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微生物学通报 2021年第1期48卷 266-277页

作者：秦智伟薛亮高珺珊胡永丹张菊梅吴清平广东省微生物研究所广东省科学院省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 昆明理工大学农业与食品学院云南昆明650504

食源性病毒已成为全球引发食品安全事件的重要病原,对新型检测技术的不断发展提出了严峻的挑战。早期PCR技术在病原检测领域中的应用,推动了对食源性病毒的全面认识。近年来核酸恒温检测技术发展迅速,包括环介导等温扩增技术、重组酶聚... 详细信息

食源性病毒已成为全球引发食品安全事件的重要病原,对新型检测技术的不断发展提出了严峻的挑战。早期PCR技术在病原检测领域中的应用,推动了对食源性病毒的全面认识。近年来核酸恒温检测技术发展迅速,包括环介导等温扩增技术、重组酶聚合酶扩增技术、核酸序列依赖性扩增技术、链置换扩增技术、滚环扩增技术等,在抗复杂基质干扰、装备要求低以及可现场实时检测等方面具有明显的技术优势,已成为食源性病毒检测领域的热点研究方向。因此,本文对近年来食源性病毒核酸恒温检测技术的原理、应用、优缺点等方面进行综述,并对未来发展方向进行了展望。

关键词：食源性病毒核酸检测环介导等温扩增重组酶聚合酶扩增核酸序列依赖性扩增

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我国部分地区即食食品和蔬菜中金黄色葡萄球菌污染分布及耐药和基因分型情况

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微生物学报 2018年第2期58卷 314-323页

作者：容冬丽吴清平吴诗张菊梅徐明芳暨南大学生命科学技术学院广东广州510632 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070

【目的】系统调查了我国15个代表性城市在即食食品(卤肉、烤肉、凉拌菜和巴氏奶)和蔬菜样品中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的污染分布情况,并对分离株进行耐药性分析及多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)研究,... 详细信息

【目的】系统调查了我国15个代表性城市在即食食品(卤肉、烤肉、凉拌菜和巴氏奶)和蔬菜样品中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的污染分布情况,并对分离株进行耐药性分析及多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)研究,为食源性金黄色葡萄球菌的风险识别和分子溯源提供基础数据。【方法】依据GB 4789.10-2010对540份即食食品和蔬菜样品进行定性和最大可能数(Most probable number,MPN)分析;采用K-B纸片扩散法检测金黄色葡萄球菌分离株的耐药特征并通过PCR检测mecA基因;应用MLST方法确证金黄色葡萄球菌的主要ST型。【结果】结果发现9.3%(50/540)的样品中检出金黄色葡萄球菌,其中卤肉污染率最高,为16.3%(30/184),其次为烤肉(9.2%,6/65),蔬菜(6/150,4.0%)污染率最低。定量分析发现62.0%的阳性样品污染水平处于0.3–1.0 MPN/g,其中3份阳性样品污染水平≥110 MPN/g。对50株分离株进行24种抗生素耐药性检测,发现82.0%的分离株对氨苄西林和青霉素耐药,64.0%的分离株为多重耐药株。对mecA阳性分离株进行SCCmec分型,发现均为SCCmecⅣa。所有分离株进行MLST分型,共检出14种型别,其中ST3595和ST3847为新ST型。【结论】普遍的多重耐药性表明我国食源性金黄色葡萄球菌的耐药状况已较为严重,对消费者的安全健康存在潜在威胁。ST型与耐药存在一定的关联性,这为进一步了解该菌在我国食品中的流行趋势和风险评估提供了科学的数据支撑。

关键词：金黄色葡萄球菌即食食品蔬菜多重耐药 MLST分型

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白木香倍半萜合成酶As-SesTPS1基因的克隆、生物信息学和表达分析

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中草药 2015年第5期46卷 733-739页

作者：何欣叶伟高晓霞王磊章卫民广东药学院药科学院广东广州510006 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 内蒙古医科大学基础医学院内蒙古呼和浩特010110

目的基于前期对白木香Aquilaria sinensis转录组测序结果,从白木香总RNA中克隆白木香倍半萜合成酶基因(As-Ses TPS1),并对其进行生物信息学及表达分析。方法利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从白木香总RNA中获得倍半萜合成酶基因As-Ses... 详细信息

