检索结果-内蒙古大学图书馆

广东省两个地区2021-2022年百日咳鲍特菌分离株的抗菌药物敏感性和抗原基因型

中国疫苗和免疫 2023年第5期29卷 498-502页

作者：李振翠马炜森王安娜张昌余青紫马伟峰刘美真广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所广东广州510000 广东省新发传染病应急检测技术研究与应用重点实验室广东广州510000 广东新发突发传染病防治工作站广东广州510000 南方医科大学公共卫生学院微生物学系广东广州510515 广州市疾病预防控制中心微生物学检验部广东广州510440

目的了解广东省两个地区百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)抗菌药物敏感性和抗原基因型。方法通过MALDI-TOF-MS微生物质谱、荧光定量PCR和血清凝集试验对广州市和佛山市2021-2022年Bp分离株进行鉴定,采用E-test法进行10种抗菌药物... 详细信息

目的了解广东省两个地区百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)抗菌药物敏感性和抗原基因型。方法通过MALDI-TOF-MS微生物质谱、荧光定量PCR和血清凝集试验对广州市和佛山市2021-2022年Bp分离株进行鉴定,采用E-test法进行10种抗菌药物的敏感性检测,利用二代测序平台和生物信息学分析软件进行全基因组测序和拼接,采用BLASTn软件分析抗原基因型和23 S rRNA基因突变。结果在15株Bp分离株中,12株(80.0%)对大环内酯类抗菌药物(红霉素、阿奇霉素和克拉霉素)耐药,且与Bp疫苗株相比存在23 S rRNA A2047 G突变,所有菌株对磺胺类、β-内酰胺类和喹诺酮类抗菌药物敏感;13株和2株分离株的抗原基因型分别为prn2/ptxA1/ptxC2/ptxP3/fim2-1/fim3-1/tcfA2和prn1/ptxA1/ptxC1/ptxP1/fim2-1/fim3-1/tcfA2。结论研究地区Bp分离株对大环内酯类抗菌药物的耐药率高,抗原基因型与疫苗株存在差异;需持续加强Bp流行株抗原基因型和药物敏感性监测。

关键词：百日咳百日咳鲍特菌抗菌药物敏感性抗原基因型

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新型甲型H1N1流感的进化、流行与挑战

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新发传染病电子杂志 2021年第2期6卷 146-150页

作者：谭静黄晓玲黄平南方医科大学公共卫生学院广州510515 广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室广州511430

新型甲型H1N1流感(novel pandemic H1N1 influenza A,H1N1pdm)于2009年出现,逐步取代原季节性H1N1流感;该毒株与H3N2和B型流感共同存在于流行季节。人类罹患流感耗减巨大社会医疗资源,同时给全球公共卫生带来巨大挑战。10年来H1N1pdm的... 详细信息

新型甲型H1N1流感(novel pandemic H1N1 influenza A,H1N1pdm)于2009年出现,逐步取代原季节性H1N1流感;该毒株与H3N2和B型流感共同存在于流行季节。人类罹患流感耗减巨大社会医疗资源,同时给全球公共卫生带来巨大挑战。10年来H1N1pdm的基因分子持续进化,本文介绍了H1N1pdm流行情况、毒株致病性、宿主适应性、生物学性状、复制感染能力、传播力、敏感药物和有效疫苗,旨在提高人们对流感等新发传染病病原体变异引起再次大流行的警惕,为临床和公共卫生防控提供参考。

关键词：甲型流感进化流行挑战

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广东省新型冠状病毒全基因组序列测定及其影响因素分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2020年第3期40卷 174-177页

作者：梁丽君李柏生刘哲李振翠郭前方宋颖超庄雪邹丽容庾健祥武婕广东省疾病预防控制中心广东省新发传染病病原学检测技术研究中心广东省病原微生物种质资源保藏与利用重点实验室广东省病原微生物监测与应急检测重点学科WHO合作培训中心广州511430

