检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2019年第7期17卷 2109-2116页

作者：郭栋梁翟世博王静韩冬梅潘学文李玲李建光广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广州510640 华南师范大学生命科学学院广东省植物生物工程重点实验室广州510631

龙眼LonGID1基因编码赤霉素(gibberellin, GA)受体,是赤霉素信号途径中一个非常关键的调节基因。本研究的主要目的是探讨龙眼GA信号受体基因LonGID1的功能初步分析。通过将克隆得到的龙眼LonGID1基因转入拟南芥Atgid1b/c缺失突变,野生... 详细信息

龙眼LonGID1基因编码赤霉素(gibberellin, GA)受体,是赤霉素信号途径中一个非常关键的调节基因。本研究的主要目的是探讨龙眼GA信号受体基因LonGID1的功能初步分析。通过将克隆得到的龙眼LonGID1基因转入拟南芥Atgid1b/c缺失突变,野生型植株中,观察其表型变化及GA信号途径中上下游基因的变化。结果表明:(1) Atgid1b/c缺失突变株系种子萌发率明显低于哥伦比亚野生型株系(columbia, Col-0);Atgid1 b/c×35S::LonGID1缺失突变恢复株系种子萌发率与Atgid1b/c缺失突变株系相比明显提高。10 nmol/L的GA处理可以提高4个拟南芥株系的萌发率,但是GA处理Atgid1b/c缺失突变株系种子萌发率仍然明显低于其他株系。5 nmol/L多效唑(Paclobutrazol, PAC)处理显著降低4个拟南芥株系的萌发率。(2) Atgid1b/c缺失突变株系花苞发育的时间比Atgid1 b/c×35S::LonGID1缺失突变恢复株系推迟约13～14 d。Atgid1 b/c×35S::LonGID1缺失突变恢复株系花苞发育的时间与Col-0野生型株系相比提前约5～6 d,35S::LonGID1超表达株系花苞发育的时间与Col-0野生型株系相比提前4～5 d。10 nmol/L的GA处理,35S::LonGID1超表达植株的花苞发育时间与Col-0野生型相比提前了5～6 d,Atgid1 b/c×35S::LonGID1缺失突变恢复株系的花苞发育时间与Atgid1b/c缺失突变株系相比提前了5～6 d。5 nmol/L的PAC处理使各株系花苞发育时间推迟。(3)GA处理Col-0野生型株系,AtGA4、AtSOC1、AtLFY、AtFT、AtGID1和AtGAI的表达变化明显;这种表达变化会因为GA受体基因Atgid1b/c的缺失而降低,而龙眼的LonGID1基因可以弥补拟南芥GA受体基因Atgid1b/c的缺失而引起的GA作用效果的降低。龙眼LonGID1基因功能的分析,对于我们了解龙眼GA信号传导途径具有积极的意义,也有助于我们更好的利用GA来调控龙眼的生长发育过程,为在生产上指导农户合理利用GA提供理论基础。

关键词： LonGID1 龙眼(Dimocarpus longan Lour.) 表型

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黄皮转录组SSR挖掘及其可用性分析

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园艺学报 2018年第1期45卷 149-158页

作者：陆育生陈喆常晓晓邱继水林志雄潘建平广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学及遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室广州510640

利用MISA软件筛选黄皮(Clausena lansium)转录组测序获得的68 998条Unigene,共检测出单核苷酸至六核苷酸重复类型的SSR位点11 825个,分布于11 000条Unigene中,出现频率为17.14%,平均分布距离为4.41 kb。6种SSR位点类型中主要为单、二、... 详细信息

利用MISA软件筛选黄皮(Clausena lansium)转录组测序获得的68 998条Unigene,共检测出单核苷酸至六核苷酸重复类型的SSR位点11 825个,分布于11 000条Unigene中,出现频率为17.14%,平均分布距离为4.41 kb。6种SSR位点类型中主要为单、二、三个核苷酸重复,分别占总SSR位点的41.48%、24.92%和27.53%。11 825个SSR位点中共发现207种重复基序,重复次数在4~24次之间,其中出现频率高的基序有A/T、AG/CT、AT/AT、AAG/CTT和AAT/ATT。位点序列长度分布在12~25 bp之间,其中12~15 bp最多,占50.95%(6 025个SSR位点)。通过Primer 3设计得到6 102对SSR引物,随机选择30对引物进行多态性验证分析,结果显示24对有效扩增引物中,13对引物在16份不同黄皮种质中表现出多态性。以上结果表明,黄皮转录组测序产生的Unigene信息可作为开发SSR标记的有效来源,开发的大批量SSR标记可为黄皮种质资源遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更加丰富可靠的标记选择。

