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乙型肝炎病毒PreC/C及S基因抗原表位突变对慢性乙型肝炎患者HBeAg血清学状态的影响

中华肝脏病杂志 2020年第7期28卷 586-590页

作者：李虎彭明利陈敏任红胡鹏重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学附属第二医院感染科400010

目的:探讨HBV PreC/C及S基因抗原表位的突变对慢性乙型肝炎患者HBeAg血清学状态的影响。方法:在横断面研究中,通过纳入35例未经抗病毒治疗慢性乙型肝炎患者,采用巢式PCR-TA克隆-测序方法筛选与HBeAg血清学状态相关的HBV PreC/C和S基因... 详细信息

目的:探讨HBV PreC/C及S基因抗原表位的突变对慢性乙型肝炎患者HBeAg血清学状态的影响。方法:在横断面研究中,通过纳入35例未经抗病毒治疗慢性乙型肝炎患者,采用巢式PCR-TA克隆-测序方法筛选与HBeAg血清学状态相关的HBV PreC/C和S基因突变位点。然后在纵向研究中(60例)利用多元回归模型校正相关混杂因素,探讨HBV PreC/C及S基因抗原表位的突变与HBeAg状态之间的独立关系。结果:在横断面研究中,64.4%的PreC/C突变和68.2%的S突变发生在抗原表位区。有10个突变位点(PreC/C50、55、79、84、103、126、145、184和s110、s213)与HBeAg阴性状态相关( P < 0.05)。在纵向研究中校正了年龄、性别、HBV基因型、血清丙氨酸转氨酶水平和PreC W28*突变等混杂因素后,结果显示Tc细胞表位(PreC47-56、PreC117-125、s208-216)和Th细胞表位(PreC176-185)的突变是影响宿主HBeAg血清学状态的主要独立危险因素。结论:HBV PreC/C区(PreC47-56、PreC117-125和PreC176-185)和S区(s208-216)表位的突变是影响宿主HBeAg状态的主要独立因素,提示这些抗原表位的突变可能参与HBeAg的血清学转换。

关键词：肝炎乙型慢性肝炎病毒乙型表位突变

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新型冠状病毒肺炎的肺外临床表现

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中华肝脏病杂志 2020年第6期28卷 528-531页

作者：李虎胡鹏重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学附属第二医院感染科 400010

自2019年12月底以来,新型冠状病毒(2019-nCoV,SARS-CoV-2)感染的肺炎(COVID-19)已在全球多个国家和地区暴发流行。研究发现SARS-CoV-2通过血管紧张素转换酶II(ACE2)感染人体并进行有效复制。ACE2广泛分布于人体各个组织及器官,如肠道上... 详细信息

自2019年12月底以来,新型冠状病毒(2019-nCoV,SARS-CoV-2)感染的肺炎(COVID-19)已在全球多个国家和地区暴发流行。研究发现SARS-CoV-2通过血管紧张素转换酶II(ACE2)感染人体并进行有效复制。ACE2广泛分布于人体各个组织及器官,如肠道上皮细胞、心肌细胞、肾小管上皮细胞、睾丸间质细胞等。这可能是COVID-19临床表现多样化的原因之一,也可能是加速病情进展、造成多系统损害的原因。现就COVID-19相关的消化系统、循环系统、泌尿生殖系统、血液系统和神经系统等肺外临床表现进行综述。

关键词：冠状病毒新型冠状病毒肺炎临床表现

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ALT正常的慢性HBV感染者疾病进展相关危险因素

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中华肝脏病杂志 2020年第12期28卷 995-998页

作者：韦丽李虎胡鹏重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学附属第二医院感染科400010

乙型肝炎病毒(HBV)感染是我国慢性肝炎常见的病因之一,积极的抗病毒治疗可有效地降低失代偿期肝硬化、肝衰竭和肝癌等终末期肝病的发生风险。目前国际和国内慢性乙型肝炎防治指南,对丙氨酸转氨酶(ALT)正常的慢性HBV感染者均建议定期随... 详细信息

乙型肝炎病毒(HBV)感染是我国慢性肝炎常见的病因之一,积极的抗病毒治疗可有效地降低失代偿期肝硬化、肝衰竭和肝癌等终末期肝病的发生风险。目前国际和国内慢性乙型肝炎防治指南,对丙氨酸转氨酶(ALT)正常的慢性HBV感染者均建议定期随访。但研究显示出有相当高比例(25.4%~88.9%)的慢性HBV感染者,虽然ALT水平始终正常,但肝脏组织学显示已存在明显的炎症、纤维化(G≥2和/或S≥2),甚至出现肝硬化和肝癌。ALT正常的慢性HBV感染者中疾病进展的过程较为隐匿,现对其过程中的相关危险因素进行介绍。

