检索结果-内蒙古大学图书馆

水产学报 2024年第11期48卷 44-56页

作者：宦章李东宇李伟豪高进王中铎潘志董忠典广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江 524088 北京市水产技术推广站北京 100176 海南热带海洋学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室海南三亚 572022 广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江 524088 广东海洋大学广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室广东湛江 524088

为深入解析苏氏圆腹䰶的遗传信息和开展基因功能研究,本实验分别提取性成熟苏氏圆腹䰶脑、鳃、心脏、肝脏、脾脏、头肾、胃、肠、性腺和肌肉组织的总RNA,等质量混合为一个样本后,利用PacBio高通量测序平台单分子实时测序技术对其进行了测... 详细信息

为深入解析苏氏圆腹䰶的遗传信息和开展基因功能研究,本实验分别提取性成熟苏氏圆腹䰶脑、鳃、心脏、肝脏、脾脏、头肾、胃、肠、性腺和肌肉组织的总RNA,等质量混合为一个样本后,利用PacBio高通量测序平台单分子实时测序技术对其进行了测序分析,获得了性成熟苏氏圆腹䰶各组织的全长转录组信息.结果显示,在苏氏圆腹䰶中共获得 1 487 336 条高质量reads,平均长度和N50 分别为 83 592 和 162 901 bp;校正后共获得1005955 条循环一致序列(circular consensus sequencing,CCS),过滤后共鉴定出667973条含有polyA结构的全长非嵌合序列(full-length non-concatemer,FLNC)序列,平均长度和N50 分别为 2 057 和 2 359 bp.614 078 条(91.93%)FLNC用于基因和转录本的注释,鉴定到的 19 835 个已知基因对应 80 915 个转录本,9 348 个新基因对应 9 954 条新转录本,预测到 50 311 个开放阅读框、79 922 个可变剪接、18 个融合基因和 20 215 个选择性多聚腺苷酸化位点.新基因在NR、GO、KEGG、KOG和SwissProt数据库中分别有3912、2385、2 167、81 和 1 520 个获得注释.另外,还预测到 4 624 个长链非编码RNA,调控 32 283个靶mRNA.研究表明,通过全长转录组测序数据及功能注释分析,丰富了苏氏圆腹䰶的遗传资源信息.本研究可为进一步开展苏氏圆腹䰶生物学特性、基因功能研究提供基础.

关键词：苏氏圆腹䰶全长转录组基因功能可变剪切长链非编码RNA

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金钱鱼孕激素受体基因的克隆、鉴定与表达研究

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水产科学 2022年第1期41卷 23-34页

作者：石红娟黄健旋朱晨阳吴佳钢何飞祥江东能黄洋朱春华李广丽广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东省普通高校重点实验室广东湛江524088 广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东湛江524088 湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室广东湛江524088

核受体(Pgr),隶属于核受体超家族,由核受体亚家族3C组成员3基因编码。孕酮通过结合Pgr介导其在脊椎动物繁殖过程中的生理学功能,因此,研究金钱鱼核受体基因(pgr基因)在不同组织及不同发育时期性腺中的表达模式,有助于为金钱鱼的繁殖提... 详细信息

核受体(Pgr),隶属于核受体超家族,由核受体亚家族3C组成员3基因编码。孕酮通过结合Pgr介导其在脊椎动物繁殖过程中的生理学功能,因此,研究金钱鱼核受体基因(pgr基因)在不同组织及不同发育时期性腺中的表达模式,有助于为金钱鱼的繁殖提供理论依据。笔者克隆金钱鱼的pgr基因,用Megalign软件比较Pgr氨基酸同源性,用MEGA 7.0.4软件构建系统进化树,利用反转录PCR和实时荧光定量PCR分别探究pgr mRNA在金钱鱼各组织和性腺发育过程中的表达。金钱鱼pgr基因的开放阅读框(ORF)的长度为2016 bp,共编码671个氨基酸。氨基酸序列相似性分析发现,它与同属一个分支的鲈形目大黄鱼同源性最高。组织分布结果显示,pgr基因在雌、雄金钱鱼各组织中均有表达,且性腺、垂体中的表达最高。在垂体中,外源雌激素17β-雌二醇(E2)能显著升高pgr基因的表达。此外,随着性腺的发育,pgr基因在性成熟金钱鱼精巢、卵巢中的表达量最高。因此,Pgr对金钱鱼的生殖细胞发育成熟可能十分重要。

