检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2016年第9期35卷 2222-2228页

作者：咸晓莹谢远亮叶娟汤瑞强蒋永华姚姿婷广西基因组与个体化医学研究重点实验室广西医科大学南宁530021

为了分析肠道内主要草酸降解细菌与肾结石疾病的相关性,本研究采集 29 名健康对照和 30 名肾结石患者的粪便样品提取微生物基因组 DNA,采用实时荧光定量 PCR 的方法,检测产甲酸草酸杆菌Oxalobacter formigenes)、乳杆菌属细菌 (Lactobac... 详细信息

为了分析肠道内主要草酸降解细菌与肾结石疾病的相关性,本研究采集 29 名健康对照和 30 名肾结石患者的粪便样品提取微生物基因组 DNA,采用实时荧光定量 PCR 的方法,检测产甲酸草酸杆菌Oxalobacter formigenes)、乳杆菌属细菌 (Lactobacillus)、双歧杆菌属细菌 (Bifidobacterium) 和肠杆菌科细菌(Enterobacteriaceae)这 4 种草酸降解细菌功能类群在总菌中相对含量的变化。结果显示 O. formigenes、Lact-%obacillus 和 Bifidobacterium 在肾结石病例组与健康对照组的肠道内的丰度无显著差异,而 Enterobacteriaceae在两组之间的差异显著。与健康对照组相比,Enterobacteriaceae 在肾结石病例组的丰度偏高(p=0.02);将肾结石病例组按照结石发生位置分为单发组和多发组,Enterobacteriaceae 在健康对照组与结石单发组的丰度无显著差异,但在结石多发组的丰度都显著高于健康对照组(p=0.001)与结石单发组(p=0.042)。结果提示Enterobacteriaceae 丰度可以作为一个灵敏的生物学指标,用于预测和评价宿主罹患多发肾结石的风险,有助于更深入的研究宿主和肠道菌群之间在肾结石发生发展中的相互作用,为从维持肠道微生态平衡角度进行针对性治疗提供参考。

关键词：草酸降解细菌肾结石多发肠杆菌科细菌实时荧光定量PCR

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人小细胞肺癌细胞株中CNDP2的检测及意义

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基因组学与应用生物学 2015年第7期34卷 1367-1371页

作者：林星谷陈迎春韦艳萍龙骏姚姿婷广西基因组与个体化医学研究重点实验室广西医科大学南宁530021

为了研究胞浆非特异性肽酶2(CNDP2)在人小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)中的作用,我们检测了29株人SCLC细胞株CNDP2的拷贝数和部分细胞株CNDP2的m RNA表达水平,并构建了CNDP2全长(CPGL)及可变剪切体(CPGL-B)过表达SCLC细胞稳转... 详细信息

为了研究胞浆非特异性肽酶2(CNDP2)在人小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)中的作用,我们检测了29株人SCLC细胞株CNDP2的拷贝数和部分细胞株CNDP2的m RNA表达水平,并构建了CNDP2全长(CPGL)及可变剪切体(CPGL-B)过表达SCLC细胞稳转株,初步分析了CPGL及CPGL-B对SCLC细胞生长和克隆形成的影响。结果表明,SCLC细胞株普遍存在CNDP2基因缺失和CPGL-B的m RNA表达水平降低的现象,CPGL和CPGL-B表达上调可抑制SCLC细胞克隆形成能力。可见,CNDP2在人小细胞肺癌中可能起着抑癌基因的作用。

关键词：人小细胞肺癌胞浆非特异性肽酶2 过表达

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UCP3、EIF2S1基因多态性与2型糖尿病患病风险的关联研究

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中国慢性病预防与控制 2021年第12期29卷 881-886页

作者：陈晓朗吕应楠董春婷谢链光杨海生张璐璐张海英广西医科大学公共卫生学院职业卫生与职业医学教研室广西南宁530021 广西高校高发疾病预防与控制研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学基因组与个体化医学研究中心广西基因组与个体化医学协同创新中心广西基因组与个体化医学研究重点实验室广西南宁530021 广西医科大学第三附属医院广西医科大学附属柳州市人民医院

目的探讨UCP3、EIF2S1基因多态性与2型糖尿病(T2DM)患病风险的关联,为T2DM的预防和治疗提供新的思路和科学依据。方法本研究基于"中国2型糖尿病患者肿瘤发生风险的流行病学研究"项目,按地理区域和经济状况选取南宁市3个社区... 详细信息

