检索结果-内蒙古大学图书馆

大连海洋大学学报 2024年第2期39卷 215-224页

作者：梁祖銮赵吉臣廖敏泽孙成波广东海洋大学水产学院广东湛江524088 广东省农业科学院动物科学研究所广东省畜禽育种与营养研究重点实验室农业农村部华南动物营养与饲料重点实验室广东广州510640 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088

为探究中国花鲈(Lateolabrax maculatus)不同生长阶段肠道和养殖环境微生物组成,选择3月龄(小规格组,体质量为79.89 g±14.97 g)、6月龄(中规格组,体质量为212.67 g±30.32 g)和9月龄(大规格组,体质量为427.56 g±69.56 g)... 详细信息

为探究中国花鲈(Lateolabrax maculatus)不同生长阶段肠道和养殖环境微生物组成,选择3月龄(小规格组,体质量为79.89 g±14.97 g)、6月龄(中规格组,体质量为212.67 g±30.32 g)和9月龄(大规格组,体质量为427.56 g±69.56 g)3个不同生长阶段的中国花鲈,采集其肠道微生物和环境微生物(养殖水和池塘底泥)进行16S rDNA基因测序数据分析。结果表明:不同月龄的中国花鲈肠道微生物与环境微生物群落结构有较大差异,而不同生长阶段的环境微生物群落结构则无显著性差异(P>0.05);环境微生物中双色藻属(Cyanobium_PCC-6307)作为差异物种,表现出与硝酸盐氮呈负相关;肠道微生物分析显示,门水平上,3月龄和6月龄中国花鲈肠道中厚壁菌门(Firmicutes)丰度低于9月龄中国花鲈,属水平上,3月龄和6月龄中国花鲈肠道中富集的可促进糖利用的鲸杆菌属(Cetobacterium)丰度高于9月龄中国花鲈,罗姆布茨菌属(Romboutsia)肠道微生物差异贡献度最高。研究表明,不同养殖阶段的环境微生物群落结构无显著性差异,不同月龄中国花鲈间的肠道微生物群落结构有显著性差异,中国花鲈肠道微生物群落结构受养殖环境的影响。

关键词：中国花鲈肠道微生物环境微生物池塘底泥

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溶藻弧菌VcrV基因缺失株的构建及生物学特性

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生物工程学报 2022年第8期38卷 3062-3075页

作者：彭新亮简纪常丁燏广东海洋大学水产学院广东湛江524088 信阳农林学院水产学院河南信阳464000 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088

为研究溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统VcrV基因的功能和生物学特性,采用同源重组技术成功构建了溶藻弧菌缺失株ΔVcrV,并用PCR检测其遗传稳定性。结果显示,缺失株遗传稳定;与野生株相比,生长和自凝集能力无显著变化;但生物膜形成能力降低,半致死... 详细信息

为研究溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统VcrV基因的功能和生物学特性,采用同源重组技术成功构建了溶藻弧菌缺失株ΔVcrV,并用PCR检测其遗传稳定性。结果显示,缺失株遗传稳定;与野生株相比,生长和自凝集能力无显著变化;但生物膜形成能力降低,半致死剂量升高16.5倍;游动性和涌动性极显著升高,细胞粘附能力极显著降低(P<0.01),对H_(2)O_(2)和NaCl的耐受性降低;对头孢呋辛、麦迪霉素、克林霉素抗生素敏感度上升,对丁胺卡那、多粘菌素B抗生素敏感度降低;活性氧含量极显著降低(P<0.01),脯氨酸、肽聚糖、β-内酰胺酶、过氧化氢酶、超氧化物歧化酶、谷胱甘肽过氧化物酶指标均极显著升高(P<0.01)。缺失株生物学特性表明,VcrV基因参与溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统性的致病性和多种生物学功能。

关键词：溶藻弧菌 Ⅲ型分泌系统 VcrV基因缺失株生物学特性

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卵形鲳鲹生物学及繁养殖技术研究进展

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大连海洋大学学报 2025年第1期40卷 1-11页

作者：陈华谱广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东省海水养殖生物育种工程实验室广东湛江524088 广东省农业技术推广中心广东广州510520

卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)是海水网箱、深远海大型化设施养殖的优良品种。近年来,中国卵形鲳鲹养殖业快速发展,卵形鲳鲹繁养殖关键技术获得突破,但其基础生物学及遗传育种研究相对薄弱导致的养殖性能下降等问题已成为产业可持续发... 详细信息

卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)是海水网箱、深远海大型化设施养殖的优良品种。近年来,中国卵形鲳鲹养殖业快速发展,卵形鲳鲹繁养殖关键技术获得突破,但其基础生物学及遗传育种研究相对薄弱导致的养殖性能下降等问题已成为产业可持续发展的瓶颈。为揭示产业研究发展现状,本文综述了卵形鲳鲹的生物学特征,包括资源分布、栖息环境、形态及和繁殖生物学特征等,总结了近年来相关人工繁育与养殖、生理生态、遗传学等方面的研究成果,并结合卵形鲳鲹资源开发、养护及发展前景提出了未来的研究方向,包括良种选育、基础遗传机制、性腺发育调控机制及新品系开发4个方面,以期为未来卵形鲳鲹产业的稳定发展提供有益参考。

关键词：卵形鲳鲹生物学繁育养殖

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斜带石斑鱼BAG-1基因克隆及表达分析

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南方农业学报 2022年第5期53卷 1399-1406页

作者：李星吴子杰温依铭刘结红蔡佳简纪常广东海洋大学水产学院广东湛江524088 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088 广东省水产经济动物病害控制重点实验室广东湛江524088

【目的】明确斜带石斑鱼(Epinephelu coioides)BAG-1基因(EcBAG-1)的结构特征、组织表达分布及在脂多糖(LPS)和聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后的表达变化,进一步揭示鱼类BAG-1在病原感染中的作用机制,也为了解鱼类的抗病免疫提供参考依据。... 详细信息

【目的】明确斜带石斑鱼(Epinephelu coioides)BAG-1基因(EcBAG-1)的结构特征、组织表达分布及在脂多糖(LPS)和聚肌胞苷酸(PolyI:C)刺激后的表达变化,进一步揭示鱼类BAG-1在病原感染中的作用机制,也为了解鱼类的抗病免疫提供参考依据。【方法】依据EcBAG-1基因EST序列设计特异性引物克隆EcBAG-1基因,通过SMART、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL、ExPASy、ClustalX及MEGA 5.0等在线软件进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR检测EcBAG-1基因的组织表达特征及其在LPS和PolyI:C刺激后的表达模式。【结果】克隆获得的EcBAG-1基因开放阅读框(ORF)长624 bp,共编码207个氨基酸残基;EcBAG-1蛋白分子量为49.84 kD,理论等电点(pI)为5.18,为疏水性蛋白。EcBAG-1蛋白具有BAG-1家族保守的BAG结构域和UBQ泛素相关结构域,无跨膜结构域,主要分布在细胞质和细胞核,其二级结构中α-螺旋占65.22%、延伸链占10.63%、无规则卷曲占20.29%、β-转角仅占3.86%。EcBAG-1氨基酸序列与大黄鱼的BAG-1氨基酸序列相似性最高(96.62%),亲缘关系最近;与原鸡和热带爪蛙的亲缘关系相对较远,对应的BAG-1氨基酸序列相似性分别为58.45%和57.50%。EcBAG-1基因在斜带石斑鱼的肝脏、胸腺、脾脏、头肾、鳃、皮肤、肌肉、大脑、外周血淋巴细胞及心脏等组织中均有表达,且以在大脑中的相对表达量最高,显著高于在其他组织中的相对表达量(P>0.05,下同);经LPS和PolyI:C刺激24 h后,斜带石斑鱼脾脏中的EcBAG-1基因相对表达量显著上调。【结论】EcBAG-1蛋白含有BAG-1蛋白家族典型的BAG结构域和UBQ结构域,具有与哺乳动物BAG-1相似的生物学功能,即EcBAG-1基因在斜带石斑鱼抵御细菌/病毒感染的过程中发挥重要作用,为深入了解鱼类的抗感染机理拓宽了思路。

关键词：斜带石斑鱼 BAG-1基因病原感染免疫反应表达分析

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尼罗罗非鱼S100A16基因克隆及其功能分析

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南方农业学报 2023年第9期54卷 2614-2623页

作者：陈钊峰苏海明黄瑜鲁义善王蓓简纪常蔡佳广东海洋大学水产学院/广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室/广东省水产经济动物病害控制重点实验室/南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江) 广东湛江524088 广西科学院/广西水产生物技术与现代生态养殖重点实验室广西南宁530007

