检索结果-内蒙古大学图书馆

中国居民1990—2019年皮肤及皮下疾病疾病负担变化趋势

中国公共卫生 2022年第5期38卷 529-533页

作者：陈东宇杨晓雨王红心樊文龙刘兴华林泳煌何玉清东莞市寮步医院皮肤科广东东莞523400 广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所

目的分析中国居民1990—2019年皮肤及皮下疾病疾病负担的变化趋势,为我国公共卫生政策的制定提供理论依据。方法收集2019年全球疾病负担(GBD 2019)研究中1990、2000、2010和2019年中国居民皮肤及皮下疾病疾病负担相关数据,采用发病数... 详细信息

目的分析中国居民1990—2019年皮肤及皮下疾病疾病负担的变化趋势,为我国公共卫生政策的制定提供理论依据。方法收集2019年全球疾病负担(GBD 2019)研究中1990、2000、2010和2019年中国居民皮肤及皮下疾病疾病负担相关数据,采用发病数、标化发病率、患病数、标化患病率、伤残调整寿命年(DALY)、标化DALY率和估计年百分比变化(EAPC)等指标分析1990—2019年中国居民皮肤及皮下疾病疾病负担的变化趋势。结果中国居民1990—2019年皮肤及皮下疾病的发病数、标化发病率、患病数、标化患病率和DALY分别增长了29.33%、27.20%、27.23%、5.52%和14.75%,但标化DALY率则降低了0.29%;女性居民标化发病率低于同时期男性居民,但标化患病率和标化DALY率均高于同时期男性居民。中国居民1990—2019年皮肤及皮下疾病标化发病率增长最快的为褥疮(EAPC=1.078,95%UI=0.826~1.317),下降最快的为蜂窝织炎(EAPC=–1.210,95%UI=–1.416~–1.019);标化患病率增长最快的为寻常痤疮(EAPC=1.087,95%UI=1.052~1.110),下降最快的为蜂窝织炎(EAPC=–1.097,95%UI=–1.289~–0.917);标化DALY率增长最快的为褥疮(EAPC=2.202,95%UI=0.905~3.451),下降最快的是蜂窝织炎(EAPC=–7.304,95%UI=–8.081~–7.087)。结论中国居民1990—2019年皮肤及皮下疾病的发病率和患病率有所增加,疾病负担虽有所改善但仍处于较高水平,其中对疾病负担增长最快的褥疮应加以重视。

关键词：皮肤及皮下疾病疾病负担变化趋势中国居民

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中国女性卵巢癌流行现状和趋势及预测分析

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重庆医科大学学报 2022年第9期47卷 1030-1035页

作者：杨晓雨陈东宇王红心樊文龙潘素跃胡敏黄巧王朴何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系、广东医科大学医学系统生物学研究所东莞523808

目的:对1990年至2019年中国女性卵巢癌流行趋势及危险因素进行分析,为我国卵巢癌的预防提供更科学的依据。方法:从全球疾病负担2019数据库获取中国及其他地区卵巢癌发病、死亡及伤残调整寿命年指标的估计数和标准化率,比较评估中国卵巢... 详细信息

目的:对1990年至2019年中国女性卵巢癌流行趋势及危险因素进行分析,为我国卵巢癌的预防提供更科学的依据。方法:从全球疾病负担2019数据库获取中国及其他地区卵巢癌发病、死亡及伤残调整寿命年指标的估计数和标准化率,比较评估中国卵巢癌的流行负担及危险因素变化。用GLOBOCAN库对2020年至2040年中国卵巢癌发病及死亡人数进行预测。结果:1990年至2019年,中国大陆和中国台湾卵巢癌的年龄标准化发病率分别由2.56/10万和4.72/10万增至4.54/10万和8.68/10万,年龄标准化死亡率由1.76/10万和2.63/10万增至2.77/10万和3.84/10万,增幅超过全球、日本及新加坡。其中,50~54岁年龄组女性发病人数最多,发病率的峰值出现在70~74岁。2019年卵巢癌死亡的三大危险因素分别是高空腹血糖、高体质指数和职业性石棉暴露。30年间,中国卵巢癌的年龄标准化伤残调整寿命年率(disability-adjusted life year,DALY)随社会人口学指数(socio-demographic index,SDI)增加而增加。此外,据GLOBOCAN数据库预测,中国卵巢癌疾病负担会持续加重,预计到2040年,发病人数较2020年增加17.9%,死亡人数增加33.0%。结论:中国女性卵巢癌疾病负担仍然较重,且在不断上升,需要针对不同年龄段及风险人群采取相应的有效预防措施,加强对高风险人群的监测,以进一步降低疾病负担。

