检索结果-内蒙古大学图书馆

全国第九次法医学术交流会

作者：林旭王建文尹雅莎谢素梅冀强南京医科大学法医学系南京医科大学数学计算机教研室

目的运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,并评估DNA质量。方法南京医科大学第一附属医院病理科2009年至201 1年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后3130型毛细管电泳... 详细信息

目的运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,并评估DNA质量。方法南京医科大学第一附属医院病理科2009年至201 1年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后3130型毛细管电泳仪分析提取DNA片段的完整性。结果经紫外分光光度计测定胃癌组织D(260nm)/D(280nm)均值为1.84±0.02,肺癌组织为1.85±0.02,甲状腺癌组织为1.82±0.02,3组间比较P>0.05,因此硅珠法提取石蜡包埋组织DNA不会因组织差异而影响提取效果;Identifiler试剂盒PCR后毛细管电泳显示其提取效果,46例(93%)得出完整的16个基因座STR峰型。结论硅珠法可应用于多种组织的DNA提取,并保证提取DNA样品的纯度和完整度。

关键词：法医病理学石蜡包埋组织硅珠法 Identifiler试剂盒 DNA

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相对误差直线回归模型两种参数估计方法的比较

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中国卫生统计 2012年第6期29卷 905-907页

作者：刘成友丁勇南京医科大学生物医学工程系 210029 南京医科大学数学与计算机教研室 210029

最小二乘法的原理是观察值与拟合值的绝对误差平方和最小,其评价依据是针对等精度数据而言的,即观测数据具有大体相同的绝对误差,这些误差服从均值为0的正态分布。然而大量的科学研究的观测数据的误差往往是相对误差,即被观测量愈大,允... 详细信息

最小二乘法的原理是观察值与拟合值的绝对误差平方和最小,其评价依据是针对等精度数据而言的,即观测数据具有大体相同的绝对误差,这些误差服从均值为0的正态分布。然而大量的科学研究的观测数据的误差往往是相对误差,即被观测量愈大,允许的实际观测误差也愈大。例如,医学应用中,浓度测定的标准曲线,样品测定的准确度和精度是以相对误差为依据的,这样的数据用通常的最小二乘法将导致参数估计的不准确,

关键词：相对误差直线回归模型度数估计方法最小二乘法绝对误差正态分布科学研究

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乳腺癌易感蛋白1序列结构特征及致病性突变的分析

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南京医科大学学报（自然科学版） 2012年第6期32卷 805-810页

作者：范燚郁芸韩新焕南京医科大学临床医学系江苏南京210029 南京医科大学基础医学院数学与计算机教研室江苏南京210029

目的:利用生物信息学方法分析乳腺癌易感基因1(BRCA1)序列结构特征,并预测BRCA1功能编码区突变与致病性遗传效应的关系。方法:采用Maximum Likelihood、ClustalW、SMART和Selecton等在线生物信息学分析工具,对BRCA1进行分子系统发育、... 详细信息

目的:利用生物信息学方法分析乳腺癌易感基因1(BRCA1)序列结构特征,并预测BRCA1功能编码区突变与致病性遗传效应的关系。方法:采用Maximum Likelihood、ClustalW、SMART和Selecton等在线生物信息学分析工具,对BRCA1进行分子系统发育、保守性、选择压力、结构域、三维结构和错义结构的分析。结果:分析获得195个固定残基位点(10.5%)和393个保守位点(21.1%),其分布是非随机性的;发现人BRCA1序列中的保守结构域BRCT的三维结构与其他物种存在着较大的差异,表明BRCT结构域在不同物种中具有不同的生物学功能;关联性分析证实发生在保守位点的突变致病性高。结论:基于生物信息学的BRCA1序列结构分析,能充分利用相关数据的资源,加深对BRCA1基因变异与肿瘤发生的相关性的认识。

关键词：乳腺癌易感蛋白1 序列分析三维同源模型生物信息学

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Dijkstra算法在蛋白质序列比对中的研究

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计算机工程与应用 2012年第24期48卷 122-126,148页