目的基于前期对白木香Aquilaria sinensis转录组测序结果,从白木香总RNA中克隆白木香倍半萜合成酶基因(As-Ses TPS1),并对其进行生物信息学及表达分析。方法利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从白木香总RNA中获得倍半萜合成酶基因As-Ses TPS1的c DNA全长序列;利用生物信息学手段对该序列进行相似性和同源性分析,并预测其编码蛋白的结构和功能;利用q RT-PCR技术检测该基因在白木香不同样品中的表达水平。结果得到倍半萜合成酶基因As-Ses TPS1,开放阅读框(ORF)全长1 671 bp,编码556个氨基酸,其与多条倍半萜合成酶基因具有较高相似性,并含有RRx8W和DDxx D的保守序列;该基因在白木香的沉香样品中高表达。结论 As-Ses TPS1的克隆及其生物信息学和在白木香不同部位表达差异性分析,为白木香倍半萜生物合成代谢途径的研究奠定基础。

关键词：白木香倍半萜合成酶克隆表达生物信息学

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药用植物白木香高质量总RNA提取方法的研究

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中药材 2013年第7期36卷 1055-1059页

作者：吴宏清王磊郭维高晓霞白玲章卫民广东省微生物研究所/广东省菌种保藏与应用重点实验室/广东省微生物应用新技术公共实验室/省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东广州510070 江西农业大学理学院江西南昌330045 广东药学院药科学院广东广州510006

目的:白木香次生代谢产物成分复杂,干扰其总RNA的提取,一般的提取方法无法获得总RNA或总RNA降解严重。为获得高质量的总RNA,本实验开展了白木香正常及结香组织采集及高质量总RNA提取方法的研究。方法:对从野外采集的白木香样品,用改良CT... 详细信息

目的:白木香次生代谢产物成分复杂,干扰其总RNA的提取,一般的提取方法无法获得总RNA或总RNA降解严重。为获得高质量的总RNA,本实验开展了白木香正常及结香组织采集及高质量总RNA提取方法的研究。方法:对从野外采集的白木香样品,用改良CTAB-LiCl法、去温浴的改良CTAB-LiCl法、SDS酸酚法、改良异硫氰酸胍-CTAB法和EASYspin RN09试剂盒5种方法分别对白木香叶、白木香枝条、白木香树干中的白木样品和结香样品进行RNA提取。结果:研究表明白木香枝条的离体样品室温保存5 h内不影响总RNA质量,确定EASYspin RN09试剂盒是白木香叶RNA的最佳提取方法,改良异硫氰酸胍-CTAB法是其他白木香组织RNA的最佳提取方法。结论:用改良异硫氰酸胍-CTAB法大量提取白木香树干中的白木样品及结香样品RNA,其28S∶18S为1.2～1.4,RIN值为6.8～7.5,并应用于转录组测序。

关键词：白木香总RNA提取改良异硫氰酸胍-CTAB法

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金属转运蛋白SLC39A14的代谢性功能研究进展

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科学通报 2020年第24期65卷 2571-2576页

作者：麦旭东韩木兰印遇龙许国焕孙嘉陈宏谢黎炜广东省科学院华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物研究所广州510070 南方医科大学珠江医院广州510070 新乡医学院公共卫生学院新乡453003 中国科学院亚热带农业生态研究所长沙410125

微量元素是维持人体生理和代谢功能的重要的营养素之一,既可参与人体生理生化功能调控,亦可作为生物大分子的组成或辅助成分,如激素和维生素有机组成.微量元素对维持机体正常生命活动具有重要意义.其中,必需微量元素是机体内不能产生或... 详细信息

微量元素是维持人体生理和代谢功能的重要的营养素之一,既可参与人体生理生化功能调控,亦可作为生物大分子的组成或辅助成分,如激素和维生素有机组成.微量元素对维持机体正常生命活动具有重要意义.其中,必需微量元素是机体内不能产生或合成但又是维持生物体正常生理机能不可或缺的,如铁、锰、锌等,主要通过消化道中不同的金属转运蛋白(metal transporter)转运吸收.近年来,随着金属转运蛋白不断被鉴定与发现以及金属转运蛋白的功能研究进展,认为SLC39A14在不同组织中参与铁、锌、锰等必需微量元素转运,并且参与多种生物学功能.基于目前对金属转运蛋白在代谢性器官以及代谢性疾病中的作用机理的了解和认识,本文回顾性总结了金属转运蛋白SLC39A14在不同代谢组织器官的代谢性功能和作用机制.

