检索结果-内蒙古大学图书馆

中国现代中药 2023年第7期25卷 1428-1440页

作者：黄丽容郭晓云胡营韦筱媚雷明陈晓英李翠缪剑华广西壮族自治区药用植物园、广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023

目的:通过高通量测序技术获得香附子Cyperus rotundus L.全长转录组的信息特征,为深入挖掘香附子功能基因奠定基础。方法:通过PacBio Sequel高通量测序系统,对香附子根、茎、叶、花4个部位的混样进行全长转录组测序及生物信息学分析。结... 详细信息

目的:通过高通量测序技术获得香附子Cyperus rotundus L.全长转录组的信息特征,为深入挖掘香附子功能基因奠定基础。方法:通过PacBio Sequel高通量测序系统,对香附子根、茎、叶、花4个部位的混样进行全长转录组测序及生物信息学分析。结果:共获得195722条环形一致性序列(CCS)获得188243个高质量转录本,并注释了148563个转录本,检测出4349个转录因子和95118个简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)位点,还预测到64929个长链非编码RNA(lncRNA)和45337个mRNA,并通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据途径分析了13个参与萜烯合酶合成相关的基因,以及7个参与β-石竹烯合成相关的基因。结论:获得了较为可靠的香附子全长转录组数据,这将显著增强对香附子发育过程中植物化学生物合成调控基础的理解,可为深入研究香附子生物学特性、相关代谢途径、信号通路及分子机制提供数据支持。

关键词：香附子全长转录组测序分析功能注释

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羊踯躅的代谢组学研究

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中国现代中药 2023年第7期25卷 1535-1546页

作者：陈晓英胡营韦筱媚杨晓男李翠雷明黄宝优蓝祖栽韦坤华缪剑华广西壮族自治区药用植物园、广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023 广西壮族自治区药用植物园、广西中药资源普查与研究重点实验室广西南宁530023

目的:鉴定羊踯躅花、茎、叶的全部代谢物和不同部位间含量有差异的代谢物,分析差异代谢物的代谢通路。方法:采用广泛非靶向代谢组学对羊踯躅不同部位的代谢物进行比较分析。结果:共鉴定出535个代谢物,其中包括金合欢素、落新妇苷、苔黑... 详细信息

目的:鉴定羊踯躅花、茎、叶的全部代谢物和不同部位间含量有差异的代谢物,分析差异代谢物的代谢通路。方法:采用广泛非靶向代谢组学对羊踯躅不同部位的代谢物进行比较分析。结果:共鉴定出535个代谢物,其中包括金合欢素、落新妇苷、苔黑酚龙胆二糖苷、去甲蟛蜞菊内酯、补骨脂定、秦皮素、络塞维等49个在其他植物中分离鉴定出的具有药用活性的化合物;鉴定出差异代谢物202个,包括β-氰基丙氨酸、蜀黍苷和黄曲霉毒素G23个有毒代谢物,且这3个有毒代谢物分别在花、茎、叶中含量最高;鉴定出百里香酚、丹皮酚、欧芹酚、东莨菪内酯、异泽兰黄素、野鸢尾黄素、石蒜碱和豆甾醇8个有药用价值的化合物,其在花、茎、叶中含量差异有统计学意义;排名前4位的差异代谢物通路中,花、茎、叶共有的通路为精氨酸生物合成,丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢,以及氨酰基-tRNA生物合成通路,其中涉及花的通路还包括氰基氨基酸代谢通路。结论:羊踯躅中存在丰富的天然药用活性产物,使其药用价值并不限于毒性成分;氨基酸的合成与代谢是不同部位代谢物差异的主要原因。研究结果可为进一步筛选解析羊踯躅中药用价值较高的关键代谢物提供参考。

关键词：羊踯躅代谢组差异代谢物代谢通路

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广西莪术全长转录组测序及生物信息学分析

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中国现代中药 2023年第7期25卷 1417-1427页

作者：胡营彭玉德雷明唐美琼梁莹韦筱媚缪剑华广西壮族自治区药用植物园、广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023

目的:获取广西莪术的全长转录组信息,了解其转录组的整体水平,挖掘姜黄素类生物合成通路基因。方法:利用Pacbio Sequel测序平台对广西莪术根、茎、叶、花4个部位的混合样品进行全长转录组测序,结合生物信息学等方法进行功能注释、代谢... 详细信息

