检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2024年第8期22卷 2555-2563页

作者：邱春桃梁芳梅吕颖王鹏良朱鹏张虹许尤厚北部湾大学广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室钦州535011

以细基江蓠为研究对象,选取其线粒体基因组序列中以AUG为起始密码子且长度大于300 bp的22条非重复序列来进行密码子偏好性分析。结果表明:密码子第3位的平均GC含量为14.60%;ENC的分布范围为28.48~43.36,平均值为36.51;RSCU值>1的密... 详细信息

以细基江蓠为研究对象,选取其线粒体基因组序列中以AUG为起始密码子且长度大于300 bp的22条非重复序列来进行密码子偏好性分析。结果表明:密码子第3位的平均GC含量为14.60%;ENC的分布范围为28.48~43.36,平均值为36.51;RSCU值>1的密码子共有29个,且密码子全部是以A或U结尾。中性绘图分析显示,GC_(12)与GC_(3)之间的相关系数为0.297,相关性未达到显著水平;ENC-plot分析发现,大部分基因位于标准曲线的附近;PR2-plot绘图分析显示,密码子第3位碱基含量T>A、G>C;对应性分析表明,第1、第2、第3、第4向量轴的贡献率分别为23.96%、11.15%、9.95%和6.38%,第1向量轴与GC、CAI、ENC、GC_(3s)均无显著相关,最终把AUA、CUU、CCA、ACU、GCU、GAA、UGA、CGA、AGU和AGA 10个密码子确定为最优密码子。研究结果为今后优化细基江蓠线粒体基因组密码子,提高表达效率和改良细基江蓠目标性状提供理论基础。

关键词：细基江蓠线粒体基因组密码子偏好性最优密码子

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密度胁迫对大口黑鲈游泳行为及肌肉能量代谢的影响

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南方水产科学 2024年第2期20卷 102-110页

作者：李江涛张艳秋张虹刘春邱小龙陈铭方俊超邱晓桐林蠡吕晓静仲恺农业工程学院/广州市水产病害与水禽养殖重点实验室广东广州510225 北部湾大学/广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

过高的养殖密度会导致鱼类生长受到抑制,为探明大口黑鲈(Micropterus salmoides)应对密度胁迫的行为生理响应,设置了低(90尾·m^(-3))、中(110尾·m^(-3))、高(130尾·m^(-3))3个密度梯度,研究了大口黑鲈在胁迫1周后的游泳... 详细信息

过高的养殖密度会导致鱼类生长受到抑制,为探明大口黑鲈(Micropterus salmoides)应对密度胁迫的行为生理响应,设置了低(90尾·m^(-3))、中(110尾·m^(-3))、高(130尾·m^(-3))3个密度梯度,研究了大口黑鲈在胁迫1周后的游泳行为及红、白肌肉能量代谢相关酶的基因表达和活性变化。结果表明:大口黑鲈游泳频率、摆尾频率和游泳速度均随密度呈显著升高趋势(P<0.05)。密度对大口黑鲈红肌己糖激酶(HK)、磷酸果糖激酶(PFK)和乳酸脱氢酶(LDH)等无氧代谢酶的基因表达和活性无显著性影响(P>0.05)。密度由低水平升至中水平时,大口黑鲈红肌丙酮酸脱氢酶(PDH)、柠檬酸合酶(CS)和苹果酸脱氢酶(MDH)等有氧代谢酶的基因相对表达量显著上调且酶活性显著上升(P<0.05),密度由低水平升至高水平时,大口黑鲈红肌PDH、CS和MDH等有氧代谢酶以及白肌HK、PFK和LDH等无氧代谢酶的基因相对表达量显著上调且酶活性显著上升(P<0.05)。研究表明,密度通过改变大口黑鲈游泳行为来影响肌肉能量代谢,中密度主要依靠红肌有氧代谢供能,高密度则主要依靠红肌有氧代谢和白肌无氧代谢来参与能量供应。

关键词：大口黑鲈密度胁迫游泳行为有氧代谢无氧代谢基因表达

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卵形鲳鲹TLR13基因的克隆、表达分析和亚细胞定位研究

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渔业科学进展 2023年第3期44卷 85-96页

作者：毛美琴蓝桢宇黄凤萍郭锡燚乐蒙胥鹏吴颖瑞彭银辉蔡小辉北部湾大学海洋学院、广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州536011

Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)是一种古老的先天性免疫受体,参与病原体相关分子模式识别,对维持免疫稳态和预防感染至关重要。本研究克隆和鉴定了卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)TLR13基因(命名为ToTLR13),其开放阅读框(ORF)为1269 ... 详细信息

Toll样受体(Toll-like receptor,TLR)是一种古老的先天性免疫受体,参与病原体相关分子模式识别,对维持免疫稳态和预防感染至关重要。本研究克隆和鉴定了卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)TLR13基因(命名为ToTLR13),其开放阅读框(ORF)为1269 bp,编码422个氨基酸,等电点为8.13。保守结构域分析显示,ToTLR13含有跨膜结构域(TM)、LRR结构域和TIR结构域,符合TLR家族的典型特征。通过建立TLR13保守域三级结构发现,ToTLR13与小鼠(Mus musculus)和大黄鱼(Larimichthys crocea)TLR13功能结构域的蛋白三级结构具有较高重叠性。多序列比对显示,ToTLR13与其他硬骨鱼TLR13具有较高的相似性,与其他纲物种的序列相似性较低。系统进化树结果显示,To TLR13与硬骨鱼TLR13聚在一起,其中与鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)最为接近,与哺乳动物、两栖类和贝类相分离。实时荧光定量PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)分析显示,ToTLR13在健康卵形鲳鲹的心、鳃、肾、头肾、肝、脾、脑和肌肉中普遍表达,其中鳃的表达量最高,其次是脾。ToTLR13在其鳃、脾、肝和肾免疫相关组织中的表达情况呈现出不同程度的上调,提示其经无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)和溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)免疫刺激后可能激活了炎症反应,启动了先天性免疫反应。亚细胞定位显示,ToTLR13定位于A549细胞质。本研究表明,ToTLR13在抵御病原菌免疫应答过程中可能发挥重要的作用,研究结果可为阐明脊椎动物TLRs的功能进化史提供基础资料。

关键词：卵形鲳鲹 TLR13 基因克隆表达谱亚细胞定位

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合浦珠母贝PfCLEC17A基因的克隆及表达分析

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华北农学报 2022年第5期37卷 230-238页

作者：郑玉斯王培郭颖白丽蓉喻达辉赵森北部湾大学广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

为了探究C型凝集素(C-type lectin)家族成员在合浦珠母贝机体内的作用及表达模式,为进一步解析合浦珠母贝PfCLEC17A的免疫应答机制,通过RACE技术克隆获得合浦珠母贝C型凝集素基因PfCLEC17A;利用生物信息学方法分析了PfCLEC17A的分子特征... 详细信息

为了探究C型凝集素(C-type lectin)家族成员在合浦珠母贝机体内的作用及表达模式,为进一步解析合浦珠母贝PfCLEC17A的免疫应答机制,通过RACE技术克隆获得合浦珠母贝C型凝集素基因PfCLEC17A;利用生物信息学方法分析了PfCLEC17A的分子特征,并通过荧光定量PCR检测PfCLEC17A基因在合浦珠母贝的鳃、外套膜、闭壳肌、性腺、血液、足和肝胰腺等组织及溶藻弧菌感染后在肝胰腺中的表达情况。结果显示,从合浦珠母贝中克隆获得新的C型凝集素基因PfCLEC17A,cDNA全长为699 bp,其中开放阅读框(ORF)长534 bp,编码178个氨基酸残基,含有一个CTL结构域。系统进化树分析表明,合浦珠母贝与其他贝类的PfCLEC17A基因聚集在一个分支。实时荧光定量PCR结果显示,PfCLEC17A在合浦珠母贝的鳃、外套膜、闭壳肌、性腺、血液、足和肝胰腺等各个组织中均有表达,其中在肝胰腺中的相对表达量最高且显著高于在其他组织中的相对表达量。肝胰腺作为软体动物重要的免疫器官,暗示PfCLEC17A基因可能参与机体免疫过程。藻弧菌感染1 h后,合浦珠母贝PfCLEC17A基因表达水平显著升高并达到最大值,说明该基因参与弧菌等微生物刺激的早期反应。综上所述,PfCLEC17A基因参与合浦珠母贝的免疫应激反应,具有一定的免疫功能。

关键词：合浦珠母贝 C型凝集素 PfCLEC17A 基因克隆基因表达

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珠母贝线粒体全基因组密码子偏好性分析

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广东海洋大学学报 2023年第2期43卷 127-134页

作者：谭传港喻达辉任童童徐志雄何积翠李素萍白丽蓉北部湾大学海洋学院广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

