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基于Illumina Novaseq高通量测序技术分析番红花不同生长期根际土壤中放线菌群落结构与多样性研究

时珍国医国药 2024年第13期35卷 3039-3046页

作者：邱远金张际昭赵亚琴阿依别克·热合木都拉樊丛照王果平朱军新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002

目的以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤放线菌群落结构与多样性。方法提取番红花不同生长时期的根际土壤放线菌总DNA,应用Illumina Novaseq高通量测序平台进行测序分析。结果对番红花3个生长期(生长初... 详细信息

目的以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤放线菌群落结构与多样性。方法提取番红花不同生长时期的根际土壤放线菌总DNA,应用Illumina Novaseq高通量测序平台进行测序分析。结果对番红花3个生长期(生长初期S1、生长中期S2、生长后期S3)的3组样本进行高通量测序,共获得1686个分类单元(OTUs),包含15个放线菌门;并对检测到的放线菌属级相对丰度前20的放线菌属进行了分析;在放线菌门水平,番红花3个生长期共有优势放线菌群落为放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形杆菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在放线菌属水平,番红花3个生长期共有优势放线菌群落为红球菌属(Rhodococcus)、芽球菌属(Blastococcus)、弗兰克氏菌属(Frankia)、农球菌属(Agrococcus)、微杆菌属(Microbacterium)和康奈斯氏杆菌属(Conexibacter);不同之处,番红花S1还有诺卡氏菌属(Nocardioides)、分枝菌酸杆形菌属(Mycolicibacterium)和暂定微丝菌属(Candidatus Microthrix)优势群落,S2有节杆菌属(Arthrobacter)、分枝菌酸杆形菌属(Mycolicibacterium)和威廉姆氏菌属(Williamsia),S3有诺卡氏菌属(Nocardioides)、土壤红杆菌属(Solirubrobacter)、贫养杆菌属(Modestobacter)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、糖霉菌属(Glycomyces)和短状杆菌属(Brachybacterium)。Alpha多样性和Beta多样性分析结果表明,不同生长期的番红花根际土壤中放线菌群落结构与多样性存在差异,其多样性随番红花的生长呈现不断上升的趋势。结论该研究在番红花根际土壤中检测到对病原微生物具有拮抗作用、可合成次级代谢产物、相对丰度较大的根际促生菌和稀有放线菌资源,可为进一步研究其对番红花的促生功能、抗逆性作用和在根际微环境中对病原菌、病毒等有害微生物的拮抗机制,以及根际微生物间相互作用对番红花种球品质影响的研究奠定坚实基础。

关键词：高通量测序番红花根际土壤放线菌群落结构与多样性

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不同激素处理对肉苁蓉种子质量的影响

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种子 2025年第3期44卷 162-167页

作者：何石涛樊丛照张际昭邱远金王果平朱军石书兵李晓瑾赵亚琴新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052 新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室乌鲁木齐830010

为探究不同植物激素处理对肉苁蓉种子质量的影响,确定各种激素的最佳使用浓度。本试验在肉苁蓉各生长期喷施激素,使用了赤霉素(GA 3)、吲哚乙酸(IAA)、6-苄氨基嘌呤(6-BA)和萘乙酸(NAA)等激素,浓度范围为5~200 mg/L。结合主成分分析和... 详细信息

为探究不同植物激素处理对肉苁蓉种子质量的影响,确定各种激素的最佳使用浓度。本试验在肉苁蓉各生长期喷施激素,使用了赤霉素(GA 3)、吲哚乙酸(IAA)、6-苄氨基嘌呤(6-BA)和萘乙酸(NAA)等激素,浓度范围为5~200 mg/L。结合主成分分析和聚类分析,评估激素对种子质量的综合影响。结果表明,GA 320 mg/L、IAA 100 mg/L、NAA 5 mg/L、6-BA 100 mg/L、缩节胺200 mg/L、矮壮素200 mg/L以及多效唑200 mg/L在提高肉苁蓉种子质量等方面均有显著效果。在植物激素的正交处理组中,Z 9处理组效果最为显著。在植物生长调节剂的正交处理组中,J 9处理组效果最佳。

关键词：肉苁蓉激素种子质量正交实验

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不同生长期喷施赤霉素对肉苁蓉种子产量及质量的影响

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耕作与栽培 2025年第3期45卷 12-18页

作者：何石涛樊丛照张际昭邱远金王果平朱军石书兵赵亚琴李晓瑾新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052 新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室乌鲁木齐830010

