检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2016年第2期35卷 265-268页

作者：杨芙柳张曼清廖烈君秦明敏韦骁元莫静雯尹利君赵文婧曾麒燕广西医科大学基础医学院南宁530021 广西医科大学生物化学与分子生物学教研室南宁530021 广西医科大学组织学与胚胎学教研室南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室南宁530021

为探索红桂木凝集素(Artocarpus Lingnanensis Lectin,ALL)受体在正常生理情况下大鼠消化系统的分布情况,本研究首先经Gal-Sepharose 6B亲和层析,从红桂木种子中分离纯化获红桂木凝集素,并进行辣根过氧化物酶(HRP)标记。其次从健康的大... 详细信息

为探索红桂木凝集素(Artocarpus Lingnanensis Lectin,ALL)受体在正常生理情况下大鼠消化系统的分布情况,本研究首先经Gal-Sepharose 6B亲和层析,从红桂木种子中分离纯化获红桂木凝集素,并进行辣根过氧化物酶(HRP)标记。其次从健康的大鼠中取出胃、肝、小肠、大肠,经固定、石蜡包埋、切成4μm的片段,再用HRP标记的红桂木凝集素进行染色,观察ALL受体的分布情况。结果发现ALL受体主要分布于肝脏组织的肝血窦,而在胃、大肠、小肠等组织中无ALL受体的分布。结论:ALL受体几乎不表达在消化系统的组织细胞。

关键词：大鼠消化组织红桂木凝集素受体辣根过氧化物酶

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CDK1、CCNB1和NDC80与乙型肝炎相关肝细胞癌的预后和进展相关:基于生物信息学方法

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南方医科大学学报 2021年第10期41卷 1509-1518页

作者：李玉杰吴登强韦常宏杨雪佳周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西南宁530021 广西医科大学长寿与老年相关疾病教育部重点实验室广西南宁530021 广西医科大学广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室广西南宁530021

目的探讨HBV转化为HCC相关的关键基因,并探索相关的分子机制。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中GSE55092、GSE84044和GSE121248的mRNA微阵列数据,其中包括119个HBV相关的HCC组织和252个HBV相关的非肿瘤组织。“sva”R包用于去除批间... 详细信息

目的探讨HBV转化为HCC相关的关键基因,并探索相关的分子机制。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中GSE55092、GSE84044和GSE121248的mRNA微阵列数据,其中包括119个HBV相关的HCC组织和252个HBV相关的非肿瘤组织。“sva”R包用于去除批间差。进行整合分析,获取HBV相关肝癌和HBV组织中的差异表达基因(DEGs),通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析对差异表达基因进行功能注释。使用相互作用基因搜索工具(STRING)构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,挖掘最重要的模块和关键基因。cBioportal用于分析hub基因的相关性。利用Kaplan-Meier和Oncomine数据库对TCGA数据库中肝癌基因表达数据进行验证,探讨hub基因与肝癌发生、发展和预后的关系。通过逆转录定量PCR(RT-qPCR)实验验证17对临床肝细胞癌样本与邻近非肿瘤组织中hub基因的表达。结果共获得121个DEGs(P<0.01),鉴定出3个遗传标记,细胞周期素依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)和核分裂周期蛋白80(NDC80),与细胞周期、嘧啶代谢和DNA复制有关,这3个基因高度相关(P<0.05)。UALCAN数据库证实这些基因在肝癌组织中高表达并获得相关预后信息。Kaplan-Meier表明,它们与HCC患者的低存活率相关。CDK1、CCNB1和NDC80与肝癌分级相关(P<0.05),RT-qPCR实验证实CDK1、CCNB1和NDC80的mRNA在肝细胞癌中的表达明显高于癌旁组织。结论CDK1、CCNB1和NDC80基因可作为HBV相关肝细胞癌的预后标志物,在肝癌的基础研究和临床治疗方面有一定的应用价值。

关键词：肝细胞癌慢性乙型肝炎病毒关键基因 CDK1 CCNB1 NDC80

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无机纳米材料在神经胶质瘤诊疗中的应用与特点

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中国生物化学与分子生物学报 2020年第6期36卷 627-633页

作者：兰颖邓桥妹刘斯佳广西医科大学广西生物医药协同创新中心再生医学重点实验室基础医学院生物化学与分子生物学教研室转化医学研究中心长寿与老年相关疾病教育部重点实验室南宁530021

神经胶质瘤是中枢神经系统中恶性程度与侵袭性最高的肿瘤之一,其难治性和高致死性亟需尽快开发新的诊疗方法。近年来,各种无机纳米材料独特的内在物化特性的探索应用,为神经胶质瘤的早期诊断和靶向治疗带来了新希望。该文系统地介绍了... 详细信息

