检索结果-内蒙古大学图书馆

现代预防医学 2025年第2期52卷 362-368页

作者：董涛何航帜胡晓娟原一玮靳婕赵卉张岩波山西医科大学医学科学院山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室山西医科大学管理学院医学信息技术教研室山西医科大学第二医院呼吸与危重症医学科山西医科大学

目的研究不同共病模式下慢性阻塞性肺疾病急性加重(AECOPD)患者健康相关生命质量(HRQoL)变化的风险因素。方法纳入2021年9月—2023年9月山西省五所医院的AECOPD患者214例。结合圣乔治呼吸问卷(SGRQ)与其最小临床重要差异(MCID)评估患... 详细信息

目的研究不同共病模式下慢性阻塞性肺疾病急性加重(AECOPD)患者健康相关生命质量(HRQoL)变化的风险因素。方法纳入2021年9月—2023年9月山西省五所医院的AECOPD患者214例。结合圣乔治呼吸问卷(SGRQ)与其最小临床重要差异(MCID)评估患者的HRQoL。从共病(参考ICD-10编码)切入，基于潜在类别分析(LCA)进行共病模式分层，进而采用有序logistic回归分析不同共病模式下患者出院3个月SGRQ评分变化的风险因素。结果 LCA将患者分为“心血管疾病组”和“肺心病低负荷组”。有序logistic回归结果显示出院3个月心血管疾病组BMI偏高(OR=2.96,95%CI:1.09～8.34,P=0.035)和直接胆红素偏高(OR=2.96,95%CI:1.07～8.35,P=0.037)患者具有临床意义的SGRQ评分升高的可能性均是两指标正常患者的2.96倍；肺心病低负荷组直接胆红素偏高(OR=3.25,95%CI:1.35～7.97,P=0.009)和氧饱和度偏低(OR=2.35,95%CI:1.05～5.55,P=0.043)患者具有临床意义的SGRQ评分升高的可能性分别是两指标正常患者的3.25倍和2.35倍。结论不同共病模式的AECOPD患者预后风险因素不同，且无论共病模式如何，直接胆红素偏高都是AECOPD患者HRQoL变化的独立危险因素。此外还应密切关注合并心血管疾病的AECOPD患者出现BMI异常变化。

关键词：共病模式慢性阻塞性肺病急性加重健康相关生命质量最小临床重要差异潜在类别分析有序logistic回归

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反事实解释框架在慢性阻塞性肺疾病急性加重患者治疗效果预判模型中的应用

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中华疾病控制杂志 2025年第4期 461-467+480页

作者：原一玮何航帜胡晓娟董涛靳婕赵卉张岩波山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室山西医科大学管理学院医学信息技术教研室山西医科大学第二医院呼吸与危重症医学科

目的针对慢性阻塞性肺疾病急性加重(acute exacerbation of chronic obstractive pulmonary disease, AECOPD)住院患者，构建结合反事实解释框架的机器学习(machine learning, ML)模型，精准预测患者住院疗效并提供临床决策支持。方法... 详细信息

目的针对慢性阻塞性肺疾病急性加重(acute exacerbation of chronic obstractive pulmonary disease, AECOPD)住院患者，构建结合反事实解释框架的机器学习(machine learning, ML)模型，精准预测患者住院疗效并提供临床决策支持。方法选择2012―2020年因AECOPD于山西医科大学第二医院住院的患者3 046例，以中位住院时长内是否好转出院作为结局变量，构建5种ML预测模型并进行性能对比。最后使用反事实框架解释最优模型并提供干预方案。结果 CatBoost(categorical boosting)模型的综合性能最好，受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线下面积(area under curve, AUC)为0.748、准确率为68.4%、精确率为70.6%、召回率为69.1%、F1值为69.8%、布里尔分数为20.4%,校准曲线接近对角线。通过反事实解释框架直观呈现了患者的结局发生机制，生成的可干预方案可协助医生改善AECOPD患者的住院疗效。结论在仅使用常规电子医疗病历数据的情况下，基于CatBoost的预测模型可实现对AECOPD患者住院疗效的预测，结合反事实解释框架可为医生提供针对AECOPD患者的个性化干预方案，为临床决策提供可靠的依据。