关键词：金钱鱼孕酮核受体基因表达模式性腺发育

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西施舌代谢物对单细胞藻类的促生长作用研究

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安徽农业科学 2022年第14期50卷 87-91页

作者：罗杰王中铎姚泽彬广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025

在实验室条件下,按规格将西施舌分为A[(2.67±0.12)cm]、B[(4.43±0.24)cm]、C[(6.42±0.27)cm]、D[(8.38±0.18)cm]和E[(10.16±0.27)cm]5组,研究了西施舌代谢物对湛江等鞭金藻、牟氏角毛藻、亚心形扁藻及波吉卵囊... 详细信息

在实验室条件下,按规格将西施舌分为A[(2.67±0.12)cm]、B[(4.43±0.24)cm]、C[(6.42±0.27)cm]、D[(8.38±0.18)cm]和E[(10.16±0.27)cm]5组,研究了西施舌代谢物对湛江等鞭金藻、牟氏角毛藻、亚心形扁藻及波吉卵囊藻4种单胞藻生长的影响。结果表明:西施舌代谢物对4种单胞藻的生长具有明显的促进作用,对不同种类单胞藻的促生长效果也存在较大差异。西施舌代谢物对湛江等鞭金藻、牟氏角毛藻的促生长作用明显优于亚心形扁藻和波吉卵囊藻;由于不同规格的西施舌排泄量不同,因而其对单胞藻的促生长效果差异极显著(P<0.01)。藻细胞的增长量随着西施舌规格的增大而增大,且D、E组单胞藻的生长维持时间较长,168 h还处于生长期。西施舌的规格与藻细胞的增长量呈正相关,其关系曲线可用Y=aln X+b表示。

关键词：西施舌代谢物单细胞藻类促生长

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雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析

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海洋与湖沼 2020年第5期51卷 1203-1213页

作者：董忠典黎学友廖健张宁郭昱嵩王中铎广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖重点实验室湛江524088

为发掘弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏功能基因、开发环境检测标记基因,本研究采用RNA-Seq技术分别测定了性成熟雌、雄弓背青鳉肝脏转录组,并获得80095044和87043984条clean reads,合并拼接出49912个unigenes(N50=2394bp)。基因表达... 详细信息

为发掘弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏功能基因、开发环境检测标记基因,本研究采用RNA-Seq技术分别测定了性成熟雌、雄弓背青鳉肝脏转录组,并获得80095044和87043984条clean reads,合并拼接出49912个unigenes(N50=2394bp)。基因表达差异分析显示在雌、雄弓背青鳉肝脏组织中存在571个差异基因(DEGs),其中364个在雄鱼中高表达,207个在雌鱼中高表达。GO和KEGG分析表明差异基因主要参与激素合成、免疫反应、氧化还原反应及卵黄发生等生物学过程。进一步,在转录组中筛选到了多个环境雌激素相关标记基因(vtgs,chgs,er,cyp450等),且这些基因在雌鱼肝脏中的表达水平显著高于雄鱼。研究结果丰富了弓背青鳉的基因资源,为研究基因功能提供了数据,也有助于进一步研究鱼类肝脏在不同性别之间的功能。

关键词：弓背青鳉肝脏转录组测序差异基因生物标志物

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马氏珠母贝V-ATPase-d基因序列特征及其与耐低温性状的关系

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水产学报 2024年第9期48卷 87-100页

作者：赖卓欣宋欣霖潘若哲谭又瑄王庆恒广东海洋大学水产学院广东省珍珠科技创新中心广东省海水养殖生物育种工程实验室广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室

液泡ATP酶（V-ATPase）在生物应对各种环境压力时发挥重要功能，为探究VATPase在马氏珠母贝低温适应过程中的作用，实验克隆了马氏珠母贝的V-ATPase-d基因，采用qRT-PCR技术研究了低温胁迫下Pm-V-ATPase-d表达量的变化，并筛选和比较了... 详细信息