神经胶质瘤是中枢神经系统中恶性程度与侵袭性最高的肿瘤之一,其难治性和高致死性亟需尽快开发新的诊疗方法。近年来,各种无机纳米材料独特的内在物化特性的探索应用,为神经胶质瘤的早期诊断和靶向治疗带来了新希望。该文系统地介绍了当前已应用于神经胶质瘤诊疗研究的一些重要无机纳米材料,包括纳米金、纳米银、超顺磁性氧化铁、石墨烯、碳纳米管、介孔硅、半导体量子点、上转换纳米材料、层状双氢氧化物以及二硫化钼。在神经胶质瘤诊断方面,超顺磁性氧化铁、量子点和上转换纳米材料等无机纳米材料,具有优异的肿瘤组织成像性能,能提高诊断的灵敏性,可实现对神经胶质瘤的早期诊断和实时监测;在治疗方面,大多数无机纳米材料进行功能性修饰后用作靶向药物载体,可加载多种抗癌的药物、基因和抗体等,提高靶向输送能力,以实现对胶质瘤的靶向治疗,延长药物在体内的半衰期,同时减少全身副作用;其中,纳米金和纳米银还可用于神经胶质瘤放射增敏治疗,碳纳米管和超顺磁性氧化铁可分别用于神经胶质瘤光热治疗和磁热治疗,达到安全特异的治疗效果。这些无机纳米材料尽管在体内降解、靶向可控性、个体化等技术性问题上还需要进一步解决,但其探索应用已为神经胶质瘤治疗研究提供了新的方向。

关键词：无机纳米材料神经胶质瘤诊断治疗

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白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析

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基因组学与应用生物学 2016年第1期35卷 183-189页

作者：马成通钱洁颖刘镛陶晨陈苏荷玲晁耐霞吴耀生广西医科大学生物化学与分子生物学教研室南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室南宁530021 广东医学院药学院东莞523808 桂林医学院桂林541004

为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合... 详细信息

为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因c DNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 k D。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。

关键词：白皮黄瓜鲨烯合酶 RACE 基因克隆生物信息学分析

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马尔尼菲青霉基于pkuB基因缺失的高效基因打靶系统构建

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基因组学与应用生物学 2015年第4期34卷 754-762页

作者：卢姗蓝秀万陶玉婷王超梁晓乐梁莹黄勇奇贺菽嘉何志义广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室南宁530021 广西医科大学基础医学中心实验室南宁530021 广西医科大学基础医学研究重点实验室南宁530021 广西医科大学生物分子医学研究重点实验室南宁530021 广西医科大学基础医学院微生物学教研室南宁530021 广西医科大学第一附属医院呼吸科南宁530021

马尔尼菲青霉是温度依赖双相性条件性致病真菌,可感染免疫缺陷人群,区域流行于东南亚和我国南方。马尔尼菲青霉已成为研究真菌双相形态转换和病原-宿主相互作用分子机制的模式系统。功能基因组学研究为深入探讨马尔尼菲青霉双相转换和... 详细信息

马尔尼菲青霉是温度依赖双相性条件性致病真菌,可感染免疫缺陷人群,区域流行于东南亚和我国南方。马尔尼菲青霉已成为研究真菌双相形态转换和病原-宿主相互作用分子机制的模式系统。功能基因组学研究为深入探讨马尔尼菲青霉双相转换和致病分子机制提供了线索,大量的候选基因功能需要高通量的基因修饰方法验证。在许多真菌中已建立基于阻断DNA非同源重组修复途径提高基因打靶效率的实验研究模型。本文报道在马尔尼菲青霉中通过缺失马尔尼菲青霉非同源重组修复途径的关键组分PKUB同源基因pkuB构建了一个高效基因打靶系统。结果表明,以pkuB基因缺失菌株(△pkuB)为出发菌株能降低外源DNA片段的非同源末端连接重组的概率而显著提高基因打靶效率,pkuB基因缺失不影响菌落形态和双相转换能力。高效基因打靶分子遗传实验模型的建立为大规模进行马尔尼菲青霉基因功能研究提供了有力的工具。

关键词：马尔尼菲青霉 pkuB 基因打靶同源重组非同源重组末端链接

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细胞与分子免疫学杂志 2020年第10期36卷 884-889页

作者：李霞琼邓芸婷顾永耀高精洧罗育林文珍谢小薰贺菽嘉广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西南宁530021 广西医科大学第一附属医院病理科广西南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学基础医学院组织学与胚胎学教研室广西南宁530021

