目的为了便于食管癌大规模流行病学筛查工作的开展,探讨一种能快速敏感地检测口腔牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,***)DNA的免核酸抽提直接PCR方法。方法收集我院门诊100例体检人员的200份口腔拭子(每人双份),以TE buffer(10 mM Tris,0.1 mM EDTA,pH 8.0)、商品化裂解液以及核酸抽提试剂盒等作为基因组提取试剂,使用***特异引物探针进行直接定量PCR检测。结果与裂解液-直接qPCR法相比,TE-直接qPCR法的灵敏度为94.12%,特异性为100%;与试剂盒-qPCR法相比,TE-直接qPCR法的灵敏度与特异性均为100%;TE-直接qPCR法与裂解液-直接qPCR法以及与试剂盒-qPCR法检测***均具有高度一致性(分别为Kappa=0.954,Kappa=1);TE-直接qPCR法与试剂盒-qPCR法检测阳性***的Ct均值无显著差异(P=0.907)。结论TE-直接qPCR法检测口腔***灵敏度高、特异性强,是快速高效检测口腔***的理想方法,可用于食管癌大规模分子流行病学研究。
目的网络药理学是一门新兴的交叉学科,综合生物学、药学、数学和计算机科学等技术构建药物作用靶点与疾病间的复杂关系网络,从而分析药物作用机制。多组分、多靶点、组分间协同作用是中药的特点,因其成分复杂,系统庞大,研究人员开展药物成分作用机制研究难度极大,基于此本文介绍一款分析中药有效成分、药物作用靶点以及与疾病相关药物作用靶点网络的综合数据库TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform),旨在帮助临床研究人员一站式实现中药复方网络药理学分析及其可视化,TCMSP数据库通过预测算法获得中药成分及其替代品作用疾病靶点间的关系,加深研究人员从基因层面对药理作用的认识,了解药物如何在特定途径、不同细胞类型以及不同患者中发挥作用,从而促进药物联合疗法的开发。
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