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基于中断时间序列分析评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响

郑州大学学报（医学版） 2024年第4期59卷 459-463页

作者：李言言李鑫潇张冰洁薛晨路王永斌新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新乡453003

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数... 详细信息

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数据构建ARIMA预测模型,用2019年7月至2019年12月数据验证模型的预测效果。以该模型预测的2020年1月至2022年9月(疫情防控期间)手足口病发病数据为预测值,同期报告数据为真实值,采用阶跃变化、脉冲变化两种评价方法,分析疫情防控对手足口病发病的影响。结果:ARIMA(0,1,1)(0,1,1)12模型的MA1=0.43(t=3.14,P<0.001),SMA1=-0.62(t=6.94,P<0.001);根据AIC、AICC和BIC最小,LL最大,确定其为最优模型。该模型的预测值与真实值的平均相对误差为10.20%。疫情防控期间估计的手足口病发病数阶跃变化为-3471(95%CI为-11794~4852)例,估计的脉冲变化为每月9210(95%CI为3153~15268)例。结论:新冠病毒感染疫情防控降低了河南省手足口病发病水平。

关键词：中断时间序列分析自回归综合移动平均模型新冠病毒感染疫情手足口病河南省

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幽门螺杆菌与白细胞介素-1基因交互作用

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中国公共卫生 2006年第11期22卷 1366-1368页

作者：廖娜段广才郗园林白雪飞新乡医学院公共卫生系流行病与卫生统计学教研室河南新乡453003 郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的探讨幽门螺杆菌（Hp）感染与白细胞介素-1基因家族中白细胞介索-1B（IL-1B）-31与IL-1B-511（IL-1B）位点单核苷酸多态性（SNP）、IL-1RN可变数目串连重复序列（VNTR）及二者交互作用与十二指肠溃疡病（DU）发病风险的关系。方法 ... 详细信息

目的探讨幽门螺杆菌（Hp）感染与白细胞介素-1基因家族中白细胞介索-1B（IL-1B）-31与IL-1B-511（IL-1B）位点单核苷酸多态性（SNP）、IL-1RN可变数目串连重复序列（VNTR）及二者交互作用与十二指肠溃疡病（DU）发病风险的关系。方法用病例对照研究方法，调查94例对照和54例DU患者，ELISA方法检测患者IgG抗体，PCR扩增目的基因，电泳检测IL-1RN可变数目串连重复序列，限制性片段多态性分析（RFLP）检测IL-1B-31、IL-1B-511单核苷酸多态性。结果 Hp感染、IL-1B-511C／C型增加DU的患病危险，OR分别为8．26（95％CI=3．02～22．59），3．05（95％CI=1．23～7．57）。Hp感染和IL-1B-31T／T、IL-1B-511C／C、非Ⅰ型IL-1RN之间有交互作用存在，交互作用项OR分别为16．75（95％CI=3．64～77．04），41．42（95％CI=8．96～191，40），4．93（95％CI=1．35～17．99），交互作用系数（γ）分别为1．22，1．7，0．84。结论 IL-1B-31T／T、IL-1B-511C／C能增加Hp感染对十二指肠溃疡病患病的危险作用，而非Ⅰ型IL-1RN则减弱Hp的危险作用。这种交互作用的存在有助于解释Hp感染临床结局的复杂性。

关键词：十二指肠溃疡幽门螺杆菌白细胞介素-1 基因多态性

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需暴露人数在流行病学中的应用

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中华流行病学杂志 2005年第7期26卷 540-543页

作者：童峰陈坤何寒青浙江大学医学院公共卫生系流行病学与卫生统计学教研室杭州310031

目的介绍需暴露人数(NNE)的基本概念、计算方法及用途.方法以琥珀水杨酸交联血红蛋白溶液(DCLHb)治疗急性创伤后出血性休克与患者入院后28天内死亡的研究为实例,计算粗NNE和调整NNE及相应95%可信区间(CI).结果通过计算得到暴露DCLHb的粗... 详细信息

目的介绍需暴露人数(NNE)的基本概念、计算方法及用途.方法以琥珀水杨酸交联血红蛋白溶液(DCLHb)治疗急性创伤后出血性休克与患者入院后28天内死亡的研究为实例,计算粗NNE和调整NNE及相应95%可信区间(CI).结果通过计算得到暴露DCLHb的粗NNEH=3.7(95% CI:2.2～11.5);在调整了基线死亡风险的混杂偏倚后,暴露DCLHb的调整NNEH=2.6(95% CI:1.6～8.0).说明在试验组研究对象的基线死亡风险(病情严重程度)的分布与对照组相同的情况下,平均每2.6例创伤后出血性休克患者暴露于DCLHb就会在入院后28天内新增1例死亡.结论NNE可用来说明在前瞻性研究中,相对于非暴露组,要新增(或预防)一例某病的发病或死亡病例,需暴露于某因素的平均估计人数.作为衡量暴露因素作用强度的一个新指标,NNE可以更为直观地表达研究的结果,易被临床医生、卫生决策者及公众所接受.

