检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学通报 2025年第3期52卷 1309-1322页

作者：迪力努尔·艾克帕贺怡田婷婷梁美婷陈邬锦陈晓瑜朱语秋杜满茜孙玉萍新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830000 新疆第二医学院基础医学部新疆克拉玛依834000 新疆医科大学第五附属医院检验科新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学基础医学院医学微生物学教研室新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学新疆地方病分子生物学重点实验室新疆乌鲁木齐830000

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌... 详细信息

【背景】高尿酸血症是一种尿酸生成与排泄失衡所导致的嘌呤代谢紊乱疾病,而肠道微生物在嘌呤代谢中发挥重要作用,其中1/3的尿酸通过肠道菌群分解,所以肠道益生菌能够有效降低体内尿酸水平,缓解高尿酸血症。【目的】获得人源性尿酸降解菌,并了解其与尿酸降解有关的基因及功能。【方法】通过体外尿酸强化培养和驯化,从正常低尿酸健康人群肠道粪便中获得具备尿酸降解能力的菌株,对其进行一般形态学观察、生化试验、16S rRNA基因序列测定,以及生物信息学分析和鉴定,并进行全基因组测序和功能基因挖掘。【结果】分离出一株具有较高尿酸降解功能的革兰氏阳性杆菌M2a,尿酸降解率达到82.73%,经鉴定为类干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei),全基因组测序发现菌株M2a具有9个与尿酸降解相关的基因。【结论】菌株M2a具有高效降解尿酸的能力,为开发和利用微生物制剂进行尿酸治疗提供了科学依据和菌种资源。

关键词：类干酪乳酪杆菌菌株鉴定全基因组测序尿酸降解功能分析

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铜死亡相关基因DLD在泛癌中的表达及其与预后、免疫浸润的相关性分析

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中国免疫学杂志 2025年第1期41卷 144-152页

作者：余春波周俞李大玉徐先林李长福范芳遵义医科大学基础医学院生物化学教研室遵义563000 遵义医科大学临床学院遵义563000

目的:利用生物信息学方法联合多数据库分析铜死亡相关基因DLD在泛癌中的表达与预后、肿瘤微环境及肿瘤免疫浸润之间的关系。方法:使用TCGA、GTEx、TISDB、GEO、UCSC、TARGET、TIMER2.0、GEPIA2、SangerBox、PrognoScan数据库及相关R软件... 详细信息

目的:利用生物信息学方法联合多数据库分析铜死亡相关基因DLD在泛癌中的表达与预后、肿瘤微环境及肿瘤免疫浸润之间的关系。方法:使用TCGA、GTEx、TISDB、GEO、UCSC、TARGET、TIMER2.0、GEPIA2、SangerBox、PrognoScan数据库及相关R软件包,分析DLD在人类癌症和邻近正常组织之间的表达差异,探讨DLD表达与预后之间的关系,探索DLD在人类癌症不同免疫亚型和分子亚型中的表达,分析DLD表达与肿瘤免疫浸润和肿瘤微环境之间的相关性,探究DLD表达与60个免疫检查点基因的相关性。结果:DLD在人类不同肿瘤组织中的表达存在差异;6种肿瘤中DLD低表达、3种肿瘤中DLD高表达与较好的预后显著相关;15种肿瘤的免疫亚型、11种肿瘤的分子亚型与DLD的表达显著相关;在37种癌症中DLD表达与免疫浸润显著相关;23种肿瘤基质评分、26种肿瘤免疫评分及25种肿瘤ESTIMATE评分中DLD表达与免疫浸润显著相关;39种肿瘤中60个免疫检查点基因与DLD表达显著相关。结论:DLD在泛癌中的表达与肿瘤的预后及免疫浸润有关,可能是肿瘤预后的潜在预测因子,可能是肿瘤的免疫调节因子。

关键词：二氢硫辛酰胺脱氢酶泛癌免疫浸润肿瘤微环境生物信息学

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基于引物交换反应的非标记荧光探针用于脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1的高灵敏检测