关键词：中国卵巢癌流行趋势危险因素预测

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基于多组学的儿童系统性红斑狼疮与皮肌炎相关共病基因分析

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国际遗传学杂志 2023年第4期46卷 264-275页

作者：黄巧潘素跃王朴胡敏彭怡李伟佳何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所

目的基于生物学信息多组学技术对儿童系统性红斑狼疮和皮肌炎共病患者相关基因的特征进行分析。方法从GEO数据库下载儿童系统性红斑狼疮(childhood-onset systemic lupus erythematos, cSLE)与皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)相... 详细信息

目的基于生物学信息多组学技术对儿童系统性红斑狼疮和皮肌炎共病患者相关基因的特征进行分析。方法从GEO数据库下载儿童系统性红斑狼疮(childhood-onset systemic lupus erythematos, cSLE)与皮肌炎(juvenile dermatomyositis, JDM)相关基因芯片表达谱, 将两者的差异基因取交集后进行GO功能富集及KEGG信号通路分析, 通过Cytoscape软件构建蛋白质互作网络, 筛选hub基因;使用CIBERSORT反卷积法分析关键基因和免疫细胞浸润的相关性, 将经验证的关键基因导入Coremine Medical数据库筛选出治疗cSLE和JDM共病药物。结果差异表达基因功能主要富集于I型干扰素通路以及抗病毒反应等;网络拓扑学分析、经外部数据集验证后共筛选出5个关键基因STAT1、ISG15、MX1、OASL、DDX58, (P均<0.05)免疫浸润细胞相关性分析显示JDM和cSLE患者的M1巨噬细胞显著上调时与关键基因呈正相关, (P均<0.05)干扰素免疫调节、抗病毒制剂与JDM和cSLE共病患者的治疗存在密切关联, (P均<0.001)结论 JDM与cSLE共同发病基因在多种生物活性、信号通路上发挥重要调控作用, 筛选出的5个关键基因及药物预测可能成为共病发生的诊断与治疗开发的理论支持。

关键词： GEO数据库儿童系统性红斑狼疮幼年皮肌炎生物信息学

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乳酸代谢相关基因对胰腺癌预后和肿瘤微环境的影响

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国际遗传学杂志 2023年第3期46卷 171-184页

作者：黄巧潘素跃王朴胡敏李伟佳彭怡何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所

目的胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma, PAAD)是消化系统中恶性程度较高的肿瘤之一, 预后较差。本研究旨在通过生物信息学方法和乳酸代谢基因构建PAAD预后模型来研究其临床意义以及分析乳酸代谢基因与肿瘤微环境之间的关系。方法分别从... 详细信息

