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第十三届全国生物材料学术会议

作者：钟大根刘宗华左琴华施云峰谢莎莎李承花薛巍暨南大学生命与健康工程研究院广东广州510632

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穿心莲内酯衍生物抗H2O2诱导胰岛RIN-mβ细胞凋亡的蛋白组学研究

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生态科学 2010年第1期29卷 80-84页

作者：周辉华丁文贾红玲王玉强晏光荣暨南大学生命与健康工程研究院广州510632 暨南大学药学院新药研究所广州510632

采用蛋白组学方法筛选穿心莲内酯衍生物（AL-1）抗过氧化氢诱导胰岛RIN—mβ细胞凋亡的差异蛋白质分子并探讨其作用分子机制。结果显示：AL-1浓度依赖性地提高H2O2处理的胰RIN-mβ细胞的存活率。经蛋白组学研究分析，成功地鉴定了18个... 详细信息

采用蛋白组学方法筛选穿心莲内酯衍生物（AL-1）抗过氧化氢诱导胰岛RIN—mβ细胞凋亡的差异蛋白质分子并探讨其作用分子机制。结果显示：AL-1浓度依赖性地提高H2O2处理的胰RIN-mβ细胞的存活率。经蛋白组学研究分析，成功地鉴定了18个与凋亡、应激等相关的蛋白，包括Prohibitin、Shmt2、RhoGDP-dissociation inhibitor-1、Galectin-1、Cytb5、Hsps等；与对照组（H202）相比，处理组（AL-1＋H2O2）中，有9个表达上调的蛋白和9个表达下调的蛋白。AL-1过调控与细胞凋亡、应激等相关的蛋白发挥其抗H2O2诱导的凋亡作用。

关键词：穿心莲内酯衍生物AL-1 H2O2 胰岛RIN-mβ细胞株双向凝胶电泳蛋白质组学

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深海沉积物高效脱氮菌筛选分离及其脱氮特性研究

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微生物学通报 2021年第10期48卷 3472-3484页

作者：姚雨欣钟新华李慧贤范蔚林项琪黄亚东暨南大学生命科学技术学院广东广州510632 暨南大学生物医药研究院广东省生物工程药物重点实验室广东广州510632 暨南大学医药生物技术研究开发中心广东广州510632

【背景】深海海域具有高压、低温、无光等环境条件,蕴含着丰富而独特的微生物资源。【目的】从深海沉积物中定向分离、筛选脱氮效率高的好氧脱氮菌株资源,并揭示其脱氮特性,为开发水体脱氮微生物技术提供物质基础。【方法】以东太平洋... 详细信息

【背景】深海海域具有高压、低温、无光等环境条件,蕴含着丰富而独特的微生物资源。【目的】从深海沉积物中定向分离、筛选脱氮效率高的好氧脱氮菌株资源,并揭示其脱氮特性,为开发水体脱氮微生物技术提供物质基础。【方法】以东太平洋、南大西洋、西南印度洋共10个站位的深海沉积物为研究材料,在28℃下使用无机氮源连续进行两轮富集培养,然后定性筛选可以脱除氨氮、亚硝态氮和硝态氮的菌株,并通过形态学和16S rRNA基因序列分析进行初步分类鉴定;对优选得到的功能菌株,分别采用以氨氮、亚硝态氮、硝态氮为唯一氮源的培养基定量研究其生长和脱氮性能。【结果】从10份大洋深海沉积物样品中共分离得到49株好氧反硝化菌,其中3株在有氧条件下反硝化效率较高,分别命名为Pseudomonassp.G111、Pseudomonassp.G112和Dietziamaris W023a,其中菌株G111和G112与模式菌株博岑假单胞菌Pseudomonas bauzanensis BZ93^(T)的16S rRNA基因序列相似度为99.2%,菌株W023a与模式菌株海洋迪茨氏菌DietziamarisATCC35013^(T)的16SrRNA基因序列相似度为99.9%。菌株G111、G112和W023a培养48h后,对氨氮的脱除率分别为98.0%、85.2%和97.6%;对亚硝态氮的脱除率分别为71.9%、67.5%和34.7%;对硝态氮的脱除率分别为66.0%、52.6%和56.3%。菌株G111、G112和W023a均为异养硝化-好氧反硝化菌,可通过好氧反硝化作用将亚硝态氮和硝态氮还原为含氮气体,也可通过异养硝化-好氧反硝化作用将氨氮转化为含氮气体。【结论】从深海沉积物中分离筛选得到3株高效好氧反硝化菌,所获得的菌株在水体净化、污水处理、生态系统修复等领域具有应用潜力。

