检索结果-内蒙古大学图书馆

2016第五届中国食品安全高峰论坛

作者：曾海燕吴清平张菊梅何文静李程思凌娜省部共建华南应用微生物重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东省微生物研究所广州510070

[目的]食源性阪崎克罗诺杆菌中CRISPR-Cas系统的分布特征分析[方法]通过基因组二代测序和生物信息学分析获得17株食品源阪崎克罗诺杆菌的全长基因组,采用CRISPRFinder分析CRISPR分子的分布情况,利用所有cas;基因(n=394)轮廓进行PSI-BLAS... 详细信息

[目的]食源性阪崎克罗诺杆菌中CRISPR-Cas系统的分布特征分析[方法]通过基因组二代测序和生物信息学分析获得17株食品源阪崎克罗诺杆菌的全长基因组,采用CRISPRFinder分析CRISPR分子的分布情况,利用所有cas;基因(n=394)轮廓进行PSI-BLAST搜索全长基因组中的cas基因,E值小于10-6为临界值.[结果]17株阪崎克罗诺杆菌中共发现5种CRISPR分子,其中CRISPR1和CRISPR2为具有活性的CRISPR分子,两种CRISPR分子的间隔序列数目多变,CRISPR2的间隔序列数显著性大于CRISPR1.唯一的一个cas基因群紧邻CRISPR1,在CRISPR2上游小于20Kb的位置,且所有阪崎克罗诺杆菌菌株均只发现一种CRISPR-Cas系统,根据cas基因组成特点,鉴定为1类I-E型的CRISPR-Cas系统.[结论]我们发现阪崎克罗诺杆菌中存在1类I-E型的CRISPR-Cas系统和两个具有活性的CRISPR分子,为未来进一步应用CRISPR分子用于阪崎克罗诺杆菌的基因分型和分子溯源奠定了基础.

关键词：阪崎克罗诺杆菌 CRISPR-Cas CRISPR 基因组二代测序分型

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原噬菌体促进阪崎克罗诺杆菌种内遗传多样性的产生

原噬菌体促进阪崎克罗诺杆菌种内遗传多样性的产生

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2016年中国微生物学会学术年会暨中国微生物学会第十一次全国会员代表大会

作者：曾海燕张菊梅吴清平李程思省部共建华南应用微生物重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东省微生物研究所广州510070

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一株陆生耐盐珊瑚球菌次生代谢产物的研究

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生物技术进展 2016年第4期6卷 271-276页

作者：黄艳朱红惠广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省微生物菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州510070 佛山市海天(高明)调味食品股份有限公司广东佛山528511

研究了陆生耐盐珊瑚球菌(Coralloccus)5X1发酵液经乙酸乙酯萃取后的化学成分,以期得到有活性的先导化合物。采用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱、高效液相色谱等方法进行分离纯化,通过理化性质和波谱数据分析鉴定化合物的结构。结果显示,从陆... 详细信息

研究了陆生耐盐珊瑚球菌(Coralloccus)5X1发酵液经乙酸乙酯萃取后的化学成分,以期得到有活性的先导化合物。采用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱、高效液相色谱等方法进行分离纯化,通过理化性质和波谱数据分析鉴定化合物的结构。结果显示,从陆生耐盐珊瑚球菌5X1的乙酸乙酯萃取物中分离得到3个化合物,分别鉴定为环(酪氨酸-脯氨酸)、环(苯丙氨酸-脯氨酸)和乙酰基苯乙胺。这3种化合物均为首次从陆生耐盐珊瑚球菌5X1中分离得到。

关键词：耐盐珊瑚球菌次生代谢产物环二肽

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氧化石墨烯/十二烷基二甲基苄基氯化铵复合物的制备和抗菌性能研究

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工业微生物 2016年第4期46卷 49-52页

作者：叶小莉施庆珊谭绍早广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 暨南大学化学系广东广州510632

本文研究了氧化石墨烯/十二烷基二甲基苄基氯化铵(GO-1227)复合抗菌材料的制备及其抗菌性能。通过傅立叶红外光谱的检测,确定GO-1227复合物已经成功合成。为了研究复合物的抗菌活性,以大肠杆菌为代表,通过观察大肠杆菌的表面形貌变化和... 详细信息

本文研究了氧化石墨烯/十二烷基二甲基苄基氯化铵(GO-1227)复合抗菌材料的制备及其抗菌性能。通过傅立叶红外光谱的检测,确定GO-1227复合物已经成功合成。为了研究复合物的抗菌活性,以大肠杆菌为代表,通过观察大肠杆菌的表面形貌变化和细菌体外离子浓度变化,证明GO-1227复合物具有相对于原材料更好的抗菌性能。

关键词：氧化石墨烯十二烷基二甲基苄基氯化铵纳米复合材料抗菌性

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一种高灵敏度的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法

一种高灵敏度的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法

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中国食品科学技术学会第十三届年会

作者：薛亮吴清平蔡伟程陈港吴浩明张菊梅广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州 510070

