检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物工程杂志 2005年第6期25卷 76-79页

作者：邵元健陈宗祥潘存红张亚芳潘学彪扬州大学植物功能基因组省级重点实验室

微卫星标记(SSR)因其操作简单和稳定可靠的特点而成为一种重要的分子标记,被广泛应用于遗传作图和种质鉴定等方面。但其在染色体上位置的正确性将直接影响到基因定位的正确性和后续研究的方向。利用美国国家生物信息技术中心(NCBI)网站... 详细信息

微卫星标记(SSR)因其操作简单和稳定可靠的特点而成为一种重要的分子标记,被广泛应用于遗传作图和种质鉴定等方面。但其在染色体上位置的正确性将直接影响到基因定位的正确性和后续研究的方向。利用美国国家生物信息技术中心(NCBI)网站的Blast程序,将2740个SSR 标记的前后引物序列与水稻粳稻品种日本晴基因组进行比对,共发现70个标记位于另一条染色体,对这70个标记重新锚定的染色体进行了更正。这将有助于今后水稻分子标记遗传连锁图的正确构建。

关键词：水稻微卫星标记染色体定位基因定位遗传连锁图序列比对

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自来水污泥与食用菌菌渣研制的新型机插秧育苗基质对水稻秧苗素质、产量及品质的影响

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江苏农业科学 2025年第2期53卷 95-101页

作者：时薇王志平张秀琴郭广军张小祥张刚肖宁潘存红刘建菊吴云雨李育红蔡跃陈梓春朱书豪余玲周长海季红娟高鹏吉春明刘建凤李爱宏黄年生江苏里下河地区农业科学研究所/国家水稻产业技术体系扬州试验综合站江苏扬州225007 扬州润江生态农业有限公司江苏扬州225232 扬州大学农学院/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室江苏扬州225009 江苏省现代作物生产协同创新中心江苏南京210095

为探究不同比例自来水污泥和食用菌菌渣配组研制的新型机插秧育苗基质对水稻生长的影响,筛选出最适宜水稻秧苗生长的育苗基质配方,以扬香玉200为试验品种,设置不同比例的3个处理:A(自来水污泥∶鹿茸菇渣∶杏鲍菇渣∶辅料=3∶3∶3∶1)、B... 详细信息

为探究不同比例自来水污泥和食用菌菌渣配组研制的新型机插秧育苗基质对水稻生长的影响,筛选出最适宜水稻秧苗生长的育苗基质配方,以扬香玉200为试验品种,设置不同比例的3个处理:A(自来水污泥∶鹿茸菇渣∶杏鲍菇渣∶辅料=3∶3∶3∶1)、B(自来水污泥∶杏鲍菇渣∶双孢菇渣∶辅料=3∶3∶3∶1)、C(自来水污泥∶鹿茸菇渣∶杏鲍菇渣∶双孢菇渣∶辅料=2∶3∶2∶2∶1),柴米河基质(D)和细土(E)为双对照,对5个处理下秧苗素质、生理指标、移栽大田后的水稻产量以及稻米品质进行测定。结果表明,处理A培育的水稻秧苗在株高、茎基宽、地上部鲜重、地上部干重较处理E均显著提高;根体积、地下部鲜重与处理E相较无显著差异,根长显著短于处理E,说明处理A根系较为粗壮,促进了秧苗地上部的生长。处理B和处理C分别减少了秧苗地下部和地上部的生物量。生理指标显示,处理A提高了秧苗叶绿素总量、可溶性蛋白含量和全氮含量,总糖含量显著降低;该处理秧苗移栽大田后,增产显著。综合比较,处理A(润江基质1号)增强了水稻叶片光合作用和代谢,提高了糖分运输效率,秧苗整体素质好,对水稻增产贡献较大,可以在实践中应用推广。

关键词：自来水污泥食用菌菌渣机插秧秧苗素质生理指标产量品质

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水稻ABCB转运蛋白基因的分子进化和表达分析

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中国水稻科学 2012年第2期26卷 127-136页

作者：徐杏邱杰徐扬徐辰武扬州大学作物遗传生理省级重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州225009

系统鉴定了水稻和拟南芥中27个和29个ABC家族B亚族(ABCB)基因,发现其外显子数目、编码蛋白质的长度和分子量在两种植物中均存在较大变异,而等电点分布的变化较小。系统发育分析把该亚族蛋白分为4个亚组,说明其功能可能已经发生了分化;... 详细信息

