检索结果-内蒙古大学图书馆

中国卫生统计 2025年第1期42卷 18-25,32页

作者：刘佳璐韩鑫浩魏孝礼陈璐程丽霞陈英东王文晗张秋菊哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院消化内科

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并... 详细信息

目的利用TCPA及UCSC Xena数据库获取样本信息,构建胃腺癌预后相关蛋白的预测模型,并检验其应用价值,以期为临床治疗与相关机制研究提供参考。方法利用R语言软件,通过单因素Cox分析和LASSO-Cox回归分析筛选与胃腺癌预后有关的蛋白质,并计算风险评分,根据风险评分结果将患者划分为高风险组和低风险组开展生存分析。同时绘制风险评分的ROC曲线、蛋白质热图等,用以评估这些蛋白质的预测能力。然后,将风险评分与患者其他临床表型数据结合,进行多因素回归分析,建立预后模型,并绘制列线图。通过C-index指标、ROC曲线、决策曲线等评估预后模型建立的准确性。进行GO富集分析与KEGG富集分析,探索相关蛋白所参与的生物学过程。结果通过单因素Cox分析及LASSO-Cox分析筛选出15个差异蛋白质(CKIT、CHK1、CLAUDIN7、COLLAGENVI、DVL3、EGFR_pY1173、ERALPHA_pS11、NFKBP65_pS536、SYK、ETS1、MYOSINIIA_pS1943、P21、P90RSK、RAPTOR、XBP1),用于计算蛋白质风险评分。通过多因素回归分析,筛选出年龄、性别、M分期、N分期、风险评分这5种因素,构建预后模型。生存分析结果认为,蛋白质风险评分划分的高低风险组之间的总生存率有显著差异(P<0.0001)。列线图可以用来预测患者3年、5年的生存率,并认为具有较好的预测价值(C-index=0.7257)。ROC曲线显示模型在预测中表现出稳定的灵敏度和特异度(AUC=0.77和0.86)。结论胃腺癌预后相关蛋白质的预测模型可用来预测患者的临床预后,研究结果可为个性化治疗和管理提供参考。

关键词：胃腺癌预测模型预后

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生物学年龄量化方法研究进展

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中华流行病学杂志 2023年第3期44卷 516-520页

作者：曹利美陈淑婷王彤山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001

生物学年龄已被证明优于时序年龄衡量个体间衰老的真实差异,但生物学年龄的量化方法在衰老研究领域至今未达成共识。本文对目前常用的一些生物学年龄的量化方法进行概述,并提出展望。

关键词：生物学年龄衰老量化

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基于TransUNet改进的多任务模型在直肠癌新辅助治疗中的应用

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中国卫生统计 2025年第1期42卷 2-6页

作者：尹淑文丁志鹏李岩高国闳程丽霞陈英东王文晗张秋菊周洋哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院影像中心

目的本研究基于深度学习方法对分割模型TransUNet做部分改进,构建既可分割又可预测分类的多任务模型,并应用于直肠癌新辅助治疗患者敏感人群识别的核磁图像中。方法多任务模型在TransUNet基础上添加分类结构,具体为全连接层(输入为512,... 详细信息

目的本研究基于深度学习方法对分割模型TransUNet做部分改进,构建既可分割又可预测分类的多任务模型,并应用于直肠癌新辅助治疗患者敏感人群识别的核磁图像中。方法多任务模型在TransUNet基础上添加分类结构,具体为全连接层(输入为512,输出为256)、ReLU激活函数、全连接层(输入为256,输出为3),实现三分类结局的预测,即疾病稳定(stable disease,SD),部分反应(partial response,PR)和完全反应(complete response,CR)。以2015—2017年哈尔滨医科大学附属肿瘤医院收治的71名直肠癌患者新辅助化疗前的3D核磁图像提取为2D图像作为研究数据,采用Dice系数和豪斯多夫距离评价分割效果,准确率、micro-precision、micro-recall和micro-F1 score评价分类效果。结果模型训练了100个轮次,分割任务在测试集上的平均Dice系数和平均豪斯多夫距离分别为0.851和10.806,分类任务从切片角度,测试集上的准确率、micro-precision、micro-recall和micro-F1 score均为0.615,从患者角度,四个指标均为0.857。结论分割任务效果良好,分类任务以切片为单位,效果一般,以患者为单位,考虑到结局为三分类,尚且可以接受。该多任务模型有潜力用于临床进行辅助诊断。