关键词：慢性阻塞性肺疾病急性加重机器学习预测模型模型可解释性反事实解释

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基于语义三元组的尿毒症中药知识发现模型

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山西医科大学学报 2025年第04期 435-444页

作者：邰杨芳安鹏伟华国旻昝彭山西医科大学管理学院医学信息检索教研室

目的提出一种基于科研文献和生物医药数据库进行尿毒症中药知识挖掘的方法并对结果进行初步验证，为揭示尿毒症的生物学机制及中药治疗方法提供思路。方法利用SemRep抽取工具从尿毒症研究文献的摘要文本中提出尿毒症的疾病-关系-基因... 详细信息

目的提出一种基于科研文献和生物医药数据库进行尿毒症中药知识挖掘的方法并对结果进行初步验证，为揭示尿毒症的生物学机制及中药治疗方法提供思路。方法利用SemRep抽取工具从尿毒症研究文献的摘要文本中提出尿毒症的疾病-关系-基因三元组，获取尿毒症潜在基因。基于String数据库对潜在基因进行蛋白质互作网络分析得到尿毒症的核心基因。对核心基因进行GO分析和通路分析，揭示尿毒症的生物分子机制。从Coremine Medical中药数据库筛选出对核心基因具有调节作用的中药，建立中药共现网络并进行聚类，提取每个类团的核心中药组分。结果从25 439篇文献中共提取出尿毒症潜在基因137个，经蛋白质互作网络分析得到15个核心基因：IL-6、IL-1B、CRP、IL-10、TGFB1、IGF-1、LEP、CXCL8、AGT、CCL2、TLR4、FGF2、IL-2、ACE和SERPINE1。核心基因参与的生物过程包括单核细胞增殖等，其分子功能涉及受体-配体活性等，细胞组分主要包括血小板α颗粒管腔等，并显著富集于AGE-RAGE和IL-17等通路。尿毒症的潜在中药可划分为4个类团，分别对糖尿病肾病、慢性肾衰竭、肾病综合征、慢性肾疾病具有药物功效，以人参、膜荚黄芪、姜皮、鱼脑石为代表的中药分别是4类疾病对应的核心药物。结论本文构建的药物知识发现路径从大规模的文献数据可对疾病基因、发生、发展机制等多方面知识进行有效挖掘，挖掘出的知识在文献层面得到验证。

关键词： SPO 知识发现尿毒症知识抽取中药预测社会网络分析

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基于生物信息学分析筛选原发性干燥综合征的特征基因

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中华疾病控制杂志 2023年第10期27卷 1193-1203页

作者：孔腾程灵婧孙翔飞郑超越冯爽邰杨芳吴胜男贺培凤于琦山西医科大学管理学院图书情报专业太原030001 山西医科大学人文社会科学学院人文医学专业太原030001 山西医科大学管理学院医学信息检索教研室太原030001 山西医科大学管理学院医学信息技术教研室太原030001 山西医科大学管理学院医学信息组织与管理教研室太原030001

目的应用生物信息学方法分析确定原发性干燥综合征(primary Sjögren′s syndrome,pSS)患者和健康对照者的特征基因,在转录组学水平上为pSS的发病机制提供思路和理论依据。方法从基因表达综合(gene expression opmnibus,GEO)数据库... 详细信息

目的应用生物信息学方法分析确定原发性干燥综合征(primary Sjögren′s syndrome,pSS)患者和健康对照者的特征基因,在转录组学水平上为pSS的发病机制提供思路和理论依据。方法从基因表达综合(gene expression opmnibus,GEO)数据库筛选获取pSS患者和健康对照者的芯片数据,数据集GSE84844和GSE66795用于分析获取目标基因,GSE40611用于验证。采用差异分析、加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)。利用生物信息学分析方法得到关键基因。通过最小绝对值收敛和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归获得与pSS发病密切相关的特征基因,受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积用来评估特征基因对pSS的诊断价值。结果与健康对照者相比,pSS患者共筛选出55个差异表达基因;基因本体(gene ontology,GO)富集分析显示差异表达基因主要参与了抗病毒反应、正调控Ⅰ型干扰素的产生、抗病毒先天免疫反应等生物学过程;京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and geno omes,KEGG)信号通路富集分析发现差异表达基因富集在甲型流感、视黄酸诱导基因蛋白(retinoic acid-inducible gene I,RIG-I)样受体信号通路、坏死性凋亡和乙型肝炎等信号通路;WGCNA联合LASSO回归筛选出4个特征基因,分别为DDX60、EPSTI1、IFI27和IFI44,4个特征基因在验证数据集GSE40611中曲面下面积分别为0.807、0.866、0.804和0.892。结论DDX60、EPSTI1、IFI27和IFI44是pSS具有诊断意义的特征基因,能够为更深入地探索原发性干燥综合征的发生发展机制提供理论依据。