作者：祁长红郁芸韩新焕南京医科大学生物医学工程系南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室南京210029

提出一种基于Dijkstra算法的序列比对方法,该算法主要用于求最短路径,而序列比对可以转化为在有向无环图中寻找最短路径问题。对于少量序列比对,使用该算法可以求出最优解。对于多序列比对,可将在N维空间求解最短路径问题转化为在二维... 详细信息

提出一种基于Dijkstra算法的序列比对方法,该算法主要用于求最短路径,而序列比对可以转化为在有向无环图中寻找最短路径问题。对于少量序列比对,使用该算法可以求出最优解。对于多序列比对,可将在N维空间求解最短路径问题转化为在二维空间求解最短路径。该算法可以简化问题复杂度,能求得相对最优解。

关键词：序列比对 Dijkstra算法最短路径有向无环图

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运用Identifiler试剂盒对硅珠法提取石蜡包埋组织DNA质量的评估

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南京医科大学学报（自然科学版） 2012年第4期32卷 577-581页

作者：林旭王建文尹雅莎谢素梅冀强南京医科大学法医学系江苏南京210029 南京医科大学数学计算机教研室江苏南京210029

目的:运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,Identifiler试剂盒评估DNA质量。方法:南京医科大学第一附属医院病理科2009～2011年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后313... 详细信息

目的:运用硅珠法从石蜡包埋的组织中提出DNA,Identifiler试剂盒评估DNA质量。方法:南京医科大学第一附属医院病理科2009～2011年石蜡包块49例,运用硅珠法提取石蜡包埋组织DNA,通过紫外分光光度计测定DNA纯度和Identifiler试剂盒PCR后3130型毛细管电泳仪分析提取DNA片段的完整性。结果:经紫外分光光度计测定胃癌组织D(260 nm)/D(280nm)均值为1.84±0.02,肺癌组织为1.85±0.02,甲状腺癌组织为1.82±0.02,3组间比较P>0.05,因此硅珠法提取石蜡包埋组织DNA不会因组织差异而影响提取效果;Identifiler试剂盒PCR后毛细管电泳显示其提取效果,46例(93%)得出完整的16个基因座STR峰型。结论:硅珠法可应用于多种组织的DNA提取,并保证提取DNA样品的纯度和完整度。

关键词：石蜡包埋组织硅珠法 Identifiler试剂盒 DNA

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中国人口数量的时间序列分析

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科技信息 2012年第32期 139-140页

作者：杨君哲吴静王娟刘潋李强南京医科大学基础医学院南京医科大学数学与计算机教研室

本文运用时间序列模型(ARIMA模型)对中国人口进行分析与预测,应用Eviews 6.0软件对1949～2007年中国人口数据进行拟合,建立ARIMA模型,运用2008～2010年的人口数据来验证模型,并对2011年的总人口数进行了预测。

关键词：时间序列 ARIMA模型人口数量预测

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基于MATLAB计算机模拟的图像分割技术研究

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中国新通信 2012年第19期14卷 3-4页

作者：李燕包一青陈建军新疆兵团广播电视大学计算机教研室新疆大学计算机信息工程学院新疆医科大学医学工程技术学院

图像分割（image segmentation）是一种非常关键的图像技术，它是从图像处理进到图像分析要经过的一个关键步骤。为了更高层次的图像分析理解得以实现，必须先进行图像分割、目标分离、特征提取等过程，把原始图像转化成为更紧凑更抽象... 详细信息

图像分割（image segmentation）是一种非常关键的图像技术，它是从图像处理进到图像分析要经过的一个关键步骤。为了更高层次的图像分析理解得以实现，必须先进行图像分割、目标分离、特征提取等过程，把原始图像转化成为更紧凑更抽象的形式。

关键词：图像分割技术 MATLAB 计算机模拟图像分析图像技术图像处理目标分离特征提取

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原发性肝细胞癌与X线修复交叉互补基因1遗传位点的相关研究