通过在肉苁蓉不同生长期(现蕾期、初花期、盛花期)喷施50 mg/L赤霉素(GA_(3)),研究对其种子产量及质量的影响。结果表明,不同生长期喷施赤霉素在肉苁蓉的花序长度、结实率、单株产量、蒴果长度、种子长度、千粒重和种子活力等指标上表... 详细信息

通过在肉苁蓉不同生长期(现蕾期、初花期、盛花期)喷施50 mg/L赤霉素(GA_(3)),研究对其种子产量及质量的影响。结果表明,不同生长期喷施赤霉素在肉苁蓉的花序长度、结实率、单株产量、蒴果长度、种子长度、千粒重和种子活力等指标上表现出显著差异。尤其是在现蕾期、初花期和盛花期联合喷施赤霉素时,效果最为显著,单株产量提升约67%,花序长度增加约30%,结实率提高56%,种子活力提升68%。此外,通径分析和多元回归模型进一步表明,结实率(X_(2))和单果种子重(X_(5))是对种子产量影响最为显著的因素,最终回归方程为Y=-2.03+0.03X_(2)+38.29X_(5)。本研究验证了多阶段赤霉素处理在提高肉苁蓉种子产量和质量方面的有效性,尤其是多阶段的联合喷施能显著改善种子产量及各项性状。单一阶段的赤霉素处理效果较为有限。因此,未来研究可进一步优化激素使用的浓度和时机,并探索更多激素组合,以实现更稳定和高效的增产效果,为肉苁蓉的高效栽培和可持续发展提供理论依据和实际参考。

关键词：肉苁蓉激素种子产量种子质量

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不同农艺措施对肉苁蓉结实率及种子质量的影响

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中国现代中药 2025年第5期27卷 918-924页

作者：何石涛樊丛照张际昭邱远金王果平朱军石书兵赵亚琴李晓瑾新疆农业大学农学院新疆乌鲁木齐830052 新疆维吾尔自治区中药民族药研究所/国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830010

目的:研究不同农艺措施对肉苁蓉结实率及种子质量的影响,为肉苁蓉种子高质量生产提供科学依据。方法:采用毛笔手工授粉比较同株异花、异株异花授粉效果;使用花粉喷雾、蜜蜂授粉及打顶处理,比较花序上、中、下3个部位的结实率、单果种子... 详细信息

目的:研究不同农艺措施对肉苁蓉结实率及种子质量的影响,为肉苁蓉种子高质量生产提供科学依据。方法:采用毛笔手工授粉比较同株异花、异株异花授粉效果;使用花粉喷雾、蜜蜂授粉及打顶处理,比较花序上、中、下3个部位的结实率、单果种子数、千粒质量及种子活力。结果:与对照比较,肉苁蓉结实率、单果种子数、千粒质量及种子活力在异株异花授粉后分别提升了31.16%、9.03%、40.15%、55.41%,同株异花授粉后分别降低了45.40%、73.90%、38.50%、11.30%;肉苁蓉授粉效率与蜜蜂活动半径相关(P<0.05),在20 m内肉苁蓉结实率、单果种子数、千粒质量及种子活力分别增加了12.50%、24.93%、33.27%、33.52%,100 m各项指标差异无统计学意义。现蕾期打顶可显著提高肉苁蓉结实率、单果种子数、千粒质量和种子活力,初花期和盛花期打顶处理效果不明显;不同农艺措施处理后的肉苁蓉花序下部种子各项指标最佳。结论:在肉苁蓉种植区内,每20 m半径放置1个含8000只意大利蜜蜂的蜂箱可显著提高肉苁蓉结实率和种子质量。

关键词：肉苁蓉农艺措施授粉打顶结实率

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基于高通量测序研究番红花不同生长期根际土壤中真菌群落结构及多样性

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中国现代中药 2023年第3期25卷 574-581页

作者：邱远金赵亚琴张际昭樊丛照阿依别克·热合木都拉王果平朱军新疆维吾尔自治区中药民族药研究所/国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002 道地药材国家重点实验室北京100700

目的:以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤真菌群落结构与多样性。方法:提取番红花不同生长期的根际土壤总DNA,应用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行测序分析。结果:对番红花3个生长期[生长初期(... 详细信息

