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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：曹维李鹏程方慧敏徐辰武杨泽峰扬州大学农学院/植物功能基因组学教育部重点实验室/江苏省作物遗传生理重点实验室/粮食作物现代产业技术协同创新中心江苏扬州225009

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水稻粒形基因GS3的功能标记开发与鉴定

水稻粒形基因GS3的功能标记开发与鉴定

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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：胡大棒李玮王德荣蒋伟薛松耿金鹏裔传灯扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室扬州225009

籽粒的大小和形状是影响水稻产量和稻米品质的主要性状。基于基因GS3 序列分析的基础上，我们对该基因第2 外显子A/C 和第5 外显子13 bp Indel 的2 个变异位点分别开发了功能标记，并将其用于294 份水稻微核心种质和2007-2013 年江苏省... 详细信息

籽粒的大小和形状是影响水稻产量和稻米品质的主要性状。基于基因GS3 序列分析的基础上，我们对该基因第2 外显子A/C 和第5 外显子13 bp Indel 的2 个变异位点分别开发了功能标记，并将其用于294 份水稻微核心种质和2007-2013 年江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明第2 外显子的A/C 变异在籼粳亚种中有着相似的分布频率，并且都对粒长、粒厚和长宽比有着极显著的影响。相对于基因型C 而言，基因型A 在籼粳亚种中都有着更长的粒长、更薄的粒厚和更大的长宽比。

关键词：水稻粒形基因GS3 功能标记

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水稻粒宽基因GS5的功能标记开发和单倍型鉴定

水稻粒宽基因GS5的功能标记开发和单倍型鉴定

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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：李玮王德荣蒋伟胡大棒高海林耿金鹏裔传灯扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室扬州225009

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一，也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。基于基因GS5 序列分析的基础上，我们对该基因的第2 外显子的ACC/CTA 和第9 外显子A/C 的两个变异位点分别开发了功能标记，并将其用于294 份... 详细信息

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一，也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。基于基因GS5 序列分析的基础上，我们对该基因的第2 外显子的ACC/CTA 和第9 外显子A/C 的两个变异位点分别开发了功能标记，并将其用于294 份水稻微核心种质和2007-2013 年江苏省审定的65 份粳稻品种的基因型鉴定。

关键词：水稻粒形基因GS5 功能标记单倍型

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水稻单株有效穗数QTL qPN1的功能研究

水稻单株有效穗数QTL qPN1的功能研究

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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：顾后文裘实缪军陶亚军刘雁华周勇梁国华扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室扬州225009

水稻是世界上重要的粮食作物之一，提高粮食产量对保障我国粮食安全具有战略意义。水稻理想株型是高产形成的基础，而分蘖和单株穗数是水稻关键的农艺性状，同时也是理性株型的重要组成部分。单株穗数主要由分蘖数决定。目前，关于水稻... 详细信息

水稻是世界上重要的粮食作物之一，提高粮食产量对保障我国粮食安全具有战略意义。水稻理想株型是高产形成的基础，而分蘖和单株穗数是水稻关键的农艺性状，同时也是理性株型的重要组成部分。单株穗数主要由分蘖数决定。目前，关于水稻分蘖相关基因的克隆主要还是以突变体为材料，相关QTLs 的克隆还很少。

关键词：水稻单株有效穗数数量性状位点基因克隆基因分析

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水稻粒形基因GW8的功能标记开发和单元型鉴定

水稻粒形基因GW8的功能标记开发和单元型鉴定

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江苏省遗传学会2016年学术年会

作者：王德荣蒋伟李玮胡大棒王颖朱泽裔传灯扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

水稻粒形性状包含粒长、粒宽、粒厚和长宽比,是一类影响水稻产量和品质的重要性状。基于基因GW8序列分析的基础上,我们对该基因启动子区10 bp的Indel和第3外显子A/C和T/G的2个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质... 详细信息

水稻粒形性状包含粒长、粒宽、粒厚和长宽比,是一类影响水稻产量和品质的重要性状。基于基因GW8序列分析的基础上,我们对该基因启动子区10 bp的Indel和第3外显子A/C和T/G的2个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质和2007-2013年江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明这3个变异位点的等位变异对主要的粒形性状有着显著或极显著的影响;其在水稻微核心种质存在的8种单元型对水稻粒形性状有着极显著的影响,其中分别有126,85和58个代表品种的Hap3,Hap6和Hap1是最主要的单元型;而江苏省审定的粳稻品种中仅发现分别有63个和2个代表品种的单元型是Hap6和Hap2。这些研究结果为水稻产量和品质育种中充分利用基因GW8的优异等位基因或单元型奠定了基础。

关键词：水稻粒形基因GW8 功能标记单元型

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利用全基因组关联与连锁分析挖掘玉米抗黄曲霉菌关键位点及候选基因

利用全基因组关联与连锁分析挖掘玉米抗黄曲霉菌关键位点及候选基...

