、做好早癌筛查有助于降低食管癌的发病与死亡风险。

关键词：食管癌年龄-时期-队列模型趋势分析

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不同MMSE评分下阿尔兹海默病发病风险因素的贝叶斯分位数回归联合模型分析

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吉林大学学报（医学版） 2023年第2期49卷 395-401页

作者：王廉源杨毅丛慧文王浩桦包绮晗李承圣周立雯丁子琛李艳丽石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院图书馆山东潍坊261053

目的:探讨校正简易精神状态检查(MMSE)评分轨迹后的阿尔兹海默病(AD)发病风险影响因素,阐明不同MMSE评分人群AD发病的风险因素。方法:基于AD神经成像计划数据库收集2005—2016年的随访数据,经筛选后最终纳入425名随访者的随访数据,采用L... 详细信息

目的:探讨校正简易精神状态检查(MMSE)评分轨迹后的阿尔兹海默病(AD)发病风险影响因素,阐明不同MMSE评分人群AD发病的风险因素。方法:基于AD神经成像计划数据库收集2005—2016年的随访数据,经筛选后最终纳入425名随访者的随访数据,采用LASSO方法对变量进行筛选;采用贝叶斯分位数回归模型分析MMSE评分在不同分位数上的影响因素,采用Cox模型和贝叶斯分位数回归联合模型方法分析影响AD发病的主要风险因素。结果:经筛选后,纳入的变量包括白蛋白、总胆固醇和血糖浓度等10个变量。贝叶斯分位数回归联合模型的纵向子模型分析,在MMSE评分的不同分位数处,影响MMSE评分轨迹变化的因素相同,均为白蛋白、血糖浓度、年龄、性别、载脂蛋白E4 (APOE4)基因、种族和教育评分。联合模型的Cox回归子模型分析,种族和APOE4基因在所有分位数上均对AD发病有影响,其中APOE4基因在4个分位数上的风险比分别为2.188 (95%CI:1.775,2.620)、1.751 (95%CI:1.422,2.042)、1.706 (95%CI:1.391,2.102)和2.056 (95%CI:1.439,3.206)。总胆固醇水平和家族史仅在部分分位数上对AD发病有影响。结论:不同MMSE评分分布的人群,AD发病的风险因素不同,影响程度也有差异。有APOE4基因和白种人在不同分位数上均是AD发病的风险因素,总胆固醇水平和家族史仅在部分分位数上是AD发病的风险因素。

关键词：贝叶斯分位数回归联合模型分位数回归模型 Cox模型阿尔兹海默病简易精神状态检查量表风险因素

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基于孟德尔随机化法的BMI与2型糖尿病因果关系研究

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郑州大学学报（医学版） 2022年第5期57卷 645-649页

作者：包绮晗李承圣王浩桦丁子琛周立雯丛慧文王廉源杨毅石福艳潘庆忠王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学系山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的:采用孟德尔随机化法,以单核苷酸多态性(SNP)为工具变量,探究BMI与2型糖尿病(T2DM)的因果关系。方法:从IEU OpenGWAS project网站获得近3 a、样本量最大的BMI(ieu-b-40)及T2DM(ebi-a-GCST006867)的GWAS数据。从ieu-b-40中筛选与BMI高度相关的SNP(以P<5×10^(-8)为筛选条件,连锁不平衡系数r^(2)为0.001,连锁不平衡区域宽度为10000 kb)。从ebi-a-GCST006867中提取BMI有关的SNP(最小r^(2)>0.8,缺失的SNP用与其具有高度连锁性的SNP代替,删除无替代位点的SNP)。汇总上述两个数据集,剔除与T2DM直接相关的SNP,最终纳入包括rs8047395、rs13021737、rs663128等451个SNP作为工具变量。采用MR-Egger回归、加权中位数法(WME)、随机效应逆方差加权法(IVW)、加权模型4种回归模型分析BMI与T2DM的因果关系。结果:GWAS数据均来源于欧洲人群,男女不限。MR-Egger回归截距项为0.0003(P=0.8261),即筛选出的SNP不存在基因多效性。MR-Egger回归、WME、IVW、加权模型的OR(95%CI)分别为2.906(2.347~3.598)、2.938(2.676~3.226)、2.842(2.619~3.085)、2.980(2.440~3.638);由于存在异质性(Q=1289.365,P<0.001),故关注随机效应IVW的结果。结论:BMI是T2DM的危险因素。

关键词： BMI 2型糖尿病孟德尔随机化

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基于随机森林算法的胰腺癌术后预测模型构建

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吉林大学学报（医学版） 2022年第2期48卷 426-435页