关键词：流行病学人数 DCLHb 血红蛋白溶液病情严重程度死亡风险出血性休克前瞻性研究计算方法可信区间混杂偏倚研究对象休克患者死亡病例作用强度暴露因素表达研究临床医生卫生决策入院后创伤后水杨酸对照组

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筛检项目总效果评价的新指标——需筛检人数

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中华流行病学杂志 2006年第8期27卷 725-727页

作者：童峰陈坤何寒青浙江大学医学院公共卫生系流行病学与卫生统计学教研室杭州310031

目的介绍需筛检人数(NNBS)的基本概念、计算方法及用途。方法利用需治疗人数(NNT)的基本思想引入评价筛检项目总效果的新指标,以大便隐血试验(FOBT)筛检结直肠癌的随机对照试验和X线检查筛检乳腺癌的随机对照试验的两项研究为实例,计算... 详细信息

目的介绍需筛检人数(NNBS)的基本概念、计算方法及用途。方法利用需治疗人数(NNT)的基本思想引入评价筛检项目总效果的新指标,以大便隐血试验(FOBT)筛检结直肠癌的随机对照试验和X线检查筛检乳腺癌的随机对照试验的两项研究为实例,计算需邀请参加筛检人数(NNI)和NNBS。结果通过计算得到欲通过实施FOBT筛检方案,要在14年内使当地45-74岁人群预防1例因结直肠癌所致的死亡,NNI为1220人,NNBS为665人;此外,欲通过实施乳腺X线检查筛检方案,要在8年内使当地40-74岁妇女预防1例因乳腺癌所致的死亡,NNI为1961人,NNBS为1494人。结论NNBS能以较直观的方式来评价筛检项目的总效果,便于研究人员、卫生决策者和社会公众进行更好的沟通和交流。

关键词：需筛检人数随机对照试验筛检

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CRISPR1上游侧翼序列用于大肠埃希菌和志贺菌鉴定的效果评价

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中华流行病学杂志 2018年第12期39卷 1607-1610页

作者：梁文娟崔聪聪段广才刘慧莹徐亚珂郗园林杨海燕陈帅印新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室 453003 郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系 450001 新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心 453003

目的探讨基于成簇规律间隔的短回文重复序列(CRJSPR)1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。方法通过BLAST重复序列识别并获得全基因组测序大肠埃希菌和志贺菌的CRISPRs和CRISPR相关基因(CRISPR-associated,cas),并分析其种... 详细信息

目的探讨基于成簇规律间隔的短回文重复序列(CRJSPR)1上游侧翼序列对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。方法通过BLAST重复序列识别并获得全基因组测序大肠埃希菌和志贺菌的CRISPRs和CRISPR相关基因(CRISPR-associated,cas),并分析其种系;选取CRISPRs上、下游各500bp侧翼序列,使用ClustalX进行序列比对;采用PCR方法扩增CRISPR1上游侧翼序列,以确定其对大肠埃希菌和志贺菌鉴定和评价效果。结果73.4%(149/203)的大肠埃希菌存在I-E型CRISPR/Cas系统,包含了A、B1、D种系;8.4%(17/203)的大肠埃希菌存在I-F型CRISPR/Cas、17.2%(35/203)的大肠埃希菌不存在CRISPR/Cas,这2种大肠埃希菌均属于B2种系;9株志贺菌均存在I-E型CRISPR/Cas。在大肠埃希菌(B2种系外)、志贺菌CRISPR1上游和大肠埃希菌(B2种系)各存在61bp侧翼序列,序列一致性为99%,且有种属特异性,PCR扩增此区域鉴定大肠埃希菌和志贺菌的灵敏度和特异度均>91%。结论基于CRISPR1上游序列可用来鉴定大肠埃希菌和志贺菌,且具有良好的效果。

