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第十八届全国防霉抗菌技术研讨会

作者：冯文超李军刘永龙许炎坤李东陶宏兵谢小保广东迪美生物技术有限公司广东广州510063 广东省防霉抗菌工程技术研究中心广东广州510070 中山大学化学工程与技术学院广东珠海519082 广东省防霉抗菌工程技术研究中心广东广州510070 广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东广州510070

造纸法再造烟叶废水中富含微生物，而了解废水中微生物的多样性，将有助于针对性的优化生化处理工艺，提高废水处理效果。本文采用16S rRNA基因高通量测序对某造纸法再造烟叶生产废水污泥中微生物多样性进行了分析。结果表明，其所包含... 详细信息

造纸法再造烟叶废水中富含微生物，而了解废水中微生物的多样性，将有助于针对性的优化生化处理工艺，提高废水处理效果。本文采用16S rRNA基因高通量测序对某造纸法再造烟叶生产废水污泥中微生物多样性进行了分析。结果表明，其所包含菌门数占到了目前细菌域中已经发现的菌门数中的80％，显示了废水污泥的物种多样性和群落结构复杂性，从侧面佐证了其在降解有机污染物和无机污染物以及降低废水水质色度方面的独特活性和广谱性，从而为再造烟叶废水处理的效果提供了稳定而高效的重要保障。

关键词：造纸法再造烟叶废水微生物多样性废水处理

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厚褶小奥德蘑栽培及其抗氧化活性

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食用菌学报 2019年第4期26卷 78-83页

作者：史钏胡惠萍莫伟鹏刘远超谢意珍广东省微生物研究所广东省科学院省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510075 广东粤微食用菌技术有限公司广东广州510663

对采自广东省鼎湖山的一株野生小奥德蘑(Oudemansiella sp.)进行分类鉴定与栽培,研究其液体培养菌丝体的水提液、醇提液和发酵液的抗氧化活性。采用形态学特征与rDNA-ITS序列分析相结合的方法,将其鉴定为厚褶小奥德蘑(***)。利用栽培料(... 详细信息

对采自广东省鼎湖山的一株野生小奥德蘑(Oudemansiella sp.)进行分类鉴定与栽培,研究其液体培养菌丝体的水提液、醇提液和发酵液的抗氧化活性。采用形态学特征与rDNA-ITS序列分析相结合的方法,将其鉴定为厚褶小奥德蘑(***)。利用栽培料(58%杂木屑、30%棉籽壳、10%麸皮、2%碳酸钙,含水量65%,pH自然),在(25±1)℃条件下遮光培养20 d,菌丝满袋后再培养15~16 d,转入出菇房,在25~28℃、相对湿度85%~90%条件下,每日300~500 lx光照10 h,菇蕾产生后,每日通风3~4次,出菇3~4潮,生物学转化率达到79.15%。本研究中,厚褶小奥德蘑菌丝体水提液的还原力和对羟自由基的清除能力明显高于菌丝体醇提液和发酵液,与对照维生素C相比,厚褶小奥德蘑菌丝体水提液的还原力低于维生素C,而对羟自由基的清除能力是维生素C的1.81倍。

关键词：小奥德蘑属 ITS分析栽培还原力羟自由基

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厌氧沉积物中PAHs降解菌与硝酸盐/硫酸盐还原菌的功能互作

厌氧沉积物中PAHs降解菌与硝酸盐/硫酸盐还原菌的功能互作

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广东省环境科学学会2020年科学技术年会

作者：杨旭楠李恩泽刘飞飞许玫英广东省科学院广东省微生物研究所510070中国广州华南应用微生物国家重点实验室 510070中国广州广东省菌种保藏与应用重点实验室 510070中国广州广东省微生物应用新技术公共实验室 510070中国广州

硝酸盐和硫酸盐是厌氧沉积物中多环芳烃(PAHs)生物降解的主要电子受体,但PAHs降解和不同电子受体还原菌群的功能互作规律及生态学过程鲜有研究.本文探索了硝酸盐和硫酸盐刺激对河流沉积物中PAHs的降解效率和功能微生物的响应关系.结果表... 详细信息

