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广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点单核苷酸多态性与2型糖尿病遗传易感性关系

中国公共卫生 2020年第12期36卷 1785-1788页

作者：王姝徐霖胡维杨辉煌闫妍王星杰潘海燕孔丹莉丁元林于海兵广东医科大学流行病与卫生统计学教研室广东东莞523808

目的了解广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点的单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM遗传易感性的关系,为中国汉族人群T2DM发病的分子机制提供科学依据。方法采用病例对照研究方法,对2011年11月—2013年10月在广东省10家医院内分泌... 详细信息

目的了解广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点的单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM遗传易感性的关系,为中国汉族人群T2DM发病的分子机制提供科学依据。方法采用病例对照研究方法,对2011年11月—2013年10月在广东省10家医院内分泌科招募的1 092例20~70岁T2DM患者和同期在医院体检且按地区和年龄匹配的1 092名20~70岁健康人群进行问卷调查、体格检查和RXRA rs11185660位点基因型检测。结果病例组T2DM患者和对照组健康人群中RXRA rs11185660位点T、C等位基因频率分别为83.2%、16.8%和83.3%、16.7%,TT、TC、CC基因型频率分别为69.0%、28.4%、2.6%和68.8%、29.1%、2.1%,2组等位基因频率和基因型频率分布差异均无统计学意义(均P> 0.05);在调整年龄、体质指数、性别前后,病例组和对照组RXRA基因rs11185660位点共显性、显性、隐性和超显性遗传模型间差异均无统计学意义(均P>0.05)。结论广东省汉族人群RXRA基因rs11185660位点SNP与T2DM患者遗传易感性不存在明显相关性。

关键词： 2型糖尿病(T2DM) 遗传易感性 RXRA基因 rs11185660位点单核苷酸多态性(SNP)

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磷酸三苯酯致大鼠肝脏代谢紊乱的生物信息学分析

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环境与职业医学 2020年第2期37卷 111-120页

作者：胡维王姝于海兵丁元林广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广东东莞523808

[背景]磷酸三苯酯(TPHP)是目前应用最广泛的有机磷酸酯类阻燃剂之一,已在多种环境介质中被检测到。由于该化合物的多重毒性,近年来TPHP的健康风险引起了广泛的关注。然而,有关TPHP暴露对肝脏代谢影响的研究较少。[目的]基于转录组测序数... 详细信息

[背景]磷酸三苯酯(TPHP)是目前应用最广泛的有机磷酸酯类阻燃剂之一,已在多种环境介质中被检测到。由于该化合物的多重毒性,近年来TPHP的健康风险引起了广泛的关注。然而,有关TPHP暴露对肝脏代谢影响的研究较少。[目的]基于转录组测序数据,采用生物信息学方法探讨TPHP暴露对大鼠肝脏代谢紊乱的效应。[方法]基于基因表达数据库(GEO)获得基因表达谱数据集。采用主成分分析和层次聚类分析方法,依据不同剂量组的基因表达模式的相似程度将样本归类至对照组(0 mg·kg^-1,含5个样本)、低剂量组(55.0、110.0、220.0 mg·kg^-1,含9个样本)和高剂量组(441.0、881.0 mg·kg^-1,含6个样本);利用R 3.5.3软件中limma包筛选差异表达基因(DEGs)。运用cluster Profiler包对DEGs进行基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析。利用STRING网络数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并运用Cytoscape 3.7.1软件的网络分析插件Cyto Hubba筛选中心基因。最后,运用cluster Profiler包对重要的中心基因进行基因集富集分析(GSEA)。[结果]与对照组相比,低剂量组DEGs共53个,其中表达上调的基因30个,表达下调的基因23个;而高剂量组DEGs共151个,其中表达上调的基因80个,表达下调的基因71个。GO和KEGG富集分析显示,两个剂量组与对照组的DEGs富集的功能相似,主要涉及昼夜节律、碳水化合物代谢、脂质代谢、氨基酸代谢、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等生物学途径。PPI网络分析和GSEA显示,Arntl基因是唯一一个在低、高剂量组PPI网络中都存在的中心基因,Arntl基因低表达、高表达组分别在6、19条通路上富集,并且其高表达富集于不饱和脂肪酸的生物合成、PPAR信号通路等生物学途径。[结论]TPHP可诱导大鼠肝脏中昼夜节律、碳水化合物、脂质和氨基酸代谢途径受到干扰。节律基因Arntl可能在TPHP暴露导致的肝脏代谢紊乱中发挥重要作用,并影响内分泌功能。