关键词：金属转运蛋白 SLC39A14 代谢性器官肥胖 2型糖尿病

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模拟胃肠消化提高蛹虫草蛋白的体外抗氧化活性

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现代食品科技 2020年第2期36卷 70-77页

作者：陈梦霏周娟娟吴书建谢意珍吴清平丁郁暨南大学食品科学与工程系食品安全与营养研究院广东广州510632 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070

探究模拟胃肠消化对蛹虫草蛋白质理化性质及抗氧化活性的影响。分别采用SDS-PAGE和酸水解法分析模拟胃肠消化前后的蛋白质分子量分布及氨基酸组成。通过体外化学评价方法,测定模拟胃肠消化前后蛹虫草蛋白质及其消化产物的抗氧化活性。构... 详细信息

探究模拟胃肠消化对蛹虫草蛋白质理化性质及抗氧化活性的影响。分别采用SDS-PAGE和酸水解法分析模拟胃肠消化前后的蛋白质分子量分布及氨基酸组成。通过体外化学评价方法,测定模拟胃肠消化前后蛹虫草蛋白质及其消化产物的抗氧化活性。构建H2O2诱导氧化损伤的PC12细胞模型,使用CCK-8试剂盒测定经蛹虫草蛋白质消化产物处理后细胞模型中的细胞活力。结果表明,经模拟胃肠消化后,蛋白质分子量的主要分布范围由10~120 ku变为8~15 ku;模拟胃肠消化前后DPPH自由基清除力的IC50值分别为1.55 mg/mL和1.06 mg/mL,Fe2+螯合力的IC50值分别为1.32 mg/mL和0.18 mg/mL,0.3 mg/mL样品的ORAC值分别为467.27±46.53μmol TE/g和948.80±24.02μmol TE/g;100μg/mL消化产物预保护H2O2损伤的PC12细胞后,细胞活力显著提高(p<0.05)。蛹虫草蛋白质模拟胃肠消化前后均具有较强的抗脂质过氧化能力及较低的Fe3+还原能力。蛹虫草蛋白质经模拟胃肠消化后产生了更多小分子量多肽,抗氧化活性显著提高,因此可对消化产物中的抗氧化肽进行进一步的研究和开发。

关键词：蛹虫草蛋白质模拟胃肠消化抗氧化 PC12细胞

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肇庆星湖湿地放线菌多样性

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微生物学报 2015年第5期55卷 616-626页

作者：薛冬赵国振赵海泉姚青朱红惠广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 安徽农业大学生命科学学院安徽合肥210095 华南农业大学园艺学院广东广州510642

【目的】了解肇庆星湖湿地放线菌多样性及其与底泥理化性质的关系。【方法】应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-density gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术对星湖湿地10个样点放线菌群落进行研... 详细信息

【目的】了解肇庆星湖湿地放线菌多样性及其与底泥理化性质的关系。【方法】应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-density gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术对星湖湿地10个样点放线菌群落进行研究,根据DGGE图谱及克隆测序结果对其物种多样性进行分析,并结合样点理化性质对其空间分布特征进行分析。【结果】通过PCR-DGGE指纹图谱发现各样品放线菌物种丰富度(S)、多样性指数(H')和均匀度指数(J')均有所不同。对不同样点放线菌群落相似性进行比较,发现它们的相似性系数存在着一定的关系,相邻样点间相似性较高。对DGGE优势条带进行回收、克隆、测序,显示优势类群主要分布于类诺卡氏菌科(Nocardioidaceae)、链霉菌科(Streptomycetaceae)、小单孢菌科(Micromonosporaceae)、微球菌科(Micrococaceae)、纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)和原小单胞菌科(Promicromonosporaceae)。典型对应分析结果表明,星湖湿地放线菌群落结构变化的主要影响因子为底泥水溶性碳(WSOC)和速效磷(A-P)。【结论】肇庆星湖湿地蕴含着大量的放线菌资源,具有较高的物种多样性,需要进一步挖掘这些新资源。

关键词：聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳放线菌群落典型对应分析

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柑橘溃疡病及其微生物防治研究进展

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微生物学报 2023年第5期63卷 1944-1958页

作者：段娇刘阳冯广达杨恩朱红惠昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500 广东省科学院微生物研究所、华南应用微生物国家重点实验室、农业农村部农业微生物组学与精准应用重点实验室、农业农村部农业微生物组学重点实验室、广东省菌种保藏与应用重点实验室广东广州510070

柑橘是我国第一大水果,柑橘溃疡病是导致柑橘产量和品质下降的最具破坏性细菌性病害之一,给柑橘产业造成了巨大的经济损失,严重阻碍了柑橘产业的可持续发展。微生物防治柑橘溃疡病具有安全、环保、高效等优点,是当前研究的热点。本文主... 详细信息