目的探讨UCP3、EIF2S1基因多态性与2型糖尿病(T2DM)患病风险的关联,为T2DM的预防和治疗提供新的思路和科学依据。方法本研究基于"中国2型糖尿病患者肿瘤发生风险的流行病学研究"项目,按地理区域和经济状况选取南宁市3个社区开展研究,研究对象均于2010—2015年到广西医科大学第一附属医院进行集中体检。采用病例对照研究,纳入774名T2DM患者为T2DM组,886名非T2DM患者为对照组。采用logistic回归分析基因多态性与T2DM的关联、与体质指数(BMI)的交互作用。采用线性回归分析基因多态性与临床代谢指标的关系。结果 logistic回归分析结果显示,EIF2S1基因rs6573769位点基因多态性与BMI存在交互作用(P_(交互)<0.01),与携带TT或TC基因型正常BMI者相比,携带CC基因型的超重和肥胖者可能与T2DM患病风险升高有关(OR=2.220,95%CI:1.560~3.159;OR=2.458,95%CI:1.438~4.201)。线性回归分析结果显示,UCP3基因rs7930460位点的显性模型下,与AA基因型携带者相比,AG或GG基因型携带者可能与糖化血红蛋白(HbA_(1C))水平的降低有关(β=-0.061,P<0.05),可能与高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平的升高有关(β=0.056,P<0.05)。结论 UCP3基因rs7930460位点、EIF2S1基因rs6573769位点多态性可能与T2DM风险有关。EIF2S1基因rs6573769位点与BMI存在交互作用,携带CC基因型的超重和肥胖者可能与T2DM患病风险的增加有关。

关键词： UCP3 EIF2S1 肥胖交互作用糖尿病 2型

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利用单细胞RNA测序探索NK细胞的异质性和特征的研究进展

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现代免疫学 2022年第5期42卷 447-451,456页

作者：包梦颖曾燕玉代艳莫曾南广西医科大学基因组与个体化医学研究中心南宁530021 广西基因组与个体化医学研究重点实验室南宁530021 广西基因组与个体化医学研究协同创新中心南宁530021 贵州省骨科医院检验科贵阳550002 广西医科大学第二附属医院急诊科南宁530021

NK细胞在先天性免疫和适应性免疫中发挥关键作用,探究NK细胞的新亚型和异质性有助于了解NK细胞的不同功能。单细胞测序技术能够无偏倚地对单个细胞进行分析,目前单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)已广泛应用于多个... 详细信息

NK细胞在先天性免疫和适应性免疫中发挥关键作用,探究NK细胞的新亚型和异质性有助于了解NK细胞的不同功能。单细胞测序技术能够无偏倚地对单个细胞进行分析,目前单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)已广泛应用于多个领域,尤其是在免疫学方面。该文总结了利用scRNA-seq技术进行NK细胞研究的策略,讨论了通过scRNA-seq技术揭示的NK细胞在不同组织中的异质性和功能。

关键词：自然杀伤细胞单细胞RNA测序异质性免疫微环境

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利用单细胞技术探究肿瘤相关巨噬细胞的特征

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实用医学杂志 2021年第3期37卷 281-285页

作者：代艳包梦颖曾燕玉刘云叶雨广西医科大学第二附属医院南宁530007 广西基因组与个体化医学研究重点实验室南宁530022 广西医科大学第一附属医院骨科南宁530021

许多研究揭示了巨噬细胞在多种疾病的发病机制中起到重要作用,而且暴露于不同的组织环境时可获得不同的表型和功能,尤其是在肿瘤组织中,以往已知的表面标记物已无法区分肿瘤中巨噬细胞亚群。而最近快速发展的质谱流式、单细胞RNA测序,... 详细信息

许多研究揭示了巨噬细胞在多种疾病的发病机制中起到重要作用,而且暴露于不同的组织环境时可获得不同的表型和功能,尤其是在肿瘤组织中,以往已知的表面标记物已无法区分肿瘤中巨噬细胞亚群。而最近快速发展的质谱流式、单细胞RNA测序,使全面绘制和研究肿瘤的各种细胞及其表型和功能成为可能。本综述通过总结这些技术在定义肿瘤中巨噬细胞亚群方面的进展,讨论不同肿瘤相关性巨噬细胞的特征表型和功能,寻找新的并具有治疗或预后潜力的生物学标记物,为今后肿瘤的临床免疫治疗提供一定的理论依据。

关键词：肿瘤相关性巨噬细胞单细胞技术肿瘤微环境异质性

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维生素D和心房颤动因果关系的孟德尔随机化研究

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广西医科大学学报 2020年第3期37卷 439-444页

作者：温政李明丽莫曾南广西医科大学基因组与个体化医学研究中心南宁530021 广西基因组与个体化医学研究重点实验室南宁530021

目的:采用两样本孟德尔随机化方法探索维生素D浓度与心房颤动(AF)发病风险的因果关系。方法:选择相互独立且与维生素D浓度相关的单核苷酸多态性位点作为工具变量,相应的AF汇总数据来自全基因组关联研究,该研究包括65446例AF病例和52274... 详细信息