关键词：原发性干燥综合征生物信息学分析差异表达基因加权基因共表达网络分析最小绝对值收敛和选择算子

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AECOPD老年患者生理与心理生命质量的交叉滞后因果分析

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山西医科大学学报 2025年第3期56卷 299-310页

作者：胡象文何航帜李莉芳胡晓娟姬祎姗张岩波赵卉山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001 山西医科大学第二医院呼吸与危重症医学科山西医科大学管理学院医学信息技术教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的采用患者报告结局(PRO)分析慢性阻塞性肺疾病急性加重(AECOPD)老年患者生理与心理状况的因果效应,并分层探讨这些因素间的相互影响。方法对2021年9月至2022年12月山西医科大学第二医院和太原市人民医院等5家医院采用随机抽样方法选... 详细信息

目的采用患者报告结局(PRO)分析慢性阻塞性肺疾病急性加重(AECOPD)老年患者生理与心理状况的因果效应,并分层探讨这些因素间的相互影响。方法对2021年9月至2022年12月山西医科大学第二医院和太原市人民医院等5家医院采用随机抽样方法选取就诊的220例AECOPD住院患者,入院时(T_(1))进行基线调查,在出院后3个月时(T_(2))电话随访。用参数与非参数检验分析影响AECOPD老年患者生命质量的社会心理和临床因素并通过交叉滞后模型(CLPM)分析生理和心理状态的相互影响。根据年龄对AECOPD老年患者分层,分为高龄老年组(≥70岁)和低龄老年组(<70岁),并对总人群以及高、低龄老年组患者的生理与心理生命质量进行分层分析。结果在全人群老年患者中生理和心理状态存在相互预测关系,即T_(1)时生理状态可预测T2时心理状态(β=0.570,P<0.001),T_(1)时心理状态可预测T2时生理状态(β=0.129,P=0.026)。影响因素分层分析结果显示,高龄老年组与低龄老年组在性别、婚姻状况、家族史及吸烟情况方面存在差异。全人群和年龄分层分析的数据均表明,全身症状与焦虑和抑郁之间存在显著的相互预测关系。全人群和分层分析表明T_(1)时全身症状能够显著预测T2时抑郁状态(β=0.472,P<0.001),T_(1)时抑郁状态也能显著预测T_(2)时全身症状(β=0.361,P<0.001)。同样地,在全人群老年患者中T_(1)时全身症状能够显著预测T_(2)时焦虑状态(β=0.235,P<0.001),T_(1)时焦虑状态也显著预测T_(2)时全身症状(β=0.143,P<0.001)。全人群老年患者中独立性与焦虑之间存在显著的相互预测关系,T_(1)时独立性状态显著预测T_(2)时焦虑状态(β=0.185,P=0.010),T_(1)时焦虑状态也显著预测T_(2)时独立性状态(β=0.936,P<0.001);该独立性与焦虑间的交叉滞后关系在年龄分层分析中得到一致验证。结论AECOPD老年患者的生理领域和心理领域之间存在双向因果关系,其中高龄患者心理健康对独立性的影响更为显著,而低龄患者生理健康对心理健康的预测作用更强,提示对于慢阻肺急性加重老年患者提供个性化干预的必要性。

关键词：慢性阻塞性肺疾病急性加重患者报告结局生理领域心理领域生命质量抑郁焦虑交叉滞后分析

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基于交叉滞后模型的COPD患者心理-社会因果效应分析

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山西医科大学学报 2025年第3期56卷 311-319页