目的:以新疆番红花Crocus sativus L.不同生长期的根际土壤为材料,研究土壤真菌群落结构与多样性。方法:提取番红花不同生长期的根际土壤总DNA,应用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行测序分析。结果:对番红花3个生长期[生长初期(S1)、生长中期(S2)、生长后期(S3)]的3组样本进行高通量测序,共获得4252个操作分类单元(OTUs),包含9个真菌门,并对检测到的真菌属中相对丰度前20的真菌属进行了分析。结果发现,不同生长期番红花优势真菌群落共有门属分别是子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)、链格孢属(Alternaria)、球腔菌属(Mycosphaerella)和爪甲白癣菌属(Arthrographis)。3个生长期的真菌组成有所不同,S1和S2生长期特有的属分别是平脐蠕孢属(Bipolaris)和谷菌根菌属(Archaeorhizomyces),S3有2个特有的属和1个特有的门,分别是棘壳孢属(Setophoma)、枝孢属(Cladosporium)和油壶菌门(Olpidiomycota)。Alpha和Beta多样性分析结果表明,不同生长期番红花根际土壤真菌群落赵氏指数(Chao1)、香农指数(Shannon)和观察到的种类数(Sobs)差异有统计学意义,样本中真菌物种组成存在一定差异。结论:利用高通量测序技术可快速、全面地获得土壤真菌组成信息。番红花不同生长时期根际土壤中真菌群落结构与多样性存在差异,菌群多样性随番红花的生长呈现不断上升的趋势;在番红花不同的生长期尤其是S1土壤样本中均检测到相对丰度较高的有害菌链格孢菌属和被孢霉门。为进一步揭示新疆番红花S1易发生种球腐烂病害,以及根际真菌的多样性与番红花球茎内生真菌、病原菌相互作用机制研究提供新思路。

关键词：高通量测序番红花根际土壤真菌群落结构与多样性

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哈萨克族习用药材新疆虫草的研究现状

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食药用菌 2022年第6期30卷 405-411页

作者：张际昭樊丛照邱远金赵亚琴王果平李晓瑾新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002

在新疆阿尔泰山森林带中产的虫草(新疆虫草)是当地哈萨克族的民间用药。作为一种重要的虫草资源,其具有固精益气、止血化痰、滋肺补肾的功效。综述新疆虫草的药用沿革、生物学特性、资源情况、人工繁育研究、化学成分及药理活性研究、... 详细信息

在新疆阿尔泰山森林带中产的虫草(新疆虫草)是当地哈萨克族的民间用药。作为一种重要的虫草资源,其具有固精益气、止血化痰、滋肺补肾的功效。综述新疆虫草的药用沿革、生物学特性、资源情况、人工繁育研究、化学成分及药理活性研究、菌丝体培养研究等,针对未来的研究方向和资源保护提出建议。

关键词：新疆虫草资源分布寄主昆虫饲养人工繁育虫草素虫草多糖虫草酸

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2021年新疆维吾尔自治区中药材生产基础数据统计分析

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中国现代中药 2023年第11期25卷 2417-2421页

作者：张际昭王果平赵亚琴郭雄飞邱远金马春梅宋海龙李晓瑾樊丛照新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002 新疆维吾尔自治区昌吉州林业技术推广中心新疆昌吉831100

目的:研究分析新疆中药材种植品种、面积、产量等基础数据,为新疆中药材种植产业的发展和政府宏观层面掌握中药材的供应保障提供参考。方法:通过查询新疆各级人民政府官方网站,参考各地州市农业农村局、林业和草原局提供的信息,整合中... 详细信息

目的:研究分析新疆中药材种植品种、面积、产量等基础数据,为新疆中药材种植产业的发展和政府宏观层面掌握中药材的供应保障提供参考。方法:通过查询新疆各级人民政府官方网站,参考各地州市农业农村局、林业和草原局提供的信息,整合中药材种植企业报送和研究人员实地调研的结果,对新疆中药材种植相关数据进行汇总和分析。结果:据不完全统计,2021年新疆25种主产中药材的种植总面积为140余万亩(1亩≈666.67 m^(2)),草本种植面积占比88%、灌木占比8%、乔木占比4%,伊犁州和阿勒泰地区种植种类最为丰富;新疆大宗特色药材“疆九味”的种植面积占比83.88%。结论:新疆中药材种植整体呈上升趋势,其生产统计结果可为产业发展和政府宏观规划提供依据。

关键词：新疆中药材生产统计种植面积种植种类

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基于指标成分及指纹图谱多模式识别的不同品种红花质量评价

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中国现代中药 2024年第6期26卷 989-996页

作者：苏改兰樊丛照邱远金张际昭王果平赵亚琴王威赵连佳石书兵李晓瑾新疆农业大学农学院新疆乌鲁木齐830052 新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002 新疆农业科学院农作物品种资源研究所新疆乌鲁木齐830091

目的:测定不同品种红花指标成分、建立指纹图谱,并结合化学识别模式法对其进行质量评价,建立不同品种红花质量比较方法。方法:采用高效液相色谱法(HPLC)测定32批不同品种红花的羟基红花黄色素A(HSYA)和山柰酚含量;利用“中药色谱指纹图... 详细信息