硝酸盐和硫酸盐是厌氧沉积物中多环芳烃(PAHs)生物降解的主要电子受体,但PAHs降解和不同电子受体还原菌群的功能互作规律及生态学过程鲜有研究.本文探索了硝酸盐和硫酸盐刺激对河流沉积物中PAHs的降解效率和功能微生物的响应关系.结果表明,PAHs降解速率与电子受体的还原速率正相关.PAHs在硝酸盐和硫酸盐还原条件下的降解半衰期分别为68.3天和164.6天.

关键词：微生物互作网络电子受体 PAHs降解生态学过程沉积物修复

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剧毒裂皮鹅膏转录组测序与毒肽相关基因家族分析

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基因组学与应用生物学 2019年第6期38卷 2603-2612页

作者：贺勇张成花邓旺秋李泰辉周小云湖南农业大学生物科学技术学院长沙410128 广东省科学院广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广州510070

裂皮鹅膏(Amanita rimosa)是中国特有的剧毒蘑菇资源,其子实体含有多种鹅膏肽类毒素,常引起严重的中毒死亡事件。剧毒鹅膏菌的毒肽基因家族可编码多种毒环肽及丰富的未知功能肽类,目前裂皮鹅膏的毒肽基因家族尚未开展系统的研究。本研... 详细信息

裂皮鹅膏(Amanita rimosa)是中国特有的剧毒蘑菇资源,其子实体含有多种鹅膏肽类毒素,常引起严重的中毒死亡事件。剧毒鹅膏菌的毒肽基因家族可编码多种毒环肽及丰富的未知功能肽类,目前裂皮鹅膏的毒肽基因家族尚未开展系统的研究。本研究以裂皮鹅膏新鲜子实体为材料提取RNA,构建cDNA文库。利用Illumina HiSeq 2000测序平台进行转录组测序,采用Trinity软件组装拼接,首次获得了裂皮鹅膏的转录组数据,转录组测序共获得19 598条Unigenes,通过Nr、KEGG、SwissPort及KOG数据库比对获得Unigene的功能注释。基于转录组序列和PCR验证获取了裂皮鹅膏的毒肽及相关肽类不同编码基因24条,分别编码α-amanitin、β-amanitin和Phallacidin等3种毒肽,以及编码21种未知功能肽类,其中16种为首次预测的新肽类。并对裂皮鹅膏毒肽基因家族编码的前体肽进行了系统聚类分析,明确了其系统发育位置。研究结果表明裂皮鹅膏具有丰富的毒肽及相关肽类的编码基因,为鹅膏肽类毒素的基因表达和新肽类资源的开发利用提供了数据。

关键词：裂皮鹅膏转录组 MSDIN 系统发育

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深海真菌Phomopsis tersa的次级代谢产物及其细胞毒活性研究

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中国海洋药物 2019年第6期38卷 8-14页

作者：陈闪冲陈玉婵李赛妮刘洪新刘昭明李浩华郭珩张捷章卫民朱爽广东药科大学生命科学与生物制药学院广东广州510006 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070

目的研究深海真菌Phomopsis tersa FS441的次级代谢产物及其细胞毒活性。方法采用正、反相硅胶柱、凝胶柱和高效液相等多种色谱技术对菌株FS441的固体发酵产物进行分离纯化,并通过NMR、MS等波谱方法鉴定化合物结构,采用SRB法对得到的单... 详细信息

