检索结果-内蒙古大学图书馆

基于高通量测序技术的发热伴血小板减少综合征病毒全基因组多重PCR测序方法的建立与评价

中华微生物学和免疫学杂志 2022年第12期42卷 931-939页

作者：王笑阳裴书君陈泽倩索文帅易志杰李懿黄学勇郭万申郑州大学公共卫生学院流行病学教研室郑州450001 新乡医学院公共卫生学院流行病学教研室新乡453000 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所郑州450016

目的基于二代测序(next generation sequencing,NGS)技术建立一种发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)基因组的测序方法。方法提取SFTSV阳性血清样本病毒核酸,利用Primer5.0软件设计SFTSV特异性引物,构建多重PCR方法对病毒核苷酸序列进行特异性扩增,利用二代测序仪进行全基因组测序。结果28份SFTSV阳性血清样本均能进行特异性扩增并获得全序,覆盖度均超过94%,A型病毒株最多(20株)、其次为B型(4株)、E型(3株)。结论本研究基于多重PCR建立了针对SFTSV的特异性强、质量好的高通量测序方法,提高了测序效率。

关键词：发热伴血小板减少综合征病毒多重PCR 高通量测序基因组

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流感疫苗接种后的细胞免疫应答研究进展

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中华疾病控制杂志 2023年第4期27卷 476-481,496页

作者：许秋夷雷雨璇文思敏舒跃龙中山大学公共卫生学院(深圳)流行病与卫生统计学教研室深圳518107 中山大学公共卫生学院(深圳)病原与传染病防控教研室深圳518107 广州市第一人民医院华南理工大学附属第二医院临床研究中心广州510000 中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所北京102600

流感病毒对人类健康是一大威胁,每年接种季节性流感疫苗是预防流感流行与降低疾病负担的重要方式。当前流感疫苗主要诱导体液免疫应答,且对疫苗免疫原性的评估主要基于抗体水平,而对作为免疫应答重要部分的细胞免疫应答诱导和评估的较... 详细信息

流感病毒对人类健康是一大威胁,每年接种季节性流感疫苗是预防流感流行与降低疾病负担的重要方式。当前流感疫苗主要诱导体液免疫应答,且对疫苗免疫原性的评估主要基于抗体水平,而对作为免疫应答重要部分的细胞免疫应答诱导和评估的较少。本文对当前研发中的疫苗诱导的细胞免疫应答进行了总结,以期为提高疫苗免疫原性及建立细胞免疫评估方法提供一定参考。

关键词：流感流感疫苗细胞免疫细胞因子

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基于MGWR模型的西安手足口病发病影响因素

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山东大学学报（医学版） 2024年第6期62卷 96-101页

作者：梁珂梦李树芬倪志松宋思豪席睿程传龙左慧段雨琪刘昆白尧李秀君山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系山东济南250012 空军军医大学军事预防医学系军队防疫与流行病学教研室陕西西安710032 西安市疾病预防控制中心传染病预防控制科陕西西安710054

目的在5 km×5 km的空间网格尺度上探讨西安市手足口病发病与环境、社会经济因素等的关系,为区域防控措施的制定提供依据。方法收集2019年西安市手足口病报告发病率数据,应用空间自相关分析手足口病空间分布特征;基于多尺度地理加... 详细信息