关键词：黄皮转录组 SSR 可用性分析

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荔枝新品种——北园绿

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中国果业信息 2019年第1期36卷 65-66页

作者：刘伟向旭农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室广东省农业科学院果树研究所广州510640

“北园绿”是从增城荔枝实生变异单株中选育的优质荔枝新品种。2017年12月通过广东省农作物品种审定委员会审定,审定编号为粤审果20180002。该品种果实歪心形或扁歪心形,果肩平或一边略高,果顶浑圆,果皮红中带黄绿,鲜艳多彩。龟裂片平,... 详细信息

“北园绿”是从增城荔枝实生变异单株中选育的优质荔枝新品种。2017年12月通过广东省农作物品种审定委员会审定,审定编号为粤审果20180002。该品种果实歪心形或扁歪心形,果肩平或一边略高,果顶浑圆,果皮红中带黄绿,鲜艳多彩。龟裂片平,排列不规则,裂片峰钝圆,裂纹深度浅、宽度中等。果实纵径3.1~3.4cm,果实横径3.4~3.8cm,平均单果重25.8g。

关键词：农作物品种审定委员会荔枝果实横径平均单果重变异单株裂纹深度广东省裂片

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黄皮转录组密码子使用偏好性分析

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分子植物育种 2018年第18期16卷 5904-5913页

作者：陆育生彭程陈喆常晓晓邱继水林志雄潘建平广东省农业科学院果树研究所广东省热带亚热带果树研究重点实验室农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广州510640

为全面了解黄皮(Clausena lansium)表达基因的密码子使用特点,以转录组测序获得的12 696条编码蛋白基因序列为数据来源,利用CodonW 14.4软件对其密码子碱基组成以及有效密码子数(effective number of codon, ENC)、同义密码子相对使用频... 详细信息

为全面了解黄皮(Clausena lansium)表达基因的密码子使用特点,以转录组测序获得的12 696条编码蛋白基因序列为数据来源,利用CodonW 14.4软件对其密码子碱基组成以及有效密码子数(effective number of codon, ENC)、同义密码子相对使用频率(relative frequency of synonymous codon, RFSC)等密码子使用参数进行计算和统计,发现黄皮表达基因密码子的平均GC含量为0.448,同义密码子第3位核苷酸的平均GC含量(GC3S)为0.400。表达基因整体的ENC取值为56.5,其中绝大部分的ENC值大于35,说明黄皮表达基因密码子使用偏好性程度整体水平较低。通过高频密码子分析法确定了GCU、AGA、AAU、GAU、AUU、UUU、UCU、CAU、CUU、UUG和GUU 11个高频密码子。将黄皮的密码子使用频率与人、小鼠、果蝇、酵母、大肠杆菌5种模式生物以及拟南芥、水稻、葡萄、草莓4种不同类型植物进行比较,发现其与果蝇和大肠杆菌存在较大差异,而与拟南芥和葡萄基本一致。以上研究结果对黄皮基因合适表达系统的选择以及外源基因在黄皮中的高效表达具有重要指导意义。

关键词：黄皮转录组密码子用法高频密码子密码子偏好性

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1-甲基环丙烯保鲜贴纸延缓香蕉后熟衰老进程的研究

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食品安全质量检测学报 2019年第9期10卷 2527-2532页

作者：孟祥春黄泽鹏凡超向旭广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广州510640

目的研究新型1-甲基环丙烯(1-methylcyclopropene, 1-MCP)保鲜贴纸在延长黄熟香蕉货架期方面的应用。方法分析1-MCP保鲜贴纸对黄熟蕉的后熟阶段值、硬度、果实呼吸速率、乙烯释放速率等后熟衰老指标、果实外观色泽和品质变化指标的影响... 详细信息