液泡ATP酶（V-ATPase）在生物应对各种环境压力时发挥重要功能，为探究VATPase在马氏珠母贝低温适应过程中的作用，实验克隆了马氏珠母贝的V-ATPase-d基因，采用qRT-PCR技术研究了低温胁迫下Pm-V-ATPase-d表达量的变化，并筛选和比较了该基因在耐低温选育系（low temperature resistant line, R） F3和北部湾野生群体（Beibu Gulf wild population, W）外显子区的SNP位点。结果显示，Pm-V-ATPase-d总长为1 473 bp，开放阅读框（ORF）为1140bp，编码379个氨基酸，具有ATP典型的结构域PfamvATPsynt＿AC39。Motif分析及三级结构预测结果表明，Pm-V-ATPase-d具有较高的保守性，其在系统进化树中与长牡蛎聚为一支。组织荧光定量结果显示，Pm-V-ATPase-d在所检测的组织中均有表达，在肝胰腺、性腺和鳃组织中表达量较高。在低温胁迫条件下，Pm-VATPase-d基因的表达量随着时间的延长呈现先上升后下降的趋势，且低温组的表达量在5 d内均显著高于对照组，这表明Pm-V-ATPase-d可能参与了马氏珠母贝对温度胁迫的响应；对Pm-V-ATPase-d外显子区的SNP分析共得到35个SNP，其中34个为同义突变，只有一个位点为非同义突变，26个SNP在W和R群体的不同基因型和等位基因之间具有显著差异，单倍型连锁不平衡分析结果显示，Pm-V-ATPase-d基因SNPs可形成6个单倍体块，14种单倍型，其中单倍型GAAT、CGC、TC、TG、AG与马氏珠母贝耐低温性状显著相关。研究表明，Pm-V-ATPase-d可能是参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因，本研究可为马氏珠母贝对低温的适应机制提供研究基础，筛选出的与抗低温性状相关的SNPs及单倍型可应用于分子辅助育种。

关键词：马氏珠母贝 V-ATPase-d基因单核苷酸多态性低温

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斑鱾dmrt1的克隆及其表达分析

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海洋渔业 2022年第2期44卷 187-200页

作者：温思民翟毅黄洋朱春华李广丽广东海洋大学水产学院广东湛江524088 广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心广东湛江524088 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088 广东省海水养殖生物育种工程实验室广东湛江524088

克隆了斑鱾(Girella punctata)dmrt1(doublesex and mab-3 related transcription factor 1)基因,用DNAMAN 9软件比较了Dmrt1蛋白的氨基酸同源性,用MEGAX软件构建了Dmrt1系统进化树,并应用实时荧光定量PCR方法检测dmrt1 mRNA在斑鱾雌雄性腺和不同胚胎发育阶段的表达。结果显示,斑鱾dmrt1的开放阅读框(ORF)全长894 bp,编码297个氨基酸,氨基酸序列含有典型的DM结构域。斑鱾Dmrt1氨基酸同源性比对分析发现,它与黄金鲈(Perca flavescens)的同源性最高,为85.71%;与人类(Homo sapiens)同源性最低,为32.89%。斑鱾Dmrt1与其他鲈形目鱼类在系统进化树上聚为一支,与传统分类地位一致。斑鱾dmrt1在精巢中有较高表达(P<0.05),在卵巢中微弱表达。此外在胚胎发育过程中,dmrt1的表达水平呈先升后降的趋势,在桑葚期表达水平最高(P<0.05)。综上所述,dmrt1可能参与了斑鱾性腺分化和早期胚胎发育。

关键词：斑鱾 dmrt1 基因克隆性腺胚胎发育

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苏氏圆腹（鱼亡）全长转录组测序

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水产学报 2024年第11期 119-131页

作者：宦章李东宇李伟豪高进王中铎潘志董忠典广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室北京市水产技术推广站海南热带海洋学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室广东海洋大学广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室

为深入解析苏氏圆腹（鱼亡）的遗传信息和开展基因功能研究，本实验分别提取性成熟苏氏圆腹（鱼亡）脑、鳃、心脏、肝脏、脾脏、头肾、胃、肠、性腺和肌肉组织的总RNA，等质量混合为一个样本后，利用PacBio高通量测序平台单分子实时测... 详细信息