目的:对呼吸道标本中新型冠状病毒进行二代测序(NGS),获取基因组序列并分析测序影响因素。方法:2020年1月,收集广东省新型冠状病毒感染病例的上呼吸道和下呼吸道标本共计8份,运用RNA建库的方法进行测序,获得新型冠状病毒的基因组序列,... 详细信息

目的:对呼吸道标本中新型冠状病毒进行二代测序(NGS),获取基因组序列并分析测序影响因素。方法:2020年1月,收集广东省新型冠状病毒感染病例的上呼吸道和下呼吸道标本共计8份,运用RNA建库的方法进行测序,获得新型冠状病毒的基因组序列,采用生物信息学软件包(CLC Genomics Workbench 12.0)对基因组序列进行分析比较。结果:从8例呼吸道标本中获得5个新型冠状病毒基因组序列,其中2份来自下呼吸道标本。与新冠病毒的核苷酸同源性为97.74%~99.90%。Ct值低的样本,测序深度、覆盖度和相对丰度高。结论:标本中新型冠状病毒的Ct值低,测序质量好。

关键词：新型冠状病毒二代测序影响因素

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2017年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析

2017年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析

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第九届传染病防控基础研究与应用技术论坛

作者：梁丽君宋颖超邹丽容钟志锋康敏武婕 5100430广州广东省疾病预防控制中心广东省新发传染病病原学检测技术研究中心广东省病原微生物种质资源保藏与利用重点实验室广东省病原微生物监测与应急检测重点学科WHO合作培训中心

目的揭示2011-2017年广东甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因进化特征和变异特点.方法采用时空抽样方法抽样,测定2017年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列,同时检索全球HA序列作为对照,采用Mega 5.05和BEASTv1.7.0软件对HA基因核苷酸序列进行比... 详细信息

目的揭示2011-2017年广东甲型H3N2毒株血凝素(HA)基因进化特征和变异特点.方法采用时空抽样方法抽样,测定2017年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列,同时检索全球HA序列作为对照,采用Mega 5.05和BEASTv1.7.0软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析.结果 2017年广东20株H3N2流感病毒的HA序列核苷酸同源性为96.7％～99.7％,2017年广东H3N2亚型流感毒HA基因与2016～2017北半球疫苗株A/HongKong/4801/2014的同源性为98.7％～99％,抗原性较为接近.序列系统进化分析显示,其进化规律都是沿着树枝主干随着时间推移向上延伸,广东毒株主要分布在3C.2a T131K R261Q R142K分支,A/Guang dong/JY-157/2017出现在3C.2a1N171K分支.广东毒株对鉴定A/Switzerland/9715293/2013(H3N2)标准血清效价较低.2017年HA基因共出现136个氨基酸位点突变,其中9个氨基酸位点突变涉及5个抗原表位,糖基化位点相对保守,尚未出现抗原变异位点N121K.结论 2017年广东甲型H3N2毒株HA抗原变异明显,抗原变异的积累可能出现抗原漂移和流感暴发,应该加强流感病原学监测.广东毒株主要流行分支为3C.2a131K 261Q R142K,推测抗原变异分支3C.2a1N121K为广东毒株进化变异方向.

关键词：流感病毒 H3N2亚型血凝素进化

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广东地区甲型H3N2流行性感冒病毒毒株血凝素基因变异与进化对抗原表位的影响

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中华传染病杂志 2016年第7期34卷 404-409页

作者：余靓张欣黄平梁丽君钟静曾完鍪倪汉忠广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室广州511430 广州市胸科医院传染科

目的揭示2014年至2015年广东地区流行性感冒（流感）H3N2病毒血凝素（HA）基因进化特征及抗原表位变异。方法采用时空抽样法抽样，检测2014年至2015年广东省分离的17株流感H3N2病毒HA基因核苷酸序列，下载GenBank中36株参考基因序列；比... 详细信息

