检索结果-内蒙古大学图书馆

自然杂志 2021年第3期43卷 225-231页

作者：吴珍程时锋中国农业科学院农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部农业基因数据分析重点实验室广东深圳518120

植物祖先从水生到陆生的演化是植物进化生物学研究的重要课题,也是改变地球陆地生态系统的关键事件,而目前植物陆地化的进化转变机制尚不明了。最近,对几种链型绿藻和一种角苔植物的高质量基因组解析为这一事件提供了线索。研究得出如... 详细信息

植物祖先从水生到陆生的演化是植物进化生物学研究的重要课题,也是改变地球陆地生态系统的关键事件,而目前植物陆地化的进化转变机制尚不明了。最近,对几种链型绿藻和一种角苔植物的高质量基因组解析为这一事件提供了线索。研究得出如下结论:①双星藻纲(Zygnematophyceae)是现存与陆地植物共同祖先最近的姐妹群系;②两类主调控因子(GRAS和PYL)的土壤细菌水平基因转移在驱动植物祖先陆地化的进程中起着重要作用;③植物祖先陆地化是渐进性演化,遗传物质经历了一系列的“预适应”,很多长期被认为陆地植物特有的基因家族在更原始的绿藻中就已存在;④基因组学是研究植物陆地化及其可逆性过程(如一些水生被子植物)的重要手段。分子机制依然是研究植物陆地化适应性进程的热点之一,包括人工设计的“实验进化”和在植物进化及适应性进程中扮演重要角色的水平基因转移这一自然的转基因工程事件。

关键词：植物陆地化链型绿藻角苔植物基因组学

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马铃薯不同生育期耐盐性鉴定

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云南师范大学学报（自然科学版） 2023年第4期43卷 29-35页

作者：谭薇刘金涛吕春桃王倩张钟祝光涛云南师范大学生命科学学院马铃薯科学研究院云南省马铃薯生物学重点试验室云南省高校马铃薯生物学重点实验室云南昆明650500 昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部农业基因数据分析重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所广东深圳518000

马铃薯是全球最重要的块茎类作物,是有效利用我国盐碱地资源、保障国家粮食安全的重要作物,但其不同生育期对盐胁迫的耐受性研究较少,限制了马铃薯耐盐资源的筛选与利用.以优薯5号为试验材料,采用200 mmol/L NaCl溶液浇灌盆栽苗,对马铃... 详细信息

马铃薯是全球最重要的块茎类作物,是有效利用我国盐碱地资源、保障国家粮食安全的重要作物,但其不同生育期对盐胁迫的耐受性研究较少,限制了马铃薯耐盐资源的筛选与利用.以优薯5号为试验材料,采用200 mmol/L NaCl溶液浇灌盆栽苗,对马铃薯不同生育期进行表型以及相关生理指标的测定.结果表明马铃薯不同生育期盐耐受性差异明显:种子萌发受盐胁迫影响较大,其萌发完全受到抑制;薯块发芽期株高明显受盐胁迫抑制;幼苗期叶片萎蔫最明显,电导率和脯氨酸含量在盐处理120 h后显著提高,叶绿素含量在72 h后降至最低,丙二醛含量在24 h显著提高;花蕾期植株生长受盐胁迫影响较小;结薯期株高受盐胁迫的影响较小.综上所述,马铃薯不同生育期的耐盐性具有显著的差异.

关键词：盐胁迫马铃薯生育期生理指标

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猪circRNAs的系统鉴定及特征分析

引用

畜牧兽医学报 2020年第12期51卷 2972-2979页

作者：李巧伟杨亚岚易国强陈慕雅王斌虎范新浩唐中林中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 中国农业科学院农业基因组研究所深圳518124 农业部农业基因数据分析重点实验室深圳518124 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳518124

旨在系统鉴定猪基因组中的环状RNAs(circular RNAs,circRNAs),并对其分子特征进行分析。本研究采集长白、通城和五指山猪16个发育阶段(妊娠33、40、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100和105 d的胚胎以及出生后0和10 d)9种不... 详细信息