为深入解析苏氏圆腹（鱼亡）的遗传信息和开展基因功能研究，本实验分别提取性成熟苏氏圆腹（鱼亡）脑、鳃、心脏、肝脏、脾脏、头肾、胃、肠、性腺和肌肉组织的总RNA，等质量混合为一个样本后，利用PacBio高通量测序平台单分子实时测序技术对其进行了测序分析，获得了性成熟苏氏圆腹（鱼亡）各组织的全长转录组信息。结果显示，在苏氏圆腹（鱼亡）中共获得1 487 336条高质量reads，平均长度和N50分别为83 592和162 901 bp；校正后共获得1 005 955条循环一致序列(circular consensus sequencing,CCS)，过滤后共鉴定出667 973条含有polyA结构的全长非嵌合序列(full-length non-concatemer,FLNC)序列，平均长度和N50分别为2 057和2 359 bp。614 078条(91.93%) FLNC用于基因和转录本的注释，鉴定到的19 835个已知基因对应80 915个转录本，9 348个新基因对应9 954条新转录本，预测到50 311个开放阅读框、79 922个可变剪接、18个融合基因和20 215个选择性多聚腺苷酸化位点。新基因在NR、GO、KEGG、KOG和SwissProt数据库中分别有3 912、2 385、2 167、81和1 520个获得注释。另外，还预测到4 624个长链非编码RNA，调控32 283个靶mRNA。研究表明，通过全长转录组测序数据及功能注释分析，丰富了苏氏圆腹（鱼亡）的遗传资源信息。本研究可为进一步开展苏氏圆腹（鱼亡）生物学特性、基因功能研究提供基础。

关键词：苏氏圆腹（鱼亡）全长转录组基因功能可变剪切长链非编码RNA

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光裸星虫与不同密度皱肋文蛤混养的生产性能及经济效益分析

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水产科技情报 2022年第6期49卷 325-331页

作者：班庭辉黄剑强陈振国王庆恒廖永山湛江市碧海湾水产科技有限公司广东湛江524382 广东海洋大学水产学院广东湛江524088 南海水产经济动物增养殖重点实验室广东湛江524088

为提高光裸星虫(Sipunculus nudus)养殖的生产性能和经济效益,进行了光裸星虫与不同密度皱肋文蛤(Meretrix lyrata)的混养生产试验。试验以相同密度(25 ind/m^(2))的光裸星虫与不同密度的皱肋文蛤进行混养,皱肋文蛤的密度分别为150 ind/... 详细信息

为提高光裸星虫(Sipunculus nudus)养殖的生产性能和经济效益,进行了光裸星虫与不同密度皱肋文蛤(Meretrix lyrata)的混养生产试验。试验以相同密度(25 ind/m^(2))的光裸星虫与不同密度的皱肋文蛤进行混养,皱肋文蛤的密度分别为150 ind/m^(2)(S1组)、200 ind/m^(2)(S2组)和250 ind/m^(2)(S3组),对照组为单养光裸星虫(C组,25 ind/m^(2))。结果显示,养殖300 d后,各组间光裸星虫和皱肋文蛤的存活率均无显著差异(P>0.05)。随着混养皱肋文蛤密度的增加,光裸星虫的终末体质量、增重率均呈下降趋势,其中S3组光裸星虫的终末体质量最小,增重率最低,分别比C组低了19.26%和22.24%。不同养殖密度对皱肋文蛤的终末壳长、终末体质量、增重率影响显著,其中S1组皱肋文蛤的终末壳长显著高于S3组(P<0.05),但与S2组差异不显著(P>0.05);S1组文蛤终末体质量、增重率显著高于S2组、S3组(P<0.05),其中S3组的终末体质量最小,增重率最低,分别比S1组低了28.99%和39.19%。随着皱肋文蛤放养密度的增加,光裸星虫的产量和产值均呈下降的趋势,而皱肋文蛤的产量和产值均呈先升后降的趋势,其中S1组经济效益最佳,比单养光裸星虫的对照组提高了35.88%。结果表明,光裸星虫与皱肋文蛤混养效益高于光裸星虫单养,但混养密度过高会导致产品规格小、毛利率和产出投入比降低。以毛利为评价指标,经多元回归分析显示,皱肋文蛤的最佳混养密度为157 ind/m^(2)。

关键词：光裸星虫皱肋文蛤混养生产性能经济效益

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环境相关浓度双酚AF暴露对成年雌性弓背青鳉生长和生殖的毒性效应