关键词：乙型肝炎慢性肝细胞癌丙氨酸转氨酶危险因素

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甲型H7N9流感病毒血凝素和神经氨酸酶的进化及抗原位点变异分析

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中华医学杂志 2013年第30期93卷 2381-2384页

作者：李虎胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所 400010

目的分析甲型H7N9流感病毒的血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）进化及其抗原位点变异。方法从美国国立生物技术信息中心（NCBI）和全球共享禽流感数据倡议组织（GISAID）数据库检索并下载从建库到2013年4月13日的I-17N9病毒HA、NA的基因... 详细信息

目的分析甲型H7N9流感病毒的血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）进化及其抗原位点变异。方法从美国国立生物技术信息中心（NCBI）和全球共享禽流感数据倡议组织（GISAID）数据库检索并下载从建库到2013年4月13日的I-17N9病毒HA、NA的基因和氨基酸序列。应用Clustal．W、MEGA5．0、NetNGlyc1．0Server、DNAMAN等生物信息学软件，对HA、NA的基因序列和氨基酸序列进行比对分析以及预测其潜在的抗原位点。结果共有26条HA基因和氨基酸序列以及24条NA基因和氨基酸序列纳入分析。美洲地区的H7N9流感病毒HA、NA基因和氨基酸的保守性较亚欧地区高。HA、NA基因进化分为亚欧地区和美洲地区两大系。所有病毒HA裂解位点附近仅含1个碱性氨基酸R（Arg）。HA蛋白裂解位点和NA蛋白糖基化位点表现出地区差异，HA蛋白糖基化位点保守。HA、NA蛋白在亚欧地区和美洲地区有多个抗原位点发生变异。7例中国分离的新型H7N9病毒进化位于亚欧地区分支，NA的茎部在69～73位有5个氨基酸缺失，HA蛋白裂解位点、糖基化位点未发生变异，HA、NA蛋白多个抗原位点发生了与其他病毒株不同的变异。结论H7N9病毒HA、NA进化表现出地区差异性。NA茎部氨基酸的缺失和HA、NA蛋白多个抗原位点的变异可能与人感染H7N9流感爆发有关。

关键词：流感病毒A型 H7N9亚型血凝素类神经氨酸酶抗原位点进化分子

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评估免疫检查点抑制剂为基础的联合治疗在原发性肝癌患者中肝损伤发生情况的真实世界研究

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中华肝脏病杂志 2022年第1期30卷 57-62页

作者：胡亚秋汪妮冉锡萍蔡大川重庆医科大学附属第二医院感染病科重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400010

目的在原发性肝癌患者中评估以免疫检查点抑制剂为基础的联合治疗引起的肝功能损伤发生情况。方法回顾性分析2018年1月1日至2021年3月31日在重庆医科大学附属第二医院感染病科住院,并接受程序性死亡蛋白其配体(PD-1/PD-L1)抗体治疗的65... 详细信息

目的在原发性肝癌患者中评估以免疫检查点抑制剂为基础的联合治疗引起的肝功能损伤发生情况。方法回顾性分析2018年1月1日至2021年3月31日在重庆医科大学附属第二医院感染病科住院,并接受程序性死亡蛋白其配体(PD-1/PD-L1)抗体治疗的65例原发性肝癌患者的临床资料。根据CTCAE V5.0标准评估治疗前后肝损伤的级别。根据性别、年龄段、是否有肝硬化、基线Child-Pugh评分、BCLC分期和治疗方案对患者进行分组,比较不同情况下患者肝损伤的发生率。多组间比较采用χ^(2)检验或秩和检验。结果根据CTCAE V5.0标准,46例(70.77%)患者在治疗观察期间发生了任意级别的肝损伤,规范化抗乙型肝炎病毒(HBV)治疗的6例患者均发生肝损伤;10例(15.38%)患者发生1级肝损伤,15例(23.08%)患者发生2级肝损伤,19例(29.23%)患者发生3级肝损伤,2例(3.08%)患者发生4级肝损伤。男性患者与女性患者的肝损伤发生率差异无统计学意义(发生率分别为68.33%和100%,P=0.180);肝损伤的发生率在各年龄组间差异无统计学意义(P=0.245);肝硬化组患者的肝损伤发生率为72.22%,非肝硬化组发生率为63.64%(P=0.370);基线Child-Pugh评分为A级、B级和C级的患者肝损伤发生率分别为71.43%、61.11%和100%,差异无统计学意义(P=0.878);肝损伤发生率在不同的BCLC分期下差异无统计学意义(P=1.000);PD-1/PD-L1抗体单药治疗组肝损伤发生率为60.00%,PD-1/PD-L1抗体联合靶向药物治疗组为67.85%,PD-1/PD-L1抗体联合经肝动脉栓塞化疗术/射频消融治疗组为86.67%,各治疗方案之间肝损伤发生率差异无统计学意义(P=0.480)。结论在原发性肝癌患者中,免疫检查点抑制剂治疗引起的肝功能损伤较为常见,严重危及患者生命安全的肝损伤罕见;患者的性别、年龄、是否合并肝硬化、基线肝功能、BCLC分期和免疫治疗方案对免疫相关性肝损伤的发生率尚无影响。

