检索结果-内蒙古大学图书馆

病原微生物生物安全国家重点实验室

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中国基础科学 2008年第6期10卷 21-23页

作者：病原微生物生物安全国家重点实验室病原微生物生物安全国家重点实验室

一、实验室概况病原微生物生物安全国家重点实验室依托于军事医学科学院,由军事医学科学院微生物流行病研究所联合生物工程研究所共同组建而成.实验室于2005年被科技部批准立项建设.

关键词：国家重点实验室病原微生物生物安全生物工程研究所中国工程院院士实验室主任军事医学学术委员会

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细胞生理代谢网络模型重构和优化的进展

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生物工程学报 2025年第3期41卷 1112-1132页

作者：肖陆驰鲁洪中上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室上海200240

细胞中自发或由酶催化的代谢反应组成了高度复杂的代谢网络,其与细胞生理代谢活动运作密切相关。细胞生理代谢网络模型的重构有助于从系统层面上解析基因型与生长表型之间的关联,为细胞生理代谢活动精准刻画与生物绿色制造等研究提供重... 详细信息

细胞中自发或由酶催化的代谢反应组成了高度复杂的代谢网络,其与细胞生理代谢活动运作密切相关。细胞生理代谢网络模型的重构有助于从系统层面上解析基因型与生长表型之间的关联,为细胞生理代谢活动精准刻画与生物绿色制造等研究提供重要的计算生物学工具。本文系统介绍了全基因组尺度代谢网络模型(genome-scale metabolic models,GEMs)、动力学模型、酶约束代谢模型(enzyme-constrained genome-scale metabolic models,ecGEMs)等不同类型细胞生理代谢网络模型发展与应用的最新研究进展;同时还介绍了GEMs自动化构建研究进展以及条件特异性GEMs建模策略。人工智能技术为高精度细胞生理代谢网络模型构建提供了全新机遇,本文进一步总结了人工智能技术在动力学模型和酶约束模型构建等领域的应用。各类细胞生理代谢网络模型的高质量重构将为今后的定量合成生物学与系统生物学等研究提供强大计算支撑。

关键词：基因组尺度代谢网络模型动力学模型酶约束代谢模型深度学习

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细菌外膜囊泡亚群的分离与蛋白质组学分析

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色谱 2025年

作者：尤柏儒邹迅吴言李荪涛肖华微生物代谢国家重点实验室上海交通大学生命科学技术学院

外膜囊泡(OMVs)是革兰氏阴性细菌分泌的20～400 nm的具膜囊泡状小体,在毒性物质传递和免疫逃逸等过程中发挥重要功能。尽管许多研究已经揭示了OMVs的关键作用,但是OMVs自身存在的异质性限制了我们对其蛋白质组成和功能的深入研究。因此,... 详细信息

外膜囊泡(OMVs)是革兰氏阴性细菌分泌的20～400 nm的具膜囊泡状小体,在毒性物质传递和免疫逃逸等过程中发挥重要功能。尽管许多研究已经揭示了OMVs的关键作用,但是OMVs自身存在的异质性限制了我们对其蛋白质组成和功能的深入研究。因此,对OMVs异质性亚群的组成及其生物学功能开展研究具有重要意义。本研究采用超速离心结合密度梯度离心,对大肠杆菌DH5α和铜绿假单胞菌PAO1分泌的OMVs进行了系统的分离和表征,并结合定量蛋白质组学技术对其进行了全面分析。首先,我们对超速离心得到的两种菌株OMVs粗提物进行了碘克沙醇密度梯度离心,得到了F1～F6 6个组分。接着,通过纳米颗粒追踪分析,确认了DH5α-OMVs和PAO1-OMVs粒径分布,DH5α-OMVs各亚群的平均粒径为131.0～161.0 nm, PAO1-OMVs各亚群的平均粒径为140.0～169.0 nm;通过透射电子显微镜观察到囊泡呈经典的茶托结构;蛋白质的银染和免疫印迹结果共同验证了密度梯度组分中OMVs亚群的分布,同时确定了DH5α-OMVs和PAO1-OMVs亚群的有效组分分别为F1a～F4a和F1b～F5b。然后,我们从DH5α-OMVs和PAO1-OMVs的各亚群中分别鉴定到2 388种和905种蛋白质。通过k-means聚类和GO富集分析,我们揭示了不同密度亚群在能量代谢、物质运输、核糖体合成等生物学功能上的异质性。最后,通过对大肠杆菌DH5α-OMVs和铜绿假单胞菌PAO1-OMVs亚群的比较分析,我们发现两种菌株虽然在OMVs的基本功能上具有共性,但在各自的亚群中也展现出了不同的功能特征。DH5α-OMVs的F1a亚群富集了与氨基酸代谢和蛋白质合成相关的功能,而PAO1的F2b亚群则表现出显著的生物大分子合成功能。本研究揭示了细菌OMVs亚群具有不同的生物学功能,进而为理解细菌的致病机制和与宿主的相互作用提供新的理论基础,有利于拓展其生物学应用。