关键词：深海沉积物脱氮菌好氧反硝化脱氮性能

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冬季南澳岛不同养殖区浮游细菌分布及微表层的富集作用

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安全与环境学报 2010年第5期10卷 78-82页

作者：张俊胡晓娟杨宇峰龚映雪暨南大学水生生物研究所水体富营养化与赤潮防治广东省教育厅重点实验室热带亚热带水生态工程教育部工程研究中心广州510632 暨南大学生命与健康工程研究院广州510632

通过对广东省南澳岛不同养殖区不同水层的调查,探讨了冬季南澳岛不同养殖区的浮游细菌分布及理化因子,并分析了海洋微表层的富集作用。结果表明,温度、盐度、叶绿素a(chl-a)、TN及TP在不同养殖区的差异不明显(p>0.05),在不同水层之... 详细信息

通过对广东省南澳岛不同养殖区不同水层的调查,探讨了冬季南澳岛不同养殖区的浮游细菌分布及理化因子,并分析了海洋微表层的富集作用。结果表明,温度、盐度、叶绿素a(chl-a)、TN及TP在不同养殖区的差异不明显(p>0.05),在不同水层之间的分布也无一定规律。除对照区微表层水体对chl-a无富集作用外,其余各站点的微表层对chl-a、TN和TP都表现出一定的富集作用。异养细菌及弧菌总数在鱼类养殖区最高,其次为贝类养殖区,最低为龙须菜栽培区;粪大肠菌群在贝类养殖区最高,其次为鱼类养殖区,最低为龙须菜栽培区。除粪大肠菌群外,异养细菌及弧菌总数均在各站点微表层水体中最高。异养细菌、弧菌和粪大肠菌群数的最高值分别为4.61×10~5cfu/mL、1.5×10~4 cfu/mL和3 500 mL^(-1)。贝类养殖区的粪大肠菌群数远超出国家海水水质标准。各站点微表层水体对异养细菌和弧菌都表现出很强的富集作用,对粪大肠菌群的富集作用则较弱。

关键词：生态学南澳岛浮游细菌微表层富集作用

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人肺腺癌细胞系与支气管上皮细胞系差异蛋白质组学研究

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中国病理生理杂志 2010年第5期26卷 917-921页

作者：李丽萍陈智鹏贾海涛王炜贾红玲卢春花暨南大学生命与健康工程研究院广东广州510632 广州医学院第一附属医院呼吸疾病国家重点实验室广东广州510120

目的:通过对肺腺癌细胞系A549细胞和正常上皮细胞系HBE蛋白组成差异的分析,寻找与肺癌发生、发展相关的差异蛋白,为进一步阐明肺癌发病机制提供更多有价值的信息;为诊断或者预后提供候选分子标记物。方法:运用固相pH梯度双向电泳和基质... 详细信息

目的:通过对肺腺癌细胞系A549细胞和正常上皮细胞系HBE蛋白组成差异的分析,寻找与肺癌发生、发展相关的差异蛋白,为进一步阐明肺癌发病机制提供更多有价值的信息;为诊断或者预后提供候选分子标记物。方法:运用固相pH梯度双向电泳和基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI/TOF/TOF/MS)分析技术筛选出A549细胞和支气管上皮细胞系HBE间表达水平显著差异的蛋白,并且利用免疫印迹方法对筛选的标记物蛋白进行验证。结果:筛选出21个差异蛋白,涉及到细胞的代谢、蛋白质修饰、细胞运动,通道蛋白和信号转导调控等方面。鉴定并且验证在A549细胞中显著高表达热休克蛋白27(HSPB1)。结论:肺腺癌细胞系与正常支气管上皮细胞系蛋白质表达存在显著差异,其中肺腺癌中高表达HSPB1可能在肺腺癌癌变过程中发挥重要作用,本结果为进一步寻找肺腺癌癌变蛋白标志物奠定了基础。

关键词： A549细胞 HBE细胞蛋白质组热休克蛋白质27

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光谱法结合分子对接研究普罗帕酮与牛血清白蛋白的相互作用

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分析试验室 2020年第10期39卷 1148-1154页

作者：李楠曾观娣孙正华银兴峰广东省高等学校功能蛋白研究重点实验室教育部肿瘤分子生物学重点实验室暨南大学生命与健康工程研究院广州510632

综合运用圆二色谱、停留-动力学、荧光、同步荧光、三维荧光、等温量热滴定法(ITC)等技术并结合分子对接进行表征牛血清白蛋白(BSA)与普罗帕酮的结合热力学及结合动力学参数。研究结果表明,BSA对普罗帕酮结合特异,在291K,298K,310K二者... 详细信息

