检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物化学与分子生物学报 2022年第4期38卷 505-514页

作者：张文桃胡艳芬吴昊刘铭李莉杜根来朱剑军山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001

本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及... 详细信息

本研究通过公共数据和实验数据,全面分析环氧化物水解酶2(epoxide hydrolase 2,EPHX2)在肝细胞癌中的表达情况、功能作用以及预后意义。利用GEO和MitoCarta数据集,筛选肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因;利用TCGA数据库分析EPHX2及其相关基因在肝细胞癌中的表达水平;运行R包绘制Kaplan-Meier生存曲线和功能富集分析;基于STRING和GSEA构建蛋白质互作网络和基因集富集分析;荧光定量PCR和GEO数据集验证EPHX2在肝细胞癌中的表达水平。本研究共筛选得到15个在肝细胞癌中呈差异表达的线粒体相关基因。EPHX2在肝细胞癌组织中的表达水平显著降低(P<0.01)。EPHX2表达水平与肝癌患者性别、分期和级别有关,而与年龄、T分期等因素无关。与EPHX2低表达组肝癌患者相比,EPHX2高表达组肝癌患者预后较好。功能富集结果显示,EPHX2与补体途径、脂肪酸降解等信号通路有关。蛋白质互作网络结果显示,EPHX2与HAO1、AGXT、ACOX1、GSTκ1、SCP-2、CAT、CYP2C8,CYP2C9,CYP2B6,和CYP2J2等密切相关。GSEA结果显示,EPHX2低表达组与肝癌细胞增殖、肝癌复发等基因集正相关。荧光定量PCR和GEO数据集验证结果显示,EPHX2在肝细胞癌组织和肝癌细胞株中呈显著低表达。EPHX2在肝细胞癌中呈显著低表达,提示其可能在肝细胞癌发生发展过程中发挥抑癌基因作用,但具体作用机制还需进一步验证。

关键词：肝细胞癌环氧化物水解酶2 公共数据库

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网格蛋白斑块的调控机制和功能多样性

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生物化学与生物物理进展 2025年

作者：赵以歌蒋昭泓周倩仪陈志明南华大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室国家卫健委出生缺陷研究与预防重点实验室南华大学附属第一医院检验医学中心

网格蛋白介导型胞吞作用（clathrin-mediated endocytosis，CME）是细胞胞吞大分子物质的主要途径，同时也是细胞囊泡运输（vesicle trafficking）的起始环节。网格蛋白斑块（clathrin plaques）是细胞质膜上大而扁平的网格蛋白包被结构... 详细信息

网格蛋白介导型胞吞作用（clathrin-mediated endocytosis，CME）是细胞胞吞大分子物质的主要途径，同时也是细胞囊泡运输（vesicle trafficking）的起始环节。网格蛋白斑块（clathrin plaques）是细胞质膜上大而扁平的网格蛋白包被结构（clathrin-coated structures，CCSs），有时也称为扁平的网格蛋白晶格（flat clathrin lattices）。与典型的网格蛋白包被小窝（clathrin-coated pits，CCPs）相比，网格蛋白斑块具有更平坦的形态、更大的面积和更长的寿命。现有的研究证据表明，网格蛋白斑块不仅可以通过CME参与大分子货物的选择性胞吞，还是一种特殊的细胞黏附结构，并作为信号转导平台参与细胞信号通路的调节。斑块在不同类型细胞的细胞黏附、机械感应、细胞迁移、病原体入侵等过程中扮演重要角色，但截至目前，国内外研究对网格蛋白斑块的功能多样性及其形成和调控机制仍未完全探明。本文回顾网格蛋白斑块的研究历程，综述网格蛋白斑块的结构特征和功能，讨论调节网格蛋白斑块动态的机制及其在CME中的最新发现。

关键词：网格蛋白斑块胞吞作用细胞黏附信号转导显微镜成像

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嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M)疗法在炎症相关抑郁症治疗中的应用

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第9期40卷 834-838页

作者：徐雨菲王涛空军军医大学基础医学院学员六大队陕西西安710032 空军军医大学基础医学院医学遗传学与发育生物学教研室陕西西安710032

经典的嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M)发挥促炎作用实现抗肿瘤免疫,但是通过改造CAR的结构设计也可以使其有类似M2的抗炎功能,从而治疗炎症性疾病。目前靶向M1型小胶质细胞的CAR-M疗法能够有效减少神经炎症,用于治疗炎症相关抑郁症。随着... 详细信息

经典的嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M)发挥促炎作用实现抗肿瘤免疫,但是通过改造CAR的结构设计也可以使其有类似M2的抗炎功能,从而治疗炎症性疾病。目前靶向M1型小胶质细胞的CAR-M疗法能够有效减少神经炎症,用于治疗炎症相关抑郁症。随着关于CAR-M抗炎作用的研究不断发展,CAR-M细胞疗法为治疗炎症相关疾病提供了新的思路。