关键词：深度学习多任务学习结直肠癌新辅助治疗

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网络增强核融合方法的改进及其在乳头状肾细胞癌多组学数据整合分子分型中的应用

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中国卫生统计 2024年第3期41卷 376-381页

作者：师国京李灵梅魏亿芳赵鑫房瑞玲杨海涛余红梅张岩波曹红艳山西医科大学卫生统计教研室 030001 重大疾病风险评估山西省重点实验室河北医科大学流行病与卫生统计学教研室

目的针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(improved network enhancement fus... 详细信息

目的针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(improved network enhancement fusion,improved ne-SNF)方法,并探讨其在乳头状肾细胞癌(papillary renal cell carcinoma,PRCC)分子分型中的应用,识别PRCC高危患者,筛选重要通路及免疫浸润细胞。方法通过模拟研究评估improved ne-SNF分型性能,并将其用于PRCC多组学数据的整合分型,利用Cox回归模型分析不同分型患者的预后风险;筛选不同分型的差异表达mRNA(DEmRNAs)、miRNA(DEmiRNAs)及差异甲基化基因(DMGs),并对其重合基因进行KEGG通路分析;最后对不同分型患者进行免疫细胞浸润分析。结果模拟研究结果表明improved ne-SNF在不同信号比例和噪声强度下的分型准确性均优于SNF和ne-SNF。improved ne-SNF方法将PRCC患者分为高危组和低危组,高危组患者的死亡风险是低危组的7.727倍;筛选出3511个DEmRNAs,96个DEmiRNAs及3426个DMGs,其联合分析的649个重合基因得到42条有统计学差异的KEGG通路。此外,筛选出3种在不同分型中存在统计学差异的免疫浸润细胞。结论improved ne-SNF分型性能优于SNF和ne-SNF,且能够有效识别PRCC预后高风险患者,并筛选出PRCC重要通路及相关免疫浸润细胞,为PRCC的治疗及预后提供新的思路和参考依据。

关键词：改进的网络增强融合乳头状肾细胞癌多组学数据整合分子亚型

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RNN、JPR及ARIMA 3种模型预测中国农村孕产妇死亡率的比较

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中华疾病控制杂志 2023年第11期27卷 1308-1313页

作者：尹小兰何芯芯杜林李远盛张俊辉西南医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室泸州646000

目的利用循环神经网络(recurrent neural network,RNN)模型、Joinpoint回归(Joinpoint regression,JPR)模型、差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型预测中国农村孕产妇死亡率(maternal mortality rate,MMR)的应用价值,并对《“健康中国2030”规划纲要》等文件提出的MMR下降目标能否实现进行统计预测。方法基于2000―2019年中国农村MMR数据建立RNN、JPR及ARIMA模型,通过平均绝对误差(mean absolute error,MAE)、均方误差(mean squared error,MSE)、均方根误差(root mean square error,RMSE)比较3种模型的回代拟合效果,通过残差及相对误差比较3种模型对2020年中国农村MMR数据进行点预测的效果,利用优选模型对2021―2030年中国农村的MMR进行预测。结果2000―2020年中国农村的MMR整体呈持续下降趋势。3种模型回代拟合效果由好到差排序为:RNN>JPR>ARIMA,RNN模型的MAE、MSE、RMSE均<0.02。3种模型的点预测效果由好到差排序为:RNN>JPR>ARIMA。最优的RNN模型预测结果显示,2022年中国农村MMR预测值为18.02/10万,能够实现《“健康中国2030”规划纲要》等文件的下降目标;2025及2030年中国农村MMR预测值分别为17.58/10万、17.27/10万,均不能实现《“健康中国2030”规划纲要》等文件的下降目标。结论RNN模型预测效果优于JPR模型及ARIMA模型,JPR模型预测效果一般,ARIMA模型不太适合本数据的预测。

关键词：孕产妇死亡率循环神经网络模型 Joinpoint回归模型差分自回归移动平均模型预测

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抗生素暴露与肥胖关系研究进展

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中国公共卫生 2022年第12期38卷 1614-1618页

作者：初蕾苏德奇戴江红新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新疆乌鲁木齐830017

抗生素常被用于治疗人与动物的疾病,残留在环境和食物中的抗生素可通过食物和饮水等途径暴露,被摄入到人体中。作为一种新型环境污染物,它与肥胖症密切相关,进而影响人类的健康,对公共安全造成威胁。本文旨在综述抗生素的暴露及途径、... 详细信息