目的研究新型1-甲基环丙烯(1-methylcyclopropene, 1-MCP)保鲜贴纸在延长黄熟香蕉货架期方面的应用。方法分析1-MCP保鲜贴纸对黄熟蕉的后熟阶段值、硬度、果实呼吸速率、乙烯释放速率等后熟衰老指标、果实外观色泽和品质变化指标的影响。结果 1-MCP保鲜贴纸可明显延长黄熟蕉的货架期3 d,一定程度地减缓呼吸速率和乙烯释放速率,延缓硬度下降,延迟衰老梅花点的出现,但1-MCP保鲜贴纸对果肉可溶性固形物、可滴定酸及维生素C含量没有显著影响(P>0.05)。结论乙烯催熟后的黄熟香蕉可采用1-MCP保鲜贴纸延长运输及货架销售期,降低黄熟蕉由于快速后熟衰老软化造成的经济损失,提高商品价值。

关键词： 1-甲基环丙烯保鲜贴纸黄熟香蕉货架期后熟衰老硬度

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香蕉对枯萎病的抗性机制研究现状与展望

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园艺学报 2018年第9期45卷 1661-1674页

作者：邵秀红窦同心林雪茜盛鸥邓贵明毕方铖胡春华李春雨易干军杨乔松湖南农业大学园艺园林学院长沙410128 广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室广州510640

重点对香蕉抗枯萎病的细胞生物学机制、激素及信号传导途径、抗病基因分离鉴定以及基于多组学挖掘香蕉抗枯萎病基因的策略等方面的研究进行概述,以期为进一步揭示香蕉对枯萎病的抗性机制研究提供参考。

关键词：香蕉枯萎病抗性机制

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‘棱尖橄榄’绿色生产技术

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热带农业科学 2019年第11期39卷 44-48页

作者：肖维强黄妙胜赖多匡石滋刘传和邵雪花贺涵广东省农业科学院果树研究所/农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室/广东省热带亚热带果树研究重点实验室广东广州510640 广东省饶平县三妙种养有限公司广东饶平515735

‘棱尖橄榄’已获得农业部颁发的“绿色食品标志”认证证书,是2019年广东省农业主导品种。本文总结了‘棱尖橄榄’绿色食品A级标准的生产技术,主要包括:基地选择,建园,定植,高接换种,栽培管理,病虫害防治,果实采收与包装,果园生产档案管理.

关键词：棱尖橄榄绿色食品生产技术

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龙眼顶芽转录组简单重复序列(SSR)标记信息分析及分子标记开发

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植物生理学报 2018年第5期54卷 863-871页

作者：郭栋梁王静韩冬梅潘学文李建光广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广州510641

随着新一代测序技术的发展,大量的转录组数据和表达序列标签(EST)成为开发简单重复序列(SSR)标记的可利用资源。本研究利用MISA软件筛选龙眼(Dimocarpus longan)顶芽转录组数据库序列,从114 445条龙眼转录组unigene序列中发现11 546个SS... 详细信息

随着新一代测序技术的发展,大量的转录组数据和表达序列标签(EST)成为开发简单重复序列(SSR)标记的可利用资源。本研究利用MISA软件筛选龙眼(Dimocarpus longan)顶芽转录组数据库序列,从114 445条龙眼转录组unigene序列中发现11 546个SSR位点,SSR出现频率为10.09%。其中1 975条unigene含有两个或两个以上EST-SSR位点,占所有SSR位点的比例为17.10%,SSR出现的平均距离为7.52 kb。从龙眼转录组SSR核苷酸基序类型来看,二核苷酸(52.11%)和三核苷酸(46.15%)出现频率最高,占所有核苷酸出现频率的99.26%。在龙眼转录组SSR中二核苷酸重复基元出现频率最高的是AG/CT(4 250个,占36.81%),三核苷酸重复基元出现频率最高的是AAG/CTT(1 109个,占9.61%)。对含SSR位点的9 571条unigene序列进行引物设计,共设计出了8 347对SSR位点特异引物。随机挑选合成50对EST-SSR引物,以‘石硖’、‘储良’、‘古山2号’、‘立冬本’等四份龙眼材料的基因组DNA为模板对这批引物进行PCR扩增、筛选,结果表明,其中21对引物能产生理想的PCR产物,有效扩增率为42%;16对引物扩增条带具有多态性,占有效引物的76.2%;16对多态性引物共扩增获得50个条带,其中多态性片段21个,每对引物平均产生1.31个多态性片段。