【目的】探究珠母贝(Pinctada margaritifera)线粒体全基因组密码子的使用偏好性,明确密码子偏好性的影响因素,为提高珠母贝外源基因表达效率及种质资源保护与遗传育种的研究提供理论依据。【方法】选取珠母贝线粒体基因组中大于300 bp... 详细信息

【目的】探究珠母贝(Pinctada margaritifera)线粒体全基因组密码子的使用偏好性,明确密码子偏好性的影响因素,为提高珠母贝外源基因表达效率及种质资源保护与遗传育种的研究提供理论依据。【方法】选取珠母贝线粒体基因组中大于300 bp的10条非重复编码序列,利用CodonW 1.4.2、Excel、SPSS 22.0等软件分析序列的密码子偏好性参数,以同义密码子相对使用度差值(△RSCU)> 0.08以及在高表达基因库中RSCU值>1.00为标准筛选最优密码子。【结果】珠母贝线粒体基因组密码子第1位GC(GC1)比例为35.2%~51.8%,平均值为45.6%;第2位GC(GC2)比例为35.8%~46.8%,平均值为40.0%;第3位GC(GC3)比例为37.7%~51.8%,平均值为44.1%;总GC比例为41.1%~47.5%,平均值为34.9%。密码子的适应指数(CAI)为0.119~0.181,平均值为0.151。密码子的偏好性指数(CBI)为-0.184~-0.04,平均值为-0.1048。最优密码子使用频率(FOP)为0.259~0.359,平均值为0.322。有效密码子数(ENC)为39.72~54.35,平均值为47.46。总平均亲水性Gravy)为0.216 6~1.038 5,平均值为0.7412。相对密码子使用度(RSCU)> 1.00的密码子数目为26个,主要以U(T)/G结尾。中性绘图、ENC-plot绘图和对应性分析均表明,珠母贝线粒体基因组密码子偏好更多受选择压力的影响。AGG、AUU、CCU、GAG、GCU、UGA等6个密码子为最优密码子。【结论】珠母贝线粒体基因组密码子偏好以U(T)/G结尾,筛选的6个最优密码子主要以U(T)/G结尾。珠母贝线粒体全基因组密码子的偏好性为弱偏好性,自然选择是偏好性形成的主要影响因素。

关键词：珠母贝密码子偏好性最优密码子线粒体基因组

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香港牡蛎糖原合酶与糖原磷酸化酶基因多态性研究及糖原含量性状相关分子标记挖掘

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海洋科学 2023年第7期47卷 35-43页

作者：贾真彭业韶孔令鑫秦越黎林杰梁柳朱鹏佘智彩北部湾大学海洋学院广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

香港牡蛎是我国南方沿海地区的主要经济贝类,糖原含量是衡量其品质高低的重要指标之一。本研究在转录组测序基础上,以三墩群体(SD,60只个体)和大风江群体(DFJ,90只个体)为研究对象,采用ELISA方法检测每个香港牡蛎糖原含量,并利用片段长... 详细信息

香港牡蛎是我国南方沿海地区的主要经济贝类,糖原含量是衡量其品质高低的重要指标之一。本研究在转录组测序基础上,以三墩群体(SD,60只个体)和大风江群体(DFJ,90只个体)为研究对象,采用ELISA方法检测每个香港牡蛎糖原含量,并利用片段长度差异等位基因特异性PCR(Fragment length discrepant allele specific PCR,FLDAS-PCR)技术开展糖原合酶和糖原磷酸化酶基因多态性研究,开发单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记。结果共开发25个SNPs,其中4个SNPs(Ch_GS680,Ch_GS1248,Ch_GP992和Ch_GP1962)在实验群体中分型成功,SPSS关联分析显示SNP位点Ch_GS680与糖原含量显著关联(P<0.05),暗示其可作为香港牡蛎糖原含量性状的潜在分子标记,研究结果为高糖原含量香港牡蛎新品种的分子标记辅助选育奠定了基础。

关键词：香港牡蛎糖原合酶糖原磷酸化酶 SNP FLDAS-PCR

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杨叶肖槿内生真菌多样性和抑菌活性研究

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西南农业学报 2024年第2期37卷 326-336页

作者：宋静静陆柳琳黎俊杰赵天义彭春艳曹宏明邱清华贾纪鑫龚斌广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011 北部湾大学广西钦州535011 钦州市农业技术推广中心广西钦州535099