目的揭示2014年至2015年广东地区流行性感冒（流感）H3N2病毒血凝素（HA）基因进化特征及抗原表位变异。方法采用时空抽样法抽样，检测2014年至2015年广东省分离的17株流感H3N2病毒HA基因核苷酸序列，下载GenBank中36株参考基因序列；比对HA基因核苷酸序列，分析基因氨基酸变异，构建遗传进化树和熵值图；同时分析2014年至2015年广东毒株HA基因的抗原表位变异和选择性。结果以疫苗株A／Texas／50／2012毒株HA基因为基准，2014年至2015年广东地区17株流感毒株HA基因共有25个位点氨基酸置换；HA1基因表位A、B、D和E发生变异，涉及11个氨基酸位点；毒株A／Guangdong／55／2015的HA基因出现N38K变异，减少1个糖基化位点。高突变位点为175位（熵值为1．16）；综合评价单似然祖先计数（SLAC）、固定效应似然比（FEL）和内部固定效应似然比（IFEL）模型筛选结果，可能正向选择位点包括位点363，负向选择位点包括位点368和425。结论广东省流感H3N2病毒HA基因表位A、B、D和E发生变异，进化正向选择位点包括位点363，负向选择位点包括位点368和425；变异累积可能导致流感H3N2病毒疫情流行。

关键词： H3N2毒株血凝素类突变进化表位

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广东地区肾综合征出血热流行特征与气象因素的ARIMA模型分析

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中华疾病控制杂志 2016年第8期20卷 851-855页

作者：余靓梁丽君黄平郝元涛广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室广东广州511430 中山大学公共卫生学院广东广州510080

目的了解广东肾综合征出血热（hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS）疫情流行特征与气象因素之间的关系。方法采集广东2004-2014年肾综合征出血热疫情病例资料和相关气象资料,采用SPSS 19.0分析其流行特征和自回归综合移动平... 详细信息

目的了解广东肾综合征出血热（hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS）疫情流行特征与气象因素之间的关系。方法采集广东2004-2014年肾综合征出血热疫情病例资料和相关气象资料,采用SPSS 19.0分析其流行特征和自回归综合移动平均模型（autoregressive integrated moving average,ARIMA）,评价气候因素对HFRS发病的影响。结果广东2004-2014年HFRS病例数逐年上升,确诊病例发病率在（0.069~0.328）/10万之间。广州、佛山、深圳、东莞、珠海市病例数占82.6%,月发病高峰集中在3~6月和12月~次年1月。男女比例为2.95∶1（x^2=427.22,P〈0.001）,15~55岁组占85.0%;工人、家政服务和农民（18.7%、17.3%和13.1%）为主要职业人群占49.1%。相关性分析发现,平均气温（-0.486）和最低气温（-0.493）与滞后2月的HFRS病例数存在负相关性;ARIMA模型（R^2=0.747）中,平均相对湿度（β=0.880,P=0.044）和日照时数（β=-0.024,P=0.033）与滞后4月的和滞后3个月的HFRS病例数比较差异有统计学意义（均有P〈0.05）。结论近年广东HFRS发病率逐年上升;多雨/阴云季节影响到啮齿动物生态,继而导致下季节人群HFRS病例数增加;应加强人群和啮齿动物生态监测。

关键词：肾综合征出血热气象因素流行病学方法

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2014年大连市伤寒沙门菌耐药及分子分型研究

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中国微生态学杂志 2016年第4期28卷 396-399页

作者：侯君陈玉凤栾明春王晓炜李柏生孙茂利于蕾薄志坚李瑞大连市疾病预防控制中心微生物检验所辽宁大连116021 大连医科大学基础医学院形态学教研室辽宁大连116044 广东省疾病预防控制中心微生物检验所广东省应急病原学检测重点实验室广东广州510000

目的了解大连市伤寒沙门菌耐药性及分子分型特点,建立沙门菌分子特征本底信息,为今后防治工作提供科学依据。方法采用微量肉汤稀释法对46株伤寒沙门菌进行8种抗生素敏感试验;运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对46株伤寒沙门菌进行分子分型... 详细信息