目的研究深海真菌Phomopsis tersa FS441的次级代谢产物及其细胞毒活性。方法采用正、反相硅胶柱、凝胶柱和高效液相等多种色谱技术对菌株FS441的固体发酵产物进行分离纯化,并通过NMR、MS等波谱方法鉴定化合物结构,采用SRB法对得到的单体化合物进行细胞毒活性测试。结果从发酵物中分离纯化得到11个化合物,分别鉴定为:5α,8α-表二氧麦角甾-6,22-二烯-3β-醇(1)、麦角甾醇(2)、12-hydroxydehydrobotrydienol(3)、5,6-二羟基-2,3,6-三甲基环己-2-烯酮(4)、1,2-二羟基-3,4-脱氢蒽酮(5)、(1S,2S,3S,4R)-3-氯-4-(2-羟基丙吡啶-2-基)-1-甲基环己烷-1,2-二醇(6)、(-)-5-methylmellein(7)、酪醇(8)、胸腺嘧啶核苷(9)、(R)-(+)-甘油1-9(Z),12(Z)-十八碳二烯酸酯(10)、亚油酸(11)。结论化合物3~6为首次从Phomopsis属分离得到,化合物1和2对SF-268、MCF-7、HepG-2和A5494种肿瘤细胞株具有较弱的细胞毒活性。

关键词：深海真菌 Phomopsis tersa 次级代谢产物细胞毒活性

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基于差异基因网络特性探究乳腺癌他莫昔芬耐药的关键标志物

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陕西科技大学学报 2020年第5期38卷 67-74页

作者：马军王雪庭陈梦杰孟磊王乐陕西科技大学食品与生物工程学院陕西西安710021 广东省科学院广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 西安交通大学第一附属医院肿瘤外科陕西西安710061 西安交通大学第一附属医院肿瘤内科陕西西安710061

他莫昔芬适用于绝经前或绝经后的患者,能有效降低雌激素受体阳性(estrogen receptor positive,ER+)患者的死亡率和复发率,目前仍然是乳腺癌内分泌治疗的基础用药,然而在临床应用中已经发现约半数患者出现原发或继发性他莫昔芬耐药.因此... 详细信息

他莫昔芬适用于绝经前或绝经后的患者,能有效降低雌激素受体阳性(estrogen receptor positive,ER+)患者的死亡率和复发率,目前仍然是乳腺癌内分泌治疗的基础用药,然而在临床应用中已经发现约半数患者出现原发或继发性他莫昔芬耐药.因此,鉴定有效的他莫昔芬耐药关键基因将为TAM治疗ER+的乳腺癌患者提供重要的参考价值.本文首先联合Cancer Cell Line Encyclopedia(CCLE)数据库中的乳腺癌细胞系表达谱和STRING数据库中人类蛋白相互作用数据,得到了基于乳腺癌的蛋白互作(breast cancer-based PPI,B_PPI)网络.再通过walktrap算法对B_PPI网络中的基因进行聚类分析,产生不同大小的群落.同时,收集并分析GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中与他莫昔芬耐药相关的乳腺癌转录组数据,从而得到表达差异基因.再用reciprocal best-hit方法对群落与表达差异基因进行相似性分析找出与他莫昔芬耐药相关的群落.依据群落的功能特性和差异基因网络特性筛选耐药核心基因.最后选用核心基因STAT1和CDH1作为示例,探究基因表达情况与预后的关系.构建了包含7904个基因和213422个连接数的乳腺癌蛋白互作网络.经预后标记物验证发现CW4、CW5、CW13、CW21和CW33群落(共3863个基因)与他莫昔芬耐药相关,且CW5的显著性最高.功能分析发现CW5中基因参与丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路.选取前5个具有高节点度的表达差异基因STAT3、STAT1、CDH1、EGR1和PRKCA作为TAM耐药的核心基因,并通过他莫昔芬治疗后预后数据及文献证据验证核心基因表达与他莫昔芬耐药密切相关.耐药核心基因的表达情况与他莫昔芬治疗ER+乳腺癌患者的疗效关系密切.表达差异基因网络特性可以用于筛选乳腺癌他莫昔芬耐药的关键基因.

