检索结果-内蒙古大学图书馆

生物信息学 2007年第2期5卷 74-77页

作者：周猛童春发施季森南京林业大学国家林业局林木遗传和基因工程重点实验室南京210037

利用Phred/Phrap/Consed、***、RepeatMasker、Blast等软件和自主开发程序,基于Linux操作系统,构建了林木EST序列分析系统,完成了从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列的去除、重复序列鉴定、EST序列分类和组装、EST序列功能注释与功... 详细信息

利用Phred/Phrap/Consed、***、RepeatMasker、Blast等软件和自主开发程序,基于Linux操作系统,构建了林木EST序列分析系统,完成了从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列的去除、重复序列鉴定、EST序列分类和组装、EST序列功能注释与功能分类以及SSR、SNP的发掘。并通过使用Perl语言结合bioperl模块写的脚本程序使分析过程自动化,从而可以快速地对大批林木EST数据进行分析,为林木的功能基因组学研究提供有用的信息。

关键词：林木 EST Perl 分析系统生物信息学

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磁珠富集法筛选马尾松微卫星标记

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分子植物育种 2007年第1期5卷 141-144页

作者：李炟季孔庶龚佳国家林业局林木遗传与基因工程重点开放实验室南京林业大学南京210037

将马尾松核基因组DNA用Sau3A Ⅰ酶切后，电泳回收300-1000bp片段。在回收的片段上连接接头PCR后与用生物素标记的微卫星探针（AC）15、（AG）15杂交运用磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段。将获得的序列通过PCR扩增后，连接pGEM-T载体，... 详细信息

将马尾松核基因组DNA用Sau3A Ⅰ酶切后，电泳回收300-1000bp片段。在回收的片段上连接接头PCR后与用生物素标记的微卫星探针（AC）15、（AG）15杂交运用磁珠富集含有微卫星序列的DNA片段。将获得的序列通过PCR扩增后，连接pGEM-T载体，转化入感受态大肠杆菌，得到微卫星序列文库。然后用PCR法直接对文库进行扩增，获得58个阳性克隆，经测序分析，获微卫星序列33个，并成功设计出马尾松微卫星引物19对。

关键词：马尾松磁珠富集微卫星

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墨西哥落羽杉离体培养及再生体系的建立

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林业科学 2007年第10期43卷 40-44页

作者：许秀玉施季森席梦利陈建新沈烈英戴永梅南京林业大学国家林业局林木遗传和基因工程重点实验室南京210037 广东省林业科学研究院广州510520 上海市林业站上海200072

以墨西哥落羽杉的幼苗为起始外植体，研究其离体培养及再生体系的建立。结果表明：幼苗在DCR＋BA0．5mg·L^-1＋IBA0．2mg·L^-1培养基上诱导分化效果最好，分化频率80％以上，平均每个外植体产芽2～5个；诱导的丛生芽转入DCR＋... 详细信息

以墨西哥落羽杉的幼苗为起始外植体，研究其离体培养及再生体系的建立。结果表明：幼苗在DCR＋BA0．5mg·L^-1＋IBA0．2mg·L^-1培养基上诱导分化效果最好，分化频率80％以上，平均每个外植体产芽2～5个；诱导的丛生芽转入DCR＋Gln 500mg·L^-1培养基中伸长效果最佳；生根培养基为3／4DCR＋0．05％AC，生根率在75％以上。

关键词：墨西哥落羽杉离体培养植株再生

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岷江百合ISSR-PCR反应体系的优化

岷江百合ISSR-PCR反应体系的优化

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江苏省遗传学会植物分子育种学术研讨会

作者：邓明文吴祝华席梦利杨立伟施季森国家林业局林木遗传和基因工程重点实验室南京林业大学

以岷江百合(Lilium regale)为材料,对影响ISSR-PCR反应的主要参数进行优化,建立了适用于岷江百合的ISSR-PCR反应体系:20μL反应体系中,内含1×PCR buffer、1.25mmol/L Mg2+、0.4mmol/L dNTPs、0.6μmol/L引物、0.5UTaq DNA聚合酶、20ng模板DNA。扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性40s,52.8℃退火45s,72℃延伸1min30s,共45个循环;最后72℃延伸8min。该优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术开展岷江百合遗传多样性研究奠定了基础。

