全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的解析人类、动物或植物表型多样性遗传基础的有效分析手段。GWAS具有高通量、高精度和高速度等显著优点,其在林木遗传育种中的作用日益凸显。本文从种质材料...
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全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的解析人类、动物或植物表型多样性遗传基础的有效分析手段。GWAS具有高通量、高精度和高速度等显著优点,其在林木遗传育种中的作用日益凸显。本文从种质材料、目标性状的选择和表型鉴定、全基因组SNP位点的获取、群体结构、连锁不平衡分析以及关联作图与候选基因发掘等方面对GWAS在林木育种中的应用进行了综述,并提出后续研究展望。以期为进一步利用GWAS技术进行林木育种中各种性状遗传基础的研究提供参考。
【目的】在我国野生土沉香被大量被采伐,种质资源越来越少,甚至面临消失的情况下,为了利用与保护野生土沉香提供理论依据,采用SRAP分子标记对其种源遗传多样性进行分析。【方法】基于我国11个土沉香种源群体和越南2个土沉香种源群体的SRAP结果,应用POPGEN32软件对遗传多样性参数进行计算。【结果】各群体Nei's基因多样度指数的变化范围为0.1715~0.5394,Shannon多样性指数的变化范围为0.2491~0.4837,多态位点百分比的变化范围为42.03%~76.81%。运用GenAlex 6.4软件对土沉香13个群体进行分子方差分析(Analysis of molecular variance,AMOVA),结果显示有30%的遗传变异来自土沉香群体间,70%的遗传变异来自土沉香群体内。【结论】13个土沉香种源有中度的遗传多样性和遗传分化,野生土沉香种质资源正日渐稀少,应该加强资源的保护与利用。
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