关键词：嵌合抗原受体巨噬细胞(CAR-M) 抑郁症炎症治疗机制综述

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华法林耐药突变体减弱人维生素K环氧化物还原酶与华法林的结合能力

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安徽医科大学学报 2024年第9期59卷 1629-1635页

作者：王雯琪沈滟李晓明沈国民河南科技大学基础医学与法医学院医学遗传学教研室洛阳471023 河南省血栓与止血国际联合实验室洛阳471023

目的探讨人维生素K环氧化物还原酶(VKORC1)耐药突变体对华法林耐药的机制。方法利用与华法林结合导致VKORC1电泳迁移率变化的原理进行电泳迁移实验,并通过酶联免疫吸附实验检测VKORC1的活性和华法林抑制VKORC1的半抑制浓度(IC_(50)),评... 详细信息

目的探讨人维生素K环氧化物还原酶(VKORC1)耐药突变体对华法林耐药的机制。方法利用与华法林结合导致VKORC1电泳迁移率变化的原理进行电泳迁移实验,并通过酶联免疫吸附实验检测VKORC1的活性和华法林抑制VKORC1的半抑制浓度(IC_(50)),评价VKORC1耐药突变体与华法林的结合能力。结果华法林与VKORC1结合后,保护其柔性跨膜螺旋1(TM1)中的一个半胱氨酸免受N-乙基马来酰亚胺(NEM)的修饰,从而增加VKORC1的电泳迁移率。增加华法林浓度可以增加具有快速迁移效应的VKORC1。与野生型VKORC1相比,华法林耐药突变体的快速迁移效应减弱或消失,表明华法林与耐药突变体的结合能力减弱;且突变体快速迁移效应越弱,其对华法林的耐药性越强。结论VKORC1耐药突变体与华法林的结合能力减弱是华法林耐药的主要原因。

关键词：凝血耐药电泳迁移实验维生素K 维生素K环氧化还原酶华法林耐药突变体华法林抗凝药

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YTHDF1通过增强肝癌细胞肿瘤干性及激活Wnt/β-catenin信号通路促进肝癌进展

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中国临床医学 2022年第5期29卷 738-744页

作者：谭坚王月帆戴智慧尹昊瓒杨富海军军医大学基础医学院医学遗传学教研室上海200433

目的探讨m6A甲基化修饰识别蛋白YTH家族蛋白1(YTH domain family protein 1,YTHDF1)促进肝癌细胞肿瘤干性及激活Wnt/β-catenin信号通路促进肝癌进展的机制。方法采用Western印迹法检测6组肝癌组织和癌旁肝组织中YTHDF1蛋白的表达情况... 详细信息

目的探讨m6A甲基化修饰识别蛋白YTH家族蛋白1(YTH domain family protein 1,YTHDF1)促进肝癌细胞肿瘤干性及激活Wnt/β-catenin信号通路促进肝癌进展的机制。方法采用Western印迹法检测6组肝癌组织和癌旁肝组织中YTHDF1蛋白的表达情况。采用Western印迹法、RIP-PCR、qRT-PCR等检测β-catenin及其下游分子的表达。qRT-PCR、成球实验、克隆形成实验、CCK8等检测YTHDF1对肝癌细胞干性的影响。采用Kaplan-Meier生存曲线分析YTHDF1表达与肝癌患者临床预后的关系。结果肝癌组织中YTHDF1的表达水平明显高于癌旁组织(P<0.001);过表达YTHDF1后,β-catenin及其下游分子的表达增加;过表达YTHDF1后,肝癌细胞的肿瘤干性明显上调、增殖能力显著增强;Kaplan-Meier生存曲线表明YTHDF1高表达的肝癌患者预后更差。结论YTHDF1在肝癌组织中高表达,促进了β-catenin及其下游分子的表达,增强了肝癌细胞的干性,对肝癌患者的预后产生了不良影响。

关键词： YTHDF1 肝癌 Wnt/β-catenin 肿瘤干性 m6A

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医学遗传学实验课程混合式教学模式应用浅探

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高校医学教学研究(电子版) 2024年第5期14卷 51-56页

作者：梅庆步郑立红张明龙刘万全岳丽玲刘丹齐齐哈尔医学院基础医学院遗传学教研室齐齐哈尔161006

针对医学遗传学实验教学存在的不足,我院重新设计教学流程、制定综合考核方案,实施线上线下与思政相融合的混合式教学模式。主要从增设线上预习与测试、转变线下授课形式,利用信息化教学助手监控学生操作和融入内生式思政教育等方面进... 详细信息

