检索结果-内蒙古大学图书馆

中国药物警戒 2023年第1期20卷 92-95页

作者：郑轶翟映红郭晓晶许金芳迟立杰郭志坚陈晨鑫梁际洲韦连慧陈枭叶小飞贺佳海军军医大学卫勤系军队卫生统计学教研室上海200433 同济大学卫生统计学教研室上海200092

目的以免疫检查点抑制剂(ICIs)甲状腺免疫相关不良反应为例,初步探索基于中国药物警戒系统(CHPS)开展药品主动监测的可行性,为相关研究提供依据。方法基于2家哨点医院的CHPS数据,提取2020年1月1日至2021年6月30日应用过ICIs的肿瘤患者信... 详细信息

目的以免疫检查点抑制剂(ICIs)甲状腺免疫相关不良反应为例,初步探索基于中国药物警戒系统(CHPS)开展药品主动监测的可行性,为相关研究提供依据。方法基于2家哨点医院的CHPS数据,提取2020年1月1日至2021年6月30日应用过ICIs的肿瘤患者信息,以及未使用过ICIs的肿瘤患者信息作为对照。基于广义估计方程,对ICIs的甲状腺免疫相关不良反应进行探索。结果共纳入1691名患者,其中ICIs组666名,对照组1025名。应用广义估计方程模型处理患者的随访数据,充分考虑了多次重复测量数据间相关性的问题,发现显性甲状腺毒症有统计学意义(P<0.05),发生率为4.50%,中位时间为41.5 d。结论ICIs的应用可能会导致显性甲状腺毒症,临床医师在给患者应用ICIs时应注意显性甲状腺毒症的发生,确保患者用药安全。

关键词：免疫检查点抑制剂甲状腺中国药物警戒系统主动监测药品不良反应

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基于肠道菌群的帕金森病早期预测模型建立及生物信息分析

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中华疾病控制杂志 2024年第9期28卷 1096-1103页

作者：何长颖韦雨婷陈佳陆军军医大学军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准... 详细信息

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准化及ZicoSeq降维,采用基于自适应最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)变量选择的logistic回归算法建立预测模型,使用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评价模型预测效能,采用临床决策曲线(decision curve analysis,DCA)进行临床使用价值的评价;另一方面,对肠道菌群宏基因KO组数据使用limma包鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。通过结合蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks,PPI)、支持向量机-递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)对DEGs进行筛选。结果基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型的ROC曲线以及校准曲线显示模型预测效果良好。DCA结果显示模型净收益较大。通过PPI网络分析及机器学习方法,最终筛选出6个核心DEGs,即阿拉伯糖转运系统渗透蛋白(L-arabinose operon Q,araQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶,Ⅱ型、dCTP脱氨酶(dCTP deaminase,dcd)、颗粒19 kDa蛋白(signal recognition particle 19,SRP19)、加工前体5,核糖核酸酶P/MRP亚基(芽殖酵母)[processing of precursor 5,ribonuclease P/MRP subunit(***),POP5]、肌醇-3-磷酸合酶1(inositol-3-phosphate synthase 1,ISYNA1)。结论基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型对PD的预测具有优势,从而实现对PD患者的早发现、早干预、早治疗;相关核心基因的发现为PD的治疗提供科学指导和帮助。

关键词：帕金森病肠道菌群机器学习生物信息学分析

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生物学年龄量化方法研究进展

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中华流行病学杂志 2023年第3期44卷 516-520页

作者：曹利美陈淑婷王彤山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001

生物学年龄已被证明优于时序年龄衡量个体间衰老的真实差异,但生物学年龄的量化方法在衰老研究领域至今未达成共识。本文对目前常用的一些生物学年龄的量化方法进行概述,并提出展望。

关键词：生物学年龄衰老量化

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基于降秩回归的血脂相关膳食模式与糖尿病的关系

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中华疾病控制杂志 2023年第1期27卷 29-35页

作者：乔婷婷张焕文罗涛赵辉张国珍戴江红新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室乌鲁木齐830000

目的探寻血脂相关膳食模式与糖尿病的关联,为糖尿病的膳食干预提供科学依据。方法选取4 759名来自伊犁州霍城县的农村居民作为研究对象,通过问卷调查、体格检查及实验室检测收集研究对象的相关资料。通过降秩回归法提取血脂相关膳食模... 详细信息