目的：本研究拟根据"4+1+1"扩增策略,建立一种快速、灵敏的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法.方法与结果：首先根据GenBank中已有GIL.17型诺如病毒基因组序列的多重比对结果,理性设计了6对病毒基因组扩增引物,用于扩增获得可... 详细信息

目的：本研究拟根据"4+1+1"扩增策略,建立一种快速、灵敏的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法.方法与结果：首先根据GenBank中已有GIL.17型诺如病毒基因组序列的多重比对结果,理性设计了6对病毒基因组扩增引物,用于扩增获得可覆盖病毒基因组的6条重叠片段.同时,还设计了2奈洲序引物II.17-Seq1R和II.17-Seq6F,用于补充基因组的两端序列.通过采用终点稀释RT-PCR方法,证实了新设计引物均可达到常规检测引物G2SKF/G2SKR的灵敏度水平.最后,应用新建立方法在一个工作日内就成功获得了9奈广州地方的GII.17型诺如病毒毒株基因组.9条基因组全长均为7495bp,并通过系统发育分析对其基因型进行了验证.结论：根据一种新颖的"4+1+1"扩增策略,本文成功建立了一种快速、灵敏的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法.意义：本文建立的新方法可作为GⅡ.17型诺如病毒基因组信息收集的重要工具,同时已获得的9株广州地区GII.17型诺如病毒基因组序列也将为病毒的进化研究提供重要参考数据.

关键词：诺如病毒 GII.17 基因组测序理性设计系统发育分析

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罐内水性涂料抗微生物侵染的试验方法研究

罐内水性涂料抗微生物侵染的试验方法研究

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2016年第十四届全国防霉防菌技术研讨及产品交流会

作者：郭晓苑李彩玲谢飞鸿刘静霞周少璐谢小保广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州510070

本文介绍了推荐性国家标准GB/T30792-2014《罐内水性涂料抗微生物侵染试验方法》制订的必要性及制订依据，针对标准适用范围、测试菌种、测试条件和实验程序等内容分别进行了系统的描述。

关键词：水性涂料防腐剂抗微生物侵染性能评价标准

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灰树花菌株遗传多样性的同工酶与ERIC综合分析

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食用菌 2016年第1期38卷 9-11,27页

作者：张一帆夏凤娜陈秋颜杨小兵谢意珍广东省微生物研究所/省部共建华南应用微生物国家重点实验室/广东省菌种保藏与应用重点实验室/广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 广东粤微食用菌技术有限公司广东广州510070

七个不同来源的灰树花(Grifola frondosus)菌株,经拮抗试验发现两两之间不完全亲和。ITS分析表明七个菌株均属灰树花,但基于ITS的聚类分析不能明确反映菌株间的差异。酯酶同工酶电泳图谱和ERIC-PCR展现了七个受试菌株间不同程度的差异,... 详细信息

七个不同来源的灰树花(Grifola frondosus)菌株,经拮抗试验发现两两之间不完全亲和。ITS分析表明七个菌株均属灰树花,但基于ITS的聚类分析不能明确反映菌株间的差异。酯酶同工酶电泳图谱和ERIC-PCR展现了七个受试菌株间不同程度的差异,综合两者的聚类分析可较明确地展现出七个灰树花菌株遗传多样性差异,但该聚类结果未能和拮抗试验结果较好契合,表明基因层面的分子标记和生理层面的表观反应,在展示遗传多样性的对应关系上存在较多复杂情况。

关键词：食用菌种质资源分类鉴定

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广药植物内生真菌多样性及其代谢产物与功能基因研究

广药植物内生真菌多样性及其代谢产物与功能基因研究

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中国菌物学会2016年学术年会

作者：叶伟李浩华陈玉婵李赛妮孙章华刘洪新章卫民邓旺秋刘桃妹广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室

广药内生真菌可产生与宿主类似功能的代谢产物,因此成为寻找新生物活性物质的重要资源,因此本课题组针对药用植物广藿香、巴戟天、阳春砂仁和白木香进行多样性鉴定、代谢产物分离鉴定及活性代谢产物功能基因鉴定。本课题组对广药植物内... 详细信息