目的:采用两样本孟德尔随机化方法探索维生素D浓度与心房颤动(AF)发病风险的因果关系。方法:选择相互独立且与维生素D浓度相关的单核苷酸多态性位点作为工具变量,相应的AF汇总数据来自全基因组关联研究,该研究包括65446例AF病例和522744例非AF病例。采用逆方差加权(IVW)方法估计因果效应值,并结合其他方法作为敏感性分析。结果:IVW方法结果显示,维生素D浓度与AF发病风险无关,其比值比(OR)为1.05(95%CI:0.84~1.31,P=0.667)。敏感性分析结果与IVW方法结果一致。MR-Egger回归表明遗传水平多效性未对结果造成偏倚(截距=0.015,P=0.092)。结论:两样本孟德尔分析结果显示,维生素D浓度和AF发病风险之间不存在因果关系,补充维生素D可能无法降低AF的发病风险。

关键词：孟德尔随机化维生素D 因果推断心房颤动

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全身运动质量评估预测不同孕周早产高危儿神经发育结局的效度比较

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中国康复理论与实践 2015年第6期21卷 683-688页

作者：林星谷林小苗邹林霞宋雄广西基因组与个体化医学研究重点实验室广西医科大学广西南宁市530021 广西壮族自治区妇幼保健院广西南宁市530021

目的比较全身运动（GMs）质量评估对不同孕周分组的早产高危儿神经发育结局的预测效度。方法按照妊娠28-31“周、32～33“周、34～36”周将180例研究对象分为A、B、C三组，分别进行扭动运动阶段GMs和不安运动阶段GMs评估。通过临床诊断... 详细信息

目的比较全身运动（GMs）质量评估对不同孕周分组的早产高危儿神经发育结局的预测效度。方法按照妊娠28-31“周、32～33“周、34～36”周将180例研究对象分为A、B、C三组，分别进行扭动运动阶段GMs和不安运动阶段GMs评估。通过临床诊断方法和Gesell发育量表，评估随访对象12月龄的运动发育结局，比较GMs评估在不同孕周分组中的预测效度。结果运动发育结局有133例发育正常，47例发育迟缓，其中10例脑瘫。对于运动发育异常的预测效度，扭动运动阶段GMs敏感性40．4％、特异性90．2％、阳性预测值59．4％和阴性预测值81．1％；不安运动阶段GMs敏感性27．7％、特异性99．2％、阳性预测值92．9％和阴性预测值79．5％。不同孕周分组间的GMs评估检出率无显著性差异（P=0．610，P=0．765，P=-0．290）。结论GMs评估特异性和阳性预测值中，不安运动缺乏的评估最高；其次是痉挛．同步性。GMs评估中不安运动缺乏及痉挛．同步性更能够准确区分运动发育结局有无异常。GMs评估对28～36^＋6周的早产儿神经运动发育异常检出率无显著性差异。

关键词：全身运动评估孕周早产儿高危预测效度

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男性睾酮与骨质疏松因果关系的两样本孟德尔随机化研究

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广西医科大学学报 2020年第4期37卷 710-721页

作者：黎远帆颜赟坤罗茜倩温政陈泽凤白玉兰龙新阳林睿莫曾南徐剑锋广西医科大学基因组与个体化医学研究中心南宁530021 广西基因组与个体化医学研究协同创新中心南宁530021 广西基因组与个体化医学研究重点实验室南宁530021

目的:运用两样本孟德尔随机化(MR)方法探讨男性血清睾酮水平与骨质疏松的因果关系,以发现新的治疗靶点。方法:以度他雄胺降低睾酮治疗前列腺癌的随机对照试验(n=3 225)的全基因组关联研究数据作为暴露数据集,来自骨质疏松症联盟的股骨颈... 详细信息

目的:运用两样本孟德尔随机化(MR)方法探讨男性血清睾酮水平与骨质疏松的因果关系,以发现新的治疗靶点。方法:以度他雄胺降低睾酮治疗前列腺癌的随机对照试验(n=3 225)的全基因组关联研究数据作为暴露数据集,来自骨质疏松症联盟的股骨颈(FN)和腰椎(LS)骨密度(BMD)的汇总数据(n=3 2965)作为结果数据集。采用逆方差加权法(IVW),MR-Egger回归和加权中位数法评估因果效应关系,其他方法用于敏感性分析。结果:共有3组工具变量:创新组1,创新组2和保守组。保守组IVW结果显示,遗传决定的较高睾酮水平与FN BMD(Beta=-0.07;95%CI:-0.17~0.04)或LS BMD(Beta=-0.06;95%CI:-0.18~0.07)之间没有因果关系。MR-Egger回归证明遗传水平多效性未对因果估计结果造成偏倚,且Q统计量也未显示存在异质性。3个工具变量组在3种MR分析方法中都获得一致结果。结论:血清睾酮水平与骨质疏松在男性人群中未发现有因果关系,这表明改变血清睾酮水平可能不会降低男性骨质疏松的发病风险。