系统鉴定了水稻和拟南芥中27个和29个ABC家族B亚族(ABCB)基因,发现其外显子数目、编码蛋白质的长度和分子量在两种植物中均存在较大变异,而等电点分布的变化较小。系统发育分析把该亚族蛋白分为4个亚组,说明其功能可能已经发生了分化;在水稻和拟南芥中各鉴定了6对和9对旁系同源基因,说明单、双子叶植物分离之后,该亚族在水稻和拟南芥中均以物种特异的方式进行了扩张。片段复制和串联重复是水稻ABC家族扩张的主要机制。多序列比对显示,核苷酸结合域(NBD)的Walker A、Walker B和ABC域基序均高度保守,而Q环和H环的保守性略差;跨膜结构域(TMD)在不同蛋白之间和同一蛋白内没有明显的保守性。表达模式分析表明,水稻ABCB基因的表达具有明显的组织特异性,不同基因的表达特征已经发生分化。非生物胁迫下的表达分析显示多数水稻ABCB基因受到至少一种非生物胁迫因素的调控。旁系同源基因Ka/Ks分析表明,净化选择在水稻ABCB基因复制后功能的保留中发挥了重要作用。

关键词：水稻 ABC转运蛋白进化表达分析

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水稻ABC1基因家族的鉴定及在非生物胁迫下的表达分析

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中国水稻科学 2011年第1期25卷 1-10页

作者：高清松张丹徐亮徐辰武扬州大学作物遗传生理省级重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室江苏扬州225009

ABC1(Activity of bc1 complex)家族属于蛋白质激酶家族,其成员普遍存在于原核和真核生物中。已有研究表明,几个植物ABC1基因参与非生物胁迫应答。为了解ABC1基因在水稻中的结构和功能,采用生物信息学方法分别在水稻和拟南芥上鉴定出15... 详细信息

ABC1(Activity of bc1 complex)家族属于蛋白质激酶家族,其成员普遍存在于原核和真核生物中。已有研究表明,几个植物ABC1基因参与非生物胁迫应答。为了解ABC1基因在水稻中的结构和功能,采用生物信息学方法分别在水稻和拟南芥上鉴定出15个和17个ABC1基因,并进行了系统发育和表达分析。结果表明,该家族在单、双子叶植物分离之前就已经发生了分化,其基本特征已经形成;单、双子叶植物分离之后,该家族在水稻和拟南芥中均以物种特异的方式进行了扩增。内含子/外显子结构分析显示多数直系同源基因之间外显子大小接近,而内含子差别较大,水稻含有更多大的内含子;内含子获得是近期伴随水稻ABC1家族进化的重要事件。多序列比对显示,ABC1结构域具有1个保守的氨基酸片段和4个保守的氨基酸残基。在线亚细胞定位预测9个水稻ABC1蛋白定位在叶绿体上。实时定量RT-PCR分析表明,水稻ABC1基因主要在叶片中表达,并且受多种非生物胁迫因素包括H2O2、脱落酸、低温、干旱、黑暗和高盐的调控。说明水稻ABC1家族不仅在逆境胁迫应答中发挥重要作用,可能还与水稻特定的生理过程有关。

关键词：水稻 ABC1基因进化分析非生物胁迫表达分析基因功能基因结构

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两个抗水稻纹枯病主效数量基因的鉴定

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中国生物工程杂志 2004年第4期24卷 79-80页

作者：谭彩霞张亚芳陈宗祥殷跃军纪雪梅杨勇潘学彪扬州大学植物功能基因组省级重点实验室江苏扬州225009

Through constructing the F-2 clonal population of an intercross,Teqing/Lemont,two quantitative trait loci(QTLs),qSB-9 and qSB-11,contributing to sheath blight resistance were preliminarily ***,from the F-2 clonal population of Teqing/Lemont,a double-susceptible and two double-resistant clonal lines was selected as pure parents and were separately intercrossed and backcrossed to recurrent parents,Teqing and *** BC-1F-1,marker-assisted selection was conducted and all backcrossed plants were inoculated by short toothpicks incubated with a strain,RH-9 of Rhizoctonia solani for identification of the *** BC-2F-1,according to the similarity of integrative traits between backcrossed plants and their recurrent parents,we gathered BC-2F-2 seeds of some ***-2F-2 plants of coinciding requirement were selected through marker-assisted selection during the period of seedling stage,and separately mixed as homozygous ***,double-susceptible lines in the background of Teqing,double-susceptible and double-resistant lines in the background of Lemont were *** results of the inoculation test suggested that method of molecular marker-assisted selection for sheath blight resistance with investigation of disease ratings in backcross generations can quickly check up the reliability of location of resistant QTL and confirm the QTL interval on chromosome.