目的胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma, PAAD)是消化系统中恶性程度较高的肿瘤之一, 预后较差。本研究旨在通过生物信息学方法和乳酸代谢基因构建PAAD预后模型来研究其临床意义以及分析乳酸代谢基因与肿瘤微环境之间的关系。方法分别从TCGA和GTEx数据库下载胰腺癌和非病变胰腺组织数据, 乳酸代谢基因从GeneCards数据库下载, 识别PAAD差异表达乳酸代谢基因后通过单变量和LASSO-Cox方法构建PAAD乳酸代谢基因预后模型。ssGSEA和ESTIMATE算法评估乳酸风险基因与肿瘤微环境之间的关系。结果预后模型由7个关键乳酸基因构成(UCA1、ARNT2、PNPLA6、ATP6V0A1、MET、PRPF8、KRT7), 对于独立预测PAAD患者的预后具有重要的临床价值。在肿瘤微环境中, 乳酸代谢高风险组多种免疫细胞浸润呈现抑制状态, 包括NK细胞、调节性T细胞、嗜酸细胞等。结论通过乳酸代谢基因构建的PAAD预后模型和肿瘤微环境的分析结果对PAAD患者的预后改善和临床治疗提供新的证据。

关键词：胰腺癌乳酸代谢基因预后模型肿瘤微环境

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应用单细胞测序识别银屑病致病相关的潜在生物标志物以及细胞互作关系

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国际遗传学杂志 2023年第1期46卷 1-13页

作者：陈东宇胡敏王朴潘素跃杨晓雨黄巧樊文龙王红心何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所

目的在单细胞水平上探究与银屑病致病相关的潜在生物标志物和细胞间的异质性水平。方法对银屑病皮肤活检组织的单细胞测序数据进行质控、降维聚类及细胞亚群注释, 以及对细胞类群进行差异基因(differentially expressed genes, DEGs)、... 详细信息

目的在单细胞水平上探究与银屑病致病相关的潜在生物标志物和细胞间的异质性水平。方法对银屑病皮肤活检组织的单细胞测序数据进行质控、降维聚类及细胞亚群注释, 以及对细胞类群进行差异基因(differentially expressed genes, DEGs)、细胞通讯及拟时序分析, 并构建TFs-miRNA-hub基因调控网络。结果基于多算法共鉴定出6个共同交集的hub基因, 分别为SPRR2A、SPRR2D、IL7R、IL1RN、IER3、LCN2。KEGG显示其主要涉及NF-κB信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等。在内皮细胞、成纤维细胞以及免疫细胞如朗格汉斯细胞、CD8+ T细胞、M1巨噬细胞、静息T细胞里SPRRs基因表达量均显著上调, IL7R则主要在多种免疫细胞中过表达。成纤维细胞、树突状细胞、Treg细胞和CD8+ T细胞在银屑病皮损的含量显著增多(P=0.023、P=0.007、P=0.046、P=0.028)。皮损组内细胞间的相互作用数量、强度和通路富集程度的活跃性均高于对照组, Treg细胞、CD8+ T细胞以及静息T细胞仅在银屑病组内与其他细胞有交互作用。拟时序分析显示免疫细胞主要分布在轨迹早期, 单核细胞全程参与并在轨迹后期表达增加。除IL7R的表达量随着拟时序变化而减少外, 其余hub基因的表达量均一直增加。预测转录因子NFKB1同时参与hub基因SPRR2A、IL1RN、IL7R和IER3的调控。结论 SPRRs基因和IL7R的过度表达以及多种免疫细胞如Treg细胞、CD8+ T细胞、静息T细胞以及单核细胞的交互作用可能通过MAPK和NF-κB途径参与银屑病的关键致病过程。本研究结果可为进一步研究银屑病的致病机制奠定理论依据。

关键词：银屑病皮损单细胞测序富含脯氨酸小蛋白免疫细胞

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1990-2019年亚洲60~89岁老年人皮肤病的疾病负担

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中国皮肤性病学杂志 2022年第11期36卷 1257-1264页

作者：樊文龙王红心杨晓雨陈东宇黄巧潘素跃胡敏王朴何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808 东莞市寮步医院广东东莞523400

目的通过分析1990-2019年60~89岁老年人皮肤病的流行病学数据,评估亚洲老年人的皮肤病负担,以便更好地促进老年人健康。方法相关数据来自GBD 2019数据库,伤残调整寿命年(DALYs)、患病率和发病率(每10万人的比率)被用来描述疾病负担,... 详细信息