作者：李承圣包绮晗郝晓燕潘庆忠王素珍石福艳潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院护理学院内外科教研室山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的:通过随机森林算法构建胰腺癌患者术后5年生存情况预测模型,为胰腺癌患者术后预后评估提供指导。方法:利用美国国立癌症研究所监测、流行病学和结果数据库(SEER)收集符合本研究要求的42618条胰腺癌患者及其预后数据,经过数据筛选最... 详细信息

目的:通过随机森林算法构建胰腺癌患者术后5年生存情况预测模型,为胰腺癌患者术后预后评估提供指导。方法:利用美国国立癌症研究所监测、流行病学和结果数据库(SEER)收集符合本研究要求的42618条胰腺癌患者及其预后数据,经过数据筛选最终纳入4020条患者信息。将研究对象随机分为训练集和测试集,采用χ2检验、多因素Logistic回归分析和随机森林变量重要性排名进行特征变量选择;利用合成少数样本过采样技术(SMOTE)将训练集调整为平衡数据集;基于平衡后数据集利用随机森林算法构建预测模型;利用测试集,基于G-mean指数、灵敏度、特异度和受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)4个评价指标,分别与Logistic回归分析、支持向量机、决策树和人工神经网络算法进行比较,对预测模型做出评价。结果:原始训练集中包含2814个样本,其中生存时间≥5年的患者有196例,占比约1/13,是不平衡数据集,经过SMOTE方法调整后获得平衡数据集,二分类样本数量基本达到平衡。最终纳入模型的变量有年龄、种族、肿瘤原发部位、肿瘤分化程度、是否放疗、T分期、N分期、婚姻状况、肿瘤大小和淋巴结阳性比率。基于随机森林算法构建的胰腺癌患者术后预测模型G-mean指数为0.830,AUC为0.833[P<0.05,95%置信区间(CI)(0.784,0.876)],优于Logistic回归分析、支持向量机、决策树和人工神经网络。结论:基于随机森林算法构建的胰腺癌术后预测模型对胰腺癌患者术后5年生存情况的预测性能优于其他常见机器学习方法,能够为临床医生改善胰腺癌患者的预后和生存状况提供依据。

关键词：胰腺肿瘤随机森林算法预测模型预后模型比较

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基于竞争风险模型的早发性结直肠癌患者预后影响因素分析

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中国医科大学学报 2023年第3期52卷 199-205页

作者：王廉源杨毅丛慧文石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的探讨竞争风险时早发性结直肠癌患者的预后影响因素。方法选取美国SEER数据库中2011年至2015年早发性结直肠癌患者4 226例。在考虑竞争风险的前提下,分别采用Gray检验和Fine-Gray模型进行单因素及多因素分析。结果 Gray检验结果显... 详细信息

目的探讨竞争风险时早发性结直肠癌患者的预后影响因素。方法选取美国SEER数据库中2011年至2015年早发性结直肠癌患者4 226例。在考虑竞争风险的前提下,分别采用Gray检验和Fine-Gray模型进行单因素及多因素分析。结果 Gray检验结果显示,婚姻状况、参保情况、发病位置、肿瘤大小、组织学分级、T分期、N分期和M分期对早发性结直肠癌患者的预后有影响(均P <0.001),种族对早发性结直肠癌患者的预后也有影响(均P=0.001)。多因素竞争风险模型结果显示,组织学分级、婚姻状况、参保情况、T分期、N分期和M分期是影响早发性结直肠癌患者预后的重要因素。结论竞争风险模型下,未参保,组织学分级越高,T分期、N分期和M分期高的早发性结直肠癌患者的预后更差。

关键词：竞争风险模型早发性结直肠癌危险因素列线图

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ARIMA乘积季节模型在山东省肺结核发病预测中的应用

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山东大学学报（医学版） 2021年第7期59卷 112-118页

作者：田庆刘永鹏张晶晶刘洪庆潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的根据山东省肺结核的季节性、趋势性建立求和自回归移动平均(ARIMA)乘积季节模型,预测山东省肺结核发病趋势,调整防控措施。方法应用R软件对2010年1月至2019年12月山东省肺结核传染病疫情月度数据建立最优模型,预测2020年1月至10月... 详细信息

目的根据山东省肺结核的季节性、趋势性建立求和自回归移动平均(ARIMA)乘积季节模型,预测山东省肺结核发病趋势,调整防控措施。方法应用R软件对2010年1月至2019年12月山东省肺结核传染病疫情月度数据建立最优模型,预测2020年1月至10月肺结核发病数,并与实际值进行比较,以此评估模型的预测效果,预测2020年11月至2021年12月的发病趋势。结果山东省肺结核发病数表现为年度周期性,最优模型为ARIMA(3,1,0)(0,1,1)12,2010年1月至2019年12月拟合结果准确性显示平均绝对百分比误差仅为5.50%, 2020年1月至10月模型预测效果的平均相对百分比误差为21.69%,2020年11月至2021年12月的发病数较同期有轻微变化。结论 ARIMA乘积季节模型能够较好地对山东省肺结核发病趋势进行拟合及预测。