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分析化学 2025年第3期53卷 464-471页

作者：王芸花王乐如杨力改陈佳政杜雨润侯嘉慧翟翔赵旭华于保锋山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室

脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE 1)是一种多功能蛋白质，在DNA修复和基因表达调控中发挥重要作用。由于APE 1在多种癌症中过表达，因此可作为癌症生物标志物，用于辅助临床诊断、指导用药及预后... 详细信息

脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE 1)是一种多功能蛋白质，在DNA修复和基因表达调控中发挥重要作用。由于APE 1在多种癌症中过表达，因此可作为癌症生物标志物，用于辅助临床诊断、指导用药及预后监测。本研究采用引物交换反应（Primer exchange reaction, PER）策略，设计了一种非标记型荧光探针，用于APE 1活性的高灵敏检测。当体系中不存在APE 1时，催化发夹（Catalytic hairpin, HP）的结构稳定，无G-四链体（G-quadruplex）生成。此时，游离的硫磺素T(Thioflavin T,ThT)不发射荧光，体系的背景荧光很低。加入APE 1后，催化发夹上的无嘌呤/嘧啶（Apurinic/apyrimidinic,AP）位点被特异性识别并切割，断裂生成的短核酸序列可直接作为引物引发PER扩增，生成大量G-四链体。游离的ThT嵌入G-四链体结构并发出荧光，导致传感体系的荧光信号显著增强。PER扩增反应策略和催化发夹的低背景设计使此探针展现出很高的灵敏度，线性检测范围为0.001～0.07 U/mL，检出限（3σ）为0.0008 U/mL。此外，引物序列可由APE 1切割直接生成而不需要额外添加，这不仅提高了反应的特异性，还简化了操作步骤。非标记型荧光信号的使用大大降低了实验成本，实现了APE 1的快速检测。利用此荧光探针检测人血清样品中APE 1的含量，回收率在91%～104%之间，表明其在生物酶研究方面拥有巨大的应用潜力。

关键词：脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1 引物交换反应 G-四链体硫磺素T 非标记荧光探针

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ULK3基因在前列腺癌中的生物信息学分析及其在DU145中的表达

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基因组学与应用生物学 2025年第1期44卷 80-91页

作者：邹雨轩张云博孙梦李梦佳韩洋洋新疆医科大学基础医学院生物学教研室新疆地方病分子生物学重点实验室

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer, PCa)中的潜在作用，并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、 UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况；利... 详细信息

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer, PCa)中的潜在作用，并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、 UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况；利用STRING数据库分析与ULK3相关的互作蛋白质，并对ULK3差异表达基因进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA);通过GO、 KEGG分析，探讨ULK3的潜在作用机制；通过miRNet平台预测调控ULK3的微RNA(miRNA),并构建PCa中潜在的ULK3-miRNA-mRNA调控网络；利用TIMER 2.0数据库分析ULK3在PCa中与免疫浸润的关系。基于上述生物信息学分析，对PCa细胞DU145进行ULK3敲降处理，并通过实时定量PCR(real-time quantitative PCR, RT-qPCR)和Western blot检测ULK3下调效率；通过划痕实验和MTT法检测ULK3稳定下调对前列腺癌细胞增殖的影响。结果显示，ULK3在PCa癌组织中比在正常前列腺组织中高表达；通过富集分析发现ULK3的表达与多种生物学功能有关，其中主要作用的通路有范可尼贫血途径和Notch信号通路；通过免疫浸润分析发现ULK3高表达时多种免疫细胞的浸润水平显著下降。此外，成功构建敲降ULK3的前列腺癌细胞系DU145,通过划痕实验和MTT法发现敲降ULK3后对DU145细胞的迁移和增殖起到抑制作用。以上结果表明ULK3在前列腺癌中发挥重要生物学作用，敲降ULK3可能对PCa存在抑制作用，这为后续PCa的基础研究与临床治疗提供了新的思路。