目的通过分析1990-2019年60~89岁老年人皮肤病的流行病学数据,评估亚洲老年人的皮肤病负担,以便更好地促进老年人健康。方法相关数据来自GBD 2019数据库,伤残调整寿命年(DALYs)、患病率和发病率(每10万人的比率)被用来描述疾病负担,年估计百分比变化(EAPCs,%)被用来描述1990-2019年皮肤病的负担趋势。结果 1990-2019年,亚洲60~89岁老年人皮肤病的患病率和发病率都持续上升(EAPC>0, 95%UI>0);真菌性皮肤病的患病率和发病率以及皮炎的DALY率始终高于其他皮肤病,褥疮的患病率、发病率和DALY率增长最快。2019年,脓皮病的死亡人数最高[15 746 (95%UI:12 271~18 979)例],占皮肤病死亡总数的55.44%;仅有褥疮的死亡率呈现上升趋势,EAPC为1.16 (95%UI:0.78~1.54);另外,真菌性皮肤病在48个国家和地区的患病率和发病率均最高。结论亚洲60~89岁老年人皮肤病的负担依然很重,30年来一直呈现上升趋势;同时真菌性皮肤病、皮炎、褥疮、脓皮病需要重点关注;各国和地区应继续改进相关的预防措施,以减少皮肤病的负担,促进老年人的健康。

关键词：皮肤病疾病负担老年人亚洲

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基于网络药理学和分子对接探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制

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皮肤性病诊疗学杂志 2024年第3期31卷 180-189页

作者：彭怡李伟佳黄巧胡敏潘素跃王朴戚嘉慧江千帆刘凌宇何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808 东莞市寮步医院广东东莞523400

目的基于网络药理学的方法,探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制。方法将口服生物利用度(OB)和类药性(DL)这两项筛选标准分别设定为OB≥30%和DL≥0.18,使用Cytoscape 3.9.1软件,通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、OMIM、Swiss Target ... 详细信息

目的基于网络药理学的方法,探讨蒺藜治疗白癜风的作用机制。方法将口服生物利用度(OB)和类药性(DL)这两项筛选标准分别设定为OB≥30%和DL≥0.18,使用Cytoscape 3.9.1软件,通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、OMIM、Swiss Target Prediction和GeneCards等多种主流数据库,筛选出蒺藜主要活性成分的作用靶点基因并构建“活性成分-作用靶点”网络,再将蒺藜主要活性成分的作用靶点基因与白癜风疾病靶点基因取交集,构建蒺藜治疗白癜风的“疾病-通路-靶点-成分-药物”网络。将交集作用靶点分别导入至STRING平台用以构建蛋白质相互作用(PPI)网络,导入DAVID数据库用以进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。利用有机小分子生物活性数据库(PubChem)和蛋白质结构数据库(PBD)找出药物关键成分的小分子结构和疾病蛋白结构,设置受体与配体后对两者进行分子对接。结果筛选出12种活性成分,包括山奈酚、蒺藜酰胺、异鼠李素、谷甾醇等,该活性成分可能在对应的71个靶点上发挥功效。依赖PPI网络分析,挖掘出RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、雌激素受体1(ESR1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、造血前列腺素D合酶(HPGDS)、胱天蛋白酶3(CASP3)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等10个主要靶标。这些潜在的靶标参与细胞凋亡、肽基丝氨酸磷酸化、细胞对活性氧的响应等众多生物过程,其中包含多种信号通路,如细胞凋亡、肿瘤坏死因子信号通路、活性氧信号通路等。分子对接结果显示山奈酚、异鼠李素等主要活性成分与核心作用靶点AKT1、TNF、ESR1对接结合稳定,证明其核心成分可以通过结合多个核心蛋白,作用于关键靶点发挥调控作用。结论蒺藜可能通过调节炎症、细胞凋亡、免疫功能、氧化应激等多个途径,来发挥对白癜风的治疗功效。