目的在5 km×5 km的空间网格尺度上探讨西安市手足口病发病与环境、社会经济因素等的关系,为区域防控措施的制定提供依据。方法收集2019年西安市手足口病报告发病率数据,应用空间自相关分析手足口病空间分布特征;基于多尺度地理加权回归(multiscale geographically weighted regression,MGWR)模型分析环境与社会经济因素对手足口病发病的影响,并与普通最小二乘(ordinary least squares,OLS)回归模型以及地理加权回归(geographically weighted regression,GWR)模型结果进行对比。结果2019年西安市手足口病年报告发病率为157.99/10万,在空间分布上存在正相关性(全局Moran's I=0.349,P<0.001)。MGWR模型拟合度优于GWR模型和OLS模型(MGWR:R^(2)=0.530;GWR:R^(2)=0.473;OLS:R^(2)=0.327)。各影响因素的作用尺度存在一定差异,GDP、土地城镇化水平、平均气温等作用尺度较大,归一化植被指数(normalized difference vegetation index,NDVI)作用尺度较小。GDP与手足口病报告发病率呈显著负相关,土地城镇化水平、平均气温与报告发病率呈显著正相关,NDVI在西安部分地区对手足口发病有显著负向影响。结论环境与社会经济因素对手足口病发病有显著影响,且各影响因素的作用存在空间差异,研究结果可为不同地区制定针对性的预防措施提供依据。

关键词：手足口病空间自相关多尺度地理加权回归地理加权回归西安

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外泌体蛋白质在消化系统恶性肿瘤中的诊断价值

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肿瘤 2023年第8期43卷 672-683页

作者：闵雨欣袁黄波邓文江蔡延玲徐珂琳蒋艳峰张铁军陈兴栋索晨复旦大学公共卫生学院流行病学教研室上海200032 复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室人类表型组研究院上海200433 卡罗林斯卡医学院医学流行病学和生物统计学系瑞典斯德哥尔摩17165 深圳大学第一附属医院深圳市第二人民医院转化医学研究院广东深圳518035 复旦大学公共卫生学院生物统计学教研室上海200032 复旦大学泰州健康科学研究院江苏泰州225300 上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032

消化系统恶性肿瘤是人类常见的恶性肿瘤之一,其高发病率和晚期的低生存率给患者、家庭和社会带来沉重的疾病负担。然而,现有肿瘤筛查手段大多具有侵入性或操作复杂等特征,不利于开展大规模的人群筛查和长期随访,所以基于循环肿瘤DNA(cir... 详细信息

消化系统恶性肿瘤是人类常见的恶性肿瘤之一,其高发病率和晚期的低生存率给患者、家庭和社会带来沉重的疾病负担。然而,现有肿瘤筛查手段大多具有侵入性或操作复杂等特征,不利于开展大规模的人群筛查和长期随访,所以基于循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)、循环肿瘤细胞(circulating tumor cell,CTC)和外泌体(exosome)等新型生物标志物的液体活检技术具有广阔的发展前景。外泌体是由活细胞分泌、具有脂质双层膜的细胞外囊泡,相比于其他标志物其具有稳定性高、分布广泛、数量多等优势。外泌体携带的各种蛋白质能够反映来源细胞的特征,对于肿瘤早期诊断具有重要的研究价值。本文对近5年外泌体蛋白质作为消化系统恶性肿瘤早期诊断生物标志物的研究成果进行综述,并总结上述研究的主要特征和局限性,为促进外泌体蛋白质的临床转化提供参考依据。

关键词：外泌体蛋白质消化系统肿瘤诊断

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IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎疫苗免疫应答水平的关联

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中华预防医学杂志 2022年第7期56卷 926-931页

作者：李嘉铃苏永健董柏青吴琪俊杨庆利陈钦艳陈世艺谭超居昱李海广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室南宁530028 桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室桂林541000 广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所南宁530028

目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<1... 详细信息

目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<100 mIU/ml设为病例组,≥100 mIU/ml设为对照组。采用多重PCR技术、重亚硫酸盐测序、使用Illumina平台对IFNG基因目标区域及其CpG位点进行DNA甲基化高通量测序。采用非条件logistic回归模型分析IFNG基因18个位点胞嘧啶-磷酸-鸟苷酸 DNA甲基化情况与HepB免疫应答水平的关联。结果病例组(104名)和对照组(159名)抗-HBs[M(Q1,Q3)]分别为62.34(30.06,98.88)mIU/ml和1 089.10(710.35,1 233.45)mIU/ml。病例组IFNG_(1)基因44和93位点甲基化水平差异高于对照组(P<0.05),非条件logistic回归模型显示,IFNG_(1)基因44位点(OR=1.18,95%CI:1.03~1.35)和93位点(OR=1.21,95%CI:1.07~1.38)DNA甲基化水平与HepB应答水平具有相关性。结论 IFNG_(1)基因44和93位点DNA甲基化水平改变可能是影响广西汉族儿童HepB应答水平的相关因素。