关键词：纹枯病水稻病害数量基因鉴定抗性

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水稻胚乳发育遗传调控的研究进展

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中国水稻科学 2021年第4期35卷 326-341页

作者：张娟牛百晓鄂志国陈忱扬州大学江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室/植物功能基因组学教育部重点实验室扬州225009 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室杭州310006

胚乳是被子植物双受精产物之一,为种子发育提供营养;同时,水稻胚乳也是人类口粮的重要来源。胚乳组织约占水稻种子干质量的70%以上,其发育直接影响稻米产量和品质。目前我们对水稻胚乳发育调控的分子机制有了较为深入的认识,克隆了一些... 详细信息

胚乳是被子植物双受精产物之一,为种子发育提供营养;同时,水稻胚乳也是人类口粮的重要来源。胚乳组织约占水稻种子干质量的70%以上,其发育直接影响稻米产量和品质。目前我们对水稻胚乳发育调控的分子机制有了较为深入的认识,克隆了一些重要基因,同时发现表观遗传调控在胚乳发育中也发挥重要作用。本文主要以水稻为例,同时穿插拟南芥和玉米等植物的相关研究进展,系统总结了胚乳细胞化、糊粉层细胞分化、储藏物质积累等胚乳发育重要生物学事件的遗传调控机制。最后我们也指出了关于胚乳发育过程中有待进一步深入研究的科学问题,以期能为今后相关研究提供一些思路。

关键词：水稻胚乳发育遗传调控细胞分化基因组印记

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抗水稻纹枯病QTL的定位

抗水稻纹枯病QTL的定位

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中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会

作者：潘学彪杨勇纪雪梅陈宗祥潘兴元张亚芳扬州大学水稻功能基因组省级重点实验室扬州大学水稻功能基因组省级重点实验室扬州大学水稻功能基因组省级重点实验室扬州大学水稻功能基因组省级重点实验室扬州大学水稻功能基因组省级重点实验室扬州大学水稻功能基因组省级重点实验室

自1997年开始,利用3个永久性遗传分析群体,各个群体均进行2年2次重复的随机区组大田试验（特青/Lemont组合第一年只有1次重复）,用短牙签嵌入接种法对各群体进行纹枯病菌（所用菌系为江苏省农科院植保所分离的强致病菌株RH-9）接种,各... 详细信息

自1997年开始,利用3个永久性遗传分析群体,各个群体均进行2年2次重复的随机区组大田试验（特青/Lemont组合第一年只有1次重复）,用短牙签嵌入接种法对各群体进行纹枯病菌（所用菌系为江苏省农科院植保所分离的强致病菌株RH-9）接种,各株系抽穗后30大左右调查病级（0～9级分级系统）,以各植株病级的平均数代表该株系平均病级。对2个F无性系群体,利用多态性RFLP和/或SSR标记构建分子标记连锁图谱,重组自交系的标记图谱由华中农业大学张启发院士提供。以田间病级数据和分子标记连锁图为基础,分别在chr2,chr3,chr5,chr7,chr9,chrl1和chr12上检测到抗纹枯病的QTL（表1）。比较这些结果可以发现,控制水稻对纹枯病抗性的不同QTL被检测的效率不同。对于

关键词：水稻纹枯病 QTL 分子标记连锁

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水稻回交世代中两个抗纹枯病主效数量基因的鉴定与标记辅助选择

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Acta Genetica Sinica 2005年第4期32卷 399-405页

作者：谭彩霞纪雪梅杨勇潘兴元左示敏张亚芳邹军煌陈宗祥朱立煌潘学彪扬州大学植物功能基因组省级重点实验室扬州225009 中国科学院遗传与发育生物学研究所植物生物工程开放实验室北京100101

对水稻品种特青与Lemont杂交组合的F2 单株无性系群体,进行 2年有重复的抗水稻纹枯病QTLs定位,在特青的第 9号染色体和Lemont的第 11号染色体上分别定位到了 1个主效抗纹枯病QTL,各自命名为qSB 9和qSB 11。从该F2 定位群体中,根据位点... 详细信息

对水稻品种特青与Lemont杂交组合的F2 单株无性系群体,进行 2年有重复的抗水稻纹枯病QTLs定位,在特青的第 9号染色体和Lemont的第 11号染色体上分别定位到了 1个主效抗纹枯病QTL,各自命名为qSB 9和qSB 11。从该F2 定位群体中,根据位点双侧标记带型,选取 2个位点均为感病等位基因纯合的 2个单株作为双感亲本,均为抗病等位基因纯合的 1个单株作为双抗亲本,分别与轮回亲本特青和Lemont进行回交。标记辅助选择始于BC2F1 及以后的各回交世代,并于BC2F1 和BC4F1 世代进行了病原菌人工接种鉴定。鉴定结果表明,qSB 9和qSB 11确实存在于原定位区间,各等位基因也在回交过程中被成功选择。BC3F2 采用秧田期大群体标记检测,从中选取符合要求的单株,分别混合得到特青背景下的双感纯合系, Lemont背景下的双感、双抗纯合系,将这些纯合系连同轮回亲本同时种植于扬州大学农学院试验田和江苏里下河农科所试验田, 2次重复,随机区组设计,进行接种实验。结果表明: 1 )相同背景下的不同纯合系间在发病程度上存在极显著的差异,不同纯合系的病情严重程度依次为:Lemont双感系>特青双感系>Lemont>特青 >Lemont双抗系; 2 )2个位点上的抗性等位基因qSB 9和qSB 11单独存在时,分别可减轻病级 1 2级左右,同时存在时可减轻病级 2级左右;

