目的 通过生物信息学分析研究索拉非尼(sorafenib)耐药及敏感的肝癌细胞间基因表达的差异,找出关键的差异表达基因,从而预测在肝细胞癌对索拉非尼耐药发生发展中的关键基因。方法 从GEO数据库中下载GSE26391基因数据(包含4个对索拉非尼敏感的肝癌细胞样本,4个对索拉非尼耐药的肝癌细胞样本)。利用Morpheus在线软件分析,筛选出差异表达基因。运用Human Protein Atlas数据库分析差异表达基因乳酸脱氢酶B(LDHB)在肝癌与正常肝组织中的蛋白表达水平。并进一根据LDHB在肝癌患者中的表达高低进行分组后行生存分析。利用在线数据库LinkedOmics分析肝癌中与LDHB表达相关的靶基因。结果 基因芯片GSE26391数据分析显示,相比于对索拉非尼敏感肝癌细胞,在索拉非尼耐药肝癌细胞中LDHB表达上调。Human Protein Atlas数据库分析显示,与正常肝组织相比,LDHB在肝细胞癌组织中表达上调。生存分析显示,LDHB高表达的肝癌患者预后相对较差。LinkedOmics数据库分析显示Vimentin、ZEB1、ZEB2、Snial等EMT相关关键蛋白与LDHB表达正相关。结论 LDHB通过上调Vimentin、ZEB1、ZEB2、Snial蛋白,可能促进EMT的发生,从而介导肝癌中索拉非尼的耐药。
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