关键词：蒺藜白癜风网络药理学炎症细胞凋亡氧化应激作用机制

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1990-2019年全球斑秃疾病负担的流行病学分析

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中国皮肤性病学杂志 2022年第7期36卷 763-768页

作者：陈东宇杨晓雨樊文龙王红心刘兴华林泳煌何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808 东莞市寮步医院皮肤科广东东莞523400

目的分析1990-2019年全球斑秃疾病负担的变化趋势,为全球各个国家的斑秃防治提供理论依据。方法根据2019年全球疾病负担(GBD 2019)研究,采用伤残调整寿命年(DALY)、标化DALY率以及估计年百分比变化(EAPC)等指标分析1990-2019年全球斑秃... 详细信息

目的分析1990-2019年全球斑秃疾病负担的变化趋势,为全球各个国家的斑秃防治提供理论依据。方法根据2019年全球疾病负担(GBD 2019)研究,采用伤残调整寿命年(DALY)、标化DALY率以及估计年百分比变化(EAPC)等指标分析1990-2019年全球斑秃疾病负担的变化趋势。结果2019年,全球斑秃共导致600570.37(95%UI:378239.38~891060.98)人年DALY,相比1990年增长了49.51%,但标化DALY率下降了2.93%。在各年龄组中,女性的DALY及DALY率均高于同年龄段的男性。从全球来看,1990-2019年斑秃标化DALY率增长最快的是低社会人口指数地区(EAPC=0.037,95%UI:0.033~0.040),下降最快的是高社会人口指数地区(EAPC=-0.158,95%UI:-0.192~-0.124);在GBD地区中,增长最快的是西撒哈拉以南非洲地区(EAPC=0.065,95%UI:0.056~0.075),下降最快的是撒哈拉以南非洲南部地区(EAPC=-0.031,95%UI:-0.035~-0.028);在国家层面,增长最快的是科威特(EAPC=0.147,95%UI:0.105~0.188),下降最快的是美国(EPAC为-0.291,95%UI:-0.389~-0.193)。此外,2019年人类发展指数与斑秃的标化DALY率呈正相关(r=0.51,P<0.05),而与标化DALY率的EAPC呈负相关(r=-0.29,P<0.05)。结论1990-2019年全球斑秃的疾病负担虽有所改善但总体上仍处于较高水平。25~39岁年龄段人群作为斑秃负担最重的群体,尤其是女性,应重点关注。

关键词：斑秃全球负担疾病伤残调整寿命年人类发展指数变化趋势

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银屑病发病关键基因筛选、与免疫细胞浸润关系及有治疗潜力的中药预测

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山东医药 2023年第27期63卷 37-42页

作者：潘素跃王朴黄巧胡敏彭怡李伟佳戚嘉慧刘凌宇江千帆何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808 东莞市寮步医院皮肤科

目的筛选银屑病发病关键基因,分析银屑病发病关键基因与免疫细胞浸润水平之间的关系,并筛选对银屑病有治疗潜力的中药,为研究银屑病的发病原因、发病机制提供参考。方法在GEO数据库检索银屑病基因芯片,筛选出银屑病差异共表达基因(DEGs)... 详细信息

