检索结果-内蒙古大学图书馆

生物医学工程学杂志 2023年第2期40卷 373-377,383页

作者：雷英鹏刘思汝吴钰萱李川(综述) 刘加林(审校) 四川大学计算机学院成都610041 美国范德堡大学医学中心生物医学信息学系纳什维尔37203 四川大学华西临床医学院成都610041 四川大学华西医院信息中心成都610041 四川大学华西临床医学院医学信息学教研室成都610041

心力衰竭是一种严重危害人类健康的疾病,已成为全球公共卫生问题。基于医学影像、临床等数据进行心力衰竭诊断与预后分析能揭示心力衰竭的病程规律,从而降低患者死亡风险,具有重要研究价值。传统基于统计学与机器学习的分析方法存在模... 详细信息

心力衰竭是一种严重危害人类健康的疾病,已成为全球公共卫生问题。基于医学影像、临床等数据进行心力衰竭诊断与预后分析能揭示心力衰竭的病程规律,从而降低患者死亡风险,具有重要研究价值。传统基于统计学与机器学习的分析方法存在模型能力不足、先验依赖造成的准确性差、模型适应性不佳等问题。近年来,随着人工智能技术的发展,深度学习方法逐渐开始在心力衰竭领域的临床数据分析应用中展现出新的前景。本文综述深度学习在心力衰竭诊断、心力衰竭生存风险、心力衰竭再入院等方面的主要工作进展、应用方式与主要成果,总结目前存在的问题,提出相关研究展望,以促进深度学习在心力衰竭临床研究的临床应用。

关键词：心力衰竭深度学习诊断预后

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赖氨酰氧化酶LOXL2稳定性的理论计算研究

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第5期40卷 685-695页

作者：林李锐林凯邹海鹰许丽艳李恩民东庚汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室广东汕头515041 汕头大学医学院生物信息学教研室广东汕头515041 汕头大学医学院医学信息学研究中心广东汕头515041 汕头大学医学院广东省沿海高发地区分子生物学重点实验室广东汕头515041 汕头大学医学院肿瘤研究中心广东汕头515041 汕头市医学科学院广东汕头515041

赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾... 详细信息

赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾病密切相关。然而,关于LOXL2的稳定性目前鲜有报道,哪些位点对其稳定性有显著影响尚不清楚。本研究采用冷冻电镜和Alphafold2的数据,建立LOXL2的全长结构,通过分子动力学模拟得到其优化构象。再通过4种方法(mCSM,PremPS,DeepDDG和FoldX),计算所有位点的稳定性属性,筛选出对稳定性有显性影响的位点(定义为关键位点)。结果表明,95个关键位点对LOXL2的稳定性具有显著影响,在5个结构域上的分布数量依次为14、13、8、11和26,而结构域间的连接肽段上也有23个关键位点。在这些关键位点中,类型及数量分别为Leu(24个)、Val(20个)、Ile(12个)、Trp(11个)、Phe(11个)、Tyr(6个)、Cys(6个)、Met(4个)和Arg(1个)。其中大部分关键位点(88个)为疏水性质,这与蛋白质折叠的主要力量为疏水作用的情况是一致的,而Cys两两成对,构成二硫键,对LOXL2的结构及功能发挥重要作用。讨论中,我们将预测结果与实验值进行比较,并用自由能微扰方法,对部分关键位点进行比较,从多方面论证此项工作的可信度。此项研究,可为靶向LOXL2的疾病治疗研究,提供重要指导。

关键词：赖氨酰氧化酶样2 稳定性分子动力学模拟计算预测吉布斯自由能

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2000-2020年全球肝癌发病和死亡状况和未来流行趋势:GLOBOCAN数据分析

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中华肝脏病杂志 2023年第3期31卷 271-280页

作者：王瑞华胡明杨之雨牛喆昀陈宏森周雄曹广文暨南大学流行病学教研室广州510632 海军军医大学流行病学教研室上海200433 同济大学医学院上海200120

目的比较全球不同地区肝癌发病和死亡的地理差异和时间趋势,对未来肝癌负担进行预测。方法收集GLOBOCAN 2020数据库中2000-2020年全球不同人类发展指数国家肝癌发病和死亡数据。使用joinpoint模型及年度百分比变化分析2000-2020年全球... 详细信息