目的:获取广西莪术的全长转录组信息,了解其转录组的整体水平,挖掘姜黄素类生物合成通路基因。方法:利用Pacbio Sequel测序平台对广西莪术根、茎、叶、花4个部位的混合样品进行全长转录组测序,结合生物信息学等方法进行功能注释、代谢通路分析、简单序列重复(SSR)分析。结果:共获得原始数据14.47 Gb,经纠错、过滤、去冗余得到高质量一致性序列151218条。对所有转录本在非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、基因本体(GO)、真核生物相邻类的聚簇(KOG)、蛋白家族(Pfam)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和SwissProt七大功能数据库进行注释及分类,结果有128414个基因被注释,占比84.92%。共有325个基因参与姜黄素的生物合成,编码4-香豆酸-辅酶A连接酶、苯丙氨酸解氨酶、姜黄素合成酶、二酮-辅酶A合成酶、肉桂酸-4-羟化酶和咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶6个关键酶。MISA分析共发现32459个SSR位点,以单核苷酸重复数量最多,占全部重复类型的38.63%;1~3个核苷酸重复序列占主导位置,占总SSR位点的93.58%。结论:在高通量全长转录组水平对广西莪术进行研究,对姜黄素合成相关基因进行了挖掘,为后续阐明广西莪术姜黄素生物合成分子机制提供依据,为进一步研究广西莪术的分子标记和优良基因挖掘提供数据基础。

关键词：广西莪术全长转录组功能注释简单序列重复

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仙鹤草茎与叶的代谢组学比较分析

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中国现代中药 2023年第7期25卷 1599-1610页

作者：万斯杨晓男胡营刘寒韦坤华缪剑华广西壮族自治区药用植物园、广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023

目的:通过代谢组学分析仙鹤草茎与叶中代谢物及其代谢通路差异,进一步阐明仙鹤草药效物质基础,促进仙鹤草合理开发利用。方法:取仙鹤草茎、叶新鲜样本,经液氮冷冻后提取代谢物,采用液相色谱-质谱法检测,所得数据运用统计学方法分析并与... 详细信息

目的:通过代谢组学分析仙鹤草茎与叶中代谢物及其代谢通路差异,进一步阐明仙鹤草药效物质基础,促进仙鹤草合理开发利用。方法:取仙鹤草茎、叶新鲜样本,经液氮冷冻后提取代谢物,采用液相色谱-质谱法检测,所得数据运用统计学方法分析并与数据库比对鉴定。结果:筛选并鉴定出105个具有明显差异的代谢物,其中茎与叶相比有34个代谢物上调、71个代谢物下调。差异代谢物共注释到62条代谢通路中。茎中叶黄素、天冬酰胺、胍丁胺及多种氨基酸等物质含量更高,氨基酸代谢更强;叶中酚酸类、黄酮类物质积累更为丰富,次生代谢更强。结论:仙鹤草茎与叶均含有丰富的药效活性成分,但叶的次生代谢更强,次生代谢物积累更为丰富,此差异或可为仙鹤草针对性开发利用提供参考。

关键词：仙鹤草代谢组学差异代谢物代谢通路

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基于非靶向代谢组学的苍耳不同药用部位代谢产物特征分析

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中国现代中药 2023年第7期25卷 1529-1534页

作者：唐美琼蓝祖栽胡营韦筱媚韦桂丽梁莹韦范杨晓男秦双双缪剑华广西壮族自治区药用植物园、广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023

目的:分析苍耳不同药用部位之间代谢产物的差异。方法:采用超高效液相色谱-电喷雾离子源-质谱法(UPLC-ESI-MS)对苍耳根、茎和叶进行测定;用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)进行数据处理;通过对代谢物精确相对分子质量... 详细信息

目的:分析苍耳不同药用部位之间代谢产物的差异。方法:采用超高效液相色谱-电喷雾离子源-质谱法(UPLC-ESI-MS)对苍耳根、茎和叶进行测定;用主成分分析(PCA)和偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)进行数据处理;通过对代谢物精确相对分子质量及碎片信息的确认,结合软件数据库搜索鉴定代谢物;对差异代谢物进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:苍耳的根、茎和叶的化学组成得到有效区分,从3个部位中共鉴定出5902个代谢物,筛选出64个差异代谢物,主要富集在植物次生代谢物质的生物合成,癌症中的中央碳代谢,鸟氨酸、赖氨酸和烟酸生物合成生物碱等通路。结论:从苍耳根、茎和叶代谢产物差异的角度揭示不同部位药性、药效差异的物质基础,为苍耳类中药资源的最大化综合利用提供参考。