综合运用圆二色谱、停留-动力学、荧光、同步荧光、三维荧光、等温量热滴定法(ITC)等技术并结合分子对接进行表征牛血清白蛋白(BSA)与普罗帕酮的结合热力学及结合动力学参数。研究结果表明,BSA对普罗帕酮结合特异,在291K,298K,310K二者的亲和常数分别是2.612×105,2.879×105,6.793×105mol^-1,结合位点数n约为1。同步荧光光谱及三维荧光光谱表明,普罗帕酮与BSA结合后,荧光光谱发生蓝移,揭示BSA结合药物分子后高级构象发生变化。BSA结合普罗帕酮的停留-动力学反应符合三级指数方程曲线,快反应在约0.03 s完成结合,结合速率常数k1=0.097!0.02 s^-1,k2=1.058!0.18 s^-1,k3=31.410!1.18 s^-1。进一步通过分子对接显示普罗帕酮结合在蛋白的I域的IB疏水性口袋中,有12个氨基酸残基参与配体结合,其中Tyr160与Phe13各提供1个氢键参与配体结合,而带电氨基酸Glu125,Lys136,Arg185紧紧把配体束缚在结合口袋中。研究工作将有助于在分子水平上更为详细了解普罗帕酮与BSA的相互作用,并为进一步了解普罗帕酮在生物体内的作用提供理论基础。

关键词：普罗帕酮圆二色谱荧光光谱停留-动力学分子对接

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TRIM21通过与ZSWIM1相互作用调节肺腺癌细胞的增殖和迁移

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中国肺癌杂志 2024年第5期27卷 337-344页

作者：陈露璇连琼华章贵吴嘉耀曾观娣高学娟暨南大学肿瘤分子生物学教育部重点实验室生物活性药物分子与成药性优化全国重点实验室暨南大学生命与健康工程研究院广州510632 暨南大学附属广东省第二人民医院传统医学与运动伤害康复研究所广州510317

背景与目的肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)是一种致病率和死亡率都极高的癌症,尽管现代医学的治疗手段在不断进步,但患者的5年生存率仍不高,因此我们想通过探究LUAD发生发展的分子机制进而鉴定新的治疗靶标。我们前期的研究报道了Z... 详细信息

背景与目的肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)是一种致病率和死亡率都极高的癌症,尽管现代医学的治疗手段在不断进步,但患者的5年生存率仍不高,因此我们想通过探究LUAD发生发展的分子机制进而鉴定新的治疗靶标。我们前期的研究报道了ZSWIM1(zinc finger SWIM-type containing 1)是一个促进LUAD细胞增殖、迁移、侵袭的新蛋白。本研究将着重探究E3泛素连接酶TRIM21(tripartite-motif protein 21)对ZSWIM1在LUAD细胞中促增殖、迁移功能的影响。方法利用蛋白免疫共沉淀技术(co-immunoprecipitation,Co-IP)和免疫荧光技术(immunofluorescence, IF)验证TRIM21和ZSWIM1之间的相互作用和共定位;利用MTT和Transwell实验检测TRIM21及TRIM21、ZSWIM1协同对LUAD增殖、迁移的影响;利用蛋白印迹实验(Westernblot,WB)检测TRIM21和ZSWIM1对LUAD细胞上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)标志物表达的影响;利用Co-IP联合WB检测TRIM21对ZSWIM1泛素化的影响。结果 TRIM21与ZSWIM1存在相互作用和共定位。TRIM21的上调可以抑制LUAD细胞的增殖和迁移。过表达TRIM21能够降低ZSWIM1对LUAD细胞增殖、迁移和侵袭的促进作用,并逆转ZSWIM1对E-cadherin和Vimentin表达的影响。敲低TRIM21则可以增强ZSWIM1对LUAD细胞增殖和迁移的促进作用。机制方面,我们发现过表达TRIM21可明显增强ZSWIM1的泛素化水平,下调ZSWIM1的蛋白表达量。结论 TRIM21通过结合并促进ZSWIM1的泛素化,进而降低ZSWIM1的蛋白表达,这抑制了ZSWIM1对LUAD细胞增殖、迁移、侵袭表型的促进作用。