目的了解大连市伤寒沙门菌耐药性及分子分型特点,建立沙门菌分子特征本底信息,为今后防治工作提供科学依据。方法采用微量肉汤稀释法对46株伤寒沙门菌进行8种抗生素敏感试验;运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对46株伤寒沙门菌进行分子分型及聚类分析。结果 46株伤寒沙门菌对萘啶酸(NAL)100.00%敏感,对氯霉素(CHL)和甲氧苄啶/磺胺甲噁唑(TMP/SMZ)耐药率为4.35%,对庆大霉素(GEN)耐药率为47.83%,发现多重耐药株1株;BioNumerics分析结果显示,46株伤寒沙门菌共产生30种PFGE带型,有7株表现为同一PFGE型别。结论大连地区存在耐庆大霉素的伤寒沙门菌;PFGE结果表明这些菌株存在遗传多态性,并有优势菌株的存在。

关键词：伤寒沙门菌耐药性脉冲场凝胶电泳

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广东省575株肺炎链球菌的毒力因子psaA、ply基因检测分析

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中国病原生物学杂志 2015年第8期10卷 693-698页

作者：熊平李柏生江锦志彭托华杨彤刘美真柯碧霞刘闪闪柯昌文华南农业大学制药工程系广东广州510640 广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学重点实验室广东省生物制品和药物研究所

目的采用PCR检测肺炎链球菌(***)毒力基因psaA和ply,研究分析两个毒力基因的特异性,为***临床诊断提供依据。方法对广东省12家医疗机构诊断为***感染患者的654份标本,经过细菌培养和乳胶凝集试验筛选出575株,以psaA、ply基因核心区域序... 详细信息

目的采用PCR检测肺炎链球菌(***)毒力基因psaA和ply,研究分析两个毒力基因的特异性,为***临床诊断提供依据。方法对广东省12家医疗机构诊断为***感染患者的654份标本,经过细菌培养和乳胶凝集试验筛选出575株,以psaA、ply基因核心区域序列设计合成扩增引物,以抽提的***分离株DNA为模板,采用常规聚合酶链反应(PCR)扩增目标基因psaA、ply片段,长度分别为838bp和209bp,调查分析不同来源标本的分离株psaA和ply基因检出率;采用乳胶凝集试验与多重PCR分型,比较两种结果中***菌株psaA和ply检出率差异,以及广东***主要血清型与非主要血清型菌株的psaA和ply检出率情况。结果经乳胶凝集试验鉴定为***的560株菌株中,psaA和ply基因检出率分别为78.21%和83.57%,ply基因检出率高于psaA基因,psaA基因阳性的***菌株,其ply基因均阳性;来源于血液和脑脊液标本的***分离株的psaA和ply基因检出率分别为93.18%和95.45%,脓液标本分离的***菌株psaA和ply基因检出率为100%。在荚膜肿胀反应和多重PCR检测为***可分型血清型菌株中,前者psaA和ply基因阳性率分别为93.90%和98.57%,后者为96.34%和98.31%;而在多重PCR检定为不可分型血清型菌株中,psaA和ply基因检出率分别为47.06%和57.84%,显著低于荚膜肿胀试验的68.59%和74.64%,但ply基因检出率也均比psaA高;可分型血清型中主要血清型菌株的psaA和ply基因检出率高于非主要血清型。结论广东地区***临床分离株中ply基因检出率比psaA高,保守性高,但其他链球菌亦能扩增出ply基因从而出现假阳性,因此,对于***菌株的鉴定,采用PCR同时扩增psaA和ply基因,并结合临床常规实验,鉴定更为可靠。此外,血液和脑脊液psaA和ply基因阳性率高可能与psaA和ply是***入侵血和脑的关键因子有关。

关键词：肺炎链球菌 psaA基因 ply基因 PCR

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2011—2015年广东省H3N2亚型流感病毒血凝素基因变异和进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2015年第12期35卷 900-904页