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江苏省遗传学会2016年学术研讨会

作者：崔敏张钰张继敏王艳秋印志同邓德祥扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

玉米是重要的粮食作物和饲料植物，对国民经济的发展起着重要作用。但玉米在收获前后，很容易感染黄曲霉菌，并产生黄曲霉毒素。黄曲霉污染可使玉米籽粒品质下降，直接威胁人和禽畜生命安全。本研究以242 个自交系构成的重组自交系群体... 详细信息

玉米是重要的粮食作物和饲料植物，对国民经济的发展起着重要作用。但玉米在收获前后，很容易感染黄曲霉菌，并产生黄曲霉毒素。黄曲霉污染可使玉米籽粒品质下降，直接威胁人和禽畜生命安全。本研究以242 个自交系构成的重组自交系群体和437个自交系构成的自然群体为材料，对收获的种子进行黄曲霉菌接种和抗性等级鉴定，并测定籽粒中黄曲霉毒素AFB1 的含量，结合重组自交系群体的916 个标记信息和自然群体56 万个SNP 标记信息分别进行QTL 分析。

关键词：玉米黄曲霉 QTL 关联分析连锁分析

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利用全基因组关联与连锁分析挖掘玉米抗黄曲霉菌关键位点及候选基因

利用全基因组关联与连锁分析挖掘玉米抗黄曲霉菌关键位点及候选基...

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江苏省遗传学会2016年学术年会

玉米是重要的粮食作物和饲料植物,对国民经济的发展起着重要作用。但玉米在收获前后,很容易感染黄曲霉菌,并产生黄曲霉毒素。黄曲霉污染可使玉米籽粒品质下降,直接威胁人和禽畜生命安全。本研究以242个自交系构成的重组自交系群体和437... 详细信息

玉米是重要的粮食作物和饲料植物,对国民经济的发展起着重要作用。但玉米在收获前后,很容易感染黄曲霉菌,并产生黄曲霉毒素。黄曲霉污染可使玉米籽粒品质下降,直接威胁人和禽畜生命安全。本研究以242个自交系构成的重组自交系群体和437个自交系构成的自然群体为材料,对收获的种子进行黄曲霉菌接种和抗性等级鉴定,并测定籽粒中黄曲霉毒素AFB1的含量,结合重组自交系群体的916个标记信息和自然群体56万个SNP标记信息分别进行QTL分析。结果如下:对重组自交系群体进行连锁分析,检测玉米黄曲霉菌的抗性QTL,定位到1个加性QTL位点,命名为qAA8,LOD为8.42,可解释表型变异的18.23%;对自然群体进行关联分析,3个SNP位点与玉米籽粒表面黄曲霉菌侵染病级数显著关联,分别位于2、8号染色体上,可解释表型变异的6.7-10.4%,22个SNP位点与玉米籽粒中AFB1显著关联,分别位于5、8、9号染色体上,可解释表型变异的6.4-26.6%。其中LOD值（21.43）最高的SNP位点chr8.S662578与玉米籽粒黄曲霉侵染病级数和籽粒AFB1含量均显著相关;通过LD分析,该SNP位点与周围的标记存在1500bp的共连锁区间,重要的是,这1500bp的物理位置就包含在连锁分析定到的qAA8区间里。最后我们在chr8.S662578标记前后1Mb的区间里发现了5个玉米抗黄曲霉的候选基因。上述研究结果可为玉米分子遗传育种提供理论依据和新的思路。

关键词：玉米黄曲霉 QTL 关联分析连锁分析

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运用PLS算法由HJ-1A/1B遥感影像估测区域冬小麦理论产量

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中国农业科学 2015年第20期48卷 4033-4041页

作者：谭昌伟罗明杨昕马昌严翔周健杜颖王雅楠扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心

【目的】作物遥感估产是遥感技术在农业生产中研究与应用的重点领域,能够向大田区域生产提供及时可靠的产量信息,准确地估测作物产量,对于确保国家粮食安全,制定社会发展规划,指导和调控宏观种植业结构调整,提高涉农企业与农民的经营管... 详细信息