关键词：蛋白与蛋白互作网络乳腺癌他莫昔芬耐药预后标记物差异基因

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实时荧光环介导等温扩增技术检测猪肉中的假单胞菌

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现代食品科技 2019年第6期35卷 264-272页

作者：李宁张友雄吴清平古其会张银志王加生孙秀兰张菊梅江南大学食品学院食品科学与技术国家重点实验室国家功能食品工程技术研究中心食品安全协同创新中心食品安全国际联合研究实验室江苏无锡214122 广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 佐治亚大学公共卫生学院环境健康科学系美国佐治亚州雅典30602

根据假单胞菌16S rDNA基因序列设计引物,并向反应体系中加入饱和型核酸染料Eva Green,利用实时荧光检测仪,建立假单胞菌属实时荧光环介导等温扩增技术(LAMP)。研究中对62株假单胞菌的16SrDNA基因通过DNAMAN软件进行序列比对后,针对共有... 详细信息

根据假单胞菌16S rDNA基因序列设计引物,并向反应体系中加入饱和型核酸染料Eva Green,利用实时荧光检测仪,建立假单胞菌属实时荧光环介导等温扩增技术(LAMP)。研究中对62株假单胞菌的16SrDNA基因通过DNAMAN软件进行序列比对后,针对共有片段设计扩增引物。对扩增体系进行了优化,优化结果经电泳鉴定。通过12株假单胞菌和23株非假单胞菌进行特异性验证,并比较了实时荧光LAMP与普通LAMP的灵敏度,对人工污染样品的检出限进行了测定。结果表明,特异性验证中12株假单胞菌为阳性,23株非假单胞菌为阴性。实时荧光LAMP检测纯菌的灵敏度为36 CFU/mL,是普通LAMP灵敏度的10倍。人工污染样品的检出限为1.73×10^3 CFU/g。本研究中建立了一种检测冷鲜猪肉中假单胞菌属的方法,实现了多个菌种的同时检测,避免了单一菌种检测的局限性,该方法快速、准确、灵敏度高,可在2h内完成冷鲜猪肉中假单胞菌的检测。

关键词：实时荧光环介导等温扩增假单胞菌检测猪肉

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食品源单增李斯特菌喹诺酮类抗生素耐药机制研究

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食品科学技术学报 2018年第4期36卷 32-40页

作者：程健恒陈谋通陈月桃张菊梅吴清平广东省微生物研究所/省部共建华南应用微生物国家重点实验室/广东省菌种保藏与应用重点实验室/广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 华南农业大学食品学院广东广州510642

以945株食品源单核细胞增生李斯特菌(Listeria monoocytogens,LM)作为研究对象,分析其对喹诺酮类抗生素耐药的分子机制。采用KB法筛选出喹诺酮类耐药的LM,利用PCR检测喹诺酮耐药决定区(quinolone resistance-determining region,QRDR)... 详细信息

以945株食品源单核细胞增生李斯特菌(Listeria monoocytogens,LM)作为研究对象,分析其对喹诺酮类抗生素耐药的分子机制。采用KB法筛选出喹诺酮类耐药的LM,利用PCR检测喹诺酮耐药决定区(quinolone resistance-determining region,QRDR)的基因突变以及质粒介导喹诺酮耐药(plasmid-mediated quinolone resistance,PMQR)基因的分布情况,结合最小抑菌浓度(MIC)值和外排泵抑制剂利血平分析其外排泵的作用,多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)结合血清组对耐药菌株进行遗传多样性分析。结果表明:32株耐药菌株中gyr A、gyr B、par C与par E的QRDR均未发生氨基酸突变,且未检测到PMQR相关基因;而7株fepR基因发现新的氨基酸突变位点,其作用机制有待阐明;外排泵基因lde在耐药LM中皆有检出,78.1%(25/32)LM加入利血平后MIC值降低至原MIC的1/2以下,lde可能是导致LM对喹诺酮耐药的重要因素。血清组分析发现32株耐药菌株分属血清组I.1、I.2、II.1、II.2和III,MLST共分为10种ST型,其中ST87、ST9和ST8为优势株,具有一定的致病能力。结果表明,lde是LM产生喹诺酮耐药的重要因素,但LM潜在喹诺酮耐药分子机制仍有待阐明,同时其潜在的致病性应引起重视。