关键词：乙型肝炎疫苗 DNA甲基化表观遗传学免疫应答水平

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儿童IL6、IL12A/B、IL13基因DNA甲基化与乙型肝炎疫苗低应答水平的关联性

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中华疾病控制杂志 2022年第2期26卷 244-248页

作者：李嘉铃苏永健董柏青吴琪俊杨庆利陈钦艳陈世艺谭超居昱李海广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心病毒性肝炎防制研究重点实验室南宁530028 桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室桂林541000 广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所南宁530028

目的本研究旨在探讨广西壮族自治区汉族儿童白细胞介素6(interleukin 6, IL6)、白细胞介素12A/B(interleukin 12A/B, IL 12A/B)、白细胞介素13(interleukin 13, IL13)基因胞嘧啶-磷酸-鸟苷酸(cytosine-phosphoric-guanylic, CpG)位点DNA甲基化与乙型肝炎疫苗(hepatitis B vaccine, HepB)免疫应答水平的相关性。方法运用非匹配病例对照方法,把来自广西壮族自治区3家医院263名8~9月龄并已接种HepB的汉族儿童作为研究对象,按抗-HBs水平将<100 mIU/ml儿童作为病例组,≥100 mIU/ml儿童作为对照组。采用多重PCR技术、重亚硫酸盐测序和高通量测序等技术,分析研究IL6、IL12A/B和IL13基因85个位点DNA甲基化情况与HepB免疫应答水平的关系。结果病例组IL6基因117位点、IL12B基因103位点和IL13;基因167位点甲基化水平均高于对照组,IL12A基因85位点病例组甲基化水平低于对照组(均有P<0.05);非条件Logistic回归分析模型分析显示IL6基因117位点和IL13;基因167位点增加了HepB低应答的风险(OR=1.07, 95%CI:1.02~1.13;OR=1.04, 95%CI:1.00~1.07)。结论提示IL6基因117位点和IL13;基因167位点DNA甲基化修饰可能是广西壮族自治区汉族儿童HepB免疫反应低应答的危险因素。

关键词： DNA甲基化细胞因子乙型肝炎病毒免疫应答水平

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2008-2017年我国手足口病发病和死亡变化趋势研究

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疾病监测 2022年第2期37卷 233-240页

作者：李嘉铃韦俞伽董柏青陈敏玫陈敏李海苏永健李荣秀广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室广西南宁530200 广西中医药大学公共卫生与管理学院广西南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室广西南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所广西南宁530028 广西医科大学基础医学院广西南宁530022

目的分析2008-2017年我国手足口病(HFMD)发病和死亡的变化趋势,为制定HFMD疫情防控策略提供科学依据。方法数据来源于中国公共卫生科学数据中心的HFMD发病和死亡数据及国家统计局的人口学资料。采用Excel 2016软件建立HFMD报告发病和... 详细信息

