检索结果-内蒙古大学图书馆

质谱学报 2024年第2期45卷 256-268页

作者：杨柱林田林云吴昊李慧敏顾颖任达兵壮可赵燕张宏易伦朝昆明理工大学食品科学与工程学院云南昆明650500 昆明理工大学附属医院云南省第一人民医院心血管内科云南昆明650032 昆明理工大学化学工程学院云南昆明650500 昆明理工大学生命科学学院云南昆明650500

本研究以47例心绞痛患者、51例心肌梗死患者和80例心力衰竭患者的血浆作为样本,结合超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)技术和化学计量学方法,分析缺血性心脏病患者疾病进程的代谢紊乱特征。实验共定性、定量鉴定97种内源性代谢物,基... 详细信息

本研究以47例心绞痛患者、51例心肌梗死患者和80例心力衰竭患者的血浆作为样本,结合超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)技术和化学计量学方法,分析缺血性心脏病患者疾病进程的代谢紊乱特征。实验共定性、定量鉴定97种内源性代谢物,基于t检验、主成分分析、偏最小二乘-判别分析、变量重要性投影等方法,分别筛选出28种和32种可区分心绞痛与心肌梗死患者,心肌梗死与心力衰竭患者的差异性特征代谢物。代谢通路分析结果表明,从心绞痛到心肌梗死,以及从心肌梗死到心力衰竭的疾病进程中,氨基酸代谢和三羧酸循环等能量代谢均发生了紊乱;从心肌梗死到心力衰竭的疾病进程中,以甘油磷脂代谢和脂肪酸生物合成为代表的脂质代谢显著紊乱;通过分析受试者工作曲线(ROC),糖胆酸、富马酸、棕榈酸、肌钙蛋白、高密度脂蛋白、谷丙转氨酶和谷草转氨酶等联合指标可提高心肌梗死诊断精度,ROC曲线下面积(AUC)值达到1.0000;瓜氨酸、柠檬酸、硬脂酸、甘油磷酸胆碱和NT-proBNP联合指标可提高心力衰竭诊断精度,AUC值达到0.9570。本研究可为缺血性心脏病患者的精准诊断和疾病发展过程中的药物、营养干预提供重要的代谢靶标。

关键词：超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS) 代谢组学心绞痛心肌梗死心力衰竭化学计量学

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基于质谱熵的小分子化合物相似性计算方法研究

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北京化工大学学报（自然科学版） 2024年第4期51卷 115-124页

作者：吴丽萍向诚张海强李勇昆明理工大学信息工程与自动化学院昆明650550 昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650550

在二级质谱(MS2)数据检索中,通常利用质谱数据之间的相似性进行检索。针对质谱数据相似性计算中数据不整齐导致的检索效率和准确性不高以及商用软件相似性计算方法单一的问题,研究提出了“拼接填充”与“匹配填充”两种MS2数据对齐方法... 详细信息

在二级质谱(MS2)数据检索中,通常利用质谱数据之间的相似性进行检索。针对质谱数据相似性计算中数据不整齐导致的检索效率和准确性不高以及商用软件相似性计算方法单一的问题,研究提出了“拼接填充”与“匹配填充”两种MS2数据对齐方法,并基于信息熵采用质谱熵相似性计算方法进行相似性检索。首先对归一化后的原始质谱数据进行特征提取,保留能突出质谱数据特征的数据,再分别采用两种数据对齐方法对质谱数据进行预处理;然后基于信息熵方法,分别计算未知质谱与已知质谱混合后的虚拟质谱与两者质谱的熵差,获得未知质谱与已知质谱的相关系数即相似性;最后选择小分子化合物的质谱数据集进行实例验证。结果表明:两种质谱数据预处理方法能够解决相似性计算中质谱长度不等的问题,基于质谱熵的相似性计算方法稳定且结果可靠,适用于小分子化合物的相似性检索,同时也为商用软件的谱图相似性计算提供了新的方案。

关键词：小分子化合物相似性计算二级质谱数据信息熵质谱熵

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液-液相分离在呼吸道病毒感染中的作用

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第12期40卷 1673-1682页

作者：郑宇航李双强董书维昆明理工大学生命科学与技术学院生物工程系昆明650500

病毒是引起呼吸道疾病的常见病原体,呼吸道病毒感染通常引起发热、头痛及肺浸润等症状,严重者还可发展为急性呼吸窘迫综合征、多器官功能障碍综合征甚至死亡,给人类健康和社会经济发展带来严峻挑战。病毒与宿主的相互作用是决定疾病严... 详细信息