关键词：磷酸三苯酯生物信息学代谢紊乱昼夜节律 Arntl基因

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广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点单核苷酸多态性与2型糖尿病遗传易感性的关联研究

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中国糖尿病杂志 2021年第4期29卷 241-245页

作者：徐霖林春文饶佳为杨辉煌谢宇荀丁元林孔丹莉潘海燕于海兵广东医科大学流行病与卫生统计学教研室东莞523808

目的探讨T2DM遗传易感性与广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点单核苷酸多态性(SNP)的关联。方法采用病例对照设计,运用SNPscan^(TM)分型技术检测T2DM组和正常对照组(NC)PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点的基因型,... 详细信息

目的探讨T2DM遗传易感性与广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点单核苷酸多态性(SNP)的关联。方法采用病例对照设计,运用SNPscan^(TM)分型技术检测T2DM组和正常对照组(NC)PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点的基因型,比较两组基因型及等位基因频率分布。结果NC、T2DM组rs6821591位点T、C等位基因频率分别为67.31%、32.69%/67.57%、32.43%,rs2970847为23.91%、76.09%/23.95%、76.05%,两组双位点等位基因频率分布及TT/CT/CC基因型频率分布比较,差异无统计学意义(P>0.05)。调整协变量前后,两组rs6821591和rs2970847位点的隐性、显性、共显性及超显性遗传模型比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论T2DM遗传易感性可能与广东汉族人群PPARGC1A基因rs6821591和rs2970847位点SNP无明显关联。

关键词：糖尿病 2型单核苷酸多态性过氧化物酶体增殖物激活受体γ辅助激活因子1α

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广东省汉族人群PRKAA1基因rs249429和rs3805486位点单核苷酸多态性与2型糖尿病遗传易感性的关联研究

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中国慢性病预防与控制 2021年第7期29卷 513-517页

作者：于海兵饶佳为徐霖林春文杨辉煌谢宇荀孔丹莉潘海燕丁元林广东医科大学流行病与卫生统计学教研室广东省东莞523808

目的探讨腺苷磷酸活化蛋白激酶催化亚基α1(PRKAA1)基因rs249429和rs3805486位点的单核苷酸多态性与2型糖尿病(T2DM)遗传易感性的关联性,为个体T2DM发病风险的预测及早期干预提供依据。方法采用病例-对照研究方法,于2011年11月至2013年1... 详细信息

目的探讨腺苷磷酸活化蛋白激酶催化亚基α1(PRKAA1)基因rs249429和rs3805486位点的单核苷酸多态性与2型糖尿病(T2DM)遗传易感性的关联性,为个体T2DM发病风险的预测及早期干预提供依据。方法采用病例-对照研究方法,于2011年11月至2013年10月选取广东医科大学附属医院等10家医院就诊的1 092例T2DM患者为病例组,并选取同期在同一家医院的1 092名健康体检者为对照组。采用单核苷酸多态性分型技术(SNPscanTM)对两组进行PRKAA1基因rs249429和rs3805486位点基因型检测,并进行相关问卷调查和生化指标检测。对两组间的基因型分布及等位基因分布进行分析,并分析不同遗传模型中基因型与T2DM遗传易感性的关联性。采用SPSS 25.0软件进行χ^(2)检验和t检验,采用多因素logistic回归分析在调整协变量前后不同遗传模型中基因型与T2DM遗传易感性的关联性。结果最终纳入1 067例T2DM患者和1 054名健康体检者,两组间PRKAA1基因rs249429和rs3805486位点的等位基因分布频率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。两组间PRKAA1基因rs249429和rs3805486位点的基因型分布频率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,在调整协变量前后PRKAA1基因rs249429和rs3805486位点在加性、共显性、显性和隐性遗传模型中基因型与T2DM遗传易感性均无相关性(P>0.05)。结论广东省汉族人群中,PRKAA1基因rs249429和rs3805486位点单核苷酸多态性与T2DM遗传易感性不存在明显的相关性。

