检索结果-内蒙古大学图书馆

植物生理学报 2019年第11期55卷 1555-1562页

作者：阙青敏欧阳昆唏李培陈晓阳华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的解析人类、动物或植物表型多样性遗传基础的有效分析手段。GWAS具有高通量、高精度和高速度等显著优点,其在林木遗传育种中的作用日益凸显。本文从种质材料... 详细信息

全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)是近几年发展起来的解析人类、动物或植物表型多样性遗传基础的有效分析手段。GWAS具有高通量、高精度和高速度等显著优点,其在林木遗传育种中的作用日益凸显。本文从种质材料、目标性状的选择和表型鉴定、全基因组SNP位点的获取、群体结构、连锁不平衡分析以及关联作图与候选基因发掘等方面对GWAS在林木育种中的应用进行了综述,并提出后续研究展望。以期为进一步利用GWAS技术进行林木育种中各种性状遗传基础的研究提供参考。

关键词：全基因组关联分析(GWAS) 连锁不平衡林木育种

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基于高通量测序的低温胁迫下赤桉miRNAs的挖掘与分析

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华南农业大学学报 2021年第3期42卷 64-74页

作者：张紫阳刘艳魏瑞研林元震华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642

【目的】预测、挖掘和分析涉及赤桉Eucalyptus camaldulensis低温胁迫应答的miRNA,为研究其调控赤桉低温胁迫应答的分子网络奠定基础。【方法】采用高通量测序对低温处理组和对照(CK)组的赤桉组培苗茎尖进行小RNA测序。以miRBase21.0、R... 详细信息

【目的】预测、挖掘和分析涉及赤桉Eucalyptus camaldulensis低温胁迫应答的miRNA,为研究其调控赤桉低温胁迫应答的分子网络奠定基础。【方法】采用高通量测序对低温处理组和对照(CK)组的赤桉组培苗茎尖进行小RNA测序。以miRBase21.0、Rfam14.1和巨桉E. grandis基因组为参考数据库,利用Bowtie、miREAP和miRDeep2等软件进行miRNA预测,使用RNAfold对预测到的miRNA前体进行二级结构的折叠;采用psRNATarget预测靶基因,通过DEGSeq包分析差异表达的miRNA,并对它们进行GO注释和KEGG富集分析。【结果】在赤桉中,共预测到隶属于54个家族的392个已知miRNA和97个新miRNA;其中,CK组共预测到282个已知miRNA,65个新miRNA;低温处理组共预测到329个已知miRNA,51个新miRNA。挖掘到80个在低温处理下显著差异表达的miRNA,包括55个上调和25个下调。GO基因功能注释和KEGG富集分析的结果表明,这些差异表达miRNA可能通过参与代谢通路、次生代谢物的生物合成、细胞膜的改变、信号转导和生物调节等响应低温胁迫。此外,还挖掘到25个可能与ICE1-CBFs-COR通路有关的miRNA。【结论】借助高通量测序和生物信息学软件初步得到了低温胁迫下差异表达的赤桉miRNA,为进一步分析这些miRNA在赤桉低温胁迫中的分子功能提供一些参考。

关键词：赤桉 miRNA 低温胁迫高通量测序

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红椿SSR-PCR体系建立和多态性引物筛选

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林业科学研究 2016年第4期29卷 565-570页

作者：湛欣鲁好君赵帅陈晓阳邓小梅华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642

[目的]本研究旨在建立红椿SSR-PCR最佳反应体系,并筛选适于红椿SSR分析的高多态性引物。[方法]通过L16(45)正交试验设计,确立红椿SSR-PCR最佳反应体系;利用优化后的体系对来自楝科植物的135对SSR引物,在6个不同的红椿居群中进行扩增,筛... 详细信息

[目的]本研究旨在建立红椿SSR-PCR最佳反应体系,并筛选适于红椿SSR分析的高多态性引物。[方法]通过L16(45)正交试验设计,确立红椿SSR-PCR最佳反应体系;利用优化后的体系对来自楝科植物的135对SSR引物,在6个不同的红椿居群中进行扩增,筛出能有效扩增的引物并进一步筛选出适于红椿的高多态性引物。[结果](1)10μL基于荧光d UTP的SSR-PCR体系中包含:10×buffer 1.0μL,Taq酶(5 U·μL-1)0.1μL,Mg Cl2(25mmol·L-1)0.8μL,d NTP(200 mmol·L-1)0.025μL,荧光d UTP(1 nmol·μL-1)0.01μL,引物(10 mmol·L-1)0.8μL,DNA模板45 ng剩余用dd H2O补足;(2)筛选出29对能有效扩增的引物,复选后获得了12对适于红椿SSR分析的高多态性引物。[结论]建立了SSR-PCR最佳反应体系并筛选出高多态性引物,为红椿的分子标记等遗传学研究提供了基础。