针对医学遗传学实验教学存在的不足,我院重新设计教学流程、制定综合考核方案,实施线上线下与思政相融合的混合式教学模式。主要从增设线上预习与测试、转变线下授课形式,利用信息化教学助手监控学生操作和融入内生式思政教育等方面进行改革,并对学生成绩和教学效果进行分析和评价。实践结果显示,学生实验成绩区分度更为明显,更能全面客观反映学生的真实学习水平;学生问卷调查显示,这种兼顾思政教育的混合式教学法获得学生广泛肯定,教学效果良好。此法的教学实施基本解决了实验课存在的教学设计、教学方法和学生思维能力、意志品质不足的问题。教师贯彻以“学生”“学习”和“探究”为中心的教学理念,为学生提供了全新的学习体验,值得进一步探索和应用。

关键词：医学遗传学混合式教学实验教学

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基于生物信息学分析胃癌双微体中增强子的调控机制

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遗传 2025年第5期47卷 558-572页

作者：安梦婷郭冠麟吴杰孙文靖贾学渊哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室哈尔滨150081 中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) 哈尔滨150081

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制,本... 详细信息

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制,本研究利用生物信息学方法通过分析CCLE细胞系数据库和TCGA实体瘤数据库中的基因组拷贝数变异数据,总结含双微体肿瘤样本的基因组特征,依此特征对胃癌样本进行分类。接着使用FANTOM5数据库、R包“GenomicRanges”、Bedtools工具以及MEME SUITE分析胃癌双微体上增强子及其调控的靶基因的功能。然后利用CIBERSORT包和GDSC药物数据库对TCGA中含和不含的胃癌样本进行免疫细胞浸润分析和耐药分析。研究显示,胃癌中的双微体基因组特征包括一类拷贝数超过10且长度≥50kb的基因组片段。双微体增强子的调控作用影响了耐药性和肿瘤免疫,其中增强子-转录因子-靶基因的调控回路扰动也与肿瘤免疫相关。进一步分析发现,双微体增强子调控的靶基因不仅导致了免疫相关基因表达的改变,还使得胃癌样本对常见化疗药物展现出更强的不敏感性,并且耐药相关靶基因在含双微体的胃癌样本中高表达并与不良预后密切相关。综上所述,该项研究为含有双微体的胃癌个体治疗提供了新的见解。

关键词：双微体增强子胃癌肿瘤免疫肿瘤耐药性生物信息学

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山奈酚调控细胞衰老治疗类风湿性关节炎的体外研究

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陆军军医大学学报 2023年第12期45卷 1281-1291页

作者：先梦麟! 耿娜娜邓琳邝彪范梦恬郭风劲重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室重庆400016 重庆医科大学附属第二医院骨科重庆400010

目的基于网络药理学以及体外实验探讨山奈酚治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的机制。方法通过TCMSP及SwissTarget数据库查询山奈酚靶点,检索GeneCards和DisGeNET数据库,获得RA相关功能靶点。山奈酚与RA靶点通过Venny2.... 详细信息

目的基于网络药理学以及体外实验探讨山奈酚治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的机制。方法通过TCMSP及SwissTarget数据库查询山奈酚靶点,检索GeneCards和DisGeNET数据库,获得RA相关功能靶点。山奈酚与RA靶点通过Venny2.1.0交叉后,利用STRING数据库进行蛋白互作(protein-protein interaction, PPI)分析,并对山奈酚和靶点进行分子对接。随后用脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)与山奈酚处理小鼠单核细胞白血病细胞RAW264.7进行验证,分组为:Control组、LPS组、LPS+Kaempferol组。MTT法检测山奈酚对RAW264.7细胞毒性的影响。使用LPS诱导RAW264.7细胞构建炎症细胞模型,检测各个处理组衰老和衰老相关炎症因子表达的影响。通过SA-β-Gal检测各组RAW264.7细胞β-半乳糖苷酶水平的变化。细胞免疫荧光检测各组IL-6的表达。结果共得到138个山奈酚的作用靶点,山奈酚抗RA的潜在作用靶点76个。PPI分析结果显示TNF、EGFR、PTGS2、AKT1可能是山奈酚抗RA的核心靶点。分子对接结果表明,山奈酚与核心靶点TNF、EGFR、PTGS2、AKT1能形成较稳定的复合物。MTT结果证明,在24 h时,0.125~16μmol/L山奈酚对RAW264.7细胞增殖均具有促进作用(P<0.05)。在48 h时,0.125~8μmol/L山奈酚能够促进RAW264.7细胞增殖(P<0.05)。而72 h时,0.125~16μmol/L山奈酚对RAW264.7细胞增殖没有显著影响。qPCR和Westerm blot结果表明山奈酚能够降低LPS诱导的IL-1β、IL-6以及TNF-α的表达(P<0.05)。山奈酚也降低了细胞衰老标志基因p16和p21的表达,同时促进细胞周期标志物CCND1和CCNE1的表达(P<0.05)。免疫荧光结果表明山奈酚能够降低IL-6表达水平(P<0.05)。SA-β-Gal染色结果显示,LPS处理可以促进RAW264.7细胞β-半乳糖苷酶的水平(P<0.05),而山奈酚可以缓解LPS诱导的β-半乳糖苷酶水平增加(P<0.05)。结论山奈酚可能通过调控炎症因子IL-1β、IL-6和TNF-α与p16/p21衰老相关基因,防止免疫细胞过早衰老,发挥治疗RA的作用。