关键词：糖尿病 2型单核苷酸多态性 PRKAA1基因

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妊娠期糖尿病发病风险预测模型构建与评价

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现代预防医学 2022年第3期49卷 441-446页

作者：饶佳为张金凤韩凤琼王星杰郭润民丁元林潘海燕广东医科大学流行病与卫生统计学教研室广东医科顺德妇女儿童医院

目的分析妊娠期糖尿病(GDM)的相关危险因素,建立妊娠期糖尿病发病风险预测模型,为个体GDM发病风险预测及早期干预提供依据。方法回顾性分析919名患妊娠期糖尿病孕妇与同期分娩的949名未患妊娠期糖尿病孕妇的既往病历资料,采用单因素分... 详细信息

目的分析妊娠期糖尿病(GDM)的相关危险因素,建立妊娠期糖尿病发病风险预测模型,为个体GDM发病风险预测及早期干预提供依据。方法回顾性分析919名患妊娠期糖尿病孕妇与同期分娩的949名未患妊娠期糖尿病孕妇的既往病历资料,采用单因素分析和多因素logistic回归分析孕妇孕早期GDM的独立危险因素,构建GDM发病风险预测模型,采用Homser-Lemeshow拟合优度检验、拟合优度校正图、受试者工作特征曲线(ROC)对该模型进行评估,采用deLong’s test进行AUC显著性差异检验。结果基于巨大儿史、糖化血红蛋白、空腹血糖、血红蛋白、白细胞计数、活化部分凝血活酶时间及胚胎移植GDM发病风险模型,拟合程度检验P=0.443>0.05,验证集ROC曲线下面积(AUC)为0.836(95%CI:0.8019～0.838),灵敏度为78.8%,特异度为78.6%,与训练集ROC曲线下面积无显著性差异(P>0.05)。结论基于危险因素构建的妊娠期糖尿病风险预测模型有较好的预测性能和泛化能力,能早期预测孕妇GDM发病风险并实施早期干预措施,从而降低GDM发病率。

关键词：妊娠期糖尿病危险因素风险预测模型

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广州市学校环境金黄色葡萄球菌耐药谱分析

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中国公共卫生 2018年第1期34卷 108-110页

作者：张婷林嘉玲白婵欧倩婷林东鑫叶家萍姚振江广东药科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系分子流行病学实验室广东广州510310

目的探究广州市小学学校环境金黄色葡萄球菌的耐药谱。方法于2016年4—6月采集广州市6所小学的课室、厕所、走廊或楼梯的环境样品共1 040份,分离检测金黄色葡萄球菌并进行药物敏感试验。结果共分离鉴定出98株环境金黄色葡萄球菌。多重... 详细信息