目的:测定不同品种红花指标成分、建立指纹图谱,并结合化学识别模式法对其进行质量评价,建立不同品种红花质量比较方法。方法:采用高效液相色谱法(HPLC)测定32批不同品种红花的羟基红花黄色素A(HSYA)和山柰酚含量;利用“中药色谱指纹图谱相似度评价系统”(2012版)对32批红花样品进行相似度评价,并采用Origin 2022软件对其进行聚类分析,采用SIMCA 14.1软件进行主成分分析。结果:32批红花样品除3批未检出外,其余29批的HSYA质量分数为0.4%~2.5%,32批红花样品中山柰酚的质量分数为0.004%~1.060%;其HPLC指纹图谱共确定16个共有峰,指认了色氨酸、HSYA和6-羟基山柰酚-3-O-β-D-葡萄糖苷等5个成分,相似度为0.510~0.936,不同品种的红花质量差异显著。结论:通过HPLC含量测定、指纹图谱建立及多模式识别法,可实现不同品种红花的质量差异分析比较,研究结果提供了不同红花品种潜在的育种方向,对红花育种工作具有重要的参考价值。

关键词：红花指标成分高效液相色谱法指纹图谱化学模式识别质量评价

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维药祖发(大苞荆芥)的质量标准研究

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生物资源 2023年第3期45卷 289-297页

作者：孙宇石磊岭张际昭马国需邱远金王果平樊丛照李晓瑾新疆维吾尔自治区中药民族药研究所、国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193

为制定维药祖发(大苞荆芥)的质量标准,依据《中华人民共和国药典》2020年版质量鉴定的基本原则,采用性状鉴定、显微鉴别、薄层色谱法、烘干法、灰分测定法、醇溶性热浸法、高效液相色谱法等对大苞荆芥的质量标准进行了研究。明确了大苞... 详细信息

为制定维药祖发(大苞荆芥)的质量标准,依据《中华人民共和国药典》2020年版质量鉴定的基本原则,采用性状鉴定、显微鉴别、薄层色谱法、烘干法、灰分测定法、醇溶性热浸法、高效液相色谱法等对大苞荆芥的质量标准进行了研究。明确了大苞荆芥的性状和显微结构特征,建立了薄层色谱方法。拟定药材常规检查项的限量标准:水分不得超过7.0%;总灰分不得超过12.0%;酸不溶性灰分不得超过8.0%;醇溶性浸出物不得低于14.0%;齐墩果酸含量不得低于0.05%;熊果酸含量不得低于0.09%。本研究制定的维药祖发(大苞荆芥)药材质量标准,研究方法可行,重复性好,能为该药材质量控制提供依据。

关键词：维药大苞荆芥质量标准薄层色谱高效液相色谱

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基于MaxEnt和GIS的新疆紫草产地生态适宜性分析

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中国现代中药 2022年第5期24卷 770-775页

作者：叶雨樊丛照张际昭赵亚琴邱远金王果平石书兵李晓瑾新疆农业大学农学院新疆乌鲁木齐830052 新疆维吾尔自治区中药民族药研究所国家中医药管理局新疆中药民族药资源重点研究室新疆乌鲁木齐830002

目的:通过对新疆紫草进行生态适宜性评价,为优质新疆紫草生产基地选址提供参考。方法:选取第四次全国中药普查新疆普查空间数据中129份新疆紫草的基本信息,利用最大熵(MaxEnt)模型和ArcGIS软件分析评价。结果:影响新疆紫草分布的主要生... 详细信息

目的:通过对新疆紫草进行生态适宜性评价,为优质新疆紫草生产基地选址提供参考。方法:选取第四次全国中药普查新疆普查空间数据中129份新疆紫草的基本信息,利用最大熵(MaxEnt)模型和ArcGIS软件分析评价。结果:影响新疆紫草分布的主要生态因子为海拔、土壤类型、植被类型、6月降水量、12月降水量、10月平均气温、等温性;新疆紫草潜在分布区为和静县、尼勒克县、博乐市、温泉县、昭苏县、霍城县、精河县、伊宁市、伊宁县、裕民县、奎屯市、阿克陶县、巩留县、乌鲁木齐县、乌恰县等;MaxEnt模型预测结果经受试者工作特征(ROC)曲线评价曲线下面积(AUC)>0.9。结论:新疆紫草的生态适宜性分布区主要集中在天山山脉中段的和静县、尼勒克县、博乐市、温泉县、昭苏县,建议优先选择上述区域开展新疆紫草人工栽培。

关键词：新疆紫草生态因子最大信息熵模型生态适宜性

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