作者：姬祎姗何航帜李莉芳胡晓娟胡象文张岩波赵卉山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001 山西医科大学第二医院呼吸与危重症医学科山西医科大学管理学院医学信息技术教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的采用患者报告结局(PRO)探索慢性阻塞性肺病(COPD)患者心理状态和社会状态的因果滞后效应。方法于2020年12月至2023年10月对山西省太原市5家医院的218例COPD住院患者入院时(T_(1))进行基线调查,在其出院后3个月(T_(2))和出院后6个月(... 详细信息

目的采用患者报告结局(PRO)探索慢性阻塞性肺病(COPD)患者心理状态和社会状态的因果滞后效应。方法于2020年12月至2023年10月对山西省太原市5家医院的218例COPD住院患者入院时(T_(1))进行基线调查,在其出院后3个月(T_(2))和出院后6个月(T_(3))进行电话随访。采用交叉滞后模型(CLPM)分析心理状态(包括焦虑、抑郁2个维度)和社会状态(包括疾病认知、疾病对社会活动的影响、社会支持3个维度)的因果时序关系及交叉作用,并根据mMRC评估的基线呼吸困难程度分层分析COPD患者的心理状态和社会状态的因果时序关系及交叉作用。结果T_(2)时焦虑评分显著正向预测T_(3)时疾病认知评分(β=0.603,P<0.05);前一个时间点的疾病对社会活动的影响评分均可显著正向预测后一个时间点的焦虑评分(β_((T_(1)-T_(2))=0.922,P<0.05;β_(T_(2)-T_(3))=0.951,P<0.05);前一个时间点的疾病对社会活动的影响评分均可显著正向预测后一个时间点的抑郁评分(β_((T_(1)-T_(2))=0.820,P<0.05;β_(T_(2)-T_(3))=0.890,P<0.05);T_(2)时抑郁评分可显著正向预测T_(3)时疾病对社会活动的影响评分(β=0.330,P<0.05);T_(1)时社会支持评分可显著正向预测T_(2)时焦虑评分(β=0.426,P<0.05);T_(2)时社会支持评分可显著正向预测T_(2)时焦虑评分(β=0.609,P<0.05);前一个时间点的社会支持评分均可显著正向预测后一个时间点的抑郁评分(β_((T_(1)-T_(2))=0.420,P<0.05;β_(T_(2)-T_(3))-0.297,P<0.05);T_(2)时抑郁评分可显著负向预测T_(3)时社会支持评分(β=-0.361,P<0.05)。T_(2)和T_(3)时呼吸困难程度较重的患者焦虑评分可以显著正向预测疾病对社会活动的影响评分(β=0.151,P<0.05),疾病对社会活动的影响评分可以显著正向预测抑郁评分(β=0.337,P<0.05)。结论慢性阻塞性肺病住院患者的心理领域和社会领域之间存在因果关系,其中疾病对社会活动的影响和社会支持与焦虑、抑郁的因果关系较为明显。呼吸困难程度较重的患者在心理状态对社会状态的滞后影响更明显,其疾病对社会活动的影响对焦虑和抑郁的滞后影响也更明显。

关键词：慢性阻塞性肺病患者报告结局心理因素社会因素交叉滞后分析因果时序关系

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基于医信融合教育的图书馆服务策略研究

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基础医学教育 2022年第10期24卷 820-824页

作者：袁永旭郭鼎元贺培凤何小峰于琦邰杨芳山西医科大学管理学院医学信息检索教研室太原030001 山西医科大学图书馆山西医科大学医学信息管理教研室山西医科大学医学信息技术教研室

医信融合教育为临床医学人才的培养带来了一种新的教学模式,也为高校图书馆的服务与发展带来机遇与挑战。图书馆作为信息服务的主要提供者,在医信融合的教育改革过程中,应当在服务内容、方式、策略等多方面进行适应性创新,为医信融合教... 详细信息

医信融合教育为临床医学人才的培养带来了一种新的教学模式,也为高校图书馆的服务与发展带来机遇与挑战。图书馆作为信息服务的主要提供者,在医信融合的教育改革过程中,应当在服务内容、方式、策略等多方面进行适应性创新,为医信融合教育提供完备资源支撑和良好服务环境。文章围绕信息资源、信息素养、信息服务、信息空间等方面分析了医信融合教育背景下高校图书馆的现存问题与发展趋势,阐明了图书馆在医信融合教育中服务方式的改进策略,为高校图书馆的发展转型提供思路和参考帮助。