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解剖科学进展 2012年第2期18卷 147-150页

作者：刘尚辉李烨马建忠中国医科大学基础医学院计算机教研室辽宁沈阳110001 中国医科大学中国医科大学基础医学院数学教研室辽宁沈阳110001

目的研究X线修复交叉互补基因1(XRCC1)遗传位点399多态性对中国人群原发性肝细胞癌的相关性。方法通过检索PubMed和CNKI等数据库,收集有关XRCC1多态性与原发性肝细胞癌关联的6篇相互独立研究文献,对1072原发肝癌病例和1400健康人进行Met... 详细信息

目的研究X线修复交叉互补基因1(XRCC1)遗传位点399多态性对中国人群原发性肝细胞癌的相关性。方法通过检索PubMed和CNKI等数据库,收集有关XRCC1多态性与原发性肝细胞癌关联的6篇相互独立研究文献,对1072原发肝癌病例和1400健康人进行Meta分析和关联研究。结果通过XRCC1 399位点所有数据研究,经等位基因病例对照,等位基因G的OR值(95%CI)为1.23(0.96,1.59),=0.11;与基因型AA比较,基因型AG+GG的OR值(95%CI)为1.33(0.92,1.92),=0.13,说明该位点多态性对原发性肝癌发生不是危险因子。通过层次分析,在乙肝或黄曲霉素暴露所诱导的那80%的肝癌患者中,该位点是原发性肝癌发生的危险因子在未知病因所诱导的肝癌患者中,该位点未显示对原发性肝癌发生危险作用。结论中国人群XRCC1基因遗传位点399与乙肝或黄曲霉素暴露所诱导的肝癌发生相关。

关键词：原发性肝细胞癌 XRCC1 单核苷酸多态性

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基于云计算的智慧型物联网实现技术研究

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软件导刊 2012年第11期11卷 112-114页

作者：李燕陈建军包一青新疆兵团广播电视大学计算机教研室新疆乌鲁木齐830001 新疆医科大学医学工程技术学院新疆乌鲁木齐830011

目前由云计算所引领的信息技术已经成为新一代计算资源的虚拟化平台,它能以简便的途径和按需的方式通过网络访问可配置的计算资源,快速部署资源。研究基于云计算虚拟化平台设计,分析智慧型物联网的实现过程,并探讨实现此类物联网的关键... 详细信息

目前由云计算所引领的信息技术已经成为新一代计算资源的虚拟化平台,它能以简便的途径和按需的方式通过网络访问可配置的计算资源,快速部署资源。研究基于云计算虚拟化平台设计,分析智慧型物联网的实现过程,并探讨实现此类物联网的关键要素、技术基础,以优化智慧型物联网的实现技术。

关键词：云计算物联网虚拟化实现技术

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BRCA1蛋白的序列及空间结构的分析

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生物信息学 2012年第3期10卷 169-173页

作者：范燚韩新焕郁芸南京医科大学临床医学系江苏南京210029 南京医科大学数学与计算机教研室江苏南京210029

查询人的BRCA1蛋白的氨基酸序列,利用生物信息学的方法进行相似性搜索,获得一系列BRCA1蛋白的氨基酸序列。选择了其中的11条序列,对BRCA1蛋白进行了多重序列分析和进化分析,对BRCA1蛋白的BRCT结构域进行三维同源模型的构建与比较分析。... 详细信息

查询人的BRCA1蛋白的氨基酸序列,利用生物信息学的方法进行相似性搜索,获得一系列BRCA1蛋白的氨基酸序列。选择了其中的11条序列,对BRCA1蛋白进行了多重序列分析和进化分析,对BRCA1蛋白的BRCT结构域进行三维同源模型的构建与比较分析。分析结果表明:BRCA1中某些特定部位的氨基酸序列高度保守;确定氨基酸的保守位点并联合进化分析可对基因错义突变的致病性做初步地猜测;相近物种来源的BRCA1具有较近的亲缘关系,而且具有极其相似的三维空间结构。这些为研究BRCA1蛋白的结构与功能关系提供指导意义。

关键词： BRCA1 蛋白序列分析三维同源模型生物信息学

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