检索结果-内蒙古大学图书馆

2008年全国高性能计算机学术年会

作者：刘旭曹小林莫则尧北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京 100088

在并行自适应结构网格计算中，多个嵌套的网格层同时需要负载均衡。为了减少层间数据通信，本文设计了一种基于逐层投影的负载平衡算法。该算法包括逐层投影和逐层剖分阶段。第一个阶段将加密区域的父子网格投影到一起，第二个阶段逐层... 详细信息

在并行自适应结构网格计算中，多个嵌套的网格层同时需要负载均衡。为了减少层间数据通信，本文设计了一种基于逐层投影的负载平衡算法。该算法包括逐层投影和逐层剖分阶段。第一个阶段将加密区域的父子网格投影到一起，第二个阶段逐层多约束剖分各层网格。数值实验表明，本算法在减小层间通信和数据迁移方面有较好的效果。

关键词：高性能计算并行计算机网格计算负载平衡

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结构网格上局部一维显式离散格式的并行自适应计算

结构网格上局部一维显式离散格式的并行自适应计算

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2008年全国高性能计算机学术年会

作者：刘青凯北京应用物理与计算数学研究所决性能计算中心 liuqk@***

局部一维显式离散格式是构造高维流体力学计算格式的常用计算方法。本文给出了一个并行自适应显式时间积分算法，用于实现局部一维显式离散格式的并行自适应计算。基于JASMIN框架，以局部一维FCT格式为例实现该算法，形成一个用于模拟... 详细信息

局部一维显式离散格式是构造高维流体力学计算格式的常用计算方法。本文给出了一个并行自适应显式时间积分算法，用于实现局部一维显式离散格式的并行自适应计算。基于JASMIN框架，以局部一维FCT格式为例实现该算法，形成一个用于模拟多介质流体力学Richtmyer-Meshkov不稳定性的并行自适应数值模拟程序。数值实验表明，该程序具有很好的并行可扩展性。

关键词：高性能计算并行计算机离散格式调度程序

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二维多群辐射输运程序LARED-R-1的并行化

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计算物理 2007年第2期24卷 146-152页

作者：张爱清莫则尧北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

利用有向图描述数据依赖关系,应用已有的并行流水线通量扫描算法,实现基于非协调网格的二维辐射输运程序LARED-R-1的并行化.同时,采用消息缓冲技术提高并行程序的性能.经测试,对于典型的问题规模(100群、3800个网格单元、40个方向),在... 详细信息

利用有向图描述数据依赖关系,应用已有的并行流水线通量扫描算法,实现基于非协调网格的二维辐射输运程序LARED-R-1的并行化.同时,采用消息缓冲技术提高并行程序的性能.经测试,对于典型的问题规模(100群、3800个网格单元、40个方向),在某并行机的64个和128个处理器上,并行程序分别获得80%和53%的并行效率.

关键词：多群辐射输运方程离散纵标法有向图并行计算

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多物理数值模拟中一种有效的并行耦合方法

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计算机学报 2007年第9期30卷 1559-1566页

作者：陈军莫则尧北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心与计算物理实验室北京100088

在实现多物理并行数值耦合模拟中,需要处理多个物理过程之间网格、并行区域分解的差异.针对该问题,该文基于三维流体力学与激光传播耦合的并行数值模拟,提出了一种实用的并行耦合方法:引入辅助状态将本地插值与通信相分离;构建并行耦合... 详细信息

在实现多物理并行数值耦合模拟中,需要处理多个物理过程之间网格、并行区域分解的差异.针对该问题,该文基于三维流体力学与激光传播耦合的并行数值模拟,提出了一种实用的并行耦合方法:引入辅助状态将本地插值与通信相分离;构建并行耦合图并定义主导属性,以确定过程间传输的最小数据集合;提供并行数据重分配算法来完成通信.并行数值结果表明:该方法是有效的,在64台处理机上使整体程序获得50.07的加速比.

关键词：并行计算多物理模拟并行数据重分配有向图

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基于面向对象的粒子类模拟并行计算研究

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计算机研究与发展 2007年第10期44卷 1647-1651页

作者：曹小林张爱清莫则尧北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088 北京应用物理与计算数学研究所计算物理实验室北京100088

针对经典分子动力学和PIC方法等粒子类模拟方法具有粒子动态移动、粒子计算局部性好等共性,首先,提出了粒子量数据片对象.该对象是单网格片上的一团粒子,其中网格片是包含多个网格单元的矩形区域.然后,设计了并行算法,包括对象之间的粒... 详细信息

针对经典分子动力学和PIC方法等粒子类模拟方法具有粒子动态移动、粒子计算局部性好等共性,首先,提出了粒子量数据片对象.该对象是单网格片上的一团粒子,其中网格片是包含多个网格单元的矩形区域.然后,设计了并行算法,包括对象之间的粒子迁移和数据交换以及动态负载平衡.最后,在JASMIN框架上具体实现,进而开发了并行经典分子动力学程序和并行PIC程序.在64个处理器上实测表明,并行PIC程序模拟包含3百万个网格、2千万个粒子的复杂物理模型时,获得了80%的并行效率.