关键词： SSR 红椿体系优化引物筛选

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广东省149个油茶品种(系)对炭疽病的抗性及其病原菌鉴定

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植物保护学报 2021年第3期48卷 652-661页

作者：黄迪饶筱吕嘉妍黎勇陈园黄永芳陈祖静华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642

为明确广东省油茶品种(系)对炭疽病的抗性及引起油茶炭疽病的病原菌种类,对广东省肇庆市、广州市和韶关市的149个油茶品种(系)进行田间抗性调查,从发病组织中分离纯化致病菌,观察菌株形态学特征,并结合3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyd... 详细信息

为明确广东省油茶品种(系)对炭疽病的抗性及引起油茶炭疽病的病原菌种类,对广东省肇庆市、广州市和韶关市的149个油茶品种(系)进行田间抗性调查,从发病组织中分离纯化致病菌,观察菌株形态学特征,并结合3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因扩增序列进行分子生物学鉴定。结果显示,有93.29%的油茶品种(系)发生炭疽病,3个调查地油茶炭疽病的平均发病率为18.86%~24.25%,较抗病的油茶品种(系)占调查总数的53.02%,感病油茶品种(系)占调查总数的46.98%。其中,海南3号、长林400号和湘林89号等10个品种(系)表现为近免疫,揭阳5号、桂14号和湘林350号等16个品种(系)表现为高抗,赣5190号、湘林27号和岑软11号等53个品种(系)表现为中抗,赣兴46号、赣州S4号和赣州R10号等36个品种(系)表现为中感,岑软11-3000号、长林53号和湘林67号等34个品种(系)表现为高感,其中岑软11-19号发病率高达65.00%。共分离获得油茶炭疽病致病菌25株,结合形态学特征和基于GAPDH序列的系统发育树分析,将其中24株鉴定为果生炭疽菌Colletotrichum fructicola,1株鉴定为为暹罗炭疽菌C. siamense。筛选的油茶抗病品种(系)可作为广东省油茶良种选育材料,且该省油茶炭疽病主要由果生炭疽菌引起。

关键词：油茶炭疽菌抗病性分离鉴定

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木本植物miRNAs参与环境胁迫应答的研究进展

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分子植物育种 2021年第16期19卷 5372-5379页

作者：张紫阳刘艳魏瑞研林元震华南农业大学广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广州510642

MicroRNA (miRNA)是一种广泛存在于植物中,长度约为21~24个核苷酸的单链内源性非编码RNA。研究证实,miRNA通过对靶基因的剪切或抑制来实现转录后水平上的负调控,并在植物的生长发育、形态建设、信号传导以及环境胁迫响应中都发挥着重要... 详细信息

MicroRNA (miRNA)是一种广泛存在于植物中,长度约为21~24个核苷酸的单链内源性非编码RNA。研究证实,miRNA通过对靶基因的剪切或抑制来实现转录后水平上的负调控,并在植物的生长发育、形态建设、信号传导以及环境胁迫响应中都发挥着重要的调控作用。与此同时,随着高通量测序和生物信息学的快速发展,大量miRNAs正不断被发现,miRNAs已成为当前植物分子生物学领域的研究热点之一。本研究首先简述了miRNA的形成过程及鉴定、表达量分析以及靶基因预测与验证的方法,其次重点综述了非生物胁迫和生物胁迫下木本植物miRNAs参与环境胁迫应答的研究现状,最后讨论了木本植物miRNAs今后的研究方向,以期为研究木本植物miRNAs参与调控植物抗逆应答的分子机理提供一些参考。