关键词： ULK3 前列腺癌(PCa) 生物信息学慢病毒增殖

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BOPPPS教学模式在医学微生物学教学中的应用

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基础医学教育 2025年第2期27卷 99-103页

作者：阿孜尔古丽·阿布都克日木卡思木江·阿西木江陈锋张蓓孙玉萍新疆医科大学基础医学院微生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆医科大学基础医学院生物化学教研室

医学微生物学是医学专业课程中的必修课。医学微生物学课程理论及实验教学的有机融合在促进掌握扎实的理论知识的同时锻炼了学生的科研创新能力及专业实践能力,是培养创新型应用人才的重要环节。BOPPPS教学模式着重于学生在课堂上的主... 详细信息

医学微生物学是医学专业课程中的必修课。医学微生物学课程理论及实验教学的有机融合在促进掌握扎实的理论知识的同时锻炼了学生的科研创新能力及专业实践能力,是培养创新型应用人才的重要环节。BOPPPS教学模式着重于学生在课堂上的主动地位,坚守以学生为中心的教学宗旨,其核心在于参与式互动学习。文章结合医学微生物学课程定位与目标,分析BOPPPS教学模式的特点,以理论课化脓性球菌章节及实验课中设计型实验内容脓汁标本的病原学检查为例,探索BOPPPS教学模式在理论及实验教学中的具体应用模式,旨在为提升医学微生物学及其相关课程教学模式提供有益的参考依据。

关键词：医学微生物学 BOPPPS教学模式教学改革课程设计教学探索

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高糖抑制蛋白KIAA0753和CCSAP表达并通过钙信号阻断小鼠胚胎成骨细胞前体细胞MC3T3-E1的成骨分化

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中国药理学通报 2025年第3期41卷 456-465页

作者：王吉春钱正霞李梦雪汪长东重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室重庆400016 重庆医科大学附属第一医院麻醉科重庆400016

目的探究高糖对蛋白KIAA0753和CCSAP的影响,以及高糖条件下KIAA0753和CCSAP与成骨分化以及钙信号通路三者之间的联系。方法利用5.5和25 mmol·L^(-1)葡萄糖浓度的成骨培养基诱导小鼠胚胎成骨细胞前体细胞(MC3T3-E1),通过Western blo... 详细信息

目的探究高糖对蛋白KIAA0753和CCSAP的影响,以及高糖条件下KIAA0753和CCSAP与成骨分化以及钙信号通路三者之间的联系。方法利用5.5和25 mmol·L^(-1)葡萄糖浓度的成骨培养基诱导小鼠胚胎成骨细胞前体细胞(MC3T3-E1),通过Western blot检测KIAA0753和CCSAP蛋白表达情况;转染过表达质粒进入人胚肾细胞(HEK-293T),免疫共沉淀检测蛋白KIAA0753和CCSAP相互作用;利用成骨培养基分别在不同葡萄糖浓度和不同诱导时间处理MC3T3-E1细胞,试剂盒检测碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)活性,Western blot检测KIAA0753、CCSAP、骨桥蛋白(osteopontin,OPN)、骨钙素(osteocalcin,OCN)等蛋白的表达情况,然后再设置5.5、25 mmol·L^(-1)和25 mmol·L^(-1)+OE-CCSAP组MC3T3-E1细胞,依次检测KIAA0753、OCN、OPN蛋白的表达情况以及ALP活性;利用高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中糖尿病鼠模型数据集筛选差异基因进行生物信息学分析;对MC3T3-E1细胞分别设置5.5、25 mmol·L^(-1)和25 mmol·L^(-1)+OE-KIAA0753组,Western blot检测钙离子-钙调蛋白依赖性蛋白激酶Ⅱ(calcium/calmodulin-dependent protein kinaseⅡbeta,CAMK2B)、受磷蛋白(phospholamban,PLN)蛋白的表达。结果与5.5 mmol·L^(-1)组相比,25 mmol·L^(-1)抑制成骨细胞中KIAA0753和CCSAP蛋白表达,且蛋白KIAA0753和CCSAP存在相互作用。同时25 mmol·L^(-1)也抑制成骨细胞ALP、OPN、OCN蛋白表达,在25 mmol·L^(-1)的条件下过表达CCSAP上调KIAA0753、OCN、OPN、ALP的表达。糖尿病鼠模型的差异基因主要富集在“信号受体、信号调控”等方面。25 mmol·L^(-1)葡萄糖抑制成骨细胞中CAMK2B、PLN蛋白的表达,且在25 mmol·L^(-1)的条件下过表达KIAA0753上调CAMK2B、PLN蛋白的表达。结论高糖抑制KIAA0753和CCSAP蛋白表达,抑制小鼠胚胎成骨细胞前体细胞成骨分化和钙信号传导,过表达CCSAP挽救高糖对成骨分化的抑制作用以及过表达KIAA0753逆转高糖对钙信号通路的抑制作用。