【目的】研究尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)钙结合蛋白S100A16的结构特征、系统进化关系及组织表达分布情况等,进一步分析S100A16在抗菌免疫中的作用,为深入研究S100A16基因在鱼类免疫防御中的功能提供参考依据。【方法】根据S100... 详细信息

【目的】研究尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)钙结合蛋白S100A16的结构特征、系统进化关系及组织表达分布情况等,进一步分析S100A16在抗菌免疫中的作用,为深入研究S100A16基因在鱼类免疫防御中的功能提供参考依据。【方法】根据S100A16基因序列设计特异性引物克隆尼罗罗非鱼S100A16基因(On-S100A16),构建原核表达载体并采用SMART 4.0、DNAMAN 9.0及MEGA 6.0等在线软件对On-S100A16氨基酸序列进行生物信息学分析。通过实时荧光定量PCR检测On-S100A16在尼罗罗非鱼各组织中的分布情况及无乳链球菌感染后在尼罗罗非鱼各组织中的表达变化,并制备融合蛋白用于孵育尼罗罗非鱼头肾淋巴细胞后,检测炎症相关因子基因的表达情况。【结果】克隆获得的On-S100A16基因编码区长度为276 bp,共编码91个氨基酸残基,含有S100保守结构域。On-S100A16氨基酸序列与斑马拟丽鱼、杂色鳉、大口黑鲈等其他鱼类的S100A16氨基酸序列具有较高的相似度,系统发育进化分析也显示On-S100A16与斑马拟丽鱼S100A16的亲缘关系最近。On-S100A16基因在尼罗罗非鱼的各组织中广泛表达,在肝脏组织中的相对表达量最高;经无乳链球菌感染后,On-S100A16基因在尼罗罗非鱼脑、肠道和脾脏组织中的表达量呈上调趋势,且均在感染24 h后达峰值。成功制备融合蛋白S100A16后用于孵育头肾淋巴细胞,实时荧光定量PCR检测结果表明,抗炎因子基因IL-4和TLR1的相对表达量极显著上调(P<0.01,下同),促炎因子基因IL-6和TNF-α的相对表达量则极显著下调。【结论】On-S100A16氨基酸序列含有S100蛋白家族典型的S100结构域,其可能具有与其他S100蛋白相似的生物学功能。On-S100A16通过调控淋巴细胞活性来参与尼罗罗非鱼的抗菌免疫反应。

关键词：尼罗罗非鱼 S100A16 融合蛋白淋巴细胞抗菌免疫

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军曹鱼响应低氧胁迫转录组SNP位点鉴定及其功能注释分析

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海洋学报 2022年第1期44卷 113-124页

作者：杨二军杨林桐王维政黄建盛张健东王忠良陈刚广东海洋大学水产学院广东湛江524088 南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江) 广东湛江524025 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088

为了研究低氧胁迫下军曹鱼肠道转录组中单核苷酸多态性(SNP)标记位点及SNP所在基因SNP-Unigene的作用,通过SOAPsnp软件对军曹鱼幼鱼对照组和低氧胁迫转录组测序结果进行SNP检测,并将其比对到GO、KOG、KEGG数据库进行功能注释。结果显示... 详细信息

为了研究低氧胁迫下军曹鱼肠道转录组中单核苷酸多态性(SNP)标记位点及SNP所在基因SNP-Unigene的作用,通过SOAPsnp软件对军曹鱼幼鱼对照组和低氧胁迫转录组测序结果进行SNP检测,并将其比对到GO、KOG、KEGG数据库进行功能注释。结果显示,军曹鱼转录组SNP位点分布在26120条SNP-Unigene上,共检测到431845个SNP位点,SNP平均发生频率约为1/171 bp;SNP-Unigene功能注释发现,在低氧胁迫条件下,军曹鱼SNP-Unigene主要涉及信号转导、传染病、癌症和内分泌系统等信号通路。进一步筛选到3417条SNP-Unigene被注释到MAPK信号通路等35条与免疫相关的通路中。基于转录组差异基因分析,检测了其中7个重要免疫通路中18个免疫相关基因的SNP位点分布情况。同时,也检测了HIF-1信号通路中PIK3CA等8个差异基因的SNP位点分布情况。研究结果将为进一步挖掘免疫及低氧相关SNP的分子遗传标记奠定基础,为军曹鱼低氧适应机制的深入研究提供科学参考。