【目的】对半红树药用植物杨叶肖槿(Thespesia populnea)内生真菌的多样性及其抑菌活性进行研究,为开发生态友好型抗菌剂提供参考依据。【方法】采用形态学和分子生物学相结合的方法,对广西北部湾沿海杨叶肖槿茎、叶和树皮组织中的内生... 详细信息

【目的】对半红树药用植物杨叶肖槿(Thespesia populnea)内生真菌的多样性及其抑菌活性进行研究,为开发生态友好型抗菌剂提供参考依据。【方法】采用形态学和分子生物学相结合的方法,对广西北部湾沿海杨叶肖槿茎、叶和树皮组织中的内生真菌进行分离鉴定。选用从柿树、核桃、荔枝中分离的炭疽菌(Colletotrichum)、香蕉枯萎病菌尖孢镰刀菌古巴专化型FOC1(Fusarium oxysporum *** 1)和FOC4(Fusarium oxysporum *** 4)、黄瓜瓜链格孢菌(Alternaria cucumerina)、白骨壤内生真菌链格孢菌(Alternaria alternata)和罗非鱼海豚链球菌(Streptococcus iniae)为指示菌,通过平板对峙法和滤纸片法对杨叶肖槿内生真菌提取物进行抗真菌和抗细菌活性筛选。【结果】从杨叶肖槿中共分离纯化出60株内真生菌,分属于5个属25个种。其中,炭疽菌属(Colletotrichum)和间座壳属(Diaporthe)为优势菌属,分离率为48.33%和26.67%;其余菌属分别是葡萄座腔霉属(Botryospha⁃eria)、亚隔孢壳属(Didymella)和小隐孢壳属(Cryptosporella),对应的分离率为15.00%、6.70%和3.33%。从杨叶肖槿树皮组织分离到的菌株最多,共分离到4个属23株菌,占总分离量的38.33%;其次为叶片组织(31.67%)和茎组织(30.00%)。发现12株内生真菌与NCBI数据库已公布ITS rDNA序列相似性低于95.00%,为潜在新种。抑菌结果表明,炭疽菌J1⁃20对8种指示菌均有较强的抑菌活性,对柿树炭疽菌、核桃炭疽菌、荔枝炭疽菌、香蕉枯萎病菌FOC1和FOC4、黄瓜瓜链格孢菌、白骨壤链格孢菌的抑菌率分别为39.39%、25.00%、19.10%、32.43%、28.20%、89.00%和74.19%,对罗非鱼海豚链球菌的抑菌圈为21.00 mm。【结论】杨叶肖槿内生真菌多样性丰富,分布较均匀。其中J1⁃20菌株对8种指示菌具有广谱抑菌性,有较好的开发潜力。

关键词：杨叶肖槿内生真菌多样性抑菌活性

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温度、盐度和pH对钝缀锦蛤耗氧率和排氨率的影响

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海洋科学 2022年第10期46卷 113-121页

作者：陆莉莉喻达辉李雷旭胡朝翟子钦陈健吴颖瑞白丽蓉北部湾大学广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

为探究温度、盐度和pH对钝缀锦蛤(Tapes dorsatus)耗氧率和排氨率的影响,作者采用室内实验生态学方法研究了不同温度、盐度和pH对钝缀锦蛤呼吸代谢的影响。实验设定了5个温度梯度(18℃、21℃、24℃、27℃、30℃)、5个盐度梯度(18、21、2... 详细信息

为探究温度、盐度和pH对钝缀锦蛤(Tapes dorsatus)耗氧率和排氨率的影响,作者采用室内实验生态学方法研究了不同温度、盐度和pH对钝缀锦蛤呼吸代谢的影响。实验设定了5个温度梯度(18℃、21℃、24℃、27℃、30℃)、5个盐度梯度(18、21、24、27、30)和5个pH梯度(5、6、7、8、9)。结果表明,温度对钝缀锦蛤的耗氧率影响显著(P<0.05),但对排氨率影响不显著(P>0.05),在温度18~30℃范围内,耗氧率随温度的升高而升高,而排氨率随温度的升高先降后升;盐度对该贝的耗氧率和排氨率影响极显著(P<0.01),耗氧率和排氨率随盐度升高先上升后下降,耗氧率和排氨率峰值分别出现在盐度为27和24;pH对钝缀锦蛤的耗氧率和排氨率影响不显著(P>0.05), pH为6~9时,钝缀锦蛤的耗氧率和排氨率变化幅度较小。在温度18~30℃,耗氧率与排氨率之比(O∶N)为5.56~45.4;在盐度18~30,O∶N为17.14~40.09;在pH5~9范围内,O∶N为27.59~40.41。研究结果为进一步研究钝缀锦蛤的生理生态奠定了一定基础。