关键词：面向对象粒子类模拟方法粒子量数据片动态负载平衡

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激光成丝不稳定性并行数值模拟研究

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高技术通讯 2007年第2期17卷 148-152页

作者：陈军莫则尧李斌郑春阳北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心＆计算物理实验室北京100088

实现了三维非线性流体力学与激光传播耦合的并行数值模拟程序，用来研究高强度激光在稀疏等离子体中的激光成丝不稳定性。并行数值实验结果表明，该程序在64台处理机上取得了较好的并行加速比，且能定性模拟激光成丝现象。

关键词：激光等离子体相互作用成丝不稳定性流体力学并行计算

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并行代数多重网格算法可扩展性能分析

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计算物理 2007年第4期24卷 387-394页

作者：徐小文莫则尧中国工程物理研究院研究生部北京100088 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

对当今求解大型稀疏线性代数方程组最有效的迭代方法之一——代数多重网格(AMG)算法的并行计算进行可扩展性能分析.给出一套并行计算可扩展性能分析方法,用于分析和指导并行迭代算法及实现技术的设计与优化并应用于并行AMG算法.分析表明... 详细信息

对当今求解大型稀疏线性代数方程组最有效的迭代方法之一——代数多重网格(AMG)算法的并行计算进行可扩展性能分析.给出一套并行计算可扩展性能分析方法,用于分析和指导并行迭代算法及实现技术的设计与优化并应用于并行AMG算法.分析表明,网格算子的平均模式大小和迭代过程的算法效率分别制约了AMG算法启动阶段和迭代求解阶段并行性能的发挥,成为该类算法急需解决的两个关键问题.

关键词：代数多重网格(AMG) 迭代方法并行计算可扩展性分析

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利用作业可塑性改进结合回填FCFS策略的性能

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计算机工程与应用 2007年第24期43卷 41-46页

作者：罗红兵张宝印曹立强北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

结合回填的FCFS策略是超级计算机上使用最为普遍的调度策略,针对该策略在响应时间和系统利用率等方面的不足,提出了改进其性能的DGA方法。该方法利用并行作业的可塑性,通过调度时对作业平均响应时间的预测来选择适合的作业请求规模,并... 详细信息

结合回填的FCFS策略是超级计算机上使用最为普遍的调度策略,针对该策略在响应时间和系统利用率等方面的不足,提出了改进其性能的DGA方法。该方法利用并行作业的可塑性,通过调度时对作业平均响应时间的预测来选择适合的作业请求规模,并利用遗传算法来解决最优作业资源请求的搜索问题。模拟器上实际作业流的模拟结果表明:该方法可以显著地改进结合回填的FCFS策略的调度效果,也优于已有的可塑性作业调度策略。

关键词：并行作业调度FCFS作业可塑性遗传算法

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可扩展并行作业调度模拟器ParaSim设计与应用

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计算机工程 2007年第18期33卷 45-47页

作者：罗红兵张宇张晓霞北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

针对作业调度研究的需求,设计和实现了一个可扩展的并行作业调度模拟器ParaSim。ParaSim采用与实际并行作业系统近似的工作流程,以资源占用矩阵来表示计算资源,使用事件驱动的模式进行模拟调度和运行,支持空间共享和时间共享等多种调度... 详细信息

针对作业调度研究的需求,设计和实现了一个可扩展的并行作业调度模拟器ParaSim。ParaSim采用与实际并行作业系统近似的工作流程,以资源占用矩阵来表示计算资源,使用事件驱动的模式进行模拟调度和运行,支持空间共享和时间共享等多种调度策略,并允许对各调度参数进行设置。ParaSim已投入实际使用,为并行机作业调度策略的定量分析、调整和优化提供了有力的支持。

关键词：大规模并行计算机作业调度调度评价模拟器

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面向大规模并行数值模拟的一种高效数据组织方式

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计算机应用 2007年第1期27卷 213-215页

作者：廖丽徐平均张爱清北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088

针对现代大规模并行数值模拟数据的存储与I/O问题,提出一种高效的数据组织方式。该方式基于XML VTK格式数据I/O通用模块,输出支持随机访问、数据压缩及可移植二进制编码的并行数据文件。与传统方式相比,按照这种方式组织数据,可以降低... 详细信息

针对现代大规模并行数值模拟数据的存储与I/O问题,提出一种高效的数据组织方式。该方式基于XML VTK格式数据I/O通用模块,输出支持随机访问、数据压缩及可移植二进制编码的并行数据文件。与传统方式相比,按照这种方式组织数据,可以降低数据的存储规模,提高可视化处理的速度。经测试,数据存储开销可降低到原存储开销的30%,数据载入到可视化软件的速度提高90%以上。且这种组织方式适于引入out-of-core技术进一步提高可视化处理效率。

关键词：大规模数据场字节序 out—of-core 可视化工具包

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