关键词：肺结核时间序列 ARIMA模型季节性预测

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乙型肝炎病毒相关肝细胞癌关键基因筛选及其与预后关系的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2023年第5期49卷 1243-1252页

作者：徐雅琪王艳玉张文婧韩梅穆华夏杨希卜伟晓陶子琨孔雨佳石福艳王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的:采用生物信息学方法识别与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)的早期诊断和不良预后相关的关键基因,阐明HBV-HCC发生发展的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索“hepatitis Binduced HCC”,下载基因数据集GSE1212... 详细信息

目的:采用生物信息学方法识别与乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)的早期诊断和不良预后相关的关键基因,阐明HBV-HCC发生发展的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索“hepatitis Binduced HCC”,下载基因数据集GSE121248,通过R软件中的“limma”数据包筛选差异表达基因(DEGs),采用“clusterProfiler”数据包对DEGs进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用STRING数据库和Cytoscape软件建立蛋白-蛋白互作(PPI)网络并筛选关键基因。采用基因表达水平值的交互式分析(GEPIA)、Kaplan Meier-Plotter和人类蛋白质图谱(HPA)数据库验证关键基因及其蛋白质表达水平,采用“CIBERSORT”数据包分析免疫细胞的浸润情况。结果:共筛选出574个DEGs,其中上调基因173个,下调基因401个。GO功能富集分析,DEGs主要富集于小分子代谢、信号转导、免疫应答和炎症反应等生物学过程;KEGG通路富集分析,DEGs主要富集于视黄醇代谢、细胞色素P450对外源药物代谢通路和化学致癌作用等。筛选PPI网络中的细胞分裂周期20(CDC20)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白A2(CCNA2)、纺锤体检测点蛋白(BUB1B)、拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)、Discs大同源相关蛋白5(DLGAP5)、异常纺锤体样小头畸形相关蛋白(ASPM)、中心体蛋白55(CEP55)、驱动蛋白超家族11(KIF11)和驱动蛋白超家族20A(KIF20A)为HBV-HCC的关键基因。GEPIA数据库分析,上述10种关键基因在HCC患者中均呈高表达。Kaplan-Meier生存曲线分析,关键基因高表达的HCC患者总生存期短于低表达患者。结论:细胞周期与病毒致癌作用相关基因(CDC20、CDK1、CCNA2和BUB1B)与HBV-HCC患者的发生发展及不良预后有密切关联,可能成为诊断标志物和治疗新靶点。

关键词：肝细胞肿瘤乙型肝炎病毒生物信息学免疫浸润预后

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基于逆概率加权法的早期三阴性乳腺癌不同治疗方案的疗效评价

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山东大学学报（医学版） 2021年第8期59卷 113-118页

作者：王喆刘玉洁毛倩管佩霞包绮晗李承圣乔晓伟潘庆忠王素珍潍坊医学院公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生学院数学教研室山东潍坊261053

目的基于逆概率加权法(IPTW)评价保乳术联合术后放疗和乳房切除术治疗早期三阴性乳腺癌患者的疗效。方法基于美国SEER数据库,收集2010至2015年诊断为T1-2N0M0期三阴性乳腺癌患者相关资料,通过广义提升模型(GBM)估计倾向指数计算逆概率权... 详细信息

目的基于逆概率加权法(IPTW)评价保乳术联合术后放疗和乳房切除术治疗早期三阴性乳腺癌患者的疗效。方法基于美国SEER数据库,收集2010至2015年诊断为T1-2N0M0期三阴性乳腺癌患者相关资料,通过广义提升模型(GBM)估计倾向指数计算逆概率权重,加权均衡组间协变量后分析两种局部治疗方式对早期三阴性乳腺癌患者生存率的影响。结果 IPTW后,组间协变量达到完全均衡,log-rank检验结果表明,保乳术联合术后放疗组的总生存率(OS)高于乳房切除术组(P<0.001);多因素Cox回归分析结果显示,保乳术联合术后放疗组与乳房切除术组相比预后更好(HR=0.74,95%CI=0.65~0.84,P<0.001)。结论对T1-2N0M0期三阴性乳腺癌患者,保乳术联合术后放疗的疗效优于乳房切除术。

关键词： T1-2N0M0期三阴性乳腺癌逆概率加权法保乳术联合术后放疗乳房切除术疗效评价

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