检索结果-内蒙古大学图书馆

南京林业大学学报(自然科学版) 2013年第4期37卷 13-16页

作者：马秋月陈赢男渠纪腾戴晓港尹佟明南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建重点实验室

对簸箕柳F1杂交组合的450株子代在1 a内的苗高生长进行了测定,利用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy等3种非线性模型对其生长变化规律进行拟合及分析,结果显示,3种模型的拟合度(R2)均在0.98以上。Logistic和Gompertz模型的早期拟合... 详细信息

对簸箕柳F1杂交组合的450株子代在1 a内的苗高生长进行了测定,利用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy等3种非线性模型对其生长变化规律进行拟合及分析,结果显示,3种模型的拟合度(R2)均在0.98以上。Logistic和Gompertz模型的早期拟合值与实际值偏离较大,而Von Bertalanffy模型在整个测定时期其拟合值与实际值均很接近,拟合度可达0.994。由此可建立理想的统计模型来追踪簸箕柳F1苗高生长率的变化。

关键词：簸箕柳生物量株高生长曲线拟合

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三种常用亲本分析软件效率的比较——以鹅掌楸属树种控制授粉子代亲本分析为例

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分子植物育种 2013年第2期11卷 241-248页

作者：李博潘文婷李康琴李火根南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

在亲本分析中,常用基于最大似然法的软件(如CERVUS,COLONY和PAPA)进行亲本推定,但不同软件各有其特点,其分析结果与亲本推定效率有时相差较大。为比较三种常用亲本分析软件(CERVUS3.0,COLONY2.0和PAPA2.0)的效率及特点,本文以包含278个... 详细信息

在亲本分析中,常用基于最大似然法的软件(如CERVUS,COLONY和PAPA)进行亲本推定,但不同软件各有其特点,其分析结果与亲本推定效率有时相差较大。为比较三种常用亲本分析软件(CERVUS3.0,COLONY2.0和PAPA2.0)的效率及特点,本文以包含278个鹅掌楸潜在亲本及90个鹅掌楸已知亲本的子代群体为材料,利用13对EST-SSR位点信息,分析子代亲本并与其真实亲本进行对照,进而评价三种亲本分析软件的效率,期望为林木亲本分析软件选择提供参考。研究结果表明,13个SSR位点在实验群体中检测出的等位基因数(A)、观测杂合度(Ho)及Shannon多样性指数(I)平均值分别为5.23,0.4766和1.4636,表明该批引物多态性高,适合用于亲本分析。就亲本分析效率而言,总体上看,谱系清楚的子代远高于谱系不清的子代,单亲分析远高于双亲分析。三种软件的分析效率及特点各有差别。对于谱系不清的林下更新子代苗木,双亲分析时,三种软件的分析效率差别不大。但单亲分析时,CERVUS与COLONY软件分析效率较高,其亲本推定的准确率分别为78.87%和69.90%,高于PAPA软件的分析效率。而对于谱系清楚的控制授粉子代,双亲分析时,采用PAPA软件对异交子代亲本推定准确率为34.72%,高于CERVUS及COLONY软件;而CERVUS与COLONY软件则适合于自交子代的亲本分析,其亲本推定的准确率分别可达83.33%及81.2%,远高于PAPA软件。

关键词：亲本分析 CERVUS COLONY PAPA 效率鹅掌楸属

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植物磺肽素在杂交鹅掌楸体胚发生中的作用

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林业科学 2013年第2期49卷 33-38页

作者：陈金慧张艳娟吴亚云王鹏凯王光萍施季森南京林业大学森林资源与环境学院林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

植物磺肽素(PSK),是近年来发现的一种新型植物肽类生长调节物质,具有促进单细胞的分裂增殖等生理功能。以杂交鹅掌楸未成熟胚来源的体胚发生体系为材料,探索PSK-α在植物体胚发生中的作用。研究发现PSK-α能够促进细胞分裂和增殖,有利... 详细信息

植物磺肽素(PSK),是近年来发现的一种新型植物肽类生长调节物质,具有促进单细胞的分裂增殖等生理功能。以杂交鹅掌楸未成熟胚来源的体胚发生体系为材料,探索PSK-α在植物体胚发生中的作用。研究发现PSK-α能够促进细胞分裂和增殖,有利于胚性细胞的形成。在杂交鹅掌楸体胚发生初期添加0.1mg·L-1的PSK-α可提高未成熟胚的脱分化率并能有效改善培养细胞的状态;0.5mg·L-1的PSK-α能够促进胚性愈伤组织的形成和增殖;体胚形成后期添加0.8mg·L-1的PSK-α利于其正常发育以及再生植株的培养。

关键词：杂交鹅掌楸体细胞胚胎发生胚性愈伤组织再生植株植物磺肽素

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‘南林895杨’遗传转化体系的优化

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林业科技开发 2013年第6期27卷 85-88页

作者：孙伟博于娟潘惠新诸葛强南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

以‘南林895杨’为研究材料,采用正交设计方法,对以农杆菌介导法转基因过程中的几个关键因素进行了筛选比较。并利用GUS染色对转化效果进行统计分析,发现‘南林895杨’合适的遗传转化体系为:预培养3 d,菌液浓度OD600值为0.8,侵染8 min,... 详细信息