关键词：原发性肝癌免疫治疗免疫检查点抑制剂 PD-1/PD-L1抗体免疫相关不良反应肝损伤

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“前DAA时代”中国慢性丙型肝炎的治疗现状与挑战

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中华肝脏病杂志 2016年第11期24卷 869-873页

作者：胡鹏任红重庆医科大学附属第二医院感染科重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室 400010

我国慢性丙型肝炎及其病情进展所致的疾病负担和社会经济负担日趋严重。目前国内治疗慢性丙型肝炎的标准方案为聚乙二醇化干扰素（PegIFN）联合利巴韦林（RBV）的PR方案，然而这仍存在诸多不足。国际上直接抗病毒药物（DAAs）治疗丙型... 详细信息

我国慢性丙型肝炎及其病情进展所致的疾病负担和社会经济负担日趋严重。目前国内治疗慢性丙型肝炎的标准方案为聚乙二醇化干扰素（PegIFN）联合利巴韦林（RBV）的PR方案，然而这仍存在诸多不足。国际上直接抗病毒药物（DAAs）治疗丙型肝炎的临床进展迅速，中国也将迎来DAAs的上市，丙型肝炎治疗即将进入“DAA时代”。本文拟对我国当前慢性丙型肝炎的疾病负担和标准方案在临床治疗中存在的主要问题进行综述，并简要介绍了DAAs治疗方案的优势和挑战，为我国丙型肝炎治疗进入“DAA时代”提供参考。

关键词：肝炎,丙型,慢性干扰素类,疾病负担直接抗病毒药物利巴韦林

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抗核孔膜蛋白和抗核体蛋白抗体对原发性胆汁性肝硬化诊断价值的meta分析

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中华肝脏病杂志 2016年第1期24卷 62-68页

作者：邓红梅胡世玲陈维贤黄英重庆医科大学附属第二医院感染科感染性疾病分子生物学教育部重点实验室病毒性肝炎研究所 400010 重庆医科大学附属第二医院检验科 400010

目的系统评价抗核孔膜蛋白（GP210）抗体和抗核体蛋白（SP100）抗体对原发性胆汁性肝硬化（PBC）的诊断价值。方法计算机检索Cochrane图书馆，MEDLINE、维普中文科技期刊数据库（VIP）、中文科技期刊全文数据库（CNKI）、中国学位论文... 详细信息

目的系统评价抗核孔膜蛋白（GP210）抗体和抗核体蛋白（SP100）抗体对原发性胆汁性肝硬化（PBC）的诊断价值。方法计算机检索Cochrane图书馆，MEDLINE、维普中文科技期刊数据库（VIP）、中文科技期刊全文数据库（CNKI）、中国学位论文全文数据库（万方）。按文内所述纳入标准收集抗GP210抗体和抗SP100抗体诊断PBC的研究，采用QUADAS量表进行质量评价，利用Meta-disc1．4及RevMan5．2软件进行数据分析，绘制SCRO曲线。结果共纳入25项抗GP210抗体和21项抗SP100抗体的研究。抗GP210抗体对PBC的诊断优势比（DOR）、汇总灵敏度和汇总特异度分别是24．854（95％a，11．957～51．660）、0．272（95％CI，0．257～0．288）和0．985（95％a，0．982～0．988），抗SP100抗体DOR、汇总灵敏度和汇总特异度分别是9．133（95％CI，4．739～17．600）、0．231（95％C／，0．213～0．249）和0．977（95％CI，0．973～0．981）。结论抗GP210抗体和抗SP100抗体对于PBC诊断特异度高，但灵敏度较低。

关键词：肝硬化胆汁性原发性 Meta分析抗体 GP210 抗体 SP100

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值得临床关注的新挑战：丙型肝炎病毒对直接抗病毒药物的耐药

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中华肝脏病杂志 2016年第3期24卷 165-169页

作者：陈志伟胡鹏任红重庆医科大学附属第二医院感染科、重庆医科大学病毒性肝炎研究所感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆400010