目的比较全球不同地区肝癌发病和死亡的地理差异和时间趋势,对未来肝癌负担进行预测。方法收集GLOBOCAN 2020数据库中2000-2020年全球不同人类发展指数国家肝癌发病和死亡数据。使用joinpoint模型及年度百分比变化分析2000-2020年全球肝癌发病和死亡状况和未来流行趋势。结果男性肝癌年龄标准化死亡率(ASMR)从2000年的8.0/10万到2015年7.1/10万(年度百分比变化=-0.7,95%CI:-1.2~-0.3,P=0.002),女性肝癌ASMR从2000年的3.0/10万到2015年2.8/10万(年度百分比变化=-0.5,95%CI:-0.8~-0.2,P<0.001)。男女ASMR比例2000年为2.67∶1,2015年为2.51∶1,说明男女死亡率差异略有缩小。2020年全球肝癌ASIR和ASMR分别为9.5/10万和8.7/10万。男性年龄标准化发病率(ASIR)和ASMR(分别为14.1/10万和12.9/10万)是女性(分别为5.2/10万和4.8/10万)的2~3倍。不同人类发展指数国家和地区ASIR和ASMR存在显著差异(P_(ASIR)=0.008,P_(ASMR)<0.001),ASMR分布和ASIR极其接近。预计2040年新发病例将增加58.6%(1436744例),死亡病例将增加60.9%(1335375例),其中亚洲发病数和死亡数分别增加397003例和374208例。结论2000-2015年,全球范围内由肝癌引起的ASMR呈下降趋势,但2020年肝癌最新流行病学现状及预测表明,未来20年肝癌防控在全球范围内仍然是一项重大挑战。

关键词：肝癌人类发展指数标化发病率标化死亡率

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临床医学科研报告的撰写

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上海预防医学 2023年第9期35卷 941-947页

作者：杨之雨曾慧娴王瑞华陈宏森沈佳莹谭晓㛃张宏伟曹广文暨南大学基础医学院流行病学教研室广东广州510632 海军军医大学海军流行病学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

临床科研报告作为科研成果的最终呈现方式,直接反映了研究质量的高低。本文介绍了不同临床科研报告的撰写,如观察性研究和随机对照试验研究,对于随机对照试验进行了重点阐述,并对所涉及的设计类型辅以实例进行概述。每种科研设计都有其... 详细信息

临床科研报告作为科研成果的最终呈现方式,直接反映了研究质量的高低。本文介绍了不同临床科研报告的撰写,如观察性研究和随机对照试验研究,对于随机对照试验进行了重点阐述,并对所涉及的设计类型辅以实例进行概述。每种科研设计都有其报告重点,科研论文的撰写都有统一的要求和特定的撰写格式,掌握科研报告的正确撰写格式对于进行高质量临床医学研究具有实际价值和重要意义。

关键词：临床研究科研设计 STROBE CONSORT 随机对照试验

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上海市新型冠状病毒肺炎流行与疫情时空变化分析

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中华流行病学杂志 2022年第11期43卷 1699-1704页

作者：范君言沈佳莹胡明赵岳林剑生曹广文海军军医大学海医系流行病学教研室上海200433 同济大学医学院上海200331 暨南大学基础医学院广州510632

目的:阐明2022年上海市新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的流行特征和空间聚集性演变规律。方法:收集2022年3月1日至5月31日上海市各行政区卫生健康委员会官方网站公布的新冠肺炎疫情数据,应用GeoDa软件进行空间自相关分析;利用logistic增长... 详细信息

目的:阐明2022年上海市新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的流行特征和空间聚集性演变规律。方法:收集2022年3月1日至5月31日上海市各行政区卫生健康委员会官方网站公布的新冠肺炎疫情数据,应用GeoDa软件进行空间自相关分析;利用logistic增长模型进行拟合预测并与实际感染病例进行对比。结果:上海市各行政区中,浦东新区确诊病例数和无症状感染者人数最多,占总病例数的29.30%和35.58%,各区累计罹患率和感染率差异有统计学意义( P<0.001),其中黄浦区显著高于其他区域。2022年3月1日至5月31日新冠肺炎罹患率具有全局空间正相关性( P<0.05),不同时段新冠肺炎罹患率空间分布不同,其中3月16-29日、4月6-12日和5月18-24日3个时段内Moran's I值差异无统计学意义( P>0.05)。局部自相关分析结果表明,8个时段共探测到22个高-高聚集区,高风险流行的热点区域经历一个“少-多-少”的变化过程。logistic增长模型拟合与实际感染者情况基本吻合。结论:本轮上海市新冠肺炎疫情整体分布具有明显的空间聚集性,防控措施有效阻止了疫情的增长,尤其在空间上遏制了高风险传播区域的扩散,减少了向其他省份的传播风险。