关键词：睾酮骨质疏松骨密度孟德尔随机化

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孕前体重指数对妊娠期糖尿病发病影响及关键基因的鉴定

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基因组学与应用生物学 2021年第5期40卷 2338-2345页

作者：宋良黄诚龙俊青盘宗琴方芳龙禹蒋永华黄奕铭广西壮族自治区妇幼保健院新阳院区产科南宁530021 广西医科大学基因组与个体化医学研究中心南宁530021 广西医科大学第一附属医院南宁530021 上海市信号转导与疾病研究重点实验室上海200092

基于加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析妊娠期糖尿病胎盘组织mRNA与孕前体重指数(Pre-pregnancy body mass index,BMI)的相关性。寻找胎盘糖、脂代谢的关键基因,探索妊娠期糖尿病防治的新靶... 详细信息

基于加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)分析妊娠期糖尿病胎盘组织mRNA与孕前体重指数(Pre-pregnancy body mass index,BMI)的相关性。寻找胎盘糖、脂代谢的关键基因,探索妊娠期糖尿病防治的新靶点。2018年5~7月纳入广西壮族自治区妇幼保健院新阳院区孕妇39例,妊娠期糖尿病组18例,健康对照组21例。收集孕妇病历资料、胎盘组织、脐血样本。通过胎盘组织mRNA测序,进行基因网络与临床指标相关性分析。妊娠期糖尿病组的孕前BMI、收缩压、舒张压、口服糖耐量实验(oral glucose tolerance test,OGTT)血糖浓度较对照组的显著增高(P<0.05)。多因素logistic回归分析孕前BMI(OR=1.336,95%CI=1.078~1.655,P=0.008)。WGCNA分析提示胎盘基因表达模块MEdarkorange与孕前BMI具有密切相关性(r=0.33,P=0.04),将该模块进行基因本体(gene ontology,GO)与KEGG(kyotoencyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,富集到糖、脂代谢以及氧化代谢相关关键通路,c-JUN、FOS、EGR1是该模块的关键基因。以上结果表明孕前高BMI是妊娠期糖尿病的独立危险因素,c-JUN、FOS、EGR1可能是妊娠期脂、糖代谢的关键基因。

关键词：加权基因共表达网络分析妊娠期糖尿病孕前体重指数

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空腹胰岛素在体重指数与非酒精性脂肪性肝病之间的中介效应

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广西医科大学学报 2023年第3期40卷 497-503页

作者：黄彩虹韦玉霜韦春梦黄芳梅黎也新麦小游苏卉伟梁莉敏刘福强刘春奇廖金玲莫曾南李龙嫚广西医科大学基因组与个体化医学研究中心广西基因组与个体化医学研究重点实验室广西基因组与个体化医学研究协同创新中心南宁530021 广西医科大学公共卫生学院南宁530021 广西医科大学全科医学院南宁530021 广西医科大学第一附属医院泌尿肾病研究所南宁530021

目的:探讨空腹胰岛素(FINS)在体重指数与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)关联中的中介效应。方法:本研究共纳入389名NAFLD患者和1530名健康体检者。采用多因素logistic回归分析评估体重指数和FINS与NAFLD之间的关系;采用多因素线性回归分析... 详细信息

目的:探讨空腹胰岛素(FINS)在体重指数与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)关联中的中介效应。方法:本研究共纳入389名NAFLD患者和1530名健康体检者。采用多因素logistic回归分析评估体重指数和FINS与NAFLD之间的关系;采用多因素线性回归分析探讨体重指数与FINS之间的关系;采用Bootstrap法分析FINS在体重指数与NAFLD关联中的中介效应。结果:在调整相关混杂因素后,体重指数、FINS与NAFLD患病风险的关联具有统计学意义(OR=1.434,95%CI:1.352~1.521,P<0.001;ORFINS=1.048,95%CI:1.026~1.071,P<0.001);体重指数增加与FINS水平升高的关联具有统计学意义(B=0.723,95%CI:0.618~0.828,P<0.001);FINS在体重指数与NAFLD关联中具有中介效应(效应值0.034,95%CI:0.015~0.059),中介效应占比为8.61%。结论:FINS在体重指数与NAFLD的关联中发挥部分中介效应。

关键词：非酒精性脂肪性肝病空腹胰岛素体重指数中介效应

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