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中国食品科学技术学会第十三届年会

作者：古其会吴清平张菊梅吴慧清孙铭广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室华南理工大学生物科学与工程学院中科院广州化学研究所中国科学院大学

微生物在饮用水处理过程中的作用是非常重要的,尤其生物滤池中的微生物对饮用水有机物去除起到了关键作用。而对该环境中的微生物群落结构及多样性缺乏系统全面的研究,主要是采用传统的分离培养、DNA指纹图谱技术、磷脂脂肪酸分析法及... 详细信息

微生物在饮用水处理过程中的作用是非常重要的,尤其生物滤池中的微生物对饮用水有机物去除起到了关键作用。而对该环境中的微生物群落结构及多样性缺乏系统全面的研究,主要是采用传统的分离培养、DNA指纹图谱技术、磷脂脂肪酸分析法及微阵列基因芯片等技术,但存在通量低和信息量小等缺点。随着第二代高通量测序技术的发展,克服了以上缺点,对于我们全面、准确和快速地了解生物滤池中的微生物群落结构及功能多样性提供了一个很好的手段。为此,本文在重点介绍第二代高通量测序技术,包括测序仪原理、类型及优越性,并在此基础上综述了该技术在分析饮用水环境微生物群落多样性中的应用。同时得出了高通量测序技术在饮用水环境微生物群落的多样性研究中具有很大的应用价值,为生物处理技术在饮用水生产中的更好应用奠定了坚实的理论基础。

关键词：饮用水高通量测序技术微生物多样性

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土壤样品长期保存对微生物群落代谢活性和功能类群的影响

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微生物学通报 2015年第6期42卷 1017-1024页

作者：周杨崔航朱红惠傅声雷姚青华南农业大学园艺学院广东广州510642 广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东省华南应用微生物重点实验室-省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东广州510070 中国科学院华南植物园广东广州510160

【目的】评估土壤长期保存(4个月)对土壤微生物群落代谢活性的影响。【方法】采用Biolog?Eco PlateTM生态板研究4°C风干保存和-20°C低温冻存的农田土壤和森林土壤中微生物群落的碳源利用模式。【结果】与新鲜土壤样品相比,长... 详细信息

【目的】评估土壤长期保存(4个月)对土壤微生物群落代谢活性的影响。【方法】采用Biolog?Eco PlateTM生态板研究4°C风干保存和-20°C低温冻存的农田土壤和森林土壤中微生物群落的碳源利用模式。【结果】与新鲜土壤样品相比,长期保存的土壤样品的微生物群落对碳源的利用能力大大降低,其多样性、均匀度和Simpson指数均降低;风干保存和低温冻存两者对土壤微生物的碳源利用的影响没有显著差异;除风干保存的土壤样品中利用多聚物类的微生物类群的代谢活性外,两种保存方法显著降低微生物群落的代谢活性,降低幅度为54.5%–99.8%。【结论】长期保存土壤可能会导致对微生物群落信息的低估,土壤微生物代谢活性研究的最佳样品为新鲜土壤。

关键词：土壤微生物风干保存低温冻存 Biolog生态板代谢活性

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微生物中抗耐药菌活性天然产物的研究进展

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天然产物研究与开发 2015年第8期27卷 1466-1482页

作者：褚福鑫白志强朱红惠广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州510070 华南农业大学兽医学院广州510000

近年来,细菌耐药性已成为全球性问题。微生物作为抗生素的重要来源,在发掘抗耐药菌新型抗生素的研究中承担了重要角色,许多微生物来源天然化合物展现了显著的抗耐药菌活性。本文主要综述了近十年发现的微生物源抗耐药菌天然化合物,并概... 详细信息

近年来,细菌耐药性已成为全球性问题。微生物作为抗生素的重要来源,在发掘抗耐药菌新型抗生素的研究中承担了重要角色,许多微生物来源天然化合物展现了显著的抗耐药菌活性。本文主要综述了近十年发现的微生物源抗耐药菌天然化合物,并概括了抗耐药菌活性天然产物的筛选方法,以期对抗耐药菌新型抗生素的发现做铺垫。