关键词：医信融合教育高校图书馆服务策略

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基于生物信息学对成人与青少年皮肌炎差异表达基因及关键通路的分析

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山西医科大学学报 2023年第6期54卷 823-833页

作者：郑超越张升校贺培凤于琦冯爽卢学春山西医科大学管理学院医学信息组织与管理教研室太原030001 山西医科大学第二医院风湿免疫科山西医科大学管理学院医学信息技术教研室山西医科大学人文社会科学学院人文医学教研室中国人民解放军总医院血液科

目的通过生物信息学方法筛选成人皮肌炎(adult dermatomyositis,ADM)和青少年皮肌炎(juvenile dermatomyositis,JDM)肌肉组织的核心基因和关键通路,为DM的研究提供新的理论依据。方法从GEO(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载符合筛选标准的基因表达芯片数据,分为ADM组和JDM组。利用R语言的相关软件包对两组数据进行处理,获得差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并对其进行功能富集分析;利用STRING数据库及Cytoscape软件筛选核心基因并通过ROC曲线加以验证;借助CIBERSORT算法分析ADM组和JDM组免疫细胞浸润情况,使用Spearman相关性分析研究两组核心基因表达量与免疫浸润细胞丰度之间的相关性。结果ADM组共筛选出552个DEGs,其中上调基因402个,下调基因150个。这些基因主要与信号转导、细胞质和蛋白质结合等方面有关,并富集在Epstein-Barr病毒感染、甲型流感和钙信号等通路上。JDM组共筛选出235个DEGs,上下调基因分别为172和63个,这些DEGs主要富集在RNA聚合酶正启动子转录的正调控、细胞质溶胶和蛋白质结合等方面,还富集在甲型流感、抗原处理和呈递以及心肌收缩等通路上。ADM组的前5位核心基因为STAT1、HLA-A、IFIT1、ISG15、MX1;JDM组的核心基因为ACTB、STAT1、DDX58、IRF1、IFIT2,且这两组核心基因ROC曲线面积均在0.8以上。免疫细胞浸润结果显示,ADM组中含量最高的免疫细胞是浆细胞,而M1巨噬细胞在JDM组渗透最为明显。结论ADM的发生发展可能与STAT1、HLA-A等核心基因、病毒感染等相关通路以及浆细胞有关;而JDM的发病可能是通过ACTB、STAT1等核心基因、甲型流感等通路及M1巨噬细胞实现的,这些结果为成人与青少年皮肌炎诊断和治疗研究提供参考依据。

关键词：皮肌炎差异表达基因核心基因关键通路生物信息学肌肉

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互作转录组测序技术在感染性疾病研究中的应用现状

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传染病信息 2024年第1期37卷 70-75页

作者：张力中陈浩然于琦卢学春山西医科大学基础医学院太原030000 山西医科大学管理学院医学信息学教研室太原030000 解放军总医院第二医学中心血液病科北京100853 国家老年疾病临床医学研究中心北京100853

伴随着第二代、第三代测序技术的发展,转录组测序技术的测序深度不断增加,并且在现今的临床医学诊断和治疗中的应用越来越广。互作转录组测序技术(dual host-pathogen ribonucleic acid sequencing,Dual RNA-seq),可以同时提取2个(或多... 详细信息

伴随着第二代、第三代测序技术的发展,转录组测序技术的测序深度不断增加,并且在现今的临床医学诊断和治疗中的应用越来越广。互作转录组测序技术(dual host-pathogen ribonucleic acid sequencing,Dual RNA-seq),可以同时提取2个(或多个)物种的RNA进行基因表达的互作分析,得到它们相互作用的机制。在医学上可用于分析感染患者或实验样本与病原体之间转录组水平的互作情况,从而评估患者或实验样本基因表达状态并可用于药物预测。本文主要综述了Dual RNA-seq的工作原理及其在传染病领域的应用,并介绍了其与单细胞测序和非编码RNA分析结合的进展,以期对感染相关的临床和研究工作提供参考。

关键词：互作转录组测序感染生物信息学病原物宿主基因交互调控

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