关键词：龙眼转录组 SSR

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五乙烯六胺改性柿单宁金属吸附剂对Pd(Ⅱ)的吸附回收

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环境化学 2019年第8期38卷 1775-1784页

作者：闵慧玉易庆平樊睿怡洪星星张青林罗正荣华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室武汉430070 荆楚理工学院生物工程学院荆门448000 广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广州510640 黄冈师范学院大别山特色资源开发湖北省协同创新中心黄冈438000

为提高柿单宁金属吸附剂对贵金属Pd(Ⅱ)的吸附能力,采用五乙烯六胺(PEHA)改性柿粉甲醛树脂(PPFR),获得新型柿单宁金属吸附剂PH-PPFR.通过静态吸附、动态吸附以及SEM、FTIR、XRD和XPS等表征手段探讨其对Pd(Ⅱ)的吸附效应.结果表明,不同... 详细信息

为提高柿单宁金属吸附剂对贵金属Pd(Ⅱ)的吸附能力,采用五乙烯六胺(PEHA)改性柿粉甲醛树脂(PPFR),获得新型柿单宁金属吸附剂PH-PPFR.通过静态吸附、动态吸附以及SEM、FTIR、XRD和XPS等表征手段探讨其对Pd(Ⅱ)的吸附效应.结果表明,不同酸性溶液中改性后PH-PPFR对Pd(Ⅱ)的吸附量均显著高于未改性PPFR,PH-PPFR在盐酸浓度高达4.0mol·L^-1的条件下仍有较强吸附能力.PH-PPFR对Pd(Ⅱ)的吸附过程符合拟二级吸附动力学过程;等温线数据对Langmuir模型线性拟合系数R^2均达到0.999,理论吸附最大值为263.16mg·g^-1.模拟线路板含钯液柱吸附-解吸附结果显示PH-PPFR对Pd(Ⅱ)的吸附具有极高的选择性,吸附后的Pd(Ⅱ)很容易被酸性硫脲洗脱.结合表征分析,推测吸附机理主要为表面螯合和氧化还原反应,同时受到阴离子交换反应及静电作用的影响,胺基基团和酚羟基为主要参与官能团.PH-PPFR制备方法简单、易行,对Pd(Ⅱ)表现出高吸附容量和选择吸附性,可实现盐酸体系下对电子废物酸浸液中贵金属Pd(Ⅱ)的高效富集和分离.

关键词：柿单宁生物吸附剂五乙烯六胺钯电子垃圾

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三倍体香蕉优良品种‘Grand Nain’全基因组变异挖掘

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植物生理学报 2018年第4期54卷 581-593页

作者：邵秀红胡春华盛鸥毕方铖邓贵明杨乔松易干军湖南农业大学园艺园林学院长沙410128 广东省农业科学院果树研究所农业部南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室广东省热带亚热带果树研究重点实验室广州510640

为全面揭示香蕉(Musa spp.)优良品种的全基因组变异类型,本研究采用高通量重测序技术,对当前香蕉主栽品种‘Grand Nain’(AAA group,Cavendish subgroup)开展全基因组重测序,测序深度53.79 X。与野生香蕉‘DH-Pahang’参考基因组比对,... 详细信息

为全面揭示香蕉(Musa spp.)优良品种的全基因组变异类型,本研究采用高通量重测序技术,对当前香蕉主栽品种‘Grand Nain’(AAA group,Cavendish subgroup)开展全基因组重测序,测序深度53.79 X。与野生香蕉‘DH-Pahang’参考基因组比对,共检测到4 598 633个单核苷酸多态位点(SNP),484 752个小片段插入缺失位点(Indel),57 047个结构变异(SV),共导致36 277个基因变异;代谢通路分析(KEGG)发现,植物激素信号转导途径相关基因的变异最多,存在442个基因变异,其中乙烯合成和信号转导途径中1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶基因(ACO)、1-氨基环丙烷-1-羧酸合成酶基因(ACS)、EIN3/EILs、ERS、RAN、EBF、EIN2等基因都存在变异。特别是序列分析发现‘Grand Nain’中的Ma ACO1基因与参考基因组相比存在2个变异位点并导致氨基酸的突变,且在A和B基因组中MaACO1基因存在2个相邻的变异位点。本研究为香蕉贮藏保鲜等相关分子标记开发、基因功能研究,以及基于基因组编辑技术的香蕉遗传改良提供依据。

关键词：香蕉全基因组重测序单核苷酸多态小片段插入缺失结构变异基因变异

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