直接抗病毒药物（DAAs）治疗是国外HCV感染的主要治疗方案.但是耐药问题却引起越来越多临床医生的关注.我国目前还没有批准DAAs上市,部分DAAs正处于临床试验阶段.但对HCV耐药有一个认识,对于优化治疗方案、提高治愈率和减少治疗失败具... 详细信息

直接抗病毒药物（DAAs）治疗是国外HCV感染的主要治疗方案.但是耐药问题却引起越来越多临床医生的关注.我国目前还没有批准DAAs上市,部分DAAs正处于临床试验阶段.但对HCV耐药有一个认识,对于优化治疗方案、提高治愈率和减少治疗失败具有重要的临床意义.现就DAAs耐药机制及屏障、预存耐药突变发生率、耐药对治疗效果的影响、耐药后治疗方案选择以及耐药检测的方法等问题作一介绍,希望能对DAAs在我国的规范化治疗提供帮助.

关键词：肝炎病毒,丙型抗病毒药耐药

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人感染H7N9禽流感病毒血凝素和神经氨酸酶的B细胞表位预测

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细胞与分子免疫学杂志 2013年第12期29卷 1319-1321,1326页

作者：李虎胡鹏重庆医科大学附属第二医院感染科感染性疾病分子生物学教育部重点实验室重庆医科大学病毒性肝炎研究所重庆400010

目的利用计算机软件预测人感染H7N9禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的B细胞表位。方法以HA、NA的氨基酸序列为基础,用Protean、PORTER、MEGA等生物信息学软件综合预测HA、NA蛋白可能的B细胞表位,再结合吴玉章的平均抗原指数方案... 详细信息

目的利用计算机软件预测人感染H7N9禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的B细胞表位。方法以HA、NA的氨基酸序列为基础,用Protean、PORTER、MEGA等生物信息学软件综合预测HA、NA蛋白可能的B细胞表位,再结合吴玉章的平均抗原指数方案进一步筛选。结果 HA蛋白最有可能的B细胞表位位于其N端的第53～57、179～183区段,HA蛋白的其它区段:62～66、98～101、164～166、315～320、424～426、443～445、493～496等也有可能存在B细胞表位。NA蛋白最有可能的B细胞表位位于N端的第321～329、379～386区段,NA蛋白的其他区段:46～48、52～54、74～78、136～141、145～150、160～164、194～197、246～248、333～343、426～431等也有可能存在B细胞表位。结论综合多种方案预测了H7N9病毒HA、NA蛋白的B细胞表位,为人感染H7N9禽流感病毒表位疫苗研究提供了实验基础。

关键词： H7N9 HA NA B细胞表位

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基于生物信息学分析筛选肝细胞癌中的核心基因:细胞周期蛋白B2可作为肝癌潜在的诊疗和预后生物标志物

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中华肝脏病杂志 2020年第9期28卷 773-783页

作者：杨双燕任红李传飞汤慧重庆医科大学附属第二医院感染科/重庆医科大学病毒性肝炎研究所/感染性疾病分子生物学教育部重点实验室 400010 重庆医科大学附属第二医院消化内科 400010

目的通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因(Hub gene),探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集,用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因(DEGs)。利... 详细信息

目的通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因(Hub gene),探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集,用GEO2R分析数据并鉴定差异表达基因(DEGs)。利用DAVID数据库对DEGs进行GO分析,Cytoscape的ClueGO插件完成KEGG信号通路富集分析,并将DEGs导入STRING数据库建立蛋白相互作用(PPI)网络图,用Cytoscape对PPI网络进行可视化,构建关键模块(cluster)和筛选核心基因。分别使用UCSC数据库和UALCAN数据库完成核心基因在TCGA肝癌中的差异表达分析和生存分析。使用Firebrowse,Oncomine和UALCAN数据库分析核心基因在包括HCC在内的多个肿瘤中的表达。用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测候选基因在HCC组织和肝癌细胞系中的表达水平。结果从四个数据集中共鉴定了73个DEGs,包括15个上调基因和58个下调基因。KEGG信号通路富集分析显示DEGs主要富集于肿瘤相关通路。基于DEGs的PPI网络图,筛选了一个关键模块和10个核心基因。CCNB2与NCAPG在多个数据库的肝癌组织中均高表达。CCNB2与NCAPG呈正相关,被认为是与预后相关的关键基因(P<0.01)。RT-qPCR结果表明CCNB2在人肝癌组织和细胞系中高表达(P<0.01)。结论成功筛选出HCC相关的DEGs和核心基因,其中CCNB2在HCC中高表达且与患者生存预后相关,有望成为HCC诊疗和预后的生物标志物。

关键词：肝细胞癌生物信息学分析细胞周期蛋白B2 生物标志物

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