病毒是引起呼吸道疾病的常见病原体,呼吸道病毒感染通常引起发热、头痛及肺浸润等症状,严重者还可发展为急性呼吸窘迫综合征、多器官功能障碍综合征甚至死亡,给人类健康和社会经济发展带来严峻挑战。病毒与宿主的相互作用是决定疾病严重程度的关键因素,病毒通过多种策略利用宿主代谢系统帮助其复制,调控宿主免疫反应,从而更好地在宿主体内生存繁殖。因此,深入探究病毒与宿主相互作用机制对治疗靶点的发现和抗病毒药物的研发至关重要。液-液相分离(liquid-liquid phase separation,LLPS)是胞内分子形成液滴状结构的一种现象,通过该作用形成的无膜细胞器允许同步甚至相互排斥的生化反应发生,在细胞生命活动中扮演重要角色。近年来,大量的研究发现,呼吸道病毒蛋白质具有与核酸或蛋白质形成LLPS凝聚体的能力,或者在该类病毒感染过程中宿主蛋白质形成的LLPS凝聚体受到干扰。这些相分离聚集体不仅参与病毒生命周期的调控,还会影响宿主免疫反应和细胞代谢等活动,是病毒发病机制研究的一个新热点。本文梳理了LLPS在呼吸道病毒生命周期、宿主免疫反应和细胞代谢活动等过程中的作用,并探讨了该领域尚待回答的问题和未来发展趋势。

关键词：相分离呼吸道病毒病毒生命周期免疫反应细胞代谢

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基于Flex-Bootstrap与神经网络融合模型的蛋白质质谱数据分析

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激光与光电子学进展 2023年第16期60卷 334-339页

作者：张海强李勇向诚昆明理工大学信息工程与自动化学院云南昆明650550 昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650550

针对蛋白质质谱数据检索研究中由于样本单一、数据不平衡导致传统的相似性匹配检索方法效率低且精度不高的问题,提出一种基于复杂的放回抽样(Flex-Bootstrap)和多次卷积神经网络(Multi-CNN)与深度神经网络(DNN)融合模型的检索方法,并与... 详细信息

针对蛋白质质谱数据检索研究中由于样本单一、数据不平衡导致传统的相似性匹配检索方法效率低且精度不高的问题,提出一种基于复杂的放回抽样(Flex-Bootstrap)和多次卷积神经网络(Multi-CNN)与深度神经网络(DNN)融合模型的检索方法,并与DNN模型、CNN与DNN融合模型相比较。Flex-Bootstrap方法结合Multi-CNN与DNN融合模型应用于蛋白质质谱数据种类预测时取得了较好的效果,其测试集的准确率提升至98.82%,损失函数值降低至0.0397。该模型不仅有效解决了使用DNN模型、CNN与DNN融合模型进行数据检索时存在的欠拟合问题,同时提高了预测的准确率以及质谱数据库的搜索效率。

关键词：医用光学蛋白质种类复杂的放回抽样深度神经网络卷积神经网络质谱数据预测

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基于房室模型和WOA-BP神经网络的药效组分配比计算方法

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北京化工大学学报（自然科学版） 2023年第6期50卷 94-104页

作者：杨婕妤李勇向诚何子懿昆明理工大学信息工程与自动化学院昆明650550 昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650550

基于房室模型建立了中药药效组分作用于机体的时-量关系,推导出药效组分的血药浓度所对应的体内药量比例;利用鲸鱼优化算法(WOA)优化的反向传播(BP)神经网络建立了药效组分的血药浓度与机体整体反应的量-效关系模型;利用WOA-BP神经网络... 详细信息

基于房室模型建立了中药药效组分作用于机体的时-量关系,推导出药效组分的血药浓度所对应的体内药量比例;利用鲸鱼优化算法(WOA)优化的反向传播(BP)神经网络建立了药效组分的血药浓度与机体整体反应的量-效关系模型;利用WOA-BP神经网络的反向传播过程调整药物效应,构建了新的量-效关系,并结合时-量关系确定药效变化后的药效组分配比。以辅助苯巴比妥抑制癫痫的青阳参(Cynanchum otophyllum)皂苷M1和M2的药效组分配比分析为例进行实证研究,初始的M1和M2配比(给药剂量比)为2∶1,利用建立的基于房室模型和WOA-BP神经网络的药效组分配比计算方法,确定在药效提升5%后M1和M2的配比为2.26∶1,此时与初始M1和M2配比时的药效相比,青阳参抑制癫痫的效果增强。本模型能够在有限的实验条件下快速确定药效提高时所对应的药效组分配比,为中药的配伍研究提供了一种新方法。