目的探究广州市小学学校环境金黄色葡萄球菌的耐药谱。方法于2016年4—6月采集广州市6所小学的课室、厕所、走廊或楼梯的环境样品共1 040份,分离检测金黄色葡萄球菌并进行药物敏感试验。结果共分离鉴定出98株环境金黄色葡萄球菌。多重耐药率达88.78%(87/98),对青霉素的耐药率最高(97.96%,96/98),其次是红霉素(89.80%,88/98)和替考拉宁(88.78%,87/98)。共36株(36.73%)甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌,其多重耐药率和对6种抗生素(头孢西丁、利奈唑胺、红霉素、莫西沙星、利福平、四环素及克林霉素)的耐药率均高于甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(P<0.05)。结论小学环境金黄色葡萄球菌的多重耐药率高,对多种抗生素耐药,并且甲氧西林耐药菌株的耐药问题比甲氧西林敏感菌株更严峻。

关键词：小学环境金黄色葡萄球菌耐药谱

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多水平模型和潜变量增长曲线模型在纵向数据分析中的应用及比较

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中华流行病学杂志 2014年第6期35卷 741-744页

作者：李丽霞周舒冬张敏张岩波郜艳晖广东药学院公共卫生学院卫生统计学教研室广东省分子流行病学重点实验室广州510310 山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室

比较多水平模型和潜变量增长曲线模型在纵向数据分析中的应用。文中以结直肠癌患者术后的生命质量情况为实例，比较两种方法的异同。结果表明两方法的参数估计值结果非常接近，多水平模型在模型构建时较为容易，而潜变量增长曲线模型在... 详细信息

比较多水平模型和潜变量增长曲线模型在纵向数据分析中的应用。文中以结直肠癌患者术后的生命质量情况为实例，比较两种方法的异同。结果表明两方法的参数估计值结果非常接近，多水平模型在模型构建时较为容易，而潜变量增长曲线模型在模型评价等方面具有优势。两方法均可很好地分析纵向观测的数据，且各有优点，研究者应根据需要选择合适的方法分析数据。

关键词：多水平模型潜变量增长曲线模型纵向数据

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中国肺结核患者家庭密切接触者活动性肺结核检出情况的Meta分析

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中国防痨杂志 2016年第10期38卷 862-868页

作者：张家泳丛守婧王涛汪保国广东药科大学流行病与卫生统计学教研室广州510310

目的了解我国肺结核患者家庭密切接触者活动性肺结核检出情况，估算活动性肺结核检出率。方法系统检索中国全文数据库总库（CNKI）、万方数据库（Wanfangdata）、维普数据库（VIP）、中国生物医学文献数据库（CBM），以及3个外文数据库P... 详细信息

目的了解我国肺结核患者家庭密切接触者活动性肺结核检出情况，估算活动性肺结核检出率。方法系统检索中国全文数据库总库（CNKI）、万方数据库（Wanfangdata）、维普数据库（VIP）、中国生物医学文献数据库（CBM），以及3个外文数据库PubMed、web of Science和Embase 2005年1月1日至2016年3月31日有关涂阳肺结核患者密切接触者活动性肺结核检出情况，且研究现场为中国大陆地区的相关文献，共检出文献3939篇，最后纳入18篇文献进行分析，依据加强流行病学观察性研究的报告（strengthening the reporting of observational studies in epidemiology，STROBE）声明要求对文献进行质量评价，采用广义倒方差模型的方法估算家庭密切接触者活动性肺结核检出合并率，以及按不同性别、年龄、地区和样本来源进行亚组分析；并进行敏感性分析，评价文献质量对结果的影响。结果18篇文献中，家庭密切接触者筛查数为44495名，共检查出活动性肺结核患者1517例，活动性肺结核检出的合并率为3．58％（95％CI=3．24％-3．96％）；其中〉60岁组的合并率（6．02％）较15-岁组（2．94％）及〈15岁组（2．45％）高，差异具有统计学意义（F=16．58，P=0．001）。结论我国涂阳肺结核家庭密切接触者活动性肺结核检出率较高，疫情不容忽视，需要加大对肺结核家庭密切接触者的筛查力度，同时做好家庭密切接触者的结核病防治宣传教育工作，提高对结核病的防范意识。