关键词：军曹鱼低氧胁迫转录组测序免疫基因单核苷酸多态性

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抗溶藻弧菌的芽孢杆菌的筛选、鉴定及其生物学特性分析

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饲料研究 2022年第10期45卷 61-65页

作者：王琳晶丁燏广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524000

试验筛选对溶藻弧菌HY9901具有拮抗作用的芽孢杆菌。于广东湛江海域的红树林根部土壤中分离出117株芽孢杆菌,通过初筛和复筛,获得1株对溶藻弧菌HY9901具有较强抑制作用的ZJ2009菌株,对其鉴定以及生物学特性分析。结果显示:ZJ2009菌株为... 详细信息

试验筛选对溶藻弧菌HY9901具有拮抗作用的芽孢杆菌。于广东湛江海域的红树林根部土壤中分离出117株芽孢杆菌,通过初筛和复筛,获得1株对溶藻弧菌HY9901具有较强抑制作用的ZJ2009菌株,对其鉴定以及生物学特性分析。结果显示:ZJ2009菌株为解淀粉芽孢杆菌;在瓶装载量10%~20%,初始pH值6.0~8.0、添加1.5%NaCl的BHI培养基中培养12 h以上生长最佳;该菌株具有广谱抑菌性,无溶血现象,对斑马鱼无毒副作用且具有一定的保护率。研究表明,解淀粉芽孢杆菌用于抑制溶藻弧菌,为弧菌病的防治提供新思路,在水产养殖领域具有开发潜能。

关键词：拮抗作用溶藻弧菌解淀粉芽孢杆菌生物学特性

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马氏珠母贝CD-MPR基因序列特征及其在耐低温品系的选择分析

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南方农业学报 2023年第4期54卷 1224-1234页

作者：韩书雅钟如卓伍灵君宋欣霖赖卓欣郑哲王庆恒广东海洋大学水产学院广东湛江524088 广东省珍珠科技创新中心/广东省海水养殖生物育种工程实验室/广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088

【目的】明确马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)阳离子依赖性甘露糖-6-磷酸受体(CD-MPR)基因(PmCD-MPR)多态性与其低温耐受能力的相关性,为马氏珠母贝耐低温品系的选育提供理论依据。【方法】采用RACE克隆PmCD-MPR基因序列全长,并... 详细信息

【目的】明确马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)阳离子依赖性甘露糖-6-磷酸受体(CD-MPR)基因(PmCD-MPR)多态性与其低温耐受能力的相关性,为马氏珠母贝耐低温品系的选育提供理论依据。【方法】采用RACE克隆PmCD-MPR基因序列全长,并运用实时荧光定量PCR检测PmCD-MPR基因在马氏珠母贝各组织及低温胁迫下的表达模式;基于马氏珠母贝耐低温选育系(R群体)和北部湾野生群体(W群体)的全基因组重测序数据筛选出PmCD-MPR基因外显子区的SNP位点,并通过遗传多态性分析、单倍型分析及频率计算获取与马氏珠母贝低温胁迫过程相关的SNP位点。【结果】PmCD-MPR基因序列全长902 bp,其开放阅读框(ORF)为792 bp,共编码263个氨基酸残基;PmCD-MPR基因编码蛋白分子量为30.22 kD,理论等电点(pI)为5.79,属于亲水性蛋白,在第18~263位氨基酸处含有1个典型的甘露糖-6-磷酸受体(Man-6-P_recep)结构域。CD-MPR氨基酸序列在N端的相似性较低,在C端的相似性较高;基于CD-MPR氨基酸相似性构建的系统发育进化树显示,马氏珠母贝与长牡蛎、加利福尼亚海兔等软体动物聚为一支,与经典的动物学分类相吻合。PmCD-MPR基因在马氏珠母贝肝胰腺的相对表达量最高,显著高于在性腺、闭壳肌和外套膜中的相对表达量(P<0.05,下同);低温胁迫组马氏珠母贝鳃组织中的PmCD-MPR基因相对表达量随着胁迫时间的延长整体上呈先上升后下降的变化趋势。从PmCD-MPR基因外显子区筛选获得34个SNPs位点,且这34个SNPs位点构成5个单倍块和15种单倍型,其中GCC、TG、CCCTCT等3种单倍型在R群体中的分布频率显著高于W群体,即与马氏珠母贝耐低温性状显著相关。【结论】PmCD-MPR基因参与马氏珠母贝的低温响应过程,与耐低温性状显著相关的基因型及单倍型可作为马氏珠母贝耐低温品系辅助育种的候选分子标记。

