目的探讨癌症分型中的多组学整合与可视化(multi-omics integration and visualization in cancer subtyping,MOVICS)集成聚类方法在低级别胶质瘤(lower-grade gliomas,LGG)多组学数据整合分型中的应用,识别LGG高危患者,筛选出潜在的生...
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目的探讨癌症分型中的多组学整合与可视化(multi-omics integration and visualization in cancer subtyping,MOVICS)集成聚类方法在低级别胶质瘤(lower-grade gliomas,LGG)多组学数据整合分型中的应用,识别LGG高危患者,筛选出潜在的生物标志物和重要通路。方法采用MOVICS方法集成LGG多组学数据的10种整合方法的分型结果,得到LGG的稳健分子分型,进一步采用Cox回归研究不同分型患者的死亡风险;针对不同分型,筛选差异表达的mRNA(DEmRNAs),miRNA(DEmiRNAs)以及差异甲基化基因(differential methylation genes,DMGs),对三者进行联合分析得到重合基因,利用GO和KEGG分析得到重合基因富集通路,进一步分析核心基因的表达水平对生存率的影响,最后对不同分型患者进行通路活性分析。结果LGG患者分为三型,其中,分型3患者的死亡风险是分型1的2.794倍;筛选出1569个DEmRNAs,140个DEmiRNAs以及337个DMGs,119个重合基因富集到有统计学差异的26条GO生物功能项和7条KEGG通路;生存分析表明DNAJB14和MTUS1可能与患者生存结局相关。通路活性分析结果显示Androgen、EGFR、Trail和VEGF通路的活性在不同分型间差异有统计学意义。结论MOVICS聚类集成方法能够有效地对LGG患者进行分型,识别预后高风险患者,筛选出潜在生物标志物以及重要通路,为LGG患者个体化治疗策略的制定提供理论依据。
目的探讨苯并[a]芘(benzo[a]pyrene,B[a]P)宫内暴露与胚胎停育的关联,以及辅助性T细胞1/辅助性T细胞2(helper T cell 1/helper T cell 2,Th1/Th2)平衡偏移的中介效应。方法选取胚胎停育患者与正常妊娠但自愿人工流产的女性作为研究对象(...
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目的探讨苯并[a]芘(benzo[a]pyrene,B[a]P)宫内暴露与胚胎停育的关联,以及辅助性T细胞1/辅助性T细胞2(helper T cell 1/helper T cell 2,Th1/Th2)平衡偏移的中介效应。方法选取胚胎停育患者与正常妊娠但自愿人工流产的女性作为研究对象(245名)。检测研究对象绒毛组织中7,8-二羟-9,10-环氧苯并[a]芘(7,8-dihydroxy-9,10-epoxy-benzo[a]pyrene,BPDE)-DNA加合物与白细胞介素(interleukin,IL)-2、干扰素-γ(interferon-γ,IFN-γ)、IL-4、IL-10水平。采用logistic回归分析模型分析B[a]P暴露与胚胎停育的关联,运用Bootstrap法分析Th1/Th2平衡偏移的中介效应。结果调整协变量后,BPDE-DNA加合物的中高暴露、高暴露水平发生胚胎停育的风险分别是低暴露水平的5.66倍(aOR=5.66,95%CI:2.00~16.01,P<0.001)、5.63倍(aOR=5.63,95%CI:1.97~16.14,P<0.001);中介分析结果显示,B[a]P对胚胎停育的总效应为1.220(0.501~1.939),Th1/Th2平衡偏移介导的中介效应为0.328(0.078~0.716),中介比例占26.89%。结论B[a]P暴露是胚胎停育的危险因素,且Th1/Th2失衡发生Th1型偏移是B[a]P暴露致胚胎停育的中介变量。
目的系统评价膳食炎症指数(dietary inflammatory index,DII)与中老年人认知障碍发生风险的关系。方法检索中国知网、万方、维普、生物医学文献、PubMed、Science Direct、Springer、Cochrane Library、Embase等数据库从建库至2022年6月20日发表的关于DII与中老年人认知障碍的文献,按照纳入、排除标准严格筛选。采用纽卡斯尔-渥太华(Newcastle-Ottawa scale,NOS)量表及美国卫生保健质量和研究机构(Agency for Healthcare Research and Quality,AHRQ)推荐的横断面研究质量评价量表评估筛选后的文献质量,采用Revman 5.4软件和Stata 15.1软件进行Meta分析,随机效应模型汇总OR值和95%CI。结果共纳入7项研究,包含15428名参与者。Meta分析显示,与最低位数DII相比,最高位数DII与中老年人认知障碍风险增加相关(OR=1.62,95%CI:1.27~2.05,P<0.01),尤其是在使用FFQ调查膳食数据(OR=1.46,95%CI:1.21~1.77,P=0.17)及计算能量调整后的DII的研究(OR=1.71,95%CI:1.26~2.33,P=0.07)中。结论与抗炎饮食相比,高促炎饮食可能与中老年人认知障碍的风险增加有关,受纳入研究数量和质量的限制,未来仍需更多高质量研究予以验证。
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