旨在系统鉴定猪基因组中的环状RNAs(circular RNAs,circRNAs),并对其分子特征进行分析。本研究采集长白、通城和五指山猪16个发育阶段(妊娠33、40、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100和105 d的胚胎以及出生后0和10 d)9种不同组织(背最长肌、心、脾、肺、肝、肾、胃、小肠和腿肌)样品,提取RNA再进行等量混合,构建链特异性转录组文库后,利用Illumina Genome Analyzer II平台进行测序,共获得1.18亿条总reads。采用CIRI2软件鉴定circRNAs,再利用生物信息学工具对鉴定的circRNAs进行分子特征分析。结果,共鉴定了8486条circRNAs,其主要分布在1、6和13号染色体,91%的circRNAs为外显子型,平均长度为350 nt,平均GC含量为47.11%,每条染色体上的circRNAs数目与mRNAs数目显著正相关(R=0.84,P=1.285×10-5)。最后,筛选出3条与骨骼肌生长发育相关的circRNAs(sus-MYH2_0025、sus-CDK13_0002和sus-FANCL_0003)。分析结果表明,sus-MYH2_0025具有高度的组织特异性,sus-CDK13_0002在猪、人和小鼠中高度保守,sus-FANCL_0003在猪和大鼠中高度保守。本研究利用转录组数据在猪基因组中对circRNAs进行系统鉴定和分子特征分析,为circRNA的功能和机制研究提供了丰富的信息,并为猪分子育种提供新的潜在候选基因。

关键词：猪环状RNA 鉴定分子特征骨骼肌

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CRISPR/Cas9技术及其在猪基因编辑中的应用

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畜牧兽医学报 2020年第3期51卷 409-416页

作者：刘思远卢丹唐中林中国农业科学院深圳农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业部农业基因数据分析重点实验室深圳518120 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 湖南农业大学长沙410128 云南农业大学昆明650201

CRISPR/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated protein 9)是一种新型基因编辑系统,是由细菌和古细菌对抗入侵病毒及外源DNA的适应性免疫防御系统演变而来的。该系统具有简易、精准、经济和高效的优点,目前已广泛应用于基因编辑及其相关研究中。本文总结了近几年CRISPR/Cas9技术在猪基因组编辑中的研究进展,并展望了其应用前景。

关键词： CRISPR/Cas9 基因编辑猪应用

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马铃薯块茎不同发育时期转录组分析

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云南师范大学学报（自然科学版） 2021年第4期41卷 25-32页

作者：卢晓月李大伟邬倩祝光涛云南师范大学生命科学学院马铃薯科学研究院云南省马铃薯生物学重点实验室云南省高校马铃薯生物学重点实验室云南昆明650500 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部农业基因数据分析重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所广东深圳518000

为解析与薯块发育相关的关键基因,以马铃薯匍匐茎、薯块起始期和膨大期的薯块为材料进行转录组分析.结果显示:匍匐茎与薯块膨大起始期、薯块膨大起始期与膨大期比较分别筛选出759个和773个差异表达基因.基因本体分析显示这些基因主要富... 详细信息

为解析与薯块发育相关的关键基因,以马铃薯匍匐茎、薯块起始期和膨大期的薯块为材料进行转录组分析.结果显示:匍匐茎与薯块膨大起始期、薯块膨大起始期与膨大期比较分别筛选出759个和773个差异表达基因.基因本体分析显示这些基因主要富集到细胞过程、代谢过程和催化活性等生物学过程,代谢通路富集分析显示差异基因主要富集到能量代谢与碳水化合物代谢等途径,这些基因可能在块茎发育过程中的淀粉合成等途径起到关键作用.对富集到上述途径的基因结合转录组鉴定到了14个在薯块起始期上调表达的基因,利用实时荧光定量PCR验证了其中7个差异表达基因,发现其表达模式与转录组结果基本一致.

关键词：马铃薯块茎发育转录组差异表达基因

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