关键词：组分配比房室模型 BP神经网络鲸鱼优化算法(WOA) 青阳参癫痫

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温泉微生物合成的碳纳米材料在生物成像方面的应用

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材料科学与工程学报 2023年第4期41卷 561-567页

作者：张春婷李波谢立国商俊杰魏云林昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500 昆明理工大学国土资源工程学院云南昆明650500

本研究以温泉分离的地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)为前体材料,通过一步水热法合成了绿色生物材料(N-CDs),N-CDs具有独特的光学特性、优异的生物相容性和可忽略不计的生物毒性,是生物多色成像的理想荧光染料。利用N-CDs作为生物... 详细信息

本研究以温泉分离的地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)为前体材料,通过一步水热法合成了绿色生物材料(N-CDs),N-CDs具有独特的光学特性、优异的生物相容性和可忽略不计的生物毒性,是生物多色成像的理想荧光染料。利用N-CDs作为生物成像的荧光探针进行实验,结果表明N-CDs能成功染色洋葱细胞的细胞膜结构,不会造成质壁分离;可对酵母细胞的细胞膜进行荧光染色,且酵母细胞可以正常出芽生殖;N-CDs可在植物叶片中通过叶脉和细胞间隙进行扩散成像;也可以正常进入线虫体内进行荧光染色,且不会影响线虫的生命特征。

关键词：地衣芽孢杆菌碳纳米材料生物成像

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电子鼻结合GC-MS鉴别不同部位的三七粉

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食品科学 2023年第20期44卷 321-329页

作者：李丽霞张浩林宇浩史磊李珊珊张付杰王俊昆明理工大学现代农业工程学院云南昆明650500 浙江大学生物系统工程与食品科学学院浙江杭州310058

为鉴别不同部位的三七粉,采用电子鼻结合气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GCMS)联用技术对三七的整根粉、剪口粉、主根粉、侧根粉和须根粉进行挥发性成分分析。通过GC-MS测定三七粉挥发物的成分和含量,并进行多重... 详细信息

为鉴别不同部位的三七粉,采用电子鼻结合气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GCMS)联用技术对三七的整根粉、剪口粉、主根粉、侧根粉和须根粉进行挥发性成分分析。通过GC-MS测定三七粉挥发物的成分和含量,并进行多重比较。利用统计学习方法提取电子鼻响应曲线的8个时域特征,并进行相关性分析,采用3种特征选择算法对特征数据进行降维。分别建立基于原始特征数据、3种特征选择数据的支持向量机(support vector machine,SVM)、最小二乘支持向量机(least square support vector machine,LSSVM)和极限学习机分类模型;引入灰狼优化(grey wolf optimization,GWO)算法对分类模型中的参数gam和sig2进行优化。结果表明:5种三七粉样品中共检测出31种挥发物成分,最优的GWO-IRIV-LSSVM模型能够对电子鼻数据进行有效区分,测试集准确率为97.5%,且能客观反映出样品种类挥发性物质的差异主要是挥发物总量、烷烃和芳香族化合物,这与GC-MS检测结果一致。本研究可用于道地产区优质三七粉混入劣质三七粉的检测。

关键词：电子鼻气相色谱-质谱法三七粉特征提取最小二乘支持向量机灰狼优化算法

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黄花败酱根和根茎中分离得到的环烯醚萜类化合物

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药学学报 2025年第4期60卷 1064-1068页

作者：赵春燕马聪普丽刘丹李洪梅昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500 中检西南计量有限公司工程测量与力学计量检测所云南昆明650034

采用硅胶、Sephadex LH-20和高效液相色谱等色谱分离技术,从黄花败酱(Patrinia scabiosaefolia)干燥根和根茎的乙酸乙酯萃取相中分离得到6个环烯醚萜类化合物。通过核磁共振、计算13C NMR和质谱等波谱学方法,将它们分别鉴定为patrinin A... 详细信息