抗生素常被用于治疗人与动物的疾病,残留在环境和食物中的抗生素可通过食物和饮水等途径暴露,被摄入到人体中。作为一种新型环境污染物,它与肥胖症密切相关,进而影响人类的健康,对公共安全造成威胁。本文旨在综述抗生素的暴露及途径、抗生素与肥胖的关系进而影响人群健康的研究进展,从而为抗生素影响人群健康进行早期干预提供科学依据。

关键词：抗生素暴露食物饮用水肥胖

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砷暴露对大鼠E2和TRH及其受体mRNA表达的影响

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环境与职业医学 2023年第1期40卷 89-94页

作者：赖媛艳李宏昀马晓薇江志红吴军新疆医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室新疆乌鲁木齐830011

[背景]砷能够进入下丘脑诱导雌激素效应并干扰神经内分泌系统正常功能。甲状腺内分泌系统(下丘脑-垂体-甲状腺轴)作为主要的内分泌系统之一,砷对其毒性机制尚不明确。[目的]为了解不同砷暴露水平下对大鼠雌二醇(E2)、下丘脑促甲状腺激... 详细信息

[背景]砷能够进入下丘脑诱导雌激素效应并干扰神经内分泌系统正常功能。甲状腺内分泌系统(下丘脑-垂体-甲状腺轴)作为主要的内分泌系统之一,砷对其毒性机制尚不明确。[目的]为了解不同砷暴露水平下对大鼠雌二醇(E2)、下丘脑促甲状腺激素释放激素(TRH)及其受体(ERα、ERβ、TRHR)m RNA的影响及其可能的下丘脑毒作用途径与机制。[方法]70只Wister大鼠随机分组为:正常对照组(无菌水);低、中、高剂量砷染毒组(0.8、4.0、20.0 mg·kg^(-1)亚砷酸钠);雌激素受体抑制剂(ICI182780)干预低、中、高剂量砷染毒组;每组10只,雌雄各半。染毒组大鼠给予19周NaAsO_(2)饮水染毒,干预组于第9周经尾静脉注射0.5 mg·kg^(-1)ICI182780,每周3次。通过ELISA检测大鼠血清中的E2、TRH水平;实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测大鼠下丘脑组织中雌激素受体α(ERα)、雌激素受体β(ERβ)和TRH受体(TRHR)m RNA表达水平。[结果](1)E2及其受体m RNA:与对照组相比,雌性大鼠血清E2水平在低、中剂量砷染毒组上升(P<0.05),雄性大鼠血清E2水平在低、中、高剂量砷染毒组上升(P<0.05),雌性E2变化大于雄性;在下丘脑组织中,与对照组相比,雌性大鼠ERα、ERβm RNA相对表达量在低、中、高剂量砷染毒组上升(P<0.05),雄性大鼠ERαm RNA相对表达量在低、中、高剂量砷染毒组上升(P<0.05)。(2)TRH及其受体TRHR m RNA:与对照组相比,雌性大鼠血清TRH水平在高剂量砷染毒组上升(P<0.05),雌性大鼠TRHR m RNA相对表达量在低、中、高剂量砷染毒组上升(P<0.05)。(1)和(2)结果提示雌性较雄性更易出现砷暴露后E2及其受体和TRH及其受体基因的异常改变。(3)与雌性大鼠中高剂量砷染毒组相比,增加ICI182780干预后,抑制了砷暴露诱导TRH、TRHR的表达(P<0.05),提示在下丘脑中砷可能是通过诱发类雌激素效应对TRH、TRHR产生毒作用。[结论]砷暴露可以在下丘脑诱发类雌激素效应,干扰甲状腺功能,并表现出剂量依赖及性别差异。E2及TRH及其受体可能是砷类雌激素效应的毒作用途径。

关键词：砷下丘脑类雌激素效应促甲状腺激素释放激素促甲状腺激素释放激素受体

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因果中介效应分析及SAS实现

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中国卫生统计 2023年第2期40卷 317-320页

作者：王柯云张洪璐王肖萌常琴雪王淳宋德胜崔壮李长平天津医科大学流行病与卫生统计学教研室 300070

目的通过模拟数据,研究父母提供的鼓励环境是否会对儿童的认知发展产生影响,探索父母鼓励是否增强了孩子的学习动机,介绍因果中介效应分析方法的原理及SAS实现。方法在未控制混杂因素和控制混杂因素两种情况下,运用因果中介效应分析方... 详细信息