关键词：外膜囊泡亚群大肠杆菌铜绿假单胞菌密度梯度离心蛋白质组学

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生产双链RNA工程菌的研究进展

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生物工程学报 2025年第2期41卷 546-558页

作者：崔锦程崔洁卞小莹山东大学微生物技术国家重点实验室山东青岛266237

保障粮食安全需要新型绿色农药。双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)农药通过外源添加特异性靶向病虫害的dsRNA来触发RNA干扰,抑制病原菌或害虫的关键基因表达,从而实现对特定病虫害的有效控制。双链RNA农药是一种环境友好型的农药,具... 详细信息

保障粮食安全需要新型绿色农药。双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)农药通过外源添加特异性靶向病虫害的dsRNA来触发RNA干扰,抑制病原菌或害虫的关键基因表达,从而实现对特定病虫害的有效控制。双链RNA农药是一种环境友好型的农药,具有较强的特异性和高效的基因沉默能力,但目前还存在生产成本高等问题。利用工程菌株生产dsRNA是一种可行的策略,然而目前还没有具有经济效益的dsRNA生产工程菌株出现。本文综述了利用微生物生产dsRNA的研究进展和生产策略,为dsRNA生产提供了参考。

关键词： RNA干扰双链RNA 工程菌株底盘

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速生集胞藻6803的光合生理及其初步机制

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微生物学通报 2025年

作者：张伟周杰张延平李寅中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室微生物生理与代谢工程研究室

【背景】蓝藻是一类能进行放氧光合作用的原核生物。随着生长速率与异养微生物相仿的速生蓝藻的出现，蓝藻在光合细胞工厂领域备受关注。集胞藻（Synechocystis sp.） PCC 6803是研究光合作用的理想模式生物，也是近年来常用的光合固碳... 详细信息

【背景】蓝藻是一类能进行放氧光合作用的原核生物。随着生长速率与异养微生物相仿的速生蓝藻的出现，蓝藻在光合细胞工厂领域备受关注。集胞藻（Synechocystis sp.） PCC 6803是研究光合作用的理想模式生物，也是近年来常用的光合固碳产化学品底盘细胞，其基因组测序最早被公开，且比常用模式蓝藻聚球藻具有更强的环境适应性及性状稳定性，但目前尚未见速生集胞藻的报道。【目的】评价本实验室选育的在高光强下可以快速生长的集胞藻6803（高光6803）在高光强下的光合生理，并初步研究其分子机制。【方法】通过比较分析光合生理，评价高光6803性状稳定性；通过基因组学及转录组学比较分析，初步解析高光6803的分子机制。【结果】获得的一株快速生长的集胞藻，即高光6803，其生长速率和光合活性均远高于普通集胞藻6803，且性状稳定；其最短倍增时间约3.1 h，与已报道的速生聚球藻2973（Synechococcus elongatus UTEX 2973）相当；其在900 μmol·m-2·s-1的高光强下仍可快速生长，且最适光强是野生型集胞藻6803的3倍以上。基因组学比较分析发现高光6803基因组中有2个特有基因突变。转录组学比较分析发现，在高光条件下，高光6803中差异表达的基因有77个，其中上调基因36个，下调基因41个。表达上调的基因主要参与光系统II（photosystem II，PSII）反应中心、高光胁迫耐受、电子传递、有机物合成，而表达下调的基因主要参与糖类、氨基酸等有机物分解过程。【结论】本研究首次报道了速生集胞藻高光6803，并对其分子机制进行初步研究。找到与其高效利用高光快速生长相关的2个突变靶基因，并从转录组水平说明高光6803是通过高效利用光能而快速生长。因此，本研究不仅拓宽了速生蓝藻的种类，为研究光合微生物固碳产化学品提供高效的底盘细胞，也为改造其他蓝藻为速生蓝藻提供可改造的基因靶点及理论基础。

关键词：蓝藻集胞藻6803 高光强速生蓝藻

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蝙蝠蛾拟青霉菌丝体多糖-纳米硒的制备、结构表征及其对MC3T3-E1细胞增殖分化的影响

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食品工业科技 2025年第7期46卷 123-132页

作者：陈旭洁梁慧嘉焦春伟何春艳陈少丹陈秋颜谢意珍高雄广东粤微食用菌技术有限公司广东广州510663 广东粤微生物科技有限公司广东肇庆526000 广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省微生物安全与健康重点实验室国家卫健委微生物食品营养与安全科技创新平台广东广州510070