目的分析2008-2017年我国手足口病(HFMD)发病和死亡的变化趋势,为制定HFMD疫情防控策略提供科学依据。方法数据来源于中国公共卫生科学数据中心的HFMD发病和死亡数据及国家统计局的人口学资料。采用Excel 2016软件建立HFMD报告发病和死亡数据库。利用Joinpoint 4.9.0.0软件进行Joinpoint回归模型分析,估计2008—2017年我国不同年龄组、不同省份年报告HFMD发病率和年报告死亡率的平均年度变化百分比(AAPC),分析HFMD变化趋势。结果从2008年1月至2017年12月共报告HFMD 18 183 889例(年平均报告发病率为134.75/10万)。共报告死亡3 632例,年平均报告死亡率为0.027/10万。2008-2017年发病率和死亡率变化趋势较为平稳(P>0.05),但2010-2017年死亡率呈下降趋势(APC:–22.98%,95%CI:-29.64%~-15.70%,P<0.05)。10个省(市)发病率呈上升趋势(P<0.05),4个省(市)发病率呈下降趋势(P<0.05),18个省(市)发病率呈稳定趋势。5个省份死亡率呈下降趋势(P<0.05)。HFMD在0~7岁组儿童高发,发病率最高的为1~岁组(3 184.19/10万)。HFMD年平均发病率随年龄增长而逐年降低(t=-2.97,P<0.05)。<20岁组人群中,HFMD病死率随年龄增长而逐年降低(t=-3.18,P<0.05)。14个年龄组的年发病率呈上升趋势(P<0.05),12个年龄组的HFMD年发病率呈稳定趋势(P>0.05)。0~7岁年龄组死亡率的变化趋势平稳(P>0.05)。结论 2008-2017年我国HFMD发病率和死亡率变化趋势总体较为平稳,但2010-2017年死亡率呈下降趋势。华南、西南、华中、华东地区省份的发病率呈上升趋势;华北、东北地区省份的发病率呈下降趋势。HFMD在0~7岁组儿童高发。建议针对不同地区HFMD的疫情变化情况加强HFMD防控工作,以减少HFMD发病和死亡病例。

关键词：手足口病变化趋势报告发病率报告死亡率

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FTO基因DNA甲基化与乙肝疫苗免疫低/无应答水平的关系

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实用医学杂志 2022年第4期38卷 468-472页

作者：李嘉铃周小婷董柏青陈钦艳胡莉萍王超苏永健李海广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室南宁530029 广西中医药大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室南宁530200

目的通过探讨m6A去甲基化酶FTO基因DNA甲基化与乙肝疫苗免疫低/无应答水平的关联性,为预测个体乙肝疫苗的应答水平、研发新型HepB疫苗提供科学的依据。方法采用非匹配病例对照的研究方法,招募于2014-2016年间至广西南宁市三所三级甲等... 详细信息

目的通过探讨m6A去甲基化酶FTO基因DNA甲基化与乙肝疫苗免疫低/无应答水平的关联性,为预测个体乙肝疫苗的应答水平、研发新型HepB疫苗提供科学的依据。方法采用非匹配病例对照的研究方法,招募于2014-2016年间至广西南宁市三所三级甲等医院就诊的8~9月龄263例儿童(已完成乙肝免疫接种程序)作为研究对象,根据乙肝表面抗体(HBsAb)水平将抗-HBs浓度<100 mIU/mL作为观察组,抗-HBs浓度≥100 mIU/mL作为对照组。采用Methyl Target技术检测FTO基因位点的DNA甲基化水平,分析FTO基因28个位点CpG岛DNA甲基化水平与乙肝疫苗免疫应答水平的关系。结果FTO基因各基因位点的DNA甲基化水平都比较低;观察组和对照组的DNA甲基化水平在FTO_1基因222位点、FTO_2基因72位点的差异具有统计学意义;观察组FTO_1基因222位点的DNA甲基化水平高于对照组(Z=-2.38,P=0.009)。观察组FTO_2基因72位点的DNA甲基化水平高于对照组(Z=-1.71,P=0.044)。结论提示人体中FTO基因存在发生甲基化的可能,乙肝疫苗接种者低/无免疫应答水平可能受FTO_1基因222位点、FTO_2基因72位点的影响。

关键词： FTO DNA甲基化乙肝疫苗免疫应答水平

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青海省肺结核发病与气象因素的时间序列分析

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中华疾病控制杂志 2021年第10期25卷 1186-1193页