关键词：糖尿病 KIAA0753 CCSAP 蛋白相互作用成骨分化钙信号

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NUF2对泛癌的预后和免疫治疗效果的预测价值

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南方医科大学学报 2025年第1期45卷 137-149页

作者：王耀彬陈柳燕罗伊凌申继清周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室//广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021

目的探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌... 详细信息

目的探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌作用,包括剖析NUF2在各种类型肿瘤组织中的表达水平、预后价值及免疫价值;采用RT-qPCR、Western blotting、免疫组化(IHC)等实验检测NUF2在肝癌细胞系和肝癌患者癌组织及血液中的表达情况。利用基因本体论(GO)、基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)探索NUF2及相关基因的分子机制并在肝癌中构建了NUF2的竞争性内源RNA(ceRNA)网络。结果与正常组织相比,NUF2表达在27种肿瘤中上调并与多种类型肿瘤的临床分期相关(P<0.05)。在部分肿瘤中,NUF2的表达上调与肿瘤患者的不良预后(总体生存期、疾病特异性生存期、无病生存期和无进展生存期)相关(P<0.05)。NUF2表达水平与多种肿瘤的肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、浸润免疫细胞(B细胞、髓样树突状细胞、中性粒细胞、CD4+T细胞)、免疫细胞maker基因(CCR7、CD163、CD19、CD4、CD79A、CD8A、CD8B、IRF5、ITGAX和MS4A4A)以及免疫检查点基因(CTLA4、HAVCR2、LAG3、PDCD1和PDCD1LG2)呈正相关(P<0.05)。RT-qPCR等实验结果显示NUF2在肝癌细胞系、肝癌患者癌组织和血液中表达上调(P<0.05),其中肝癌患者经手术治疗之后,使得血液中NUF2表达下调(P<0.05)。GO和KEGG富集分析表明,NUF2相关基因与染色体分离、微管运动以及细胞周期相关(P<0.05)。GSEA分析提示,在肝癌中NUF2高表达与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢以及调控神经活性配体受体相互作用有关(P<0.05)。结论NUF2在27种肿瘤中表达上调并与部分肿瘤的临床分期、不良预后有关。此外NUF2的表达与多种肿瘤的免疫细胞浸润密切相关,可能作为这些癌症免疫治疗效果的潜在预测因子。

关键词： NUF2 泛癌分析免疫浸润预后

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基于基础医学创新研究暨实验设计论坛和“大创”项目对本科生科研能力提升的实践与思考

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内江科技 2025年第3期46卷 27-29页

作者：朱稷蔚周文骏杨桐桐木艾塔尔·艾斯卡尔王汉铭卡思木江·阿西木江新疆医科大学新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室

在医学生本科教育中,学生科研能力的培养至关重要,同时也是综合素质和创新思维培养的关键。在从医学生向临床医生转变的过程中,基础医学发挥着举足轻重的作用。本文以第九届基础医学创新研究暨实验设计论坛参与者和指导教师为主体,结合... 详细信息