本研究制备了蝙蝠蛾拟青霉菌丝体多糖-纳米硒(selenium nanoparticles,SeNPs),并探索其在促进骨形成方面的潜力。通过透析、醇沉、除蛋白以及阴离子交换柱层析,从蝙蝠蛾拟青霉菌丝体水提取物中分离纯化得到多糖组分PHPW,采用苯酚硫酸法... 详细信息

本研究制备了蝙蝠蛾拟青霉菌丝体多糖-纳米硒(selenium nanoparticles,SeNPs),并探索其在促进骨形成方面的潜力。通过透析、醇沉、除蛋白以及阴离子交换柱层析,从蝙蝠蛾拟青霉菌丝体水提取物中分离纯化得到多糖组分PHPW,采用苯酚硫酸法、高效凝胶渗透色谱法和高效阴离子交换色谱法分析PHPW的基本理化特性;以PHPW为模板,通过氧化还原法制备PHPW-SeNPs,采用纳米粒度仪、透射电子显微镜、X射线衍射仪、X射线光电子能谱仪、傅里叶变换红外光谱仪表征PHPW-SeNPs结构,并评价其稳定性;采用CCK-8法、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)检测试剂盒及实时定量PCR技术评价PHPW-SeNPs对MC3T3-E1细胞增殖分化的影响。结果表明,PHPW是一种以葡萄糖为主的中性多糖,其多糖含量和重均分子量分别为99.1%和29.4 kDa。利用200μg/mL PHPW制备获得的PHPW-SeNPs粒径最小且分散性好,呈现零价态、无定形、球状的结构,分析测定的元素中含有碳(63.1%)、氧(3.5%)和硒(33.4%),PHPW中的羟基可通过类似氢键作用稳定SeNPs。PHPW-SeNPs溶液在pH6~8、4℃避光条件下具有较好的稳定性。PHPW-SeNPs在1.25~20μmol/L浓度范围内,MC3T3-E1细胞增殖率呈剂量、时间依赖性提高,当浓度为20μmol/L时,MC3T3-E1细胞ALP活力增强至对照组的1.8倍,骨形态发生蛋白2(bone morphogenetic protein 2,BMP2)、RUNT相关转录因子2(Runt-related transcription factor 2,RUNX2)、osteorix(OSX)及ALP mRNA表达量分别上调至对照组的2.9、4.7、3.2和3.8倍。综上所述,以多糖组分PHPW为模板可成功制备稳定性较好的PHPW-SeNPs,其能够显著促进MC3T3-E1细胞增殖、分化,在预防骨质疏松方面具有良好的应用潜力,有望开发成促进骨健康的保健品。

关键词：蝙蝠蛾拟青霉菌丝体多糖纳米硒结构特性 MC3T3-E1细胞成骨分化

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碱熔-电感耦合等离子体质谱法测定土壤中全硼

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质谱学报 2025年

作者：陈家舒熊雄段锦梅陈颖麟江家俊朱红惠广东省科学院微生物研究所广东省微生物分析检测中心华南应用微生物国家重点实验室农业农村部农业微生物组学与精准应用重点实验室农业农村部农业微生物组学重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室

本研究使用碳酸钠高温碱熔消解试样，通过优化熔融温度、熔融时间、酸溶解条件等实验条件，建立了碱熔-电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）法测定土壤中全硼的方法。实验表明，向样品中加入2.0 g碳酸钠于950 ℃碱熔20 min后，使用6 mol/L... 详细信息

本研究使用碳酸钠高温碱熔消解试样，通过优化熔融温度、熔融时间、酸溶解条件等实验条件，建立了碱熔-电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）法测定土壤中全硼的方法。实验表明，向样品中加入2.0 g碳酸钠于950 ℃碱熔20 min后，使用6 mol/L盐酸溶液溶解熔块，溶解效果最好。碱熔法有效避免了硼在氢氟酸中易挥发损失的问题。通过使用有证标准物质和实际样品对方法进行验证，结果表明，该方法测定全硼含量在0～100 μg/L浓度范围内的线性关系良好，线性相关系数为0.9995，方法检出限为0.20 mg/kg，定量限为0.65 mg/kg，方法精密度（RSD，n=6）为1.92%～3.79%，相对误差（RE）为－0.32%～3.69%。实际样品测定的相对标准偏差（RSD，n=6）为0.99%～1.82%。相比于电感耦合等离子体发射光谱（ICP-OES）法，本方法数据稳定性更好、工作效率更高、适用范围更广，适用于土壤中全硼的测定。