目的通过模拟数据,研究父母提供的鼓励环境是否会对儿童的认知发展产生影响,探索父母鼓励是否增强了孩子的学习动机,介绍因果中介效应分析方法的原理及SAS实现。方法在未控制混杂因素和控制混杂因素两种情况下,运用因果中介效应分析方法对鼓励和认知得分之间的因果路径进行分解,确定中介变量动机在因果关系中的作用程度。结果学习动机在父母鼓励与儿童认知发展之间起中介作用,中介效应占总效应的比例为47%(不控制混杂因素)、37%(控制混杂因素)。结论学习动机是中介变量,父母鼓励可以通过增强孩子的学习动机来提高儿童的认知发展。在满足相关前提和假设下,CAUSALMED过程可以实现因果中介效应分析,探索因果关系的内在影响机制。

关键词：中介效应分析因果中介间接效应

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pET30a-CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)重组质粒的构建及表达产物的纯化与鉴定

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中国病原生物学杂志 2023年第2期18卷 185-189,196页

作者：李艳敏赵商岐马西智郑佳龚巧巧丁剑冰周晓涛新疆医科大学基础医学院免疫学教研室新疆乌鲁木齐830011

目的构建pET30a-CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)原核表达质粒,诱导表达后纯化,获得重组蛋白CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4),并对其免疫学特性进行初步鉴定,对其空间结构进行预测。方法利用DNA重组技术构建重组质粒pET30a-CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4),将测序正确的质粒转化至*** BL21(DE)菌株中,分别采用不同浓度的IPTG在不同诱导时间及温度下诱导表达重组蛋白。取菌液超声破碎,SDS-PAGE分析上清及沉淀中蛋白的表达;通过镍柱亲和层析法纯化蛋白并进行Western blot鉴定。通过生物信息学技术,利用SOPMA、I-TASSER在线数据库预测重组蛋白CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)的空间结构。结果成功构建pET30a-CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)重组质粒,转化至*** BL21(DE)后诱导表达相对分子质量为53×10^(3)的重组蛋白CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)。SDS-PAGE分析CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)重组蛋白在IPTG浓度为0.7 mmol/L,37℃、4 h条件下上清中表达量较高。镍柱层析纯化用20 mmol/L咪唑浓度洗脱的蛋白浓度及纯度较高。Western blot检测重组蛋白CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)能被相应抗体识别,反应条带位于53×10^(3)处,与预期相符。生物信息学在线软件分析CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)中各蛋白均能正常折叠,未对优势表位产生影响。结论利用原核表达成功获得CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4)重组蛋白,并预测出该蛋白的三维结构模型,为细粒棘球蚴重组疫苗的研制提供了重要的实验依据。

关键词：细粒棘球蚴重组质粒 CTLA-4IgV-EgG1Y162-2(4) 原核表达

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重组蛋白EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162的原核表达、纯化及鉴定

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中国病原生物学杂志 2024年第7期19卷 784-788页

作者：米热古丽·艾乃都王卫国陈娜菲周彦霞马西智单文豪李艳敏周晓涛新疆医科大学维吾尔医学院新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院免疫学教研室新疆医科大学第一附属医院新疆地方病及分子生物学重点实验室

目的利用pET30a-EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162重组质粒,诱导表达、纯化获得EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162目的蛋白,并对其进行鉴定,为后续研究提供前提条件。方法利用双酶切的方法验证pET30a-EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162质粒,并将其转化至*** BL21(DE3)菌株,获得表达菌株。采用不同浓度的IPTG在不同诱导时间及温度下诱导表达重组蛋白,菌液超声破碎后,经SDS-PAGE检测上清及沉淀中蛋白的表达。通过镍柱亲和层析法纯化蛋白并进行Western blot鉴定。结果成功鉴定重组质粒pET30a-EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162;重组蛋白EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162在IPTG终浓度为0.5 mmol/L,28℃条件下诱导6 h,上清中的蛋白表达量最高;300 mmol/L咪唑时洗脱得到的目的蛋白较多,洗脱效果较好;Western blot检测重组蛋白EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162能被相应抗体识别,反应条带在35 ku处,与预期相符。结论成功构建pET30a-EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162重组质粒,表达出相应重组蛋白,为细粒棘球病重组疫苗的研究创造条件。

关键词：细粒棘球蚴重组蛋白EgG1Y162-GGGGSGGG-EgG1Y162 蛋白表达及鉴定

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