目的探寻血脂相关膳食模式与糖尿病的关联,为糖尿病的膳食干预提供科学依据。方法选取4 759名来自伊犁州霍城县的农村居民作为研究对象,通过问卷调查、体格检查及实验室检测收集研究对象的相关资料。通过降秩回归法提取血脂相关膳食模式;利用Pearson相关分析评估血脂相关膳食模式评分及各食物组摄入量与血脂的相关性;并通过logistic回归分析模型探寻血脂相关膳食模式与糖尿病患病风险之间的关联。结果血脂相关膳食模式主要以小麦、畜肉和油炸面食摄入较多,而杂粮、蔬菜和水果等摄入较少为特征。血脂相关膳食模式与TC (r=0.296,P<0.001)、LDL-C(r=0.225,P<0.001)及TG(r=0.332,P<0.001)呈正相关,而与HDL-C(r=-0.237,P<0.001)呈负相关。logistic回归分析模型分析结果显示,调整混杂因素后,血脂相关膳食模式评分Q4组比Q1组的糖尿病患病风险增加99%(OR=1.99;95%CI:1.47~2.68;P<0.001),且随着膳食模式评分增高,糖尿病患病风险具有升高的线性趋势(P_(趋势)<0.001)。结论血脂相关膳食模式评分与糖尿病患病风险呈正相关,通过膳食来优化血脂水平可能有助于糖尿病的早期预防。

关键词：降秩回归血脂膳食模式糖尿病

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机器学习方法在FAERS布加替尼不良反应信号检测中的应用

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中国药物警戒 2023年第6期20卷 639-645页

作者：陈枭郭晓晶许金芳韦连慧陈晨鑫梁际洲郑轶叶小飞海军军医大学卫生统计学教研室上海200433

目的评估机器学习算法在检测布加替尼(Brigatinib)药品不良反应信号中的性能。方法使用美国食品药品监督管理局(FDA)不良反应事件报告系统(FAERS)2017年4月1日至2022年3月31日收集的布加替尼药品不良反应信号数据开展研究。首先为研究... 详细信息

目的评估机器学习算法在检测布加替尼(Brigatinib)药品不良反应信号中的性能。方法使用美国食品药品监督管理局(FDA)不良反应事件报告系统(FAERS)2017年4月1日至2022年3月31日收集的布加替尼药品不良反应信号数据开展研究。首先为研究药品构建一个输入数据集,包括药品标签上列出的已知不良反应和未知不良反应。对于已知不良反应,训练4种机器学习算法,并通过曲线下面积(AUC)评估机器学习算法[随机森林(random forest,RF)、极限梯度提升机(extreme gradient boosting)、Logistic回归和邻近算法(k-NearestNeighbor,kNN)]与传统不相称分析方法[报告优势比(ROR)]和信息成分(IC)]进行比较。结果kNN算法具有最高的AUC,平均值0.875,其余方法中Logistic回归(0.852),XGBoost(0.722),RF(0.662)和DPA(0.548)。在未知不良反应数据集中,以kNN算法建立的机器学习模型检出6个额外信号(占15.8%),传统不相称方法检出4个额外信号(占10.5%)。结论以kNN算法建立的机器学习模型比传统DPA方法在药品不良反应信号检测方面性能更佳。

关键词：不相称分析布加替尼信号检测药品不良反应机器学习算法美国食品药品监督管理不良反应事件报告系统

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RNN、JPR及ARIMA 3种模型预测中国农村孕产妇死亡率的比较

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中华疾病控制杂志 2023年第11期27卷 1308-1313页

作者：尹小兰何芯芯杜林李远盛张俊辉西南医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室泸州646000