关键词：苍耳草非靶向代谢组学药用部位化学成分代谢通路

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广金钱草全长转录组测序分析

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中国现代中药 2023年第7期25卷 1441-1450页

作者：秦双双韦桂丽韦坤华韦筱媚胡营梁莹缪剑华广西壮族自治区药用植物园、广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023

目的:获得广金钱草Desmodium styracifolium(Osb.)Merr.全长转录组数据,深入挖掘其功能基因。方法:采用PacBio Sequel测序平台,对广金钱草的根、茎、叶3个部位混合样品进行全长转录组测序及分析。结果:共获得转录本140069条,N50长度为15... 详细信息

目的:获得广金钱草Desmodium styracifolium(Osb.)Merr.全长转录组数据,深入挖掘其功能基因。方法:采用PacBio Sequel测序平台,对广金钱草的根、茎、叶3个部位混合样品进行全长转录组测序及分析。结果:共获得转录本140069条,N50长度为1542 nt,其中118906个(84.89%)转录本被成功注释。非冗余蛋白(NR)数据库注释中,与广金钱草最相近的物种是豆科植物密花豆Spatholobus suberectus Dunn;真核生物相邻类的聚簇(KOG)数据库注释中,比对到一般功能预测的转录本最多,有18064个;基因本体(GO)数据库注释中,86459个转录本分布于生物学过程、细胞组成和分子功能三大类45个功能组;京都基因与基因组百科全书(KEGG)注释中,参与广金钱草生物合成和其他次生代谢转录本3721个。在基因结构分析中,共得到74174个编码序列、3663个转录因子。简单序列重复(SSR)分析表明,40456个SSR中腺嘌呤和鸟嘌呤(AG)/胞嘧啶和胸腺嘧啶(CT)、AAG/CTT分别是二碱基、三碱基中优势重复类型。结论:获得了广金钱草全长转录本,为其后续的分子研究提供数据支持。

关键词：广金钱草全长转录组基因注释基因结构

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岩黄连保育研究进展

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热带农业科学 2025年第3期45卷 164-170页

作者：黄彦棋李翠雷明张占江肖冬彭玉德广西壮族自治区药用植物园/国家中医药传承创新中心/广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023 广西大学农学院广西南宁530004

岩黄连(Corydalis saxicola Bunting)生于岩石隙缝中,广泛分布于喀斯特地貌。岩黄连是一种对肝脏病症有特殊疗效的中药材。为了推进国家二级重点保护野生植物岩黄连资源可持续发展,提高人们科学保育的意识,笔者在分析岩黄连保育现状与... 详细信息

岩黄连(Corydalis saxicola Bunting)生于岩石隙缝中,广泛分布于喀斯特地貌。岩黄连是一种对肝脏病症有特殊疗效的中药材。为了推进国家二级重点保护野生植物岩黄连资源可持续发展,提高人们科学保育的意识,笔者在分析岩黄连保育现状与问题的基础上,对其保育技术方法与应用、进展与突破展开综述。结合保育成果,分析带来的经济效益、社会效益、生态效益;阐述当前保育存在的挑战与限制,展望保育研究热点,将岩黄连保育融入生态建设中。

关键词：岩黄连保育意义保育现状保育措施

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蛇足石杉HsCAO2基因的克隆、生物信息学分析及载体构建

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中草药 2021年第23期52卷 7309-7316页

作者：刘爱佳陈晓英李翠闫志刚冯世鑫张占江雷明缪剑华广西壮族自治区药用植物园广西药用资源保护与遗传改良重点实验室广西南宁530023 广西中医药大学药学院广西南宁530200 广西壮族自治区药用植物园广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023 广西壮族自治区药用植物园广西南宁530023

目的为筛选高活性的蛇足石杉铜胺氧化酶(copper-containing amine oxidase,CAO),通过生物工程方法实现石杉碱甲(huperzine A,HupA)的合成、为加快新药创制进度提供理论依据。方法基于蛇足石杉转录组测序得到的CAO序列片段,利用c DNA末... 详细信息

