检索结果-内蒙古大学图书馆

国际遗传学杂志 2022年第6期45卷 429-440页

作者：王朴陈东宇潘素跃樊文龙黄巧胡敏杨晓雨王红心何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所东莞东莞市寮步医院东莞

目的筛选出斑秃的差异表达基因(differentially expressed gene , DEGs), 探究其免疫浸润机制并预测中药治疗靶点, 为斑秃的发病机制和中医治疗探究提供新的思路。方法从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载斑秃相关基因芯片表达谱... 详细信息

目的筛选出斑秃的差异表达基因(differentially expressed gene , DEGs), 探究其免疫浸润机制并预测中药治疗靶点, 为斑秃的发病机制和中医治疗探究提供新的思路。方法从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载斑秃相关基因芯片表达谱;筛选DEGs并进行富集分析;基于String数据库构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction, PPI), 并通过Cytoscape软件筛选关键基因;通过CIBERSORT反卷积法分析免疫细胞浸润相关性;利用医学本体信息检索平台Coremine medical数据库筛选关键基因对应的中药靶点。结果在3个斑秃芯片样本中共筛选出164个DEGs。GO富集分析显示这164个DEGs主要富集在皮肤发育、分子活性、内肽酶抑制物活性、超分子纤维等方面;KEGG富集分析筛选出金黄色葡萄球菌感染、雌激素信号通路、Wnt信号通路、转化生长因子β(TGF-β)等信号通路。通过PPI分析共筛选出KRT85、BMP2、KRTAP3-1、KRT27、MSX2、KRTAP11-1、HOXC13、DSG4、KRT82、TCHH这10个关键基因。DEGs与免疫浸润细胞相关性分析结果显示, γδT细胞(P<0.001)、M1巨噬细胞(P<0.001)等差异具有统计学意义。通过Coremine medical数据库映射出黄芪(P=0.0178)、鳖甲(P=0.0012)、降香(P=0.0033)等潜在中药靶点。结论本研究利用生物信息学方法筛选斑秃发病相关候选基因, 表明其与免疫浸润细胞密切相关, 并筛选出了潜在的中药治疗靶点, 为深入研究斑秃病理学机制和治疗方法提供了理论依据。

关键词：斑秃生物信息学差异表达基因免疫浸润中药治疗

来源：评论

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整合生物信息学分析痤疮的关键基因与免疫浸润水平

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皮肤性病诊疗学杂志 2022年第5期29卷 412-420页

作者：樊文龙王红心陈东宇杨晓雨黄巧胡敏潘素跃王朴何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808 东莞市寮步医院广东东莞523400

目的通过整合分析多芯片数据,探究与痤疮发病相关的关键基因及免疫细胞浸润水平。方法从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用“limma”R包和加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与痤疮表型相关基因模块中的差异表达基因(DEGs),并进行GO功... 详细信息

目的通过整合分析多芯片数据,探究与痤疮发病相关的关键基因及免疫细胞浸润水平。方法从GEO数据库获取基因芯片数据集,采用“limma”R包和加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与痤疮表型相关基因模块中的差异表达基因(DEGs),并进行GO功能富集和KEGG通路分析;利用STRING在线数据库及Cytoscape软件构建蛋白质互作网络,并筛选出关键基因;基于CIBERSORT算法分析免疫细胞浸润情况。结果共筛选到154个DEGs。DEGs与信号受体结合、细胞因子活性、趋化因子受体结合等有关,主要集中在病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号传导、NF-κB信号传导、IL-17信号传导等通路。构建的PPI网络中,得到139个节点,1597条边,筛选到两个关键基因(CCR5、CXCL8)。22种免疫细胞浸润中,相对于正常对照组,皮损组中有更多的中性粒细胞、活化的肥大细胞、活化的树突状细胞、活化的CD4记忆T细胞等,而调节性T细胞、静息的树突状细胞、静息的肥大细胞等相对更少。结论本研究利用生物信息学方法筛选的关键基因及免疫细胞浸润水平的变化可能在痤疮发病中起到重要作用。

关键词：痤疮关键基因加权基因共表达网络分析免疫浸润发病机制

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综合生物信息学方法识别银屑病免疫抑制相关的潜在生物标志物

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医学综述 2022年第11期28卷 2223-2233页

作者：陈东宇杨晓雨王红心樊文龙刘兴华林泳煌何玉清东莞市寮步医院皮肤科广东东莞523400 广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系广东东莞523808 广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808

目的通过生物信息学方法寻找银屑病的潜在生物标志物,为探讨其发病机制提供理论依据。方法采用加权基因共表达网络分析和基因集富集分析(GSEA)算法筛选银屑病皮损和非皮损活检样本之间的差异表达基因(DEGs)。基于STRING 11.0数据库和Cyt... 详细信息