目的分析黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4)蛋白的理化性质、结构和功能,构建MAGE-D4真核表达载体。方法通过生物信息学软件分析MAGE-D4蛋白的理化性质、结构和功能。以MAGE-D4/pMAL-C2原核重组质粒为模板,经PCR扩增、酶切后与pEGFP-C1真核表... 详细信息

目的分析黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4)蛋白的理化性质、结构和功能,构建MAGE-D4真核表达载体。方法通过生物信息学软件分析MAGE-D4蛋白的理化性质、结构和功能。以MAGE-D4/pMAL-C2原核重组质粒为模板,经PCR扩增、酶切后与pEGFP-C1真核表达质粒连接,转化大肠杆菌。连接产物经抗生素筛选、酶切、测序鉴定后,通过脂质体转染A549肺癌细胞。结果MAGE-D4蛋白为不稳定亲水性蛋白,无跨膜结构和信号肽,二级结构以α螺旋为主,具有多个功能性修饰位点,主要定位在细胞核。SLLLVILGV可能为MAGE-D4来源的HLA-A*0201限制性T细胞表位。与MAGE-D4存在潜在相互作用的前3位蛋白依次是染色体成分4非结构维持蛋白同源物A(NSMCE4A)、T细胞识别的黑素瘤抗原1(MLANA/MART-1)、黑素瘤B抗原5(BAGE5)。测序结果证实重组质粒含有MAGE-D4的全长编码序列(CDS),能成功转染A549肺癌细胞。结论MAGE-D4蛋白为不稳定核蛋白,可通过与多种黑素瘤相关蛋白相互作用而发挥功能,其来源的短肽可能具有较强的免疫原性,并构建了MAGE-D4真核表达载体。

关键词：黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4) 生物信息学分析 pEGFP-C1

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基于TCGA分析GALNT14在肾透明细胞癌中的表达及预后意义

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广西科学 2022年第6期29卷 1111-1124页

作者：韦玉琴吴帆张胜锋谭炎林臧宁晁耐霞吴群英周青鸟广西医科大学基础医学院广西南宁530021 广西医科大学广西高等学校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西南宁530021

本研究拟探索N-acetylgalactosaminyltransferase 14 ( GALNT14)的表达水平对肾透明细胞癌(Kidney Renal Clear Cell Carcinoma, KIRC)的临床预后意义及其在疾病进展中的功能。从The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库获取肾透明细胞癌的临床信息和相应的mRNA表达数据,使用R语言进行差异表达分析和配对差异表达分析,检测 GALNT14在肾透明细胞癌的表达;通过Logistic回归分析、Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析探究 GALNT14的表达量与肾透明细胞癌临床特征的相关性;从STRING数据库中获得GALNT14相互作用的蛋白质,通过Linkedomics和GeneMANIA数据库分析GALNT14的蛋白质-蛋白质相互关系;通过基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)探索 GALNT14在肾透明细胞癌中介导的生物信号通路。结果表明,肾透明细胞癌组织中 GALNT14的mRNA相对表达量显著高于癌旁组织;肾透明细胞癌 GALNT14的高表达与肿瘤原发灶大小、Tumor Node Metastasis (TNM)分期、患者年龄、组织分级显著相关;肾透明细胞癌患者 GALNT14的高表达与患者总生存率(Overall Survival, OS)正相关,与无病生存率(Disease Free Survival, DFS)负相关;GALNT14可作为肾透明细胞癌患者的独立预后因子;GALNT14的共调控基因与肾透明细胞癌关系密切;GALNT14的高表达与肿瘤细胞中氨基酸代谢、脂肪酸代谢和糖代谢等信号通路相关。因此, GALNT14在肾透明细胞癌中高表达且与患者预后相关,可作为该疾病的独立预后因子。

关键词：肾透明细胞癌 GALNT14 生物信息学表达分析预后因子

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胞内DNA感受器及其在癌症中的研究进展

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生命科学 2023年第9期35卷 1192-1199页

作者：葛刘欣周佳敏林玮李科志周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室长寿与老年相关疾病教育部重点实验室广西高校生物分子医学研究重点实验室区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室南宁530021

胞内DNA感受器是DNA片段的模式识别受体(pattern recognition receptor, PRR),通过激活细胞内部的不同信号通路参与调控先天免疫防御和细胞程序性死亡,不同感受器之间存在调节作用,共同维持机体的稳态。随着研究的深入,发现胞内DNA感受... 详细信息