作者：梁丽君倪汉忠张欣曾宪鍫邹丽容李来庆宋颖超黄平武婕广东省疾病预防控制中心广东省新发传染病病原学检测技术研究中心广东省病原微生物种质资源保藏与利用重点实验室广东省病原微生物监测与应急检测重点学科WHO合作培训中心广州511430 广州优迪生物科技有限公司

目的揭示2011-2015年广东地区甲型H3N2毒株血凝素（HA）基因进化特征和变异特点。方法采用时空抽样方法抽样，测定2011—2015年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列，同时检索全球HA序列作为对照，采用MEGA5．05、BEAST v1．7．0和BioEdit7．1... 详细信息

目的揭示2011-2015年广东地区甲型H3N2毒株血凝素（HA）基因进化特征和变异特点。方法采用时空抽样方法抽样，测定2011—2015年广东甲型H3N2毒株HA核苷酸序列，同时检索全球HA序列作为对照，采用MEGA5．05、BEAST v1．7．0和BioEdit7．1．3软件对HA基因核苷酸序列进行比对和分析。结果广东48株H3N2流感病毒的HA序列核苷酸同源性为96．4％-100．00％，2013-2015年广东H3N2亚型流感病毒HA基因与南半球疫苗株A／Switzerland／9715293／2013的同源性为97．8％～98．7％，抗原性较为接近。序列系统进化分析显示，其进化规律都是沿着树枝主干随着时间推移向上延伸，广东毒株主要分布在3C．3a分支，2015年部分毒株出现在3C.2a分支。2011—2015年HA基因共出现116个氨基酸位点突变，其中12个氨基酸位点突变涉及4个抗原表位，N241D（N225D）和K192C突变发生在受体结合部位和其中的190螺旋区内。结论2011-2015年广东甲型H3N2毒株HA抗原变异明显，抗原变异的积累可能出现抗原漂移和流感暴发，应该加强流感病原学监测，及时发现新的流感变异株，为流感防控和降低流感对公众健康危害提供科学依据。

关键词：流感病毒 H3N2亚型血凝素进化

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应用TaqMan荧光定量RT-PCR检测猪肝中戊型肝炎病毒的研究

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华南预防医学 2015年第2期41卷 171-175页

作者：林虹管大伟邓小玲梁辉李柏生周少君钟贤武柯昌文中山大学公共卫生学院广东广州510080 广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学重点实验室广东省疾病预防控制中心国家食品安全风险监测广东中心

目的建立适用于猪肝样本中戊肝病毒检测的荧光RT-PCR方法。方法采用匀浆处理直接提取法（方法一）与聚乙二醇处理法（方法二）两种处理方法对染毒猪肝样本进行病毒富集,针对4种型别戊肝病毒的基因组而设计的特异性引物和探针,建立一套Ta... 详细信息

目的建立适用于猪肝样本中戊肝病毒检测的荧光RT-PCR方法。方法采用匀浆处理直接提取法（方法一）与聚乙二醇处理法（方法二）两种处理方法对染毒猪肝样本进行病毒富集,针对4种型别戊肝病毒的基因组而设计的特异性引物和探针,建立一套Taq Man荧光定量RT-PCR方法,并评价该方法的准确性和灵敏性。采用新建荧光定量RT-PCR检测人工染毒的猪肝样本并比较两种方法的处理效率。结果所建立的Taq Man荧光定量RT-PCR标准曲线显示在10^2-10^8copies/μL范围内具有良好的线性关系,相关系数为0.999。批内和批间重复性实验结果表明,不同浓度的质粒标准品检测所获得的Ct值的变异系数分别在0.11%-3.75%、2.47%-6.62%间。2种方法均可以检测出10^2copies/μL的染毒猪肝中戊肝病毒拷贝数。结论所建立的Taq Man荧光定量RT-PCR方法具有灵敏度高、稳定性好、特异性强等特点,适用于HEV的定量检测。匀浆处理直接提取法更加快捷,适用于长期监测。

关键词：肝戊型肝炎病毒属聚合酶链反应

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