关键词： miRNA 环境胁迫调控木本植物

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团花树α扩展蛋白基因的克隆及表达分析

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林业科学 2013年第9期49卷 62-71页

作者：欧阳昆唏李俊成黄浩刘明骞陈晓阳广东省森林植物种质创新与利用重点实验室华南农业大学林学院广州510642

采用扩增保守区域、基因组步移及3’RACE技术,在团花树中克隆到15个α-expansin基因的cDNA序列,命名为AcEXPA2-16(GenBank注册号JF922686-JF922700),其相对应的基因组序列GenBank注册号为JF922701-JF922715。包括已知的AcEXPA1,这16个EXPA蛋白的大小及序列高度保守,包括N端的信号肽、3个外显子和2个内含子。通过氨基酸序列比对和系统进化树分析,AcEXPA1-16分为4个亚族,分别为A、B、C和D亚族。定量PCR分析显示AcEXPA1-16基因在同一组织中的表达存在冗余现象,而单个基因在不同的组织中又存在特异表达,尤其AcEXPA8在形成层中的表达水平极高。这表明AcEXPA8在木质部发生的过程中可能起到重要的作用。研究结果为在团花树中研究α-expansin基因与木质部的生长和材质的关系提供信息,并最终为林木分子育种提供潜在的候选基因。

关键词：团花树 α扩展蛋白基因克隆定量PCR

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不同油茶品种苗对高温胁迫的生理响应及耐热性评价

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林业科学研究 2024年第2期37卷 189-200页

作者：傅志强张恒刘祯奚如春华南农业大学林学与风景园林学院广东广州510642 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642

[目的]近年来我国南方高温频发,高温环境已成为油茶生长发育的重要限制因素。为探究不同油茶品种高温胁迫的生理响应及耐热性差异,筛选出适合在高温地区种植的油茶品种。[方法]选用我国各省(区)现行的15个油茶品种为研究对象,以其3年生... 详细信息

[目的]近年来我国南方高温频发,高温环境已成为油茶生长发育的重要限制因素。为探究不同油茶品种高温胁迫的生理响应及耐热性差异,筛选出适合在高温地区种植的油茶品种。[方法]选用我国各省(区)现行的15个油茶品种为研究对象,以其3年生嫁接幼苗为试验材料,分别调查测定各油茶品种在高温胁迫(覆膜增温)下的叶片相对含水量、干物质含量、光合色素、渗透调节物质和抗氧化酶活性等12个生理生化指标,并利用主成分分析法和隶属函数法对15个品种的耐热性进行综合评价。[结果]在高温胁迫下,参试油茶品种的叶片相对含水量和干物质含量降低;光合色素含量降低,且多数存在显著差异(p<0.05);丙二醛含量、抗氧化酶活性和渗透调节物质含量均升高;隶属函数分析表明,15个油茶品种的耐热性存在差异,其强弱顺序为华金>赣州油1号>华硕>岑软2号>湘林210>赣无2>长林53号>粤韶75-2>粤韶77-1>长林4号>岑软3号>华鑫>长林40号>赣州油7号>赣石83-4。[结论]15个油茶品种中,华金、赣州油1号、华硕、岑软2号和湘林210耐热性强,适宜高温地区引种栽培。

关键词：油茶高温胁迫生理响应耐热性综合评价

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高州油茶花粉形态及其贮藏特征

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林业科学研究 2019年第1期32卷 90-96页

作者：张鹏杨颖奚如春黄容容华南农业大学林学与风景园林学院广东广州510642 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642

[目的]探究高州油茶花粉特征。[方法]通过纤维素酶法、扫描电镜法、养分测定、TTC染色法等方法对花粉数量、花粉形态、花粉养分含量及花粉贮藏特征进行研究。[结果]表明:(1)单枚花药的花粉量平均为2 699粒,单花花粉数平均为461 186粒;(2... 详细信息

[目的]探究高州油茶花粉特征。[方法]通过纤维素酶法、扫描电镜法、养分测定、TTC染色法等方法对花粉数量、花粉形态、花粉养分含量及花粉贮藏特征进行研究。[结果]表明:(1)单枚花药的花粉量平均为2 699粒,单花花粉数平均为461 186粒;(2)高州油茶花粉大小属中等水平,极轴长44.66～54.08μm,赤道轴长27.38～34.29μm,呈长球形,赤道面观为长椭圆形,极面观为三裂圆形,花粉萌发孔在正常状态下为三(拟)孔沟型;(3)高州油茶花粉养分中全N、全P、全K、全Ca、全Mg、全Zn和全B的含量分别为58.72、7.73、8.65、1.94、1.22 g·kg^(-1)和135.93、2.73 mg·kg^(-1),全N、全P、全K、全Ca的含量与‘岑软2号’的差异不明显,全Zn和全B含量与‘岑软2号’的差异明显;(4)低温、干燥条件有利于高州油茶花粉的贮藏,4℃干燥贮藏60 d后花粉生活力保持在80%以上,-20℃干燥、-80℃干燥贮藏360 d后花粉生活力仍在30%以上。