关键词：肺肿瘤 TRIM21 ZSWIM1 增殖迁移

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视网膜神经节细胞生存与凋亡分子机制的研究进展

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生命科学 2022年第7期34卷 838-847页

作者：张佳姚凯武汉科技大学生命科学与健康学院视神经科学与干细胞工程研究院武汉430065

视网膜神经节细胞(retinal ganglion cell, RGC)是位于视网膜最终段的神经细胞,具有将视觉信息传递到脑部的功能。RGC及其轴突进行性丢失导致青光眼等疾病。在青光眼发展过程中,促凋亡因子(如丝裂原活化蛋白激酶、转化生长因子-β、活... 详细信息

视网膜神经节细胞(retinal ganglion cell, RGC)是位于视网膜最终段的神经细胞,具有将视觉信息传递到脑部的功能。RGC及其轴突进行性丢失导致青光眼等疾病。在青光眼发展过程中,促凋亡因子(如丝裂原活化蛋白激酶、转化生长因子-β、活性氧、Ca^(2+)、Bcl-2相关X蛋白、Bcl-2细胞死亡调节因子、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶等)上调引起RGC死亡,最终导致视力丧失,而增多的促生存因子(如Wnt、脑源性神经营养因子)则有助于RGC的存活。该文通过分析近年来RGC生存与凋亡相关的研究成果,总结了生存因子促进RGC存活和凋亡因子引起RGC死亡的分子机制。掌握促凋亡因子和促生存因子的作用机理将有助于了解青光眼复杂的病理生理过程,为新的分子靶标和药物开发提供思路。

关键词：视网膜神经节细胞丝裂原活化蛋白激酶 Wnt 脑源性神经营养因子

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破解新一代测序的危机困局:超高精度算法FANSe2及云分析平台

破解新一代测序的危机困局:超高精度算法FANSe2及云分析平台

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2015年广东省医学会循环生物标志物检测与临床应用研讨会

作者：张弓暨南大学生命与健康工程研究院翻译组字实验室

新一代测序的危机困局The crisis of next-genjeration sequencing难验证突变无法验证基因表达检测假阳性和假阴性率高临床误诊率高难重复不同的实验室、不同的仪器测出来的结果难以重现不同参数,计算结果大相径庭,稳健性差难使用计算...

新一代测序的危机困局The crisis of next-genjeration sequencing难验证突变无法验证基因表达检测假阳性和假阴性率高临床误诊率高难重复不同的实验室、不同的仪器测出来的结果难以重现不同参数,计算结果大相径庭,稳健性差难使用计算设备昂贵、需专业人员维护计算量巨大参数难设定大量需要编程定制

关键词：

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模型多肽Trp-Cage折叠形成机制的研究进展

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物理化学学报 2013年第9期29卷 1842-1850页

作者：吴晓敏袁晓辉薛书蕾查岭生王光利张海军淮北师范大学生命科学学院资源植物生物学安徽省重点实验室安徽淮北235000 东北林业大学生物资源生态利用国家地方联合工程实验室哈尔滨150040 暨南大学生物医药研究院广州510632

蛋白质折叠是目前结构生物学领域的核心问题之一,理解蛋白质结构折叠机制及其与生物功能之间的相互关系一直是生命科学家非常重要的研究内容,并且该研究受到越来越多不同学科领域研究工作者的高度重视.蛋白质大多数在数十毫秒、微秒或... 详细信息

蛋白质折叠是目前结构生物学领域的核心问题之一,理解蛋白质结构折叠机制及其与生物功能之间的相互关系一直是生命科学家非常重要的研究内容,并且该研究受到越来越多不同学科领域研究工作者的高度重视.蛋白质大多数在数十毫秒、微秒或几秒内完成自我折叠过程,但其折叠过程中所发生的分子结构精细转变却在纳秒甚至更短时间尺度内完成.由于其折叠时间分辨率的限制,目前无论是从常规实验还是理论计算角度对其研究都存在一定的难度.本文首先概述了蛋白质折叠研究在实验和理论模拟方面存在的一些问题,然后以结构典型且可快速折叠的人工设计多肽Trp-cage为例,主要对其折叠过渡温度、折叠形成模型及其肽链上关键氨基酸残基在折叠过程中的作用三个方面进行了详细讨论,综述了模型多肽Trp-cage的折叠动力学行为分别在实验和理论模拟方面的研究进展.最后就如何有效化解蛋白质残基间相互作用网络进而降低其折叠机制的复杂性提出了一些新的建议,不仅有助于阐明该迷你蛋白Trp-cage快速折叠、稳定形成的驱动力成因,而且也能为蛋白质折叠机制研究和多肽设计提供有益参考.

关键词：实验与理论模拟折叠机制过渡温度残基突变关键氨基酸

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