关键词：大肠埃希菌志贺菌成簇规律间隔的短回文重复序列侧翼序列鉴定

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河南省农村集中式供水微生物污染卫生现状及其影响因素分析

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吉林大学学报（医学版） 2016年第6期42卷 1230-1236页

作者：任静朝张光辉郝鹏飞陈璐范中原王宽杨海燕段广才新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室河南新乡453003 郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室河南郑州450001 河南省新乡市疾病预防控制中心公共卫生科河南新乡453003

目的：了解河南省农村集中式供水微生物污染卫生现状,分析影响水质微生物的影响因素,为制定农村饮用水安全发展规划提供科学依据。方法：2011—2014年对河南省新乡市8个县（市）农村集中式供水进行采样,并开展卫生学状况调查（水源类型... 详细信息

目的：了解河南省农村集中式供水微生物污染卫生现状,分析影响水质微生物的影响因素,为制定农村饮用水安全发展规划提供科学依据。方法：2011—2014年对河南省新乡市8个县（市）农村集中式供水进行采样,并开展卫生学状况调查（水源类型、水期类型、供水规模、季节、地方病和消毒情况等）,依据《生活饮用水标准检验方法》（GB/T5750-2006）对出厂水和末梢水进行微生物检测,包括菌落总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群和大肠埃希氏菌,并采用Logistic回归分析集中式供水菌落总数超标的影响因素,采用Poisson回归分析集中式供水菌落总数和总大肠菌群数的影响因素。结果：2011—2014年分别采水样824、820、526和636份。供水水源以深井水为主（90.0%）,未经任何处理的饮用水水样占70.6%。4年水样的菌落总数合格率分别为76.0%、75.5%、66.5%和72.6%;总大肠菌群合格率依次为97.3%、94.9%、99.6%和94.3%。2011—2014年消毒供水的菌落总数超标率均低于未消毒供水（P〈0.05）;2012—2014年末梢水中菌落总数超标率高于出厂水（P〈0.05）;2013年和2014年中型供水能力（100～1 000t）工程的供水中菌落总数超标率低于大型供水能力（≥1 000t）和小型供水能力（〈100t）的供水工程（P〈0.05）。Logistic回归分析,丰水期的水样中菌落总数超标率高于枯水期（χ^2=12.31,P〈0.001）;消毒能够降低菌落总数超标率（χ^2=85.32,P〈0.001）;以除氟和解决苦咸水为目的的供水工程供水中菌落总数超标率较低（χ^2=34.44,P〈0.001;χ^2=39.44,P〈0.001）。Poisson回归分析,丰水期（χ^2=6 972.75,P〈0.001）、未消毒（χ^2=5 415.46,P〈0.001）、末梢水（χ^2=97.64,P〈0.001）、运营时间长（χ^2=26.57,P〈0.001）、供水能力小（χ^2=4 502.57,P〈0.001）、以除氟和解决苦咸水为目的的改水工程（χ^2=6 226.68,P〈0.001;χ^2=13 441.50,P〈0.001）的水样中菌落总数较高。而100^1 000t的供水能力工程（χ^2=802.18,P〈0.001）及以除氟和苦咸水为目的供水工程（χ^2=2 711.88,P〈0.001;χ^2=1 470.91,P〈0.001）水样中的总大肠菌群数较低,丰水期（χ^2=16 583.10,P〈0.001）、未消毒（χ^2=276.34,P〈0.001）、末梢水（χ^2=1 205.26,P〈0.001）和运营时间长（χ^2=3 220.58,P〈0.001）的水样中总大肠菌群数较高。结论：河南省农村集中式供水消毒比例较低,菌落总数合格率不高,总大肠菌群合格率高。水期类型、是否消毒、水样类型、运行年、供水能力和供水工程目的均不同程度地影响农村集中式供水的水质微生物。

关键词：农村集中式供水微生物卫生监测总大肠菌群耐热大肠菌

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非预防医学专业本科阶段《医学统计学》教学满意度评价及建议

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现代预防医学 2013年第23期40卷 4486-4489页

作者：陈卫中魏敏杨书杨晓虹成都医学院公共卫生系流行病与卫生统计学教研室

目的了解某校非预防医学专业《医学统计学》课程的教学现况和教学满意度,发现教学过程中的薄弱环节及存在的主要问题,并提出相关建议。方法采用无记名问卷的方式对该校2011年春季学期255名临床、药学、生物技术专业本科生进行了调查。... 详细信息