广药内生真菌可产生与宿主类似功能的代谢产物,因此成为寻找新生物活性物质的重要资源,因此本课题组针对药用植物广藿香、巴戟天、阳春砂仁和白木香进行多样性鉴定、代谢产物分离鉴定及活性代谢产物功能基因鉴定。本课题组对广药植物内生真菌纯培养分离,然后进行宏基因组测序,结果表明:内生真菌在宿主植物的分布具有一定的组织特异性或偏好性,但散囊菌目Eurotiales广泛分布在四种植物中;内生真菌多样性指数均大于2（H`=2.05-3.89）,显示出菌群结构的复杂性较高,多样性丰富。通过对分离得到的内生真菌ITS序列分析,共鉴定了232株内生真菌,拟茎点霉属（Phomopsis）、刺盘孢属（Colletotrichum）、镰刀菌属（Fusarium）真菌是分离菌株中的优势菌群;初步研究确定6株为我国新纪录种,分别为Microdochiumfisheri、Arthriniumhyphopodii、Arthriniumxenocordella、Scolecobasidium ***、Pestalotiopsisdiploclisia。本课题组从广药植物内生真菌中筛选出113株抗菌或抗肿瘤活性菌株;以10株活性菌株为研究材料进行发酵培养和分离提取,从中分离鉴定了100多个化合物,发现了25个新结构化合物。活性筛选发现具有抗肿瘤活性的化合物有16个,并对广药植物内生真菌中分离得到的单端孢霉烯的抗肿瘤机制进行了分析;本课题组还从广药植物内生真菌中分离得到具有抗细菌活性的化合物有3个,本课题组针对广藿香内生真菌Myrotheciumroridum A553和Bipolarissorokiniana A606进行了转录组测序,分析了高活性代谢产物单端孢霉烯和禾旋腔孢醌类化合物的生物合成途径,对单端孢霉烯生物合成相关基因Tri4（P450单加氧酶）、Tri5（单端孢霉烯合成酶）和Tri6（转录调控蛋白）进行异源表达纯化及功能基因分析,为阐明广药植物内生真菌高活性代谢产物的生物合成途径奠定了基础。

关键词：广药植物内生真菌代谢产物多样性功能基因

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广藿香内生真菌类群分析及其抗菌活性研究

广藿香内生真菌类群分析及其抗菌活性研究

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中国菌物学会2016年学术年会

作者：李浩华谭国慧李赛妮叶伟章卫民广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室

从药用植物广藿香组织中分离得到18株内生真菌,经内转录间隔区（ITS）序列测定进行初步鉴定及多样性分析;采用滤纸片法对其发酵液提取物进行抗菌活性测定。结果显示:从广藿香中分离得到的内生真菌分属于25属40个分离单元,其中分布最广... 详细信息

从药用植物广藿香组织中分离得到18株内生真菌,经内转录间隔区（ITS）序列测定进行初步鉴定及多样性分析;采用滤纸片法对其发酵液提取物进行抗菌活性测定。结果显示:从广藿香中分离得到的内生真菌分属于25属40个分离单元,其中分布最广的类群是拟茎点霉属（Phomopsis）、刺盘孢属（Colletotrichum）和镰刀菌属（Fusarium）,内生真菌的类群分布存在一定的组织特异性,其中茎中分离得到内生真菌的分离频率最高,占分离总株数的77.8%。通过活性测试发现:广藿香内生真菌发酵粗提物中共有15个属的34株内生真菌至少对1种供试菌有抗菌活性。因此,广藿香内生真菌多样性丰富,部分菌株具有良好的抑菌活性,值得进一步深入研究。

关键词：内生真菌多样性抗菌活性广藿香

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深海真菌埃德菌的转录组测序及胶黏毒素生物合成相关基因分析

深海真菌埃德菌的转录组测序及胶黏毒素生物合成相关基因分析

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中国菌物学会2016年学术年会

作者：叶伟刘桃妹李赛妮章卫民李浩华广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室

胶黏毒素是一种具有广谱抑菌、抑病毒、强抗肿瘤活性和免疫调节活性的毒素,可制备成杀菌剂和杀虫剂防治植物病害,尤其对防治水稻纹枯病、稻瘟病和稻曲病有很好的防治效果。本课题组组前期在深海真菌埃德菌的代谢产物中分离纯化得到了大... 详细信息

胶黏毒素是一种具有广谱抑菌、抑病毒、强抗肿瘤活性和免疫调节活性的毒素,可制备成杀菌剂和杀虫剂防治植物病害,尤其对防治水稻纹枯病、稻瘟病和稻曲病有很好的防治效果。本课题组组前期在深海真菌埃德菌的代谢产物中分离纯化得到了大量胶黏毒素及其衍生物,在此基础上提取埃德菌的总RNA进行了转录组测序,测序结果获得9.70Gb Clean Data,Q20碱基百分比为97.70%,GC含量为53.38%,De novo组装后共获得19125个Unigene。对Unigene进行功能注释,包括与NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO数据库的比对,共获得15916条Unigene的注释结果,其中在3000以上的Unigene有7230条,预示着埃德菌中丰富的次级代谢产物合成相关基因,比对到蛋白库的预测编码蛋白框有15343个。注释获得了10多种胶黏毒素生物合成相关基因的序列,包括Gli A、Gli C、Gli F、Gli G、Gli I、Gli M、Gli O、Gli P、Gli Z、Gli3基因。通过blastx将Unigene序列比对至蛋白数据库,对蛋白功能进行注释并进行分类统计,其中预测功能蛋白所占比例最高,预示其中存在大量较新的功能基因需要阐明,并从宏观上了解埃德菌的基因功能分布特征。本课题组对Gli G（谷胱甘肽硫转移酶）、Gli I（氨基转移酶）、Gli O（乙醛还原酶）和Gli Z（转录调控蛋白）在大肠杆菌中进行了异源表达纯化,得到目的蛋白,为后期阐明胶黏毒素的生物合成途径奠定基础。

关键词：埃德菌胶黏毒素转录组测序生物合成

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