关键词：天然活性产物耐药性药物开发抗生素筛选

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白木香倍半萜合成酶As-SesTPS1基因的克隆、生物信息学和表达分析

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中草药 2015年第5期46卷 733-739页

作者：何欣叶伟高晓霞王磊章卫民广东药学院药科学院广东广州510006 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 内蒙古医科大学基础医学院内蒙古呼和浩特010110

目的基于前期对白木香Aquilaria sinensis转录组测序结果,从白木香总RNA中克隆白木香倍半萜合成酶基因(As-Ses TPS1),并对其进行生物信息学及表达分析。方法利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从白木香总RNA中获得倍半萜合成酶基因As-Ses... 详细信息

目的基于前期对白木香Aquilaria sinensis转录组测序结果,从白木香总RNA中克隆白木香倍半萜合成酶基因(As-Ses TPS1),并对其进行生物信息学及表达分析。方法利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从白木香总RNA中获得倍半萜合成酶基因As-Ses TPS1的c DNA全长序列;利用生物信息学手段对该序列进行相似性和同源性分析,并预测其编码蛋白的结构和功能;利用q RT-PCR技术检测该基因在白木香不同样品中的表达水平。结果得到倍半萜合成酶基因As-Ses TPS1,开放阅读框(ORF)全长1 671 bp,编码556个氨基酸,其与多条倍半萜合成酶基因具有较高相似性,并含有RRx8W和DDxx D的保守序列;该基因在白木香的沉香样品中高表达。结论 As-Ses TPS1的克隆及其生物信息学和在白木香不同部位表达差异性分析,为白木香倍半萜生物合成代谢途径的研究奠定基础。

关键词：白木香倍半萜合成酶克隆表达生物信息学

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肇庆星湖湿地放线菌多样性

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微生物学报 2015年第5期55卷 616-626页

作者：薛冬赵国振赵海泉姚青朱红惠广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 安徽农业大学生命科学学院安徽合肥210095 华南农业大学园艺学院广东广州510642

【目的】了解肇庆星湖湿地放线菌多样性及其与底泥理化性质的关系。【方法】应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-density gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术对星湖湿地10个样点放线菌群落进行研... 详细信息

【目的】了解肇庆星湖湿地放线菌多样性及其与底泥理化性质的关系。【方法】应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-density gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术对星湖湿地10个样点放线菌群落进行研究,根据DGGE图谱及克隆测序结果对其物种多样性进行分析,并结合样点理化性质对其空间分布特征进行分析。【结果】通过PCR-DGGE指纹图谱发现各样品放线菌物种丰富度(S)、多样性指数(H')和均匀度指数(J')均有所不同。对不同样点放线菌群落相似性进行比较,发现它们的相似性系数存在着一定的关系,相邻样点间相似性较高。对DGGE优势条带进行回收、克隆、测序,显示优势类群主要分布于类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)、链霉菌科(Streptomycetaceae)、小单孢菌科(Micromonosporaceae)、微球菌科(Micrococaceae)、纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)和原小单胞菌科(Promicromonosporaceae)。典型对应分析结果表明,星湖湿地放线菌群落结构变化的主要影响因子为底泥水溶性碳(WSOC)和速效磷(A-P)。【结论】肇庆星湖湿地蕴含着大量的放线菌资源,具有较高的物种多样性,需要进一步挖掘这些新资源。

关键词：聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳放线菌群落典型对应分析

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肇庆星湖湿地可培养放线菌多样性

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微生物学报 2015年第11期55卷 1485-1494页

作者：薛冬赵国振姚青赵海泉朱红惠安徽农业大学生命科学学院安徽合肥210095 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 华南农业大学园艺学院广东广州510642

【目的】探究星湖湿地可培养放线菌物种多样性,筛选潜在药源活性代谢产物产生菌,为后续菌种资源开发奠定基础。【方法】采用5种选择性分离培养基分离星湖湿地底泥中的放线菌,通过16S rRNA基因同源性分析代表性菌株的物种多样性;以3株病... 详细信息