关键词：碱熔电感耦合等离子体质谱(ICP-MS) 土壤全硼

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碱熔-电感耦合等离子体质谱法测定土壤中全硼

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质谱学报 2025年第03期 361-369页

本研究使用碳酸钠高温碱熔消解试样，通过优化熔融温度、熔融时间、酸溶解条件等实验条件，建立了碱熔-电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）法测定土壤中全硼。实验表明，向样品中加入2.0 g Na2CO3于950℃碱熔20 min后，使用HCl水溶液（1:1,... 详细信息

本研究使用碳酸钠高温碱熔消解试样，通过优化熔融温度、熔融时间、酸溶解条件等实验条件，建立了碱熔-电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）法测定土壤中全硼。实验表明，向样品中加入2.0 g Na2CO3于950℃碱熔20 min后，使用HCl水溶液（1:1,V/V）溶解熔块的效果最好。碱熔法可以有效避免硼在HF中易挥发损失的问题。使用有证标准物质和实际样品对方法进行验证，结果表明，该方法测定全硼含量在0～100μg/L浓度范围内的线性关系良好，线性相关系数为0.999 5，方法检出限为0.20 mg/kg，定量限为0.65 mg/kg，方法精密度（RSD,n=6）为1.92%～3.79%，相对误差（RE）为-0.32%～3.69%。实际样品测定的相对标准偏差（RSD,n=6）为0.99%～1.82%。相比于电感耦合等离子体发射光谱（ICP-OES）法，本方法的数据稳定性更好、工作效率更高，适用于土壤中全硼的测定。

关键词：碱熔电感耦合等离子体质谱(ICP-MS) 土壤全硼

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重金属全细胞微生物传感器:设计原理、优化策略及监测应用

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微生物学报 2025年第3期65卷 1033-1052页

作者：王明月许玫英纠敏陈杏娟河南科技大学食品与生物工程学院河南洛阳广东省科学院微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东广州

重金属因其毒性、持久性、生物蓄积性以及对抗性基因的潜在贡献等特点,已引起人们越来越多的关注。对环境中重金属进行准确、快速、高效和灵敏的监测,对于保护环境和人体健康具有重要意义。全细胞微生物传感器作为一种集成生物识别模块... 详细信息

重金属因其毒性、持久性、生物蓄积性以及对抗性基因的潜在贡献等特点,已引起人们越来越多的关注。对环境中重金属进行准确、快速、高效和灵敏的监测,对于保护环境和人体健康具有重要意义。全细胞微生物传感器作为一种集成生物识别模块与传感处理模块的生物监测技术,为环境重金属污染的监测提供了新的解决方案。近年来,基于转录因子的全细胞微生物传感器在重金属监测应用方面取得了显著进展。本文综述了重金属全细胞微生物传感器的基本组成及设计原理,总结了近年来研发的重金属全细胞微生物传感器的构建及其应用情况,分析了通过合成生物学技术优化重金属全细胞微生物传感器检测性能的应用实例,并展望了该领域面临的挑战及未来可能的研究方向。本文有望为环境中重金属污染的高效监测与有效防控提供重要参考。

关键词：重金属全细胞微生物传感器设计优化应用

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动态浊度法测定饲料中细菌内毒素含量的研究

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中国饲料 2025年第5期 112-117页

作者：陈家舒熊雄段锦梅韩和悦熊诗阳朱红惠广东省科学院微生物研究所广东省微生物分析检测中心华南应用微生物国家重点实验室农业农村部农业微生物组学与精准应用重点实验室农业农村部农业微生物组学重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室广东广州510070

本实验基于动态浊度法的基础,旨在利用动态试管仪建立饲料中细菌内毒素的测定方法。将供试品配成10%溶液,涡旋混合后,采用10000 r/min离心10 min后取上清液,应用动态浊度法进行细菌内毒素测定。结果显示:该方法的相关系数(r)为0.9977,... 详细信息

本实验基于动态浊度法的基础,旨在利用动态试管仪建立饲料中细菌内毒素的测定方法。将供试品配成10%溶液,涡旋混合后,采用10000 r/min离心10 min后取上清液,应用动态浊度法进行细菌内毒素测定。结果显示:该方法的相关系数(r)为0.9977,加标回收率为97.1%~156.4%,相对标准偏差(RSD)(n=6)为2.0%~7.9%,28种不同类型的饲料样品中细菌内毒素含量在0~349.220 EU/mg。研究表明,实验所用方法操作简便、准确度高、重复性好、应用范围广,适用于饲料中细菌内毒素含量的测定。

关键词：饲料细菌内毒素动态浊度法动态试管仪

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