作者：梁达商越王兆芬马斌忠青海大学医学院公共卫生系流行病学教研室青海省疾病预防控制中心传染病预防控制所

目的探索气象因素与青海省肺结核发病之间的关系,并构建ARIMAX（autoregressive integrated moving average model-X, ARIMAX）模型对肺结核病例数进行短期预测。方法利用地理加权回归（geographically weighted regression, GWR）分析气象因素对肺结核发病的影响。以2014—2018年肺结核月发病数作为响应序列,气象因素作为输入序列,通过互相关函数（cross-correlatioan function, CCF）图确定与肺结核发病有关的气象因素并构建ARIMAX模型,分别回代拟合和预测2014—2018年肺结核月发病数和2019年肺结核月发病数,并与实际发病数相比较。结果降水量和相对湿度对肺结核发病存在正向影响,气压、气温和日照时数为负向影响,风速既存在正向影响,也存在负向影响;通过CCF图确定平均气温和平均风速与肺结核发病存在相关,并最终建立纳入2个协变量（平均气温3阶滞后和平均风速2阶滞后）的ARIMAX（0,1,2）×（0,1,0）12最优模型,通过回代拟合和预测得出该模型拟合优度（R2）为0.71,平均绝对百分比误差（mean absolute percentage error, MAPE）为24.91%。结论气象因素在不同程度上影响着青海省肺结核的发病,本研究建立的最优ARIMAX模型可用于预测肺结核发病。

关键词：肺结核地理加权回归气象因素 ARIMAX模型时间序列分析

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MicroRNA基因单核苷酸多态性和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗无或低免疫应答的关联性

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中国疫苗和免疫 2021年第4期27卷 370-376页

作者：李嘉铃董柏青苏永健吴琪俊杨庆利陈钦艳陈世艺谭超居昱李海广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室广西南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室广西南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室广西南宁530028 桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室广西桂林541000 广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所广西南宁530028

目的探讨MicroRNA基因单核苷酸多态性(SNP)和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗(HepB)无或低免疫应答的关联性。方法选取广西壮族自治区三家医院出生且已完成3剂HepB接种的8-9月龄儿童,采集血标本,开展乙型肝炎病毒(HBV)DNA含量和血清标志物... 详细信息

目的探讨MicroRNA基因单核苷酸多态性(SNP)和DNA甲基化与儿童乙型肝炎疫苗(HepB)无或低免疫应答的关联性。方法选取广西壮族自治区三家医院出生且已完成3剂HepB接种的8-9月龄儿童,采集血标本,开展乙型肝炎病毒(HBV)DNA含量和血清标志物检测、MicroRNA基因位点的基因型/等位基因SNP检测和DNA甲基化检测;比较HepB无/低应答和正常/高应答儿童MicroRNA基因位点的基因型/等位基因分布和DNA甲基化β值(中位数)。结果miR196A2基因rs11614913位点的基因型(C/C、C/T、T/T)和等位基因(C、T)、miR499基因rs3746444位点的基因型(G/G、G/A、A/A)和等位基因(G、A)的分布在110名无/低应答和391名正常/高应答儿童之间均无显著性差异。miR196A22基因204位点、miR499B基因44、80、162位点的DNA甲基化β值在104名无/低应答和159名正常/高应答儿童之间均有显著性差异(0.028 vs 0.024,Z=-2.12,P=0.017;0.963 vs 0.956,Z=-2.43,P=0.007;0.965 vs 0.958,Z=-1.92,P=0.028;0.976 vs 0.973,Z=-1.93,P=0.027)。结论本研究中儿童HepB无/低免疫应答与MicroRNA基因SNP无显著性关联,而可能与miR196A22基因204位点、miR499B基因44、80和162位点的DNA甲基化存在关联。

关键词： MicroRNA基因单核苷酸多态性 DNA甲基化乙型肝炎疫苗免疫应答

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