【目的】探究星湖湿地可培养放线菌物种多样性,筛选潜在药源活性代谢产物产生菌,为后续菌种资源开发奠定基础。【方法】采用5种选择性分离培养基分离星湖湿地底泥中的放线菌,通过16S rRNA基因同源性分析代表性菌株的物种多样性;以3株病原细菌为指示菌检测分离菌株的抑菌活性;PCR扩增代表菌株的聚酮合酶(PKS I、PKS II)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因、安莎类化合物(AHBA)基因及3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGA)基因。【结果】分离到135株放线菌菌株,被鉴定为放线菌纲的7个目、10个科、13个属,优势类群为链霉菌、小单孢菌及诺卡氏菌。83株检测菌中,24.09%抗金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),4.8%抗大肠杆菌(Escherichia coli);24株高活性菌株中PKS I阳性率16.7%,PKS II阳性率62.5%,NRPS阳性率16.7%,AHBA阳性率12.5%,HMGA阳性率29.2%。活性复筛及HPLC结果显示,菌株XD007、XD114和XD128显著抑制3株病原指示菌,且能产生大量次级代谢产物。【结论】星湖湿地底泥中放线菌资源丰富,筛选到的活性菌株可用于后续药源活性次级代谢产物的分离。

关键词：放线菌多样性功能基因活性筛选

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镰刀菌诱导结香对白木香倍半萜合成酶基因表达与倍半萜含量的影响研究

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中国药学杂志 2015年第21期50卷 1861-1868页

作者：陈晓东谢明容刘少烽周伟平章卫民高晓霞广东药学院药科学院广州510006 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州510070 广州潮徽化工科技有限公司广州510730 无限极(中国)有限公司广州510070

目的研究镰刀菌诱导结香对白木香倍半萜合成酶（sesqui-TPS）表达的影响与倍半萜类化合物含量的动态变化。方法小孔滴注法进行镰刀菌诱导造香实验并割取造香前后12月内7个时间点的结香部位（沉香树脂）,采用实时荧光定量PCR法（q PCR）... 详细信息

目的研究镰刀菌诱导结香对白木香倍半萜合成酶（sesqui-TPS）表达的影响与倍半萜类化合物含量的动态变化。方法小孔滴注法进行镰刀菌诱导造香实验并割取造香前后12月内7个时间点的结香部位（沉香树脂）,采用实时荧光定量PCR法（q PCR）测定sesqui-TPS基因表达水平,气相色谱-质谱联用（GC-MS）技术分析倍半萜类化合物含量的动态变化。结果镰刀菌诱导白木香形成沉香2~12个月内sesqui-TPS基因相对表达量分别为10.85,0.793 1,6.484,611.4,5 800,4 211;人工诱导2个月前未检出倍半萜类次生代谢产物,4~12个月内共检出14个倍半萜类化合物,其相对百分含量分别为21.40%,25.52%,36.44%,32.40%和55.70%。结论镰刀菌诱导白木香结香过程中sesqui-TPS基因主要在后期响应伤害胁迫,其表达水平对促进倍半萜类成分生物合成具有滞后性,为进一步研究白木香结香过程中功能基因对萜类成分的生物合成途径调控作用奠定基础。

关键词：镰刀菌诱导结香白木香倍半萜合成酶倍半萜类化合物

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白肉灵芝--中国西南地区一个重要灵芝种类

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食用菌学报 2015年第4期22卷 49-52,F0003页

作者：沈亚恒李挺胡惠萍熊卫平闫文娟李泰辉广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 西藏自治区农牧科学院蔬菜研究所西藏拉萨850000

通过形态、显微结构观察和ITS测序,介绍了白肉灵芝(Ganoderma leucocontextum)的正确学名、宏观形态、显微形态和分子生物学特征。

关键词：灵芝形态学特征 ITS

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基于ITS2条形码序列鉴定商品沉香基源植物

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时珍国医国药 2015年第8期26卷 1932-1935页