关键词：岷江百合 ISSR-PCR 反应体系

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高山松种实性状与生殖适应性

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植物生态学报 2007年第2期31卷 291-299页

作者：毛建丰李悦刘玉军刘灏王晓茹中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100093 中国科学院研究生院北京100049 北京林业大学教育部林木花卉遗传育种重点实验室北京100083 西藏大学农牧学院林学系西藏林芝860000 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100093

高山松(Pinus densata)是云南松(P. yunnanensis)与油松(P. tabulaeformis)自然杂交产生的二倍体杂种,是植物同倍体杂交物种形成的典型案例.高山松分布于青藏高原东南缘,占据了两个亲本种都不能正常生长的高海拔地带.良好生殖适应性的... 详细信息

高山松(Pinus densata)是云南松(P. yunnanensis)与油松(P. tabulaeformis)自然杂交产生的二倍体杂种,是植物同倍体杂交物种形成的典型案例.高山松分布于青藏高原东南缘,占据了两个亲本种都不能正常生长的高海拔地带.良好生殖适应性的产生是物种形成的关键,但对高山松在高海拔生境下生殖适应性的变异与杂交起源遗传背景关系的研究尚未见报道.该研究通过对来自该种分布区内6个代表居群样本、13个反映高山松生殖适应性的种实性状的分析,探讨了其生殖性状在居群水平的变异模式,揭示了具有不同遗传组成和起源历史的高山松居群的生殖特性.研究结果表明:6个研究居群在种实性状上存在显著差异;可育种鳞数、总种鳞数、总种子数、可育种鳞率和可育种鳞密度等与纬度呈显著负相关关系;球果结种率与经度和生态梯度值呈显著的正相关关系;胚珠败育率则与经度和生态梯度值呈显著的负相关关系;球果长度也呈现了与经度的显著负相关.高山松球果结种率很高,平均为74%;球果的结种数、种子长和种翅长与云南松、油松及其它松属双维管亚属多数种接近;球果长度、球果总种鳞数接近油松的报道.这些结果表明,高山松在亲本种不能正常生长、繁衍的高原环境下具备正常的生殖能力;其种实特征在居群间分化显著并呈现一定的地理梯度变化.居群间的显著差异反映了其杂种起源特性,与高山松居群的遗传背景有关,也反映了处在异质生态环境中的高山松居群具有各自的生殖生态进化趋向.

关键词：自然杂种居群分化生殖特性变异模式生态适应性

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三个卷瓣组百合的根尖染色体C-带比较

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分子植物育种 2007年第6期5卷 887-889页

作者：刘光欣胡凤荣席梦利吴祝华池坚施季森江苏省国家林业局林木遗传和基因工程重点实验室南京林业大学南京210037

利用染色体组型分析进行种和种质资源的识别是一种有效的手段。本文利用Gemisa C-分带方法对三个卷班组百合南川百合(***)、川百合(***)和金佛山百合(***)根尖染色体进行了研究。南川百合的带型公式为:2n=24=10C+8CL+2L+2N+2,川百合的... 详细信息

利用染色体组型分析进行种和种质资源的识别是一种有效的手段。本文利用Gemisa C-分带方法对三个卷班组百合南川百合(***)、川百合(***)和金佛山百合(***)根尖染色体进行了研究。南川百合的带型公式为:2n=24=10C+8CL+2L+2N+2,川百合的带型公式为:2n=24=4C+2CI^++2I+6I_++ 2I^++2I_+T^++2T_++2CNT_++2,金佛山百合的带型公式为:2n=24=4C+4CI+4CI_++4I_++2I^++2I_++2I_+T^++2。通过Gemisa C-分带方法不但可以很好的区分各种的各条染色体,而且可以很好的区分这三个卷瓣组野生百合。

关键词：南川百合川百合金佛山百合染色体 Giemsa C-带分析

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泸定百合根尖染色体C-带分析

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南京林业大学学报(自然科学版) 2007年第6期31卷 91-93页

作者：刘光欣胡凤荣席梦利吴祝华池坚施季森南京林业大学森林资源与环境学院南京林业大学森林资源与环境学院国家林业局江苏省林木遗传和基因工程重点实验室江苏南京210037

利用Giemsa C-带方法对泸定百合(Lilium sargentiae Wilson)进行了研究。结果表明:泸定百合的染色体数目为2n=24,每条染色体都显示出了可以明显区别的特征带;强带主要集中在染色体的着丝粒区域,在长短臂上也显示出可以相互识别的深浅不... 详细信息