关键词：钝缀锦蛤(Tapes dorsatus) 温度盐度 pH 耗氧率排氨率

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温度和盐度对织锦巴非蛤耗氧率和排氨率的影响

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四川农业大学学报 2023年第2期41卷 360-364页

作者：陆莉莉喻达辉覃绥杰陈健赵森白丽蓉北部湾大学海洋学院/广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室广西钦州535011

【目的】探究温度和盐度对织锦巴非蛤(Paphia textile)耗氧率和排氨率的影响,为该贝的繁育和养殖提供依据。【方法】采用实验生态学方法研究温度(10、15、20、25、30℃)和盐度(15、20、25、30)对织锦巴非蛤耗氧率和排氨率的影响。【结... 详细信息

【目的】探究温度和盐度对织锦巴非蛤(Paphia textile)耗氧率和排氨率的影响,为该贝的繁育和养殖提供依据。【方法】采用实验生态学方法研究温度(10、15、20、25、30℃)和盐度(15、20、25、30)对织锦巴非蛤耗氧率和排氨率的影响。【结果】温度在10~30℃时,随着水温的升高,织锦巴非蛤的耗氧率逐渐增大,而排氨率先增加后下降,20℃时达到最大值;盐度在15~30时,随盐度的升高,织锦巴非蛤的耗氧率逐渐增大,排氨率也逐渐增大,当盐度为25时,排氨率略有下降。在盐度29,水温10~30℃范围内,织锦巴非蛤的O∶N值为16.320~71.046,平均值为31.692。在水温24℃,盐度为15~30时,O∶N值为10.459~32.974,平均值为19.060。在本实验条件下,根据数据得出耗氧率与温度的拟合方程:y=0.027 7x+0.130 1,R2=0.985 2;排氨率与温度:y=-0.000 2x^(2)+0.007 8x-0.045 4,R^(2)=0.808 4;耗氧率与盐度:y=0.047 2x-0.637 4,R2=0.922;排氨率与盐度:y=-0.000 2x^(2)+0.010 2x-0.117 9,R2=0.767 3;O∶N与温度:y=0.296 5x^(2)-9.898x+96.218,R2=0.874 1;O∶N与盐度:y=0.233 4x^(2)-11.58 1x+154.21,R^(2)=1。【结论】织锦巴非蛤生存的最适温度为25℃,最适盐度为25。

关键词：织锦巴非蛤耗氧率排氨率温度盐度

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茶多酚对牡蛎酶解液的风味改善作用

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食品与发酵工业 2023年第11期49卷 147-154页

作者：张自然李雪霜游刚方怀义陈静庞庭才广西北部湾海洋生物多样性养护重点实验室(北部湾大学) 广西壮族自治区钦州535011 北部湾大学食品工程学院广西壮族自治区钦州535011

为研究茶多酚对牡蛎酶解液风味的影响,在探讨酶解时间、茶多酚处理方式和添加剂量对牡蛎酶解液水解度和感官评分的影响基础上,借助电子鼻和GC-MS对茶多酚处理前后牡蛎肉酶解液中的挥发性风味物质进行比较鉴定。结果表明:酶解会引起牡蛎... 详细信息

为研究茶多酚对牡蛎酶解液风味的影响,在探讨酶解时间、茶多酚处理方式和添加剂量对牡蛎酶解液水解度和感官评分的影响基础上,借助电子鼻和GC-MS对茶多酚处理前后牡蛎肉酶解液中的挥发性风味物质进行比较鉴定。结果表明:酶解会引起牡蛎风味变差;酶解前添加茶多酚可显著改善牡蛎酶解液的风味,且不会影响氨基态氮的释放,最佳添加剂量为0.4%;从牡蛎酶解液及茶多酚预处理牡蛎酶解液中分别鉴定出31和23种挥发性化合物,共同被检测出的成分有13种;关键性风味化合物分别为8种和5种,同时分别有6种和4种挥发性化合物对两组酶解液的风味起重要的修饰作用。结合感官数据和电子鼻分析结果,研究发现酶解前添加0.4%茶多酚不会显著影响氨基态氮的释放,可通过改变挥发性成分的组成及含量,有效减弱酶解液的腥臭味,提升果香味,从而达到改善牡蛎酶解液风味的效果。

关键词：牡蛎酶解液风味茶多酚气相色谱-质谱法

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