关键词：新型冠状病毒肺炎流行特征空间自相关

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2006-2020年中国20岁及以上人群胰腺癌死亡分析及趋势预测

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中华肿瘤防治杂志 2023年第12期30卷 699-707页

作者：陈宏森杨之雨蒋栋铭胡明牛喆昀王瑞华曹广文海军军医大学流行病学教研室生物安全防御教育部重点实验室上海市医学防护重点实验室上海200433 暨南大学流行病学教研室广东广州510632 同济大学医学院上海200092

目的分城乡和性别阐明中国≥20岁人群胰腺癌死亡变化特征及未来趋势。方法基于中国死因监测数据集,采用局部加权回归和Joinpoint回归,明确2006-2020年胰腺癌的死亡趋势,通过年龄时期队列模型分析、预测胰腺癌死亡趋势。结果 2006-2020... 详细信息

目的分城乡和性别阐明中国≥20岁人群胰腺癌死亡变化特征及未来趋势。方法基于中国死因监测数据集,采用局部加权回归和Joinpoint回归,明确2006-2020年胰腺癌的死亡趋势,通过年龄时期队列模型分析、预测胰腺癌死亡趋势。结果 2006-2020年,胰腺癌粗死亡率为6.320/10万,年龄标化死亡率(ASMR)为4.551/10万。城市和农村人群ASMR分别为5.643/10万和3.976/10万,男性和女性分别为5.485/10万和3.653/10万。胰腺癌死亡持续增加,农村人群每年上升3.684%(t=18.609,P<0.001),高于城市人群的0.173%,t=0.800,P=0.438。男性和女性ASMR每年增加基本一致,分别为1.834%(t=7.456,P<0.001)和1.994%(t=8.055,P<0.001)。年龄效应随年龄增长而增加,60岁以后所有人群年龄效应增长趋势放缓。时期效应随着时间推移而上升,城市和农村人群死亡风险15年间分别增加了57.054%和112.852%,男性和女性则各增加了79.803%和87.989%。队列效应随时期而下降,1976年以后出现反弹。预测未来20年,男性、女性胰腺癌ASMR仍会增长。结论中国≥20岁人群胰腺癌死亡趋势持续上升,呈现城市死亡增加高于农村,男性高于女性的特征。预测发现,在未来20年胰腺癌死亡趋势仍会持续上升。

关键词：胰腺癌死亡成年人 Joinpoint回归局部加权回归年龄时期队列模型趋势分析与预测

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新型冠状病毒的变异株进展:起源、变异动力与防控措施

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上海预防医学 2022年第1期34卷 81-86页

作者：沈佳莹林剑生曹广文同济大学医学院上海200331 暨南大学基础医学院广东广州510632 海军军医大学流行病学教研室上海200433

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)自2019年12月出现后,迅速在全球流行,演变为全球重大公共卫生问题。新型冠状病毒(SARS-CoV-2)为单股正链核糖核酸(RNA)病毒,自然突变率较高;变异株的出现往往是"变异—选择—适应"的进化产物。此外... 详细信息

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)自2019年12月出现后,迅速在全球流行,演变为全球重大公共卫生问题。新型冠状病毒(SARS-CoV-2)为单股正链核糖核酸(RNA)病毒,自然突变率较高;变异株的出现往往是"变异—选择—适应"的进化产物。此外,炎症状态下激活的APOBEC酶可促进病毒变异。目前发现有公共卫生意义的SARS-CoV-2主要突变株为B.1.1.7(Alpha)、B.1.351(Beta)、P.1(Gamma)、B.1.6.7.2(Delta)和B.1.1.529(Omicron)等,其进化和变异趋势可能发生传播能力增强、对中和抗体敏感度降低、发生免疫逃逸,以及可能增加疾病严重程度与病死率。因此,追踪病毒变异、研发针对变异的疫苗和加强隔离措施是当下与未来应对SARS-CoV-2变异的重要防控手段。

关键词：新型冠状病毒肺炎 APOBEC 病毒进化新型冠状病毒防控

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阻断半乳糖凝集素⁃受体相互作用对弓形虫感染小鼠小肠免疫病理的影响

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中国寄生虫学与寄生虫病杂志 2023年第3期41卷 279-285页