目的筛选银屑病发病关键基因,分析银屑病发病关键基因与免疫细胞浸润水平之间的关系,并筛选对银屑病有治疗潜力的中药,为研究银屑病的发病原因、发病机制提供参考。方法在GEO数据库检索银屑病基因芯片,筛选出银屑病差异共表达基因(DEGs);通过WGCNA包筛选出银屑病相关性最高的基因模块;将获取的银屑病DEG s与银屑病相关性最高的模块取交集,获得银屑病高度相关DEG s,并对其进行GO分析、KEGG分析。采用MCC、DEGREE、EPC和CLOSENESS算法从银屑病高度相关DEG s中筛选出与银屑病相关性更强的DEGs为银屑病发病关键基因。利用CIBERSORT反卷积法、Pearson相关分析银屑病发病关键基因与免疫浸润细胞比例的关系。通过将银屑病发病关键基因映射至COREMINE medical数据库,筛选出对银屑病有治疗潜力的中药。结果共筛选出348个DEG s。GO富集分析显示DEGs主要富集在对外部生物刺激的反应、线粒体蛋白复合体、内肽酶活性、丝氨酸型肽酶活性等方面;KEGG富集分析显示其主要涉及NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、P53信号通路、IL-17信号通路等与银屑病发病相关的信号通路。最终得到了PCNA、CXCL8、S100A9、CCNB1四个银屑病发病关键基因。银屑病发病关键基因PCNA和CCNB1与中性粒细胞和活化的树突状细胞均呈正相关性,S100A9和CXCL8与单核细胞均呈负相关性(P均<0.05)。有银屑病治疗潜力的中药为朴花、大黄等。结论银屑病的四个关键基因PCNA、CXCL8、S100A9、CCNB1均与免疫浸润细胞比例存在较强相关性;对银屑病具有治疗潜力的中药为厚朴花、大黄。

关键词：银屑病差异表达基因免疫浸润细胞中药材反卷积法生物信息学

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TRPV3基因突变导致表皮功能障碍和角质细胞异常分化的作用机制研究

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国际遗传学杂志 2023年第2期46卷 85-94页

作者：潘素跃陈东宇樊文龙胡敏王朴黄巧杨晓雨王红心何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广东医科大学医学系统生物学研究所东莞东莞市寮步医院皮肤科东莞

目的运用生物信息学方法筛选与瞬时感受器电位香草素受体亚家族3(transient receptor potential vanillin 3,TRPV3)突变密切相关的一组基因和信号通路, 探讨TRPV3突变对局灶型掌跖角化症和Olmsted综合征表皮功能和角质细胞增殖分化的影... 详细信息

目的运用生物信息学方法筛选与瞬时感受器电位香草素受体亚家族3(transient receptor potential vanillin 3,TRPV3)突变密切相关的一组基因和信号通路, 探讨TRPV3突变对局灶型掌跖角化症和Olmsted综合征表皮功能和角质细胞增殖分化的影响。方法对转染TRPV3突变体的HEK293T细胞进行Sanger DNA测序。筛选与TRPV3突变相关的差异基因, 利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)筛选与样本特征相关性最大的模块, 两者取交集后得到差异共表达基因, 并进行富集和功能注释。基于STRING数据库构建蛋白质相互作用网络, 利用多算法筛选出与TRPV3突变相关的关键基因。结果用野生型或TRPV3突变体转染HEK293T细胞24 h后, 发现各细胞系的活细胞数减少, 尤其是Gly573Cys、Gly573Ser和Trp692Gly。综合WGCNA和差异分析筛选得到共30个与TRPV3突变相关的差异共表达基因, 其中GO显示其主要富集在RNA聚合酶Ⅱ对转录的正调控和核酸模板转录的正调控等功能;京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路分析发现主要富集在丝裂原活化蛋白激酶信号通路、TRP通道的炎症介质调节、细胞衰老和鞘脂代谢等途径。将CytoHubba 4种算法的结果进行交叉, 共鉴定出4个关键靶基因, 包括FOS、EGR1、ATF3、EGR2。结论本研究发现TRPV3突变抑制细胞活性, 与Olmsted综合征和局灶型掌跖角化病等皮肤角化性疾病密切相关, 并通过生物信息学方法筛选得到与TRPV3突变相关的差异共表达基因, 可为后续研究TRPV3突变引起相关疾病的发病机制和治疗提供参考依据。

关键词：局灶型掌跖角化症差异表达基因加权基因共表达网络分析

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