目的通过生物信息学方法寻找银屑病的潜在生物标志物,为探讨其发病机制提供理论依据。方法采用加权基因共表达网络分析和基因集富集分析(GSEA)算法筛选银屑病皮损和非皮损活检样本之间的差异表达基因(DEGs)。基于STRING 11.0数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络并验证DEGs的表达水平。运用CIBERSORT算法分析DEGs与免疫浸润细胞特征基因表达量的相关性。结果交集得到89个与银屑病发病相关的DEGs。基因本体富集结果显示,DEGs主要与体液免疫反应、能量代谢过程以及趋化因子活性有关。GSEA获得的6条交集通路均受到抑制,分别是嘧啶代谢、利什曼原虫感染、亚油酸代谢、细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路和嘌呤代谢。DEGs与22种免疫细浸润胞的特征基因表达量的相关分析显示,单磷酸胞嘧啶-N-乙酰神经氨酸羟化酶假定蛋白、LOC100506990、神经前体分化调节同系物、原肠(胚)形成糖蛋白、蛋白酪氨酸磷酸酶非受体21、排斥导向分子B、维甲酸相关孤儿受体α、盐诱导激酶1、Wnt家族成员2和锌指蛋白273的表达量均与免疫细胞浸润呈显著负相关(P<0.05)。结论本研究利用生物信息学方法筛选得到的与银屑病发病相关的DEGs,在一定程度上可抑制疾病的发生,可为后续深入研究银屑病的致病机制奠定理论依据。

关键词：银屑病生物标志物发病机制加权基因共表达网络分析免疫浸润

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白藜芦醇诱导沉默信息调节因子1改善阿尔茨海默病记忆能力的研究进展

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中国全科医学 2018年第23期21卷 2891-2894页

作者：何小艺于海兵闫妍何玉清丁元林孔丹莉广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广东省东莞市523808 广东省东莞市环境医学重点实验室 523808 广东省东莞市医学系统生物学研究所 523808

阿尔茨海默病(AD)以进行性认知功能障碍和记忆能力损伤为主,是一种中枢神经系统退行性疾病。由于AD的病因以及发病机制未明,所以尚无有效治疗药物。近年来相关研究表明白藜芦醇可有效预防AD的发生及发展。白藜芦醇具有神经保护作用,可改... 详细信息

阿尔茨海默病(AD)以进行性认知功能障碍和记忆能力损伤为主,是一种中枢神经系统退行性疾病。由于AD的病因以及发病机制未明,所以尚无有效治疗药物。近年来相关研究表明白藜芦醇可有效预防AD的发生及发展。白藜芦醇具有神经保护作用,可改善AD动物模型记忆能力,但具体机制未明。白藜芦醇可以诱导沉默信息调节因子1(SIRT1),而且SIRT1具有调节记忆能力的作用,故白藜芦醇可能通过激活SIRT1来提高AD患者记忆能力。本文综述白藜芦醇诱导SIRT1改善AD记忆能力的研究进展,为白藜芦醇防治AD提供参考依据。

关键词：阿尔茨海默病白藜芦醇记忆 SIRT1

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白藜芦醇对阿尔茨海默病动物模型miRNA-106 b的影响

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中华神经科杂志 2016年第11期49卷 846-851页

作者：孔丹莉赵祖国何玉清丁元林罗燕鸿梁碧玉王瑾于海兵广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室东莞523808 广东医科大学公共卫生学院微生物与免疫教研室东莞523808 广东医科大学系统生物学研究所东莞523808 广东医科大学基础医学院东莞523808 广东医科大学科技处东莞523808

目的：探讨白藜芦醇对阿尔茨海默病（ AD）动物模型中miRNA-106b的影响。方法取3月龄健康昆明雄性小鼠50只，按照完全随机区组的抽样方法将其分为正常对照组、AD模型组和白藜芦醇高、中、低剂量组，每组10只。除正常对照组外，对其余各... 详细信息