作者：欧阳然刘星卓黄世光吕芳丽中山大学中山医学院寄生虫学教研室广东广州510080 深圳南油麦芽口腔门诊部广东深圳518067 暨南大学口腔医学院广东广州511468 中山大学附属第七医院检验科广东深圳518107 中山大学医学院寄生虫学教研室广东深圳518107 中山大学热带病防治研究教育部重点实验室广东广州510080

目的探讨半乳糖凝集素与受体的相互作用对弓形虫感染小鼠小肠免疫病理的调节作用。方法将18只雌性BALB/c小鼠随机分成4组:未感染组(naive组)4只、α⁃乳糖组(lactose组)4只、弓形虫感染组(Tg组)5只和弓形虫感染+lactose组(Tg+lactose组)... 详细信息

目的探讨半乳糖凝集素与受体的相互作用对弓形虫感染小鼠小肠免疫病理的调节作用。方法将18只雌性BALB/c小鼠随机分成4组:未感染组(naive组)4只、α⁃乳糖组(lactose组)4只、弓形虫感染组(Tg组)5只和弓形虫感染+lactose组(Tg+lactose组)5只。Tg组和Tg+lactose组每鼠腹腔注射约1000个弓形虫速殖子,naive组和lactose组腹腔注射PBS 0.2 ml。感染后当天开始,Tg+lactose组和lactose组每鼠腹腔注射0.2 mol/L的lactose 0.2 ml,naive组和Tg组每鼠腹腔注射等体积的PBS,早、晚各1次,连续注射7 d。感染弓形虫后,记录各组小鼠的生存时间。在感染后第7天处死小鼠,取空肠中段进行石蜡切片和HE染色,观察小鼠小肠组织的病理变化;取小鼠空肠下段提总RNA后逆转录,以β肌动蛋白(β⁃actin)作为内参基因,qRT⁃PCR检测小鼠小肠组织弓形虫表面抗原1(SAG1)、半乳糖凝集素3(galectin⁃3)、galectin⁃9、T细胞免疫球蛋白黏蛋白⁃3(Tim⁃3)、白细胞分化抗原137(CD137)、白细胞介素12(IL⁃12)、γ⁃干扰素(IFN⁃γ)、IL⁃10、IL⁃4、转化生长因子β(TGF⁃β)、趋化因子受体2(CCR2)、和几丁质酶3样分子3(Ym1)的mRNA相对表达水平。结果感染弓形虫后,naive组和lactose组小鼠无死亡,Tg组小鼠的存活时间为182~188 h,Tg+lactose组小鼠的存活时间为180~182 h;两组小鼠的生存时间差异有统计学意义(χ^(2)=19.52,P<0.05)。HE染色结果显示,naive组和lactose组小鼠的空肠组织未观察到炎症改变;Tg组和Tg+lactose组小鼠的小肠组织观察到肠绒毛缩短,肠隐窝变浅,绒毛顶端上皮细胞坏死,小肠黏膜组织中有炎症细胞浸润。与Tg组的相比,Tg+lactose组小鼠小肠组织的病理损伤更加严重。qRT⁃PCR结果显示,Tg+lactose组小鼠小肠组织SAG1的mRNA相对表达水平为9.17±1.65,高于Tg组的1.00±0.84(t=4.40,P<0.05)。naive组、lactose组、Tg组和Tg+lactose组小鼠小肠组织galectin⁃3的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.28、1.71±0.31、2.46±1.11和7.10±1.57(F=10.15,P<0.01),galectin⁃9的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.31、1.44±0.26、3.21±1.01和7.00±1.08(F=14.53,P<0.01),Tim⁃3的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.12、0.88±0.28、1.64±0.31和4.89±0.69(F=19.15,P<0.01),CD137的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.42、1.03±0.30、0.89±0.11和3.84±0.77(F=8.46,P<0.01),IL⁃12的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.35、1.14±0.56、12.37±4.43和18.42±3.89(F=10.18,P<0.01),IFN⁃γ的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.56、1.65±0.53、5.57±1.84和21.26±6.48(F=10.38,P<0.01),IL⁃10的mRNA相对表达水平分别为1.00±0.20、1.10±0.25、8.65±2.52和21.98±3.96(F=20.84,P<0.01)。小鼠小肠组织中IL⁃4、TGF⁃β和CCR2的mRNA相对表达水平在naive组、lactose组、Tg组和Tg+lactose组之间差异无统计学意义(F=1.09、4.74、2.03,均P>0.05)。naive组和lactose组未检测到Ym1的mRNA表达,Tg组和Tg+lactose组Ym1的mRNA相对表达水平差异无统计学意义(t=0.24,P>0.05)。结论阻断半乳糖凝集素⁃受体相互作用后,弓形虫感染小鼠的小肠组织虫荷增加、病理损伤加重,galectin⁃3、galectin⁃9、Tim⁃3、CD137、IL⁃10和IFN⁃γ的表达上调。