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安徽农业科学 2023年第8期51卷 79-85页

作者：黄泽胤谢明花陈月碧黎学友郭昱嵩王中铎董忠典广东海洋大学水产学院/南海水产经济动物增养殖重点实验室广东湛江524088 湖南师范大学生命科学学院/省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室湖南长沙410081

以成年雌性弓背青鳉(Oryzias curvinotus)为研究对象,研究了不同环境相关浓度(0.93、9.33和102.33μg/L)双酚AF(BPAF)短期暴露对其生存、生长和生殖的影响。结果表明,102.33μg/L BPAF暴露21 d极显著降低了成年雌性弓背青鳉的存活率和... 详细信息

以成年雌性弓背青鳉(Oryzias curvinotus)为研究对象,研究了不同环境相关浓度(0.93、9.33和102.33μg/L)双酚AF(BPAF)短期暴露对其生存、生长和生殖的影响。结果表明,102.33μg/L BPAF暴露21 d极显著降低了成年雌性弓背青鳉的存活率和生长状况因子;9.33和102.33μg/L BPAF暴露导致成年雌性弓背青鳉肝细胞排列松散、脂肪积累减少,102.33μg/L BPAF暴露还导致肝细胞形态出现明显肿胀;102.33μg/L BPAF暴露导致其卵母细胞大多停留在初级卵母细胞阶段,抑制了卵母细胞的成熟。另外,102.33μg/L BPAF暴露显著或极显著上调了vtglike、vtg1、vtg2和chgh在肝脏中的转录水平以及cyp11a、cyp19a1a和gsdf在卵巢中的转录水平。不同环境相关浓度的BPAF暴露对成年弓背青鳉雌鱼有较强的致死效应、生长抑制效应、雌激素效应,并可引起肝损伤和卵母细胞发生障碍。

关键词：弓背青鳉内分泌干扰物双酚AF 雌激素效应生殖毒性

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盐度胁迫对弓背青鳉水通道蛋白基因转录的影响

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生物技术 2022年第4期32卷 415-420页

作者：黄泽胤陈月碧黎学友张宁郭昱嵩王中铎董忠典广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖重点实验室广东湛江524088 广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室广东湛江524088 省部共建淡水鱼类发育生物学国家重点实验室湖南长沙410081

[目的]探究短期盐度胁迫对弓背青鳉(Oryzias curvinotus)水通道蛋白基因(Aquaporin family genes,aqps)转录水平的影响。[方法]以不同盐度(0、13和26)对实验室淡水养殖的弓背青鳉成鱼进行7 d的盐度胁迫,观察弓背青鳉的生存和生长,通过... 详细信息

[目的]探究短期盐度胁迫对弓背青鳉(Oryzias curvinotus)水通道蛋白基因(Aquaporin family genes,aqps)转录水平的影响。[方法]以不同盐度(0、13和26)对实验室淡水养殖的弓背青鳉成鱼进行7 d的盐度胁迫,观察弓背青鳉的生存和生长,通过实时荧光定量PCR(quantitative Real-time PCR,qPCR)方法检测aqps在肝脏和鳃组织中转录水平的变化。[结果]淡水对照组和13盐度胁迫处理组弓背青鳉在实验过程中均无死亡;26盐度胁迫处理组在实验初期有2个体死亡。短期盐度胁迫未改变aqps在弓背青鳉鳃组织及aqp0、aqp1、aqp3、aqp10、aqp11在肝脏组织中的转录水平;但显著影响了aqp7和aqp12在肝脏中的转录水平:aqp12转录水平随着盐度的升高而升高,在26盐度胁迫下转录水平显著高于对照组和13盐度组(P<0.05);aqp7的转录水平则随着胁迫盐度的升高而下降,在26盐度胁迫下aqp7表达水平较对照组显著下调(P<0.05)。[结论]弓背青鳉对短期盐度胁迫具有较好的适应能力,肝脏中aqp12和aqp7可能通过调节自身转录水平参与了机体对盐度变化的适应过程。该研究有助于明晰弓背青鳉的广盐性分子机制,为将其开发成广盐性模式生物提供了基础数据。

关键词：弓背青鳉盐度胁迫水通道蛋白转录水平鳃肝脏

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