【目的】作物遥感估产是遥感技术在农业生产中研究与应用的重点领域,能够向大田区域生产提供及时可靠的产量信息,准确地估测作物产量,对于确保国家粮食安全,制定社会发展规划,指导和调控宏观种植业结构调整,提高涉农企业与农民的经营管理水平具有重要意义,为进一步提高遥感估产精度,显示国产影像在农业估产中的应用效果。通过筛选冬小麦理论产量的敏感遥感变量,构建基于国产影像的理论产量遥感估测模型,实现区域冬小麦理论产量遥感估测,为及时了解不同生态区域冬小麦产量丰欠变化趋势提供参考。【方法】以2010年4月26日、2011年4月28日、2012年4月28日和2013年5月2日冬小麦开花期四景HJ-1A/1B影像为遥感数据,提取出13个遥感变量,以江苏省泰兴、姜堰、仪征、兴化、大丰5县作为试验采样区,于各实验区选取具有代表性的样点进行采样,并于室内进行测定,将335个实测的冬小麦理论产量样本按3﹕2比例分成建模集和验证集样本,依据估算残差平方和处于最小值确定模型所需主成分数,将决定系数、均方根误差和相对误差为模型评价参数,利用建模集样本分析了卫星遥感变量与冬小麦理论产量的定量关系,运用偏最小二乘回归算法构建及验证了以理论单产为目标的多变量遥感估产模型,将其算法模型估产效果与线性回归算法和主成分分析算法模型进行比较,并制作了冬小麦理论产量空间等级分布图。【结果】理论产量与所选的大多数遥感变量间关系密切,且多数遥感变量两两间具有极显著的多重相关性;理论产量偏最小二乘回归模型的最佳主成分数为4,且结构加强色素植被指数、归一化植被指数、绿色归一化植被指数和植被衰减指数为理论产量遥感估测的敏感变量;经建模集和验证集评价,理论产量估测模型的决定系数分别为0.79和0.76,均方根误差分别为720.45和928.05kg·hm-2,相对误差分别为11.45%和13.92%,且估测精度比线性回归算法分别提高了25%以上和27%以上,比主成分分析算法分别提高了15%以上和16%以上,说明偏最小二乘回归算法模型估测区域理论产量的效果明显好于线性回归和主成分分析算法,且具有较强的应用能力。【结论】该模型应用结果与冬小麦理论产量实际区域分布情况相符合,为提高遥感对区域冬小麦理论产量的估测精度提供了一种有效途径,有利于大面积应用和推广。

关键词：遥感冬小麦 HJ-1A/1B影像偏最小二乘法理论产量估测模型

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水稻粒形基因GS3的功能标记开发与鉴定

水稻粒形基因GS3的功能标记开发与鉴定

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江苏省遗传学会2016年学术年会

作者：胡大棒李玮王德荣蒋伟薛松耿金鹏裔传灯扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

籽粒的大小和形状是影响水稻产量和稻米品质的主要性状。基于基因GS3序列分析的基础上,我们对该基因第2外显子A/C和第5外显子13 bp Indel的2个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质和2007-2013年江苏省审定的65份... 详细信息

籽粒的大小和形状是影响水稻产量和稻米品质的主要性状。基于基因GS3序列分析的基础上,我们对该基因第2外显子A/C和第5外显子13 bp Indel的2个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质和2007-2013年江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明第2外显子的A/C变异在籼粳亚种中有着相似的分布频率,并且都对粒长、粒厚和长宽比有着极显著的影响。相对于基因型C而言,基因型A在籼粳亚种中都有着更长的粒长、更薄的粒厚和更大的长宽比。但是第5外显子的13bp缺失变异只在粳稻中极低频率(0.74%)的出现,属于稀有变异类型,其比13bp插入变异有着更短的粒长和更小的长宽比。这些研究结果为水稻产量和品质育种中充分利用基因GS3的优异等位基因奠定了基础。

关键词：水稻粒形基因GS3 功能标记

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水稻粒宽基因GS5的功能标记开发和单倍型鉴定

水稻粒宽基因GS5的功能标记开发和单倍型鉴定

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江苏省遗传学会2016年学术年会

作者：李玮王德荣蒋伟胡大棒高海林耿金鹏裔传灯扬州大学江苏省作物遗传生理国家重点实验室培育点/粮食作物现代产业技术协同创新中心教育部植物功能基因组学重点实验室

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一,也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。基于基因GS5序列分析的基础上,我们对该基因的第2外显子的ACC/CTA和第9外显子A/C的两个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核... 详细信息

水稻粒宽是影响籽粒粒形的重要因素之一,也是一个与水稻产量和稻米品质密切相关的重要性状。基于基因GS5序列分析的基础上,我们对该基因的第2外显子的ACC/CTA和第9外显子A/C的两个变异位点分别开发了功能标记,并将其用于294份水稻微核心种质和2007-2013年江苏省审定的65份粳稻品种的基因型鉴定。研究结果表明这两个变异位点的等位变异在水稻籽粒的粒长、粒宽和长宽比性状上存在显著或极显著的差异;其在水稻微核心种质中组成的4种单倍型在水稻籼亚种的粒宽、粒厚和长宽比性状上存在极显著的差异,在粳亚种的粒宽和长宽比性状上存在极显著的差异;而江苏省审定的粳稻品种中仅发现Hap1和Hap2,其分别有64个和1个代表性品种。这些研究结果为水稻产量和稻米品质育种中充分利用基因GS5的优异等位基因或单倍型奠定了基础。

关键词：水稻粒形基因GS5 功能标记单倍型

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