关键词：高州油茶花粉形态花粉贮藏养分含量

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火炬松核心育种群体子代生长变异与选择

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林业科学 2013年第2期49卷 27-32页

作者：刘天颐刘纯鑫黄少伟钟伟华陈炳铨广东省森林植物种质创新与利用重点实验室华南农业大学林学院广州510642

广东省火炬松第1代核心育种群体68个全同胞组合的子代,组成了第2代核心群体的基本群体,在8,10,15年时分别对其树高、胸径和材积生长性状进行研究。结果表明:8,10,15年时,各生长性状在组合间都存在极显著差异。根据15年时各亲本子代的生... 详细信息

广东省火炬松第1代核心育种群体68个全同胞组合的子代,组成了第2代核心群体的基本群体,在8,10,15年时分别对其树高、胸径和材积生长性状进行研究。结果表明:8,10,15年时,各生长性状在组合间都存在极显著差异。根据15年时各亲本子代的生长表现,选择8个优良母本和4个优良父本,可用于营建精选种子园或控制授粉种子园,生产遗传改良度高的种子。以15年全同胞家系平均材积作为选择指标,共选出10个组合,材积平均增益为18.94%,通过重复制种获得的种子可以用于营建插穗圃,通过扦插繁殖生产优良的全同胞家系苗木;采用配合选择共选出55个优良个体参与构建第2代育种群体,其中30个进入第2代核心群体,其余25个进入第2代主群体。

关键词：火炬松核心育种群体正向同型交配生长变异选择

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高州油茶糖积累及其代谢相关酶活性

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林业科学研究 2024年第4期37卷 41-51页

作者：刘祯陈锐帆申春晖奚如春邓小梅华南农业大学林学与风景园林学院广东广州510642 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室广东广州510642

[目的]研究高州油茶生长发育过程中各源库器官糖积累特征及其与糖代谢相关酶活性的关系,为进一步完善华南地区特色油茶品种糖积累理论提供依据。[方法]以高州油茶为研究对象,利用13C同位素脉冲标记法测定不同发育时期各源库器官的13C含... 详细信息

[目的]研究高州油茶生长发育过程中各源库器官糖积累特征及其与糖代谢相关酶活性的关系,为进一步完善华南地区特色油茶品种糖积累理论提供依据。[方法]以高州油茶为研究对象,利用13C同位素脉冲标记法测定不同发育时期各源库器官的13C含量,同时测定对应时期各器官非结构性碳水化合物(NSC)含量、糖组分特征及相关酶活性的变化。[结果]1)13C标记的光合产物在运输趋于稳定后,在发育前期主要积累在叶片中,后期种仁逐渐成为了同化物分配积累的中心。2)各器官可溶性糖含量基本表现为果皮>种仁>叶片,淀粉含量表现为叶片>种仁>果皮。3)SPS和SS-Ⅱ与叶片、果皮和种仁的可溶性糖含量都呈正相关关系;B-AI主要在发育后期起着作用,种仁中B-AI活性分别在8月和10月存在峰值;在叶片中,NI为主要的糖转化酶,活性在50~60 U·g^(−1)之间;种仁中,S-AI与NI的活性大致相同,S-AI主要在发育前期起作用,而NI在发育后期起作用。[结论]高州油茶发育前期光合产物主要积累在源器官叶片之中,随着果实生长发育种仁逐渐成为了同化物分配的中心;在糖积累情况上,种仁在发育前期主要积累果糖和葡萄糖,发育后期则主要积累蔗糖。在发育后期运输到果皮的蔗糖会分解为果糖和葡萄糖,果皮依旧会进行增厚和延伸,继续完成木质化,此时果皮与种仁会对养分进行激烈竞争,最终呈现出果大皮厚的现象。SPS和SS-Ⅱ功能互补,同时影响着高州油茶糖分的积累,且SS-Ⅱ是糖分积累的关键酶;可能是引起各源库器官糖含量差异的主要原因,高州油茶糖积累受糖代谢相关酶的综合调控,NI为叶片的主要转化酶,S-AI与NI分别在种仁发育前后期发挥作用,果皮中蔗糖转化主要依靠S-AI;B-AI主要在发育后期起作用,但活性相对较低,转化能力有限。

关键词：糖含量酶活性 13C脉冲标记高州油茶

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