在医学生本科教育中,学生科研能力的培养至关重要,同时也是综合素质和创新思维培养的关键。在从医学生向临床医生转变的过程中,基础医学发挥着举足轻重的作用。本文以第九届基础医学创新研究暨实验设计论坛参与者和指导教师为主体,结合国家级“大创”项目,并以参赛者视角回顾和总结作为本科生参加实验设计论坛以及“大创”项目申请、实施、结题的全过程,从个人能力、团队基础、以赛促研、协同合作等方面依次分析科研能力培养的重要性和实践经验。

关键词：科研能力培养大创协同合作医学创新项目申请实验设计基础医学学生科研能力

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敲低DRAM2抑制肺癌细胞系A549的增殖和迁移

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基础医学与临床 2025年第2期45卷 197-202页

作者：楼海均童卓云张振宇阿合叶尔克·马合沙提孟·孟根乌都木丽新疆医科大学基础医学院病理教研室新疆乌鲁木齐830017 新疆医科大学第五临床医学院检验科新疆乌鲁木齐830017

目的探讨DNA损伤调节自噬因子2(DRAM2)如何通过调节p53和自噬对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞增殖和迁移的影响。方法利用慢病毒技术敲低A549细胞系DRAM2基因,免疫荧光和Western blot检测自噬标志物。CCK8和Transwell实验检测细胞增殖和迁移... 详细信息

目的探讨DNA损伤调节自噬因子2(DRAM2)如何通过调节p53和自噬对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞增殖和迁移的影响。方法利用慢病毒技术敲低A549细胞系DRAM2基因,免疫荧光和Western blot检测自噬标志物。CCK8和Transwell实验检测细胞增殖和迁移,同时探究激活自噬和p53敲低对DRAM2敲低细胞自噬及功能的影响。结果敲低DRAM2抑制A549细胞p62表达上调(P<0.05)和LC3-Ⅱ降低(P<0.05)。敲低DRAM2抑制了NSCLC细胞的增殖(P<0.001)和迁移(P<0.001)。激活自噬能够部分消除敲低DRAM2对细胞增殖(P<0.01)和迁移(P<0.01)的抑制作用。当DRAM2和p53同时敲低时,恢复自噬、细胞增殖(P<0.05)和迁移能力(P<0.001)。结论敲低DRAM2抑制肺瘤细胞系A549的增殖和迁移,为未来非小细胞肺癌的治疗策略提供了可能的干预方向。

关键词：非小细胞肺癌 DNA损伤调节自噬调节因子2(DRAM2) 肿瘤蛋白p53 自噬

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泛凋亡在肿瘤中的研究进展

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生理学报 2025年第02期77卷 277-288页

作者：罗伊凌陈柳燕王耀彬周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西高校生物分子医学研究重点实验室

泛凋亡(PANoptosis)是一种由泛凋亡复合体调控的程序性细胞死亡，具有细胞焦亡、凋亡和(或)坏死性凋亡的关键特征。作为最复杂的程序性细胞死亡方式，泛凋亡涉及多种程序性细胞死亡之间的补偿作用，可以通过多种信号通路调节肿瘤细胞的... 详细信息

泛凋亡(PANoptosis)是一种由泛凋亡复合体调控的程序性细胞死亡，具有细胞焦亡、凋亡和(或)坏死性凋亡的关键特征。作为最复杂的程序性细胞死亡方式，泛凋亡涉及多种程序性细胞死亡之间的补偿作用，可以通过多种信号通路调节肿瘤细胞的增殖，迁移和侵袭等恶性表型的发生过程，从而影响恶性肿瘤的进展。研究发现泛凋亡在肿瘤进展和治疗中具有抑癌和促癌双重作用，因此深入研究泛凋亡在肿瘤发生、发展中的相关分子机制意义重大。本文综述了细胞凋亡、焦亡和坏死性凋亡的分子机制，总结了泛凋亡及其复合体的激活和调控机制以及泛凋亡在肿瘤发生、发展中的作用，以期为癌症治疗和预后评估提供新的思路。

关键词：细胞凋亡焦亡坏死性凋亡泛凋亡泛凋亡复合体肿瘤

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