利用Giemsa C-带方法对泸定百合(Lilium sargentiae Wilson)进行了研究。结果表明:泸定百合的染色体数目为2n=24,每条染色体都显示出了可以明显区别的特征带;强带主要集中在染色体的着丝粒区域,在长短臂上也显示出可以相互识别的深浅不一的带纹。通过Giemsa C-带方法可以将泸定百合的每条染色体区分开。

关键词：泸定百合染色体 C-带分析

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杉木雄球花减数分裂及其进程

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南京林业大学学报(自然科学版) 2007年第6期31卷 6-10页

作者：徐进施季森王桂凤南京林业大学森林资源与环境学院国家林业局江苏省林木遗传和基因工程重点实验室江苏南京210037 南京林业大学森林资源与环境学院

利用压片法,通过连续的采样,研究了杉木雄球花花粉母细胞减数分裂的规律。结果表明:杉木雄球花花粉母细胞减数分裂与一般植物的花粉母细胞(PMCs)减数分裂相似,但其减数分裂的染色体进程因个体的不同而不同,甚至同一个体不同部位的减数... 详细信息

利用压片法,通过连续的采样,研究了杉木雄球花花粉母细胞减数分裂的规律。结果表明:杉木雄球花花粉母细胞减数分裂与一般植物的花粉母细胞(PMCs)减数分裂相似,但其减数分裂的染色体进程因个体的不同而不同,甚至同一个体不同部位的减数分裂时期也表现为不同步。在某一雄球花内,小孢子叶从中央向两端逐步成熟。杉木花粉母细胞减数分裂时期与颜色和大小变化有密切的关系,其颜色发生从黄褐色—翠绿色—绿色—褐色—深褐色的变化,其中杉木雄球花颜色变化与其减数分裂进程有极其密切的关系。

关键词：杉木雄球花减数分裂进程

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基于Perl语言的序列同源性分析过程自动化的实现

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生物技术 2007年第1期17卷 60-63页

作者：周猛童春发施季森南京林业大学国家林业局林木遗传和基因工程重点实验室江苏南京210037

Perl语言已经成为用于生物信息学应用程序开发最流行的语言。为了简化本地的序列同源性分析过程,作者基于Perl语言设计开发了序列同源性分析的自动化程序,该程序具有无需编译、可移植性好、简单易用等优点,大大提高了工作效率,充分体现... 详细信息

Perl语言已经成为用于生物信息学应用程序开发最流行的语言。为了简化本地的序列同源性分析过程,作者基于Perl语言设计开发了序列同源性分析的自动化程序,该程序具有无需编译、可移植性好、简单易用等优点,大大提高了工作效率,充分体现了Perl语言在生物信息学研究中所具备的优势。

关键词： Perl语言 Blast 同源性分析自动化

来源：评论

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萱草属植物ISSR-PCR反应体系的优化

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林业科技开发 2007年第4期21卷 45-48页

作者：朱云华朱生树苏倩施季森国家林业局林木遗传与基因工程重点实验室(南京林业大学) 南京中山陵园管理局

以萱草属的3种植物为材料,对影响ISSR-PCR扩增效果的因素Taq酶用量、Mg2+浓度、dNTP用量、引物用量、模板DNA浓度以及退火温度等指标进行单因子筛选和优化,建立了适合萱草属植物ISSR-PCR分析的最佳PCR反应体系:20μL反应体系中Taq酶0.6U... 详细信息

以萱草属的3种植物为材料,对影响ISSR-PCR扩增效果的因素Taq酶用量、Mg2+浓度、dNTP用量、引物用量、模板DNA浓度以及退火温度等指标进行单因子筛选和优化,建立了适合萱草属植物ISSR-PCR分析的最佳PCR反应体系:20μL反应体系中Taq酶0.6U、Mg2+1.8mmol/L、1×Buffer2μL、dNTP0.2mmol/L、引物0.6mmol/L、DNA模板10ng/μL。扩增程序为94℃预变性5min,94℃变性40s,52℃退火45s,72℃延伸1.50min,共39个循环;72℃完全延伸5min,4℃保持。该反应体系及扩增程序扩增谱带清晰,产物量多,为利用ISSR-PCR分子标记研究萱草属植物的遗传多样性提供标准反应条件。

关键词：萱草属植物 ISSR—PCR 反应体系优化

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