关键词：食源性致病菌单核细胞增生李斯特菌喹诺酮类抗生素耐药性利血平外排泵

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鲜猪肉中沙门氏菌生长动力模型的建立与验证

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食品科学技术学报 2018年第3期36卷 33-39页

作者：殷玉洁倪培恩刘丹蕾张菊梅吴清平王大鹏上海交通大学农业与生物学院食品科学与工程系上海200240 广东省微生物研究所/省部共建华南应用微生物国家重点实验室/广东省菌种保藏与应用重点实验室/广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070

为研究市售猪肉中沙门氏菌的生长规律,从3种血清型的沙门氏菌分离株中各随机挑选1株,制成混合菌液(终浓度为103~104CFU/mL),并对新鲜市售猪肉进行人工污染,建立不同恒温条件下沙门氏菌的生长动力模型。通过内、外部实验对模型进行验证,... 详细信息

为研究市售猪肉中沙门氏菌的生长规律,从3种血清型的沙门氏菌分离株中各随机挑选1株,制成混合菌液(终浓度为103~104CFU/mL),并对新鲜市售猪肉进行人工污染,建立不同恒温条件下沙门氏菌的生长动力模型。通过内、外部实验对模型进行验证,结果显示,所建立的生长预测模型可靠性高,可以归纳出猪肉中沙门氏菌的生长规律。此外,根据消费者从超市购买新鲜猪肉到回家贮藏的过程中温度变化的实际情况,以"等效生长时间"理论建立了波动温度下猪肉中沙门氏菌的生长预测模型。实验验证结果显示,该模型可准确地反映出波动温度下猪肉中沙门氏菌的生长规律。结果提示,消费者在购买猪肉后应尽快食用或低温保存,以降低因沙门氏菌增殖而增加的食品安全风险。

关键词：猪肉沙门氏菌预测微生物学生长动力模型波动温度

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我国市售食用菌中金黄色葡萄球菌污染调查、耐药性及其肠毒素基因检测

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食品科学技术学报 2018年第3期36卷 25-32,55页

作者：黄嘉慧吴诗张峰张菊梅吴清平广东省微生物研究所/省部共建华南应用微生物国家重点实验室/广东省菌种保藏与应用重点实验室/广东省微生物应用新技术公共实验室广东广州510070 华南理工大学生物科学与工程学院广东广州510006

调查了2011—2016年我国市售食用菌中金黄色葡萄球菌的污染情况,并对分离到的相关菌株进行了肠毒素基因的检测和耐药性分析。收集全国39个城市699份市售食用菌,利用定性和定量检测方法,检出金黄色葡萄球菌阳性样品33份,平均污染率4.72%... 详细信息

调查了2011—2016年我国市售食用菌中金黄色葡萄球菌的污染情况,并对分离到的相关菌株进行了肠毒素基因的检测和耐药性分析。收集全国39个城市699份市售食用菌,利用定性和定量检测方法,检出金黄色葡萄球菌阳性样品33份,平均污染率4.72%,污染水平9.75MPN/g。24种抗生素的药敏结果显示,分离株耐药情况严重,对利奈唑胺、利福平敏感,对氨苄西林等22种抗生素都产生不同程度的耐药。7株分离株经表型和分子鉴定确定为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌。运用聚合酶链式反应法对分离的39株金黄色葡萄球菌进行了18种肠毒素基因检测,约60%分离株携带4～6种肠毒素基因,携带率最高的肠毒素基因是sei,其次是sem、seg、seq、sec、seb、sen。本研究反映了我国市售食用菌金黄色葡萄球菌污染的潜在风险,相关分离株具毒性潜力,且耐药性严重,应引起重视。

关键词：金黄色葡萄球菌食用菌污染水平肠毒素基因耐药性

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