目的为筛选高活性的蛇足石杉铜胺氧化酶(copper-containing amine oxidase,CAO),通过生物工程方法实现石杉碱甲(huperzine A,HupA)的合成、为加快新药创制进度提供理论依据。方法基于蛇足石杉转录组测序得到的CAO序列片段,利用c DNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术,扩增、拼接并验证获得该基因的全长c DNA序列,并将其命名为HsCAO2。结果通过RACE技术得到Hs CAO2的c DNA全长为2696 bp,CDS为2199 bp,编码732个氨基酸。氨基酸序列同源性比对发现,HsCAO2具有保守的氨基酸位点和Cu2+结合位点;进化树分析结果表明,HsCAO2与蛇足石杉中的另一个CAO(HsCAO1)同源性最高,达91.67%;蛋白质结构分析结果表明,HsCAO2也可能在生物体里以同源二聚体的形式存在。在此基础上,进一步分别构建了超表达载体pOX-Hs CAO2和体外蛋白表达载体pET-28a(+)-HsCAO2。结论HsCAO2很可能是蛇足石杉中的一个新的功能性CAO,且超表达载体和体外蛋白表达载体的成功构建为进一步研究其功能奠定了基础。

关键词：蛇足石杉石杉碱甲铜胺氧化酶基因克隆载体构建

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钙胁迫对瑶药岩黄连生长、光合特性及有效成分含量的影响

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中药材 2022年第12期45卷 2817-2821页

作者：黄丽容韦莹雷明张占江檀龙颜李翠广西壮族自治区药用植物园/广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心广西南宁530023 贵州中医药大学药学院贵州贵阳550025

目的:研究钙胁迫对瑶药岩黄连生长、光合特性及有效成分含量的影响。方法:以岩黄连Corydalis saxicola Bunting幼苗为实验材料,分别用浓度为0、4、30、100、300、400 mmol/L的CaCl_(2)溶液处理1个月苗龄的岩黄连幼苗,25 d后检测植物叶... 详细信息

目的:研究钙胁迫对瑶药岩黄连生长、光合特性及有效成分含量的影响。方法:以岩黄连Corydalis saxicola Bunting幼苗为实验材料,分别用浓度为0、4、30、100、300、400 mmol/L的CaCl_(2)溶液处理1个月苗龄的岩黄连幼苗,25 d后检测植物叶片的净光合速率及水分利用效率,并测定其生长指标、可溶性糖及内源钙离子含量,采用高效液相色谱法测量岩黄连碱含量。结果:在钙离子浓度为4 mmol/L时根冠比达到最大值,100 mmol/L时株高、茎粗和地上干重达到最大值,且增加钙离子处理浓度,能够有效提高岩黄连的折干率;岩黄连净光合速率(Pn)在CaCl_(2)浓度为400 mmol/L时达到最大值。水分利用效率(WUE)随着钙离子浓度升高呈现先升高再降低的趋势;内源钙离子和可溶性糖含量随外源钙离子浓度的升高而增加;岩黄连碱含量随着钙离子处理浓度的升高呈现先升高后降低的趋势。结论:通过提高细胞内渗透调节物质可溶性糖和内源钙含量,岩黄连对高钙环境表现较强的耐受性和较好的适应性。

关键词：岩黄连岩黄连碱钙胁迫理化特性高效液相色谱法

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药用植物密花豆染色体核型分析及分子鉴定

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扬州大学学报（农业与生命科学版） 2022年第6期43卷 105-110页

作者：秦双双谢月英梁莹胡营韦坤华陈成彬缪剑华广西药用植物园广西药用资源保护与遗传改良重点实验室南宁530023 广西药用植物园广西壮族自治区中药资源智慧创制工程研究中心南宁530023 南开大学生命科学学院天津300071

以密花豆根尖为材料,采用常规压片法进行染色体制片和核型分析,研究药用植物密花豆细胞学特征;通过PCR扩增密花豆ITS序列,构建系统发育树,评价密花豆资源的系统进化及品种间的亲缘关系。结果表明:密花豆为二倍体(2n=18),染色体相对长度... 详细信息

以密花豆根尖为材料,采用常规压片法进行染色体制片和核型分析,研究药用植物密花豆细胞学特征;通过PCR扩增密花豆ITS序列,构建系统发育树,评价密花豆资源的系统进化及品种间的亲缘关系。结果表明:密花豆为二倍体(2n=18),染色体相对长度为9.111%~13.373%,着丝粒指数为22.666%~48.392%,臂比值介于1.066~3.412之间,染色体组成为8M2+10M1,最长染色体与最短染色体之比为1.47,核型不对称系数为59.59%。密花豆与同属物种美丽密花豆亲缘关系最近,与胡枝属物种及国外物种亲缘关系较远。密花豆染色体核型公式为2n=2x=18=14m+2sm+2st(2SAT),第5对染色体具有随体,核型属于2A类型,在进化史上处于相对原始的地位,通过ITS序列构建系统发育树可对密花豆进行物种分子鉴定。

关键词：密花豆染色体制片核型分析分子鉴定

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