关键词：结核肺接触者追踪家庭多项筛查患病率 Meta分析

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灭蚊幼虫缓释包预防蚊幼虫孳生的现场试验

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中华地方病学杂志 2017年第6期36卷 423-427页

作者：肖扬甘平胜李晓宁景钦隆罗雷杜晓云杨洁莹杨智聪许雅王鸣广东药科大学公共卫生学院流行病与卫生统计教研室、广东省分子流行病学重点实验室广州510310 广州市疾病预防控制中心广州510440

控制中心为试验现场，于2014年7 - 12月，设置20个试验点，每个试验点设4个玻璃瓶（瓶内注入清水和放置富贵竹），分别投放2包、1包灭蚊幼虫缓释包，1%双硫磷颗粒剂3 g 和不采取干预措施，即为高剂量组、低剂量组、阳性对照组和空白对... 详细信息

控制中心为试验现场，于2014年7 - 12月，设置20个试验点，每个试验点设4个玻璃瓶（瓶内注入清水和放置富贵竹），分别投放2包、1包灭蚊幼虫缓释包，1%双硫磷颗粒剂3 g 和不采取干预措施，即为高剂量组、低剂量组、阳性对照组和空白对照组。每10 d开展1次现场观察（共19次），记录水体浑浊度、蚊幼虫数量和水生植物损害等情况。在5个固定试验点采集水样，测定其耗氧量、氨氮和有机磷含量。结果高剂量组、低剂量组、阳性对照组和空白对照组幼虫孳生率分别为0（0／380）、1.1%（4／380）、0.8%（3／380）、63.4%（241／380），植物损害率分别为5.0%（19／380）、5.5%（21／380）、4.7%（18／380）、4.7%（18／380），水体浑浊率分别为24.5%（93／380）、19.7%（75／380）、33.4%（127／380）、20.3%（77／380）。不同处理组幼虫孳生率和水体浑浊率比较差异有统计学意义（χ2 = 823.565、24.715，P均〈 0.05），水生植物损害率比较差异无统计学意义（χ2 = 0.332，P 〉 0.05）。高剂量组、低剂量组和阳性对照组双硫磷含量分别为1.24、0.78、2.33 mg／L，不同处理组间比较差异有统计学意义（H = 35.426，P 〈 0.01），但耗氧量和氨氮含量比较差异无统计学意义（H = 0.239、0.013，P均〉 0.05）。结论灭蚊幼虫缓释包对水体污染少，不影响水体清澈度，未对水生植物造成损害，可有效预防登革热流行期的蚊幼虫孳生。

关键词：灭蚊双硫磷水生植物登革热

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广东省COVID-19疫情的空间流行病学分析

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重庆医科大学学报 2020年第7期45卷 904-910页

作者：李清清高铭郑沾福胡维广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室东莞523808

目的:基于地理信息系统,探索广东省新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的空间分布特征及社会因素对疫情流行程度的影响。方法:收集广东省报告病例信息,探索其发病重心轨迹的迁移情况、空间相关性;通过地理加权回归模... 详细信息

目的:基于地理信息系统,探索广东省新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的空间分布特征及社会因素对疫情流行程度的影响。方法:收集广东省报告病例信息,探索其发病重心轨迹的迁移情况、空间相关性;通过地理加权回归模型探索人口密度、人均国内生产总值、同期内人口迁入指数和市内出行强度这4个社会因素对COVID-19流行程度的影响。结果:至截止日,广东省累计报告确诊病例1331例,新增病例流的重心轨迹始终在珠三角地区迁移。自2月2日,COVID-19存在显著的空间聚集性。社会因素对COVID-19流行具有正相关关系。结论:广东省COVID-19疫情虽然存在空间聚集性,但是高发聚集区较少且局限在珠三角地区。此外,人均国内生产总值、人口流入指数及市内出行情况这3个社会因素对珠三角地区疫情的影响较大。

关键词：新型冠状病毒肺炎重心轨迹空间自相关地理加权回归

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