目的了解某校非预防医学专业《医学统计学》课程的教学现况和教学满意度,发现教学过程中的薄弱环节及存在的主要问题,并提出相关建议。方法采用无记名问卷的方式对该校2011年春季学期255名临床、药学、生物技术专业本科生进行了调查。结果大部分学生对理论授课的满意程度较高,不满意率为8.98%,而22.22%的学生对软件实习情况不满意。Logistic回归分析表明,学习兴趣及信心、授课进度、教师授课注重学科交叉程度、与教师的交流充分程度等因素是与满意度有关联的因素。结论针对不同专业背景,采取合理的教学模式,并合理安排教学内容,强化统计思维的培养,以提高《医学统计学》的教学效果。

关键词：医学统计学教学满意度本科

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基于CRISPR1上游侧翼序列鉴定沙门菌的效果评价

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中国病原生物学杂志 2020年第11期15卷 1310-1313页

作者：梁文娟王鹏飞段广才郗园林杨海燕陈帅印新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室河南新乡453003 河南科技大学医院郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系

目的评价基于成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)1上游侧翼序列鉴定沙门菌的效果。方法在NCBI里通过已知的重复序列BLAST识别并获得全基因组测序沙门菌的CRISPRs和CRISP... 详细信息

目的评价基于成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)1上游侧翼序列鉴定沙门菌的效果。方法在NCBI里通过已知的重复序列BLAST识别并获得全基因组测序沙门菌的CRISPRs和CRISPR相关基因(CRISPR-associated,cas)信息;选择并提取确定CRISPRs的上、下游各500bp的侧翼序列,使用Clustal X软件比对侧翼序列;采用PCR方法扩增沙门菌的CRISPRs序列和CRISPR1上游特异侧翼序列,与金标准API方法鉴定的菌株比较,评价CRISPR1上游特异侧翼序列检测对鉴定沙门菌的效果。结果329株全基因测序和38株实验室保存的沙门菌均存在I-E CRISPR/Cas,除猪霍乱沙门菌C500外,其余所有菌株均存在CRISPR1和2两个位点。在沙门菌的CRISPR1上游侧翼序列存在61bp的特异序列,一致性为99%,且具有种属特异性,通过PCR扩增此序列鉴定沙门菌的灵敏度为97.4%,特异度为99.1%。结论基于CRISPR1上游侧翼序列鉴定沙门菌的方法灵敏特异,效果良好。

关键词：沙门菌成簇规律间隔的短回文重复序列侧翼序列鉴定

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优势比在诊断试验评价中的应用

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中华流行病学杂志 2005年第10期26卷 813-814页

作者：童峰陈坤何寒青浙江大学医学院公共卫生系流行病学与卫生统计学教研室杭州310031

诊断试验是辅助临床医师进行疾病诊断的试验方法,评价诊断试验准确度的常用指标,包括灵敏度(真阳性率,TPR)、特异度(真阴性率,TNR)、假阴性率(FNR)、假阳性率(FPR)、约登指数、似然比(LR)、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)等.

关键词：诊断试验评价优势比评价诊断试验假阴性率阳性预测值阴性预测值试验方法疾病诊断临床医师常用指标

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CVA6高通量测序方法的建立及应用

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现代预防医学 2023年第9期50卷 1700-1705页

作者：裴书君李懿卢世栋索文帅王笑阳陈泽倩王若琳黄学勇新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的建立柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）基于多重PCR扩增的高通量测序方法，并应用于CVA6的基因进化研究。方法利用PRIMER5.0设计7对CVA6型特异性引物，在同一体系构建并优化多重PCR高通量测序方法，并应用该方法对河南... 详细信息

目的建立柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）基于多重PCR扩增的高通量测序方法，并应用于CVA6的基因进化研究。方法利用PRIMER5.0设计7对CVA6型特异性引物，在同一体系构建并优化多重PCR高通量测序方法，并应用该方法对河南省39份CVA6标本开展基因测序，分析核苷酸氨基酸同源性和构建系统进化树。结果本研究成功建立基于多重PCR的CVA6高通量测序方法，基因特征分析表明此次河南省检出的CVA6流行亚型为D3a亚型，与山东、湖南、浙江、云南、辽宁、江西等地区的毒株亲缘关系较近。结论本研究建立CVA6的高通量测序方法特异性强，扩增效率高，为CVA6型基因型遗传特征和变异规律提供了技术支持，可应用于CVA6的同源性分析及基因进化研究分析。

关键词： CVA6 多重PCR引物高通量测序系统进化

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