目的：探讨白藜芦醇对阿尔茨海默病（ AD）动物模型中miRNA-106b的影响。方法取3月龄健康昆明雄性小鼠50只，按照完全随机区组的抽样方法将其分为正常对照组、AD模型组和白藜芦醇高、中、低剂量组，每组10只。除正常对照组外，对其余各组均制作AD模型，连续30 d。从第31天起对对照及模型组每天灌胃双蒸水，其余组分别灌胃不同剂量白藜芦醇，连续60 d。给药结束后，观测小鼠行为记忆功能；检测各组小鼠大脑组织中淀粉样前体蛋白（ APP）、P62、载脂蛋白A1（ApoA1）、miRNA-106b、三磷酸腺苷结合盒转运子A1（ABCA1）表达变化；同时验证APP 3′UTR 序列中是否包含miRNA-106b的结合位点。结果通过跳台实验发现模型组小鼠记忆功能较对照组有不同程度下降，白藜芦醇干预组小鼠记忆功能较模型组均有不同程度提高（均P＜0.05）；AD小鼠大脑组织中APP表达（1.131±0.035）较正常对照组（0.652±0.026）高，而P62（0.412±0.022）、ApoA1（0.534±0.032）表达较低（均P＜0.05），高、中剂量白藜芦醇处理后可不同程度下调APP水平（0.733±0.018，0.929±0.019，F＝177.733）并升高P62（0.954±0.035，0.633±0.015，F＝434.5）、ApoA1（1.042±0.051，0.824±0.034，F＝286.582）水平（均P＜0.05）。 AD模型组动物脑组织miRNA-106b （0.464±0.314）及ABCA1（0.293±0.042）的表达较正常对照组miRNA-106b（1.064±0.032，F＝238.159）及ABCA1（0.781±0.027，F＝341.61）降低（均P＜0.05），高、中剂量白藜芦醇处理后miRNA-106b（0.843±0.034，0.601±0.012）及ABCA1（0.882±0.025，0.624±0.036）水平有不同程度升高（均P＜0.05）；荧光素酶报告载体实验表明APP 3′UTR序列中包含miRNA-106b的结合位点。结论 APP是miRNA-106b的靶基因之一，白藜芦醇可通过提高AD动物模型中miRNA-106b的表达并降低其靶基因APP的表达，同时可通过提高其他靶基因P62、ApoA1的水平来改善AD情况。这为AD的临床治疗提供了新的理论依据。

关键词：白藜芦醇阿尔茨海默病 miRNA 抗-淀粉样前体蛋白

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子宫颈癌靶向治疗方法及其作用机制研究进展

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中国肿瘤生物治疗杂志 2016年第3期23卷 441-445页

作者：叶蕾罗燕鸿孔丹莉何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广东东莞523808 广东医科大学东莞市环境医学重点实验室广东东莞523808 广东医科大学医学系统生物学研究所广东东莞523808

子宫颈癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,发病率逐年上升且呈年轻化趋势。全球每年新发病例达到50万以上,死亡人数过半。相对于传统的化疗而言,肿瘤的靶向治疗是针对肿瘤细胞中特殊的分子进行的治疗,能特异性地与致癌位点相结合发生作用,... 详细信息

子宫颈癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,发病率逐年上升且呈年轻化趋势。全球每年新发病例达到50万以上,死亡人数过半。相对于传统的化疗而言,肿瘤的靶向治疗是针对肿瘤细胞中特殊的分子进行的治疗,能特异性地与致癌位点相结合发生作用,具有专一性高、疗效好和毒副作用小等明显优越性,因此也将成为未来子宫颈癌治疗的主要趋势。本文总结了近年来国内外子宫颈癌分子靶向治疗研究的现状及其作用机制,旨在为开发更好的抗肿瘤治疗方法和肿瘤靶向治疗的临床应用提供理论依据。

关键词：子宫颈癌分子靶向治疗光动力疗法射频消融术

来源：评论

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miRNAs在不同级别宫颈癌中的差异性表达分析及其临床意义

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国际遗传学杂志 2016年第3期39卷 162-168页

作者：罗燕鸿林娟娟叶蕾孔丹莉何玉清广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广东医科大学医学系统生物学研究所广东省医学分子诊断重点实验室东莞市环境医学重点实验室

宫颈癌是女性常见的恶性肿瘤之一,虽然高危型人乳头瘤病毒持续性感染是导致宫颈癌发生的最主要因素,但是表观遗传学调控在其发展过程中也具有重要作用。研究发现,微小核糖核酸(microRNAs,miRNAs)在不同级别宫颈癌中有明显差异性表达,并... 详细信息

宫颈癌是女性常见的恶性肿瘤之一,虽然高危型人乳头瘤病毒持续性感染是导致宫颈癌发生的最主要因素,但是表观遗传学调控在其发展过程中也具有重要作用。研究发现,微小核糖核酸(microRNAs,miRNAs)在不同级别宫颈癌中有明显差异性表达,并广泛参与了宫颈癌发生的各个生物学过程。本文系统分析了85篇实验性文章中报道的不同阶段宫颈癌组织的miRNAs差异性表达谱,并将其分别归类到宫颈上皮内瘤样病变1-3级(cervical intraepithelial neoplasia,CIN1-3)和宫颈癌4个病理分级中,为评价miRNAs在宫颈癌早期诊断和预后监测中的临床应用价值提供了科学的理论依据。

关键词：宫颈癌微小核糖核酸差异性表达

来源：评论

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