目的利用循环神经网络(recurrent neural network,RNN)模型、Joinpoint回归(Joinpoint regression,JPR)模型、差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型预测中国农村孕产妇死亡率(maternal mortality rate,MMR)的应用价值,并对《“健康中国2030”规划纲要》等文件提出的MMR下降目标能否实现进行统计预测。方法基于2000―2019年中国农村MMR数据建立RNN、JPR及ARIMA模型,通过平均绝对误差(mean absolute error,MAE)、均方误差(mean squared error,MSE)、均方根误差(root mean square error,RMSE)比较3种模型的回代拟合效果,通过残差及相对误差比较3种模型对2020年中国农村MMR数据进行点预测的效果,利用优选模型对2021―2030年中国农村的MMR进行预测。结果2000―2020年中国农村的MMR整体呈持续下降趋势。3种模型回代拟合效果由好到差排序为:RNN>JPR>ARIMA,RNN模型的MAE、MSE、RMSE均<0.02。3种模型的点预测效果由好到差排序为:RNN>JPR>ARIMA。最优的RNN模型预测结果显示,2022年中国农村MMR预测值为18.02/10万,能够实现《“健康中国2030”规划纲要》等文件的下降目标;2025及2030年中国农村MMR预测值分别为17.58/10万、17.27/10万,均不能实现《“健康中国2030”规划纲要》等文件的下降目标。结论RNN模型预测效果优于JPR模型及ARIMA模型,JPR模型预测效果一般,ARIMA模型不太适合本数据的预测。

关键词：孕产妇死亡率循环神经网络模型 Joinpoint回归模型差分自回归移动平均模型预测

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哮喘后慢性阻塞性肺疾病发生风险及影响因素

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中国医科大学学报 2025年第2期54卷 103-108,114页

作者：郭贵雅宋旺辰王爱民孔雨佳王素珍石福艳山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的研究哮喘后发生慢性阻塞性肺疾病(COPD)的风险,探讨哮喘发生及进一步发展为COPD的影响因素。方法基于英国生物样本(UKB)数据库构建随访队列,采用多状态模型(MSM)进行哮喘和COPD转归风险预测及影响因素分析。结果在不考虑协变量... 详细信息

目的研究哮喘后发生慢性阻塞性肺疾病(COPD)的风险,探讨哮喘发生及进一步发展为COPD的影响因素。方法基于英国生物样本(UKB)数据库构建随访队列,采用多状态模型(MSM)进行哮喘和COPD转归风险预测及影响因素分析。结果在不考虑协变量影响的情况下,3种转归路径中由COPD到死亡的累积风险最高,然后为哮喘到COPD、哮喘到死亡。高龄、男性、糖尿病、高腰臀比、高血压、汤森剥夺指数增高、吸烟频率增加和家族史是哮喘人群发展为COPD的危险因素;高龄、男性、糖尿病、高腰臀比、高血压、汤森剥夺指数增高和吸烟频率增加是哮喘人群发生死亡的危险因素;高龄、男性、糖尿病、汤森剥夺指数增高是COPD人群发生死亡的危险因素。结论高龄、男性、糖尿病、高腰臀比、高血压、汤森剥夺指数增高、吸烟频率增加和家族史会增加哮喘人群COPD的发生风险。多状态模型可用于预测哮喘后发生COPD的影响因素及程度,揭示COPD进程的变化规律。

关键词：哮喘慢性阻塞性肺疾病英国生物样本数据库多状态模型影响因素

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多阅片者多病例设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法

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中国循证医学杂志 2024年第9期24卷 1085-1093页

作者：何倩潘喆敏向蔓宛慧琴秦婴逸贺佳海军军医大学军队卫生统计学教研室上海200433 同济大学医学院上海200092

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rocket... 详细信息

目的通过公式推导和实例验证,分析多阅片者多病例(multi-reader multi-case,MRMC)设计影像诊断试验准确度评价的统计分析方法。方法本研究包括理论推导和实例验证两个部分。理论部分详细介绍了MRMC统计分析方法,特别是Obuchowski-Rockette(OR)与Dorfman-Berbaum-Metz(DBM)方法的原理和步骤。实例部分研究共纳入了100例受试者,其中67例疾病患者。四名阅片者分别采用传统胶卷影像方法和数字化影像方法进行阅片。通过OR与DBM方法对阅片结果进行分析。结果实例研究显示,OR和DBM方法结果具有较高的一致性。当OR方法采用Jackknife估计协方差矩阵时,其结果与DBM方法完全吻合。结论为准确评估影像诊断试验的临床性能,推荐采用OR和DBM方法进行影像诊断试验准确性评价的统计分析,以确保阅片者因素对评价结果的影响得到充分考虑。OR与DBM方法的结果较为接近,实际应用时应考虑具体数据特点和研究设计选择合适的分析方法。同时,OR与DBM方法的应用目前仍存在一定挑战,如软件实现、缺失数据处理,未来仍需要进一步的探索。