关键词：水稻纹枯病数量性状基因回交分子标记辅助选择

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不同直链淀粉含量软米品种品质性状的比较

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中国水稻科学 2022年第6期36卷 601-610页

作者：史玉良杨勇李雪飞李钱峰黄李春张昌泉宋学堂刘巧泉扬州大学农学院/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室江苏扬州225009 江苏(武进)水稻研究所江苏常州213175

【目的】具有较低直链淀粉含量(5%~12%)的优良食味软米在国内市场上广受消费者欢迎,然而不同软米品种间稻米品质表现差异较大,造成这种差异的原因尚未明确。因此,有必要深入研究不同类型软米理化品质的差异及其成因。【方法】选取了江... 详细信息

【目的】具有较低直链淀粉含量(5%~12%)的优良食味软米在国内市场上广受消费者欢迎,然而不同软米品种间稻米品质表现差异较大,造成这种差异的原因尚未明确。因此,有必要深入研究不同类型软米理化品质的差异及其成因。【方法】选取了江苏地区具有显著品质差异的4个软米品种、2个糯稻品种和2个常规品种(均为粳稻品种)为对象,对其稻米理化品质和淀粉结构进行了系统的比较分析。【结果】测序结果表明,软米品种南粳5055和南粳9108携带Wx^(mp)等位基因,而软米品种香软玉和武香粳113携带跟2个常规粳稻品种相同的Wx^(b)等位基因。品质分析表明,香软玉和武香粳113稻米较另两个软米品种中的直链淀粉含量更低,籽粒胚乳透明度更差;4个软米类稻米胚乳淀粉粒内部存在明显的孔隙,并且稻米胚乳越不透明,孔隙越明显;较低直链淀粉含量的软米食味表现更佳,这可能与低直链淀粉含量稻米具有更低的冷胶黏度、较大的崩解值和较小的消减值有关。淀粉精细结构测定表明,与常规粳稻米相比,软米的直链淀粉组分占比较低,而支链淀粉短链组分占比较高。【结论】目前江苏地区软米品种间存在显著的遗传和理化品质特性的差异,这为新型软米品种的培育和优异基因的克隆与利用提供依据。

关键词：水稻软米直链淀粉含量透明度食味品质

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不同类型优良食味软米粳稻品种品质性状的比较

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中国水稻科学 2022年

作者：史玉良杨勇李雪飞李钱峰黄李春张昌泉宋学堂刘巧泉扬州大学农学院/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物基因组学和分子育种重点实验室江苏(武进)水稻研究所

【目的】具有低直链淀粉含量的优良食味软米在国内市场上广受消费者欢迎，然而不同软米品种间稻米品质表现差异较大，造成这种差异的原因尚没有明确的研究。因此，有必要研究不同软米类型稻米品质差异的原因。本研究选取了江苏地区具有... 详细信息

【目的】具有低直链淀粉含量的优良食味软米在国内市场上广受消费者欢迎，然而不同软米品种间稻米品质表现差异较大，造成这种差异的原因尚没有明确的研究。因此，有必要研究不同软米类型稻米品质差异的原因。本研究选取了江苏地区具有显著品质差异的6个软米水稻品种和2个常规品种进行了系统的稻米品质分析。【结果】不同软米品种所携带的Wx基因并不相同，软米品种南粳5055和南粳9108携带Wxmp等位基因，而软米品种香软玉、武香粳113和常规品种均携带Wxb等位基因。品质分析表明，香软玉和武香粳113稻米较常规软米直链淀粉含量更低，籽粒更不透明。淀粉粒结构分析表明软米类稻米淀粉粒中存在明显的空腔，并且稻米胚乳越不透明，空腔越明显。食味测定表明，较低直链淀粉含量的软米食味表现更佳。淀粉热力学分析表明稻米直链淀粉含量与稻米糊化特性无显著相关性，而稻米糊化特性比较表明低直链淀粉含量稻米具有更低的冷胶黏度，较大的崩解值和最小的消减值。淀粉精细结构测定表明低直链淀粉含量稻米的直链淀粉组分含量最低，支链淀粉短链组分含量较高。【结论】目前江苏地区软米品种间存在显著的遗传和稻米品质特性的差异，这为后续新型软米品种的培育和基因克隆提供了重要遗传资源。

关键词：水稻软米直链淀粉含量透明度食味品质

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