作者：高晓霞刘少烽陈晓东严寒静钟兆健章卫民朱爽广东药学院广东广州510006 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070

目的在沉香性状、显微和理化鉴别、浸出物含量测定的基础上,通过探讨不同品种间的r DNA TIS2序列差异及系统发育分析,为商品沉香的鉴定提供分子生物学依据。方法以白木香、商品沉香及人工诱导沉香为材料,对其进行醇溶性浸出物测定、性... 详细信息

目的在沉香性状、显微和理化鉴别、浸出物含量测定的基础上,通过探讨不同品种间的r DNA TIS2序列差异及系统发育分析,为商品沉香的鉴定提供分子生物学依据。方法以白木香、商品沉香及人工诱导沉香为材料,对其进行醇溶性浸出物测定、性状及显微鉴别,提取总DNA、扩增r DNA ITS2片段并直接测定序列,MEGA5.0软件计算种内种间Kimura 2-parameter（K2P）遗传距离并进行系统发育分析,构建邻接树（NJ）和最大简约树（MP）。结果人工沉香、商品沉香醇溶性浸出物含量均高于10%,性状和显微鉴别均符合《中国药典》（2010年版）一部有关规定。沉香种内平均K2P遗传距离为0-0.003,种间平均K2P遗传距离为0.005-0.023。白木香、人工沉香和商品沉香在系统发育树上聚为一支。结论在沉香性状、显微和理化鉴别、浸出物含量分析的基础上,基于ITS2条形码序列可以准确鉴别沉香基源植物,为商品沉香的鉴定提供分子生物学依据。

关键词：沉香 ITS2 鉴定

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矿泉水和山泉水中铜绿假单胞菌污染调查及分离菌株毒力基因与耐药性分析

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微生物学通报 2015年第1期42卷 125-132页

作者：魏磊吴清平张菊梅吴克刚郭伟鹏阙绍辉广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 广东工业大学轻工化工学院食品工程与科学系广东广州510006 广东环凯微生物科技有限公司广东广州510663

【目的】初步掌握全国矿泉水和山泉水生产过程中铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的污染情况。分析矿泉水与山泉水中铜绿假单胞菌的致病性与耐药性。【方法】研究通过对广西、湖北、云南等全国9个省36家水厂进行采样,共采集108个样... 详细信息

【目的】初步掌握全国矿泉水和山泉水生产过程中铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的污染情况。分析矿泉水与山泉水中铜绿假单胞菌的致病性与耐药性。【方法】研究通过对广西、湖北、云南等全国9个省36家水厂进行采样,共采集108个样本,并根据《饮用天然矿泉水检测方法》国家标准(GB/T 8538-2008)检测其铜绿假单胞菌的污染率、污染水平。对分离出的铜绿假单胞菌菌株进行毒力基因与药敏实验。【结果】全国矿泉水水源水、活性碳过滤后水、成品水的污染率分别为16.7%、16.7%、0,污染水平分别为3.7、2.0、0 CFU/250 m L。全国山泉水水源水、活性碳过滤后水、成品水的污染率分别为66.7%、83.3%、5.6%,污染水平分别为5.1、7.3、2.0 CFU/250 m L。对所分离出的36株铜绿假单胞菌进行毒力基因检测和药敏试验显示:exo U、exo S、phz M、tox A、las B检出率分别为25.0%、75.0%、100%、88.8%、100%,但对美国国家临床实验室标准化委员会标准中14种抗生素均无耐药性。【结论】山泉水水源水、活性碳过滤后水、成品水污染率明显高于矿泉水,但污染水平均较低,无大于40.0 CFU/250 m L样品检出。山泉水活性碳过滤后污染率最高,表明大部分企业在活性碳过滤环节存在污染问题。毒力基因exo U、exo S、phz M、tox A、las B在分离到的36株铜绿假单胞菌检出率高,但分离到的菌株对所选取的14种抗生素均无耐药性。

关键词：矿泉水山泉水铜绿假单胞菌毒力基因耐药性

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