柑橘是我国第一大水果,柑橘溃疡病是导致柑橘产量和品质下降的最具破坏性细菌性病害之一,给柑橘产业造成了巨大的经济损失,严重阻碍了柑橘产业的可持续发展。微生物防治柑橘溃疡病具有安全、环保、高效等优点,是当前研究的热点。本文主要概述了柑橘溃疡病特征及其病原菌分类、分布,全面分析了柑橘溃疡病病原菌主要致病机理和协助致病机理;系统梳理了柑橘溃疡病生防微生物的多样性;重点总结了微生物通过产生活性物质、诱导激活植物免疫防御系统等防治柑橘溃疡病的作用机制;最后,我们提出了柑橘溃疡病微生物防治面临的挑战以及未来可能的解决途径,以期为柑橘产业的健康发展提供参考。

关键词：柑橘溃疡病病原菌致病机理生防微生物生防机制

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肇庆星湖湿地可培养放线菌多样性

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微生物学报 2015年第11期55卷 1485-1494页

作者：薛冬赵国振姚青赵海泉朱红惠安徽农业大学生命科学学院安徽合肥210095 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 华南农业大学园艺学院广东广州510642

【目的】探究星湖湿地可培养放线菌物种多样性,筛选潜在药源活性代谢产物产生菌,为后续菌种资源开发奠定基础。【方法】采用5种选择性分离培养基分离星湖湿地底泥中的放线菌,通过16S rRNA基因同源性分析代表性菌株的物种多样性;以3株病... 详细信息

【目的】探究星湖湿地可培养放线菌物种多样性,筛选潜在药源活性代谢产物产生菌,为后续菌种资源开发奠定基础。【方法】采用5种选择性分离培养基分离星湖湿地底泥中的放线菌,通过16S rRNA基因同源性分析代表性菌株的物种多样性;以3株病原细菌为指示菌检测分离菌株的抑菌活性;PCR扩增代表菌株的聚酮合酶(PKS I、PKS II)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因、安莎类化合物(AHBA)基因及3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGA)基因。【结果】分离到135株放线菌菌株,被鉴定为放线菌纲的7个目、10个科、13个属,优势类群为链霉菌、小单孢菌及诺卡氏菌。83株检测菌中,24.09%抗金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),4.8%抗大肠杆菌(Escherichia coli);24株高活性菌株中PKS I阳性率16.7%,PKS II阳性率62.5%,NRPS阳性率16.7%,AHBA阳性率12.5%,HMGA阳性率29.2%。活性复筛及HPLC结果显示,菌株XD007、XD114和XD128显著抑制3株病原指示菌,且能产生大量次级代谢产物。【结论】星湖湿地底泥中放线菌资源丰富,筛选到的活性菌株可用于后续药源活性次级代谢产物的分离。

关键词：放线菌多样性功能基因活性筛选

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罗伊氏乳杆菌对组胺引起黄颡鱼肝肠损伤修复效果评价

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水生生物学报 2019年第1期43卷 94-101页

作者：成艳波李薇韩木兰许国焕谢黎炜印遇龙梁建庆广东省微生物研究所广东省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州510070 广东碧德生物科技有限公司广州510663 中国科学院亚热带农业生态研究所长沙410125

以黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)(14.23±0.65) g为实验对象,分别饲喂3组等氮饲料(C组:组胺含量147 mg/kg; H组:479 mg/kg和H+B组:496 mg/kg+1×10~5 CFU/g罗伊氏乳杆菌Lactobacillus reuteri),进行56d的养殖实验,研究组胺及罗伊氏乳杆菌对黄颡鱼的影响。结果显示, H+B组血清谷丙转氨酶(ALT)及谷草转氨酶(AST)活力显著低于H组(P<0.05),而与C组无差异(P>0.05); H+B组肝脏谷胱甘肽S转移酶(GSH-ST)活力及丙二醛(MDA)含量显著低于H组(P<0.05),与C组无差异(P>0.05);肝脏HE染色显示, H组肝脏中有较多炎症细胞浸润,而H+B组肝脏细胞结构完整,无明显损伤;肠道HE染色显示, H组肠道皱襞数量明显减少、长度显著变短,有水肿发生,而H+B组肠道皱襞数量、长度与对照组无差异,水肿程度不明显。结果表明:组胺会引起黄颡鱼肝脏、肠道损伤,而罗伊氏乳杆菌对组胺引发的肝肠损伤有保护功效。

关键词：黄颡鱼罗伊氏乳杆菌组胺 HE染色保护功效

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