关键词：多阅片者多病例影像诊断试验准确性

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含有测量误差与缺失值的纵向数据亚组分析方法的模拟研究

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中国卫生统计 2024年第1期41卷 12-17页

作者：薛雅心秦国友复旦大学公共卫生学院生物统计学教研室 200032

目的研究可以同时处理协变量含有测量误差和响应变量含有缺失值的纵向数据下的亚组分析方法。方法基于阈值回归模型进行亚组分析;利用重复测量之间的独立性来处理测量误差,并引入逆概率加权来处理缺失值,从而构造一个新的广义渐近无... 详细信息

目的研究可以同时处理协变量含有测量误差和响应变量含有缺失值的纵向数据下的亚组分析方法。方法基于阈值回归模型进行亚组分析;利用重复测量之间的独立性来处理测量误差,并引入逆概率加权来处理缺失值,从而构造一个新的广义渐近无偏估计方程。结果计算机随机模拟显示该估计方法在处理测量误差和缺失数据方面具有良好的效果,相比于未修正测量误差或缺失数据的广义估计方程方法具有更小的偏倚和均方误差。结论亚组分析中,当协变量存在测量误差、响应变量存在缺失值时,通常需要考虑对测量误差和缺失值进行处理,以便得到可靠的参数估计。

关键词：亚组分析纵向数据广义估计方程测量误差缺失值

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基于Fine-Gray竞争风险模型的小肝癌患者预后模型构建与验证

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中华肿瘤防治杂志 2023年第23期30卷 1435-1443页

作者：钱迪涂博祥陈枭张鹤巍叶小飞赵艳芳海军军医大学卫生勤务系军队卫生统计学教研室上海200433

目的探究小肝癌患者预后影响因素,构建预后预测模型,为患者的个体化预后评估提供更精确的工具。方法通过SEER数据库收集2004-2015年确诊的2648例小肝癌患者信息,按照7∶3的比例,将患者随机分成训练集(1853例)与验证集(795例)。使用Fine-... 详细信息

目的探究小肝癌患者预后影响因素,构建预后预测模型,为患者的个体化预后评估提供更精确的工具。方法通过SEER数据库收集2004-2015年确诊的2648例小肝癌患者信息,按照7∶3的比例,将患者随机分成训练集(1853例)与验证集(795例)。使用Fine-Gray竞争风险模型对训练集资料进行单因素和多因素分析,探究影响小肝癌患者预后的独立危险因素,建立预后模型,从区分度和校准度两个角度分别对训练集与验证集数据的预测效果进行验证,基于预后模型结果绘制列线图并采用R-shiny构建生存率计算器。结果多因素分析结果表明,年龄(HR=1.165,95%CI为1.005~1.349,P=0.042)、婚姻状况(HR=1.250,95%CI为1.084~1.440,P=0.002)、肿瘤分级(HR=1.440,95%CI为1.197~1.733,P<0.001)、N分期(HR=0.442,95%CI为0.285~0.684,P<0.001)、M分期(HR=0.502,95%CI为0.325~0.776,P=0.002)、肿瘤大小(HR=1.216,95%CI为1.052~1.404,P=0.008)、手术情况(HR=2.732,95%CI为2.311~3.230,P<0.001)是小肝癌患者预后的独立影响因素。根据独立影响因素构建的列线图,在训练集中1、3和5年特异性生存率的曲线下面积分别为0.782、0.761和0.741,在验证集中分别为0.772、0.756和0.737;校准曲线显示在训练集与验证集中1、3和5年预测模型的预测发生率与实际发生率基本一致。结论Fine-Gray竞争风险模型能高效辨别小肝癌患者的预后独立影响因素,以此为依据构建的预后模型能更准确预测患者的特异性生存率,为医师进行决策提供有价值的参考依据。

关键词：小肝癌特异性生存率列线图 SEER数据库预后

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