关键词：山奈酚类风湿性关节炎网络药理学分子对接炎性衰老衰老相关分泌表型

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ATG5通过细胞自噬调控Ⅱ型胶原表达的实验研究

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陆军军医大学学报 2023年第17期45卷 1828-1837页

作者：邓琳先梦麟杨玉有耿娜娜邝彪郭风劲重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室重庆400016 重庆医科大学附属第二医院骨科重庆400010

目的探究自噬相关蛋白ATG5通过影响自噬功能调控软骨细胞中Ⅱ型胶原的表达水平。方法 GEO数据库下载13例人软骨组织样本的转录组数据分析ATG5和COL2A1表达的相关性。雷帕霉素(Rapamycin, Rapa)和巴佛洛霉素A1(Bafilomycin A1,BafA1)处... 详细信息

目的探究自噬相关蛋白ATG5通过影响自噬功能调控软骨细胞中Ⅱ型胶原的表达水平。方法 GEO数据库下载13例人软骨组织样本的转录组数据分析ATG5和COL2A1表达的相关性。雷帕霉素(Rapamycin, Rapa)和巴佛洛霉素A1(Bafilomycin A1,BafA1)处理人软骨细胞C28/I2,Western blot及免疫荧光检测Ⅱ型胶原(CollagenⅡ,COL2)的表达水平。构建人源COL2A1启动子质粒,双荧光素酶报告实验检测过表达ATG5对COL2A1启动子转录活性的影响。mRFP-GFP-LC3自噬双标腺病毒动态监测过表达和敲低ATG5后自噬流的变化。Western blot检测过表达或敲低ATG5后Rapa及BafA1对COL2、LC3Ⅱ/LC3Ⅰ表达水平的影响。结果 GEO数据库相关性分析结果显示在人软骨组织中ATG5和COL2A1的mRNA表达呈现正相关;Rapa和BafA1分别显著促进和抑制C28/I2细胞COL2的表达(P<0.05);成功构建人源COL2A1启动子质粒,并用双荧光素酶报告实验证实过表达ATG5上调COL2A1启动子转录活性(P<0.01);自噬双荧光病毒处理后,过表达ATG5组LC3-GFP荧光淬灭(P<0.01),自噬激活;敲低ATG5后,LC3-GFP荧光增强(P<0.05),自噬抑制;Rapa促进过表达ATG5上调的COL2和LC3Ⅱ/LC3Ⅰ的表达(P<0.05),BafA1显示与Rapa相反的作用(P<0.05)。结论过表达ATG5上调Ⅱ型胶原的表达,且ATG5调控Ⅱ型胶原的表达依赖于细胞自噬。

关键词：骨关节炎软骨细胞 Ⅱ型胶原细胞自噬 ATG5

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脑机接口技术在神经科学教学领域的融合展望

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基础医学教育 2025年第4期27卷 341-348页

作者：刘泽曹莉袁一旻林森浦颖艳张悦海军军医大学基础医学院神经生物学教研室上海200433 海军军医大学基础医学院医学遗传学教研室

医学神经生物学是一门重要的基础医学课程。脑机接口(BCI)技术是一种直接连接大脑与外部设备的通信系统,旨在实现大脑与设备之间的直接信息交换。脑机接口技术为医学神经学课程带来了全新的发展机遇。通过理论与实践相结合、学科交叉学... 详细信息

医学神经生物学是一门重要的基础医学课程。脑机接口(BCI)技术是一种直接连接大脑与外部设备的通信系统,旨在实现大脑与设备之间的直接信息交换。脑机接口技术为医学神经学课程带来了全新的发展机遇。通过理论与实践相结合、学科交叉学习与应用实例的引入,这一领域正朝着更加多元、创新和实用的方向发展。教师应及时把握这些机遇,将其转化为教学的优势,有助于培养出更具创新力和实际能力的神经科学领域人才。

关键词：医学神经生物学脑机接口技术学科交叉教学改革应用实例

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