关键词：弓形虫感染小鼠小肠半乳糖凝集素

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上海郊区居民高血压和糖尿病共患的相关因素分析

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上海预防医学 2022年第10期34卷 1033-1037页

作者：蔡仕良鲜林峰李子帅蒲蕊王瑞华曹广文海军军医大学流行病学教研室上海200433 暨南大学医学院广东广州510632

【目的】调查上海市郊区居民高血压和糖尿病(HT‑DM)共患的相关因素。【方法】在上海市郊区某镇中,采用整群随机抽样方法选择1个村组中年龄≥35岁常住居民为研究对象,共计2159名。调查其基本社会学特征及血脂水平,通过χ^(2)检验分析高... 详细信息

【目的】调查上海市郊区居民高血压和糖尿病(HT‑DM)共患的相关因素。【方法】在上海市郊区某镇中,采用整群随机抽样方法选择1个村组中年龄≥35岁常住居民为研究对象,共计2159名。调查其基本社会学特征及血脂水平,通过χ^(2)检验分析高血压和HT‑DM与性别、年龄、文化程度、婚姻状况、原户籍和现户籍的分布关系。通过非条件logistic回归模型分析高血压和HT‑DM与血脂水平的关系。【结果】在研究人群中,高血压患病率26.35%,HT‑DM共患病率4.68%。高血压患者在不同年龄、婚姻状况、文化程度、现户籍和原户籍中的分布差异均有统计学意义(均P<0.05),HT‑DM在不同年龄、文化程度、现户籍和原户籍中的分布差异均有统计学意义(均P<0.05)。χ^(2)趋势分析发现:在男性和女性人群中,高血压患病率均随着年龄增长而升高(χ^(2)=129.82、193.04,均P<0.001);在男性和女性人群中,HT‑DM患病率均随着年龄增长而升高(χ^(2)=9.29、40.57,均P<0.01)。非条件logistic回归模型分析发现,较低的高密度脂蛋白胆固醇水平和较高的三酰甘油水平分别使高血压患病风险增加2.79倍和2.06倍;较低的高密度脂蛋白胆固醇水平使HT‑DM共患风险增加4.21倍。【结论】上海市郊区高血压患病率较高,年龄、文化程度、农业户籍和高密度脂蛋白胆固醇是高血压与HT‑DM患病的共同相关因素。

关键词：高血压高血压‑糖尿病共患高密度脂蛋白胆固醇三酰甘油相关因素

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小鼠甲状腺原代细胞的快速培养和鉴定

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中国病理生理杂志 2024年第3期40卷 572-576页

作者：谭秋婵林嘉伟阳小雅潘丽姚丹丹王立伟陈丽新巫株华广州卫生职业技术学院生理学教研室广东广州510450 佛山市第一人民医院乳腺外一科广东佛山528000 暨南大学医学院广东广州510632 广东省结核病控制中心广东广州510630

目的:探索一种快速且简便易行的小鼠原代甲状腺细胞的培养方法。方法:通过酶消化法分离小鼠甲状腺细胞,并用改良的培养液对其进行培养,观察14 d内细胞的形态、特征以及分泌功能。结果:甲状腺组织经25 min消化即可获得活性较好的原代细胞... 详细信息

目的:探索一种快速且简便易行的小鼠原代甲状腺细胞的培养方法。方法:通过酶消化法分离小鼠甲状腺细胞,并用改良的培养液对其进行培养,观察14 d内细胞的形态、特征以及分泌功能。结果:甲状腺组织经25 min消化即可获得活性较好的原代细胞;细胞第2天贴壁生长;第5~7天可出现次级滤泡结构;95%以上细胞胞质内可检测到甲状腺球蛋白;7 d内,总三碘甲状腺原氨酸和总甲状腺素分泌量均能保持60%以上;特异性基因的表达在10 d内仍能达到50%以上。结论:应用该方法可快速培养小鼠甲状腺原代细胞,细胞在7 d内可用于甲状腺内分泌相关的研究,在10 d内可用于基因的研究。

关键词：甲状腺内分泌原代培养小鼠

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