关键词：马氏珠母贝 PmCD-MPR基因低温耐受 SNP位点选择分析

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鰤鱼诺卡氏菌多重PCR分型方法的建立与应用

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大连海洋大学学报 2024年第6期39卷 956-967页

作者：李雨豪陈宝鑫费晴林冠英黄婷夏立群广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088 广东海洋大学深圳研究院广东省水生动物健康评估工程技术研究中心深圳海水经济动物种苗健康评价公共技术服务平台广东深圳518120 广西壮族自治区水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室广西南宁530021

为建立一种鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)多重PCR的分型方法,对已公布的20个鰤鱼诺卡氏菌全基因组数据进行对比分析,筛选鰤鱼诺卡氏菌种内差异基因片段并设计PCR引物,经单重PCR验证确认后进行引物组合、引物配比优化,构建鰤鱼诺卡氏... 详细信息

为建立一种鰤鱼诺卡氏菌(Nocardia seriolae)多重PCR的分型方法,对已公布的20个鰤鱼诺卡氏菌全基因组数据进行对比分析,筛选鰤鱼诺卡氏菌种内差异基因片段并设计PCR引物,经单重PCR验证确认后进行引物组合、引物配比优化,构建鰤鱼诺卡氏菌的多重PCR菌株分型方法,并对该菌株分型方法进行灵敏度分析和病例应用。结果表明:在试验中构建的多重PCR菌株分型方法可用于鰤鱼诺卡氏菌培养物和感染鱼样分型,并确认鰤鱼诺卡氏菌ArsC、AraC、ISOPREN、ALAT、IclR基因片段具有种内差异;其中多重PCR引物组合Ⅰ(ISOPREN-F/R、ALAT-F/R、IclR-F/R)引物最优配比为ISOPREN-F/R∶ALAT-F/R∶IclR-F/R=2∶1∶2,灵敏度达125 pg/μL,组合Ⅱ(AraC-F/R、ALAT-F/R、IclR-F/R)引物最佳配比为AraC-F/R∶ALAT-F/R∶IclR-F/R=1∶1∶1,灵敏度达500 pg/μL,组合Ⅲ(ArsC-F/R、ALAT-F/R、IclR-F/R)引物最佳配比为ArsC-F/R∶ALAT-F/R∶IclR-F/R=1∶2∶2,灵敏度达500 pg/μL。研究表明,本研究中建立的鰤鱼诺卡氏菌的多重PCR菌株分型方法,可在1~2 h内完成鰤鱼诺卡氏菌的菌株分型鉴定,为水产实践中鰤鱼诺卡氏菌感染病例的菌株分型提供了快速、准确、实用的鉴定方法,可助力鱼类诺卡氏菌病的防控。

关键词：鰤鱼诺卡氏菌多重PCR 菌株分型

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利用酵母双杂交系统筛选与鉴定石斑鱼EcBAG3互作因子

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生物技术通报 2022年第8期38卷 77-83页

作者：蔡佳梁振宇黄瑜鲁义善施钢简纪常广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东省水产经济动物病害控制重点实验室南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)湛江524088 广西科学院广西北部湾海洋研究中心广西海洋天然产物与组合生物合成化学重点实验室南宁530007

以参与石斑鱼抗病毒免疫反应的EcBAG3蛋白为研究对象,采用酵母双杂交等技术筛选与鉴定EcBAG3的互作蛋白。首先构建了石斑鱼脾脏细胞的酵母双杂交cDNA文库,文库的容量为5.6×10^(6) CFU,插入片段的平均长度在750 bp以上,重组率为100... 详细信息

以参与石斑鱼抗病毒免疫反应的EcBAG3蛋白为研究对象,采用酵母双杂交等技术筛选与鉴定EcBAG3的互作蛋白。首先构建了石斑鱼脾脏细胞的酵母双杂交cDNA文库,文库的容量为5.6×10^(6) CFU,插入片段的平均长度在750 bp以上,重组率为100%。进一步利用此文库筛选EcBAG3的互作因子,初步得到了83个阳性克隆。对这些克隆进行测序与一对一互作验证,最终获得7个候选互作蛋白,功能预测结果显示,互作蛋白涉及免疫调控、转录调节、胁迫响应、信号转导等方面的功能,为进一步解析石斑鱼BAG3在病毒感染中的作用机制奠定了基础。

关键词：石斑鱼酵母双杂交 BAG3 互作蛋白

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