采用硅胶、Sephadex LH-20和高效液相色谱等色谱分离技术,从黄花败酱(Patrinia scabiosaefolia)干燥根和根茎的乙酸乙酯萃取相中分离得到6个环烯醚萜类化合物。通过核磁共振、计算13C NMR和质谱等波谱学方法,将它们分别鉴定为patrinin A (1)、patrinin B (2)、loganin aglycone (3)、isovillosol (4)、1,3-dimethoxy-4,7-dimethyloctahyhro-cyclopenta[c]pyran-6,7-diol (5)和viburnshosin A (6)。其中,化合物1和2为新化合物。此外,对6个化合物进行了抗流感病毒和抗炎活性评价。

关键词：黄花败酱忍冬科环烯醚萜抗流感病毒抗炎

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中美环保社会组织环境民事公益诉讼起诉资格规则之比较:基于立法与司法的视角

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中国地质大学学报（社会科学版） 2023年第5期23卷 79-94页

作者：王曦郭祥昆明理工大学法学院云南昆明650500 昆明理工大学生态文明与环境法治研究基地云南昆明650500 昆明理工大学环境科学与工程学院

通过辨析起诉资格和环境公益诉讼概念并考察和对比中美两国有关法律文本,发现虽然中美两国都通过立法授权环保社会组织提起环境民事公益诉讼,但由于环保社会组织的特殊身份,两国立法机关对环保社会组织环境民事公益诉讼起诉资格规则的... 详细信息

通过辨析起诉资格和环境公益诉讼概念并考察和对比中美两国有关法律文本,发现虽然中美两国都通过立法授权环保社会组织提起环境民事公益诉讼,但由于环保社会组织的特殊身份,两国立法机关对环保社会组织环境民事公益诉讼起诉资格规则的设定有两个重要的区别。一是在环境民事公益诉讼诉前程序设定上的不同。美国的《清洁空气法》等法律的公民诉讼条款规定了一个“诉前通知期”程序。它的存在迫使公民诉讼的原告和法院尊重对被控行为有管辖权的当地行政机关的优先管辖权。我国法律无此规定。我国这类诉前程序的缺失,一方面导致在环境民事公益诉讼中环保社会组织和法院可能僭越行政权;另一方面,导致司法权被不适当地前移到与行政权并列的位置,从而使其失去了其本身特有的“最后防线”的功能。二是在环境民事公益诉讼原告利害关系审查要求上的不同。本研究表明,美国的法院在环境公益诉讼中坚持对原告与其提告案件的利害关系进行审查。我国立法机关和法院则默示地完全放弃了这项审查。这项放弃在法理上值得商榷。这些立法上的差异提醒我们要高度重视立法活动的系统性影响。为此建议对我国现行环境民事公益诉讼制度增补一个“诉前通知期”程序。如此既可避免环境民事公益诉讼对行政优先管辖原则的违反,又可弥补现行法律放弃环境民事公益诉讼原告利害关系审查要求的弊端。

关键词：环境民事公益诉讼起诉资格立法司法比较法系统性影响

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UPLC-HRMS结合质谱分子网络高通量分析人血浆中的代谢物

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质谱学报 2022年第3期43卷 365-373页

作者：熊倩杨丽娟丁筱雪李文婷易伦朝张宏昆明理工大学食品科学与工程学院云南昆明650500 昆明理工大学附属医院云南省第一人民医院心血管内科云南昆明650032 昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500

本文建立了超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)结合质谱分子网络(MSMN)分析血浆中代谢物的方法。采用Folch方法提取血浆中的代谢物,运用UPLC-HRMS技术同时检测水相和有机相中的多种代谢物。以标准品准确定性的代谢物为种子化合物,采... 详细信息

本文建立了超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)结合质谱分子网络(MSMN)分析血浆中代谢物的方法。采用Folch方法提取血浆中的代谢物,运用UPLC-HRMS技术同时检测水相和有机相中的多种代谢物。以标准品准确定性的代谢物为种子化合物,采用MSMN筛选与种子化合物质谱特征相似的代谢物,扩展代谢物定性范围,提高代谢物定性效率。将该方法用于人血浆中代谢物的定性分析,共检测到187个代谢物。其中,在水相中定性检测到氨基酸、脂肪酸、糖类等80个代谢物,在有机相中定性检测到107个脂类代谢物,实现了人血浆中多类代谢物的高通量分析。

关键词：超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS) 代谢组学质谱分子网络(MSMN) 血浆

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