胞内DNA感受器是DNA片段的模式识别受体(pattern recognition receptor, PRR),通过激活细胞内部的不同信号通路参与调控先天免疫防御和细胞程序性死亡,不同感受器之间存在调节作用,共同维持机体的稳态。随着研究的深入,发现胞内DNA感受器的表达在肿瘤的发生发展中发挥重要作用,其参与肿瘤免疫调节的功能有望作为抗癌新靶点,为临床肿瘤治疗提供更多新方向。本综述旨在介绍胞内DNA感受器的激活机制和肿瘤调节机制,及其在临床抗癌研究和应用中的最新进展。

关键词： DNA感受器模式识别受体免疫防御细胞死亡肿瘤调节机制

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黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4)多克隆抗体的制备和应用

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细胞与分子免疫学杂志 2017年第1期33卷 104-108页

作者：贺菽嘉顾永耀肖绍文张庆梅陈芳罗彬付骏谢小薰广西医科大学生物化学与分子生物学教研室广西南宁530021 广西医科大学广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学第一附属医院广西南宁530021 广西医科大学组织学与胚胎学教研室广西南宁530021 广西医科大学广西高校基础医学研究重点实验室广西南宁530021

目的制备兔抗人黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4)多克隆抗体,鉴定其免疫学特性,并进行初步应用。方法对构建的p MAL-C2/MAGE-D4重组质粒进行原核表达及纯化,获得MBP/MAGE-D4融合蛋白,并以此蛋白免疫新西兰兔制备多克隆抗体。抗体经蛋白A凝胶... 详细信息

目的制备兔抗人黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4)多克隆抗体,鉴定其免疫学特性,并进行初步应用。方法对构建的p MAL-C2/MAGE-D4重组质粒进行原核表达及纯化,获得MBP/MAGE-D4融合蛋白,并以此蛋白免疫新西兰兔制备多克隆抗体。抗体经蛋白A凝胶柱亲和层析法纯化后,通过SDS-PAGE检测其纯度;间接ELISA、Western blot法检测抗体的效价及特异性;免疫组织化学染色法检测肺癌组织中MAGE-D4的表达及定位。结果获得纯度较高的抗MAGE-D4多克隆抗体,ELISA检测抗体的效价为1∶256 000,Western blot法分析显示MAGE-D4多克隆抗体可特异性识别MAGE-D4重组蛋白,免疫组织化学结果表明,该抗体能识别肺癌组织中的内源性MAGE-D4蛋白,表达的阳性率为69.6%(17/23)。结论制备的MAGE-D4多克隆抗体具有较高的特异性和灵敏度。

关键词：黑素瘤相关抗原D4(MAGE-D4) 多克隆抗体肿瘤相关抗原

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健康宿主马尔尼菲青霉病肺部受累三例报告并文献复习

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中国呼吸与危重监护杂志 2016年第1期15卷 12-16页

作者：戴小英陈欢李梅华张建全白晶邓静敏柳广南钟小宁蓝秀万何志义广西医科大学第一附属医院呼吸内科一病区广西南宁530021 广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西南宁530021 广西高校基础医学研究重点实验室广西南宁530021 广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021

目的探讨健康宿主感染马尔尼菲青霉菌的临床特征及临床诊治。方法回顾分析3例主要累及肺部、支气管及胸膜的健康宿主感染马尔尼菲青霉菌的病例报告,并以"马尔尼菲青霉病"为关键词检索国内外相关文献,筛选出健康宿主感染的病... 详细信息

目的探讨健康宿主感染马尔尼菲青霉菌的临床特征及临床诊治。方法回顾分析3例主要累及肺部、支气管及胸膜的健康宿主感染马尔尼菲青霉菌的病例报告,并以"马尔尼菲青霉病"为关键词检索国内外相关文献,筛选出健康宿主感染的病例进行文献复习。结果 3例健康宿主患者均以发热、咳嗽、淋巴结肿大、白细胞升高为主要临床表现,胸部影像学检查表明肺部均有累及。病例2纤维支气管镜下可见多个息肉样结节,病例3胸腔镜下可见脏壁层胸膜有较多粘连带和多个白色小结节。3例患者均培养出马尔尼菲青霉菌而确诊,抗真菌治疗有效但治疗时间长未能停药。36例相关健康宿主感染马尔尼菲青霉菌的文献报告中,临床症状以发热、咳嗽/咳痰、皮疹/皮肤脓肿以及白细胞升高最为常见,胸部影像学以肺部炎性浸润常见,治疗上以使用两性霉素B单用或者联合伊曲康唑最为常见,高达47.22%误诊为结核。结论健康宿主感染马尔尼菲青霉菌肺部表现为多样性,易误诊为结核病,治疗较其他真菌感染需要更长时间。

关键词：马尔尼菲青霉病健康宿主临床特征临床诊治

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