以‘南林895杨’为研究材料,采用正交设计方法,对以农杆菌介导法转基因过程中的几个关键因素进行了筛选比较。并利用GUS染色对转化效果进行统计分析,发现‘南林895杨’合适的遗传转化体系为:预培养3 d,菌液浓度OD600值为0.8,侵染8 min,共培养3 d。通过抗性筛选确定卡那霉素在分化阶段的筛选浓度为20 mg/L,在生根阶段的筛选浓度为10 mg/L,头孢霉素浓度为100 mg/L。优化了‘南林895杨’遗传转化体系,为利用转基因技术开展杨树的遗传改良研究奠定了基础。

关键词： '南林895杨’ 遗传转化体系优化农杆菌介导

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不平衡巢式设计遗传模型分析

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林业科学 2013年第3期49卷 1-8页

作者：童春发杨立伟蒋安纳施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学信息科学技术学院南京210037

虽然巢式试验设计在动植物育种中得到广泛应用,但是在不平衡数据条件下有关遗传参数估计和假设检验统计量的计算还存在着很多问题。文中针对不平衡数据条件下的巢式试验设计,使用固定效应模型和随机效应模型估计相关的遗传参数并进行相... 详细信息

虽然巢式试验设计在动植物育种中得到广泛应用,但是在不平衡数据条件下有关遗传参数估计和假设检验统计量的计算还存在着很多问题。文中针对不平衡数据条件下的巢式试验设计,使用固定效应模型和随机效应模型估计相关的遗传参数并进行相应的统计假设检验。对于固定效应模型,使用约束线性模型方法推导出亲本配合力估计及亲本间配合力假设检验统计量的计算公式。对于随机效应模型,采用混合线性模型中的方差分析法,推导出方差分量估计的计算公式,并给出方差分量估计标准误以及方差分量假设检验统计量的计算方法,进而给出遗传力计算公式及其标准误的近似计算方法。最后,用VC++编写多种形式巢式设计遗传模型的各种遗传参数估计和假设检验统计量计算的Windows应用软件,供林木遗传育种工作者使用。

关键词：巢式设计一般配合力方差分量遗传力

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杂交鹅掌楸悬浮细胞高效摄取具有良好生物相容性的超微介孔氧化硅纳米颗粒

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中国科学：生命科学 2013年第2期43卷 177-184页

作者：夏兵董琛张文一陆叶陈金慧施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学现代分析测试中心南京210037

采用扫描电子显微镜（SEM）和激光共聚焦显微镜（LSCM）系统研究了超微介孔氧化硅纳米颗粒（MSNs）和杂交鹅掌楸悬浮细胞共孵育的互作特征.将MSNs通过异硫氰酸荧光素（FITC）标记后,再利用LSCM观察其被植物细胞摄取的情况.结果表明,5~1... 详细信息

采用扫描电子显微镜（SEM）和激光共聚焦显微镜（LSCM）系统研究了超微介孔氧化硅纳米颗粒（MSNs）和杂交鹅掌楸悬浮细胞共孵育的互作特征.将MSNs通过异硫氰酸荧光素（FITC）标记后,再利用LSCM观察其被植物细胞摄取的情况.结果表明,5~15nm的MSNs可以通过内吞途径有效将FITC分子载入完整植物细胞.然而,在无MSNs作为载体的情况下,游离FITC分子则无法进入完整植物细胞.SEM观察结果进一步表明,MSNs容易聚集在完整植物细胞的表面,而且通过硅元素含量对比分析,直接证明了MSNs可以被完整植物细胞摄取到其内部.其次,利用荧光素二乙酸酯染料分析和MSNs共培养24h后的植物细胞的活性,其结果表明,这些细胞仍然保持很好的活力,而且也没有观察到明显的细胞死亡.最后发现,这些和MSNs共培养后的鹅掌楸细胞仍可以通过胚胎发育实现植株再生.综上所述,在植物生物学中,这种超微MSNs作为纳米载体可以应用到细胞的体外外源基因转染.

关键词：介孔氧化硅纳米颗粒内吞细胞毒性胚胎发育

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第三代测序技术及其应用

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中国生物工程杂志 2013年第5期33卷 125-131页

作者：张得芳马秋月尹佟明夏涛 1南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学森林资源与环境学院南京210037

第二代测序技术发展到一定阶段以后其缺陷逐渐显现,而第三代测序技术的出现在一定程度上弥补了第二代测序技术在应用方面的缺点。就目前正在发展的5种第三代高通量测序技术的原理进行了阐述,并比较了这几种测序技术的优缺点,最后对三代... 详细信息

第二代测序技术发展到一定阶段以后其缺陷逐渐显现,而第三代测序技术的出现在一定程度上弥补了第二代测序技术在应用方面的缺点。就目前正在发展的5种第三代高通量测序技术的原理进行了阐述,并比较了这几种测序技术的优缺点,最后对三代测序技术在基因组测序,甲基化研究,RNA测序以及医学方面的应用作了简单介绍。

关键词：第三代测序单分子测序技术SMRT tSMS

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基于454测序的油茶DNA序列微卫星观察与分析

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林业科学 2013年第8期49卷 43-50页

作者：温强徐林初江香梅李江顾胤聪徐立安黄敏仁南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 江西省林业科学院南昌330032

采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的... 详细信息

采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的;在所有被检索序列的二至六碱基微卫星中,均以二碱基微卫星最多(>55%),并以(AG)n类型为主,但三碱基微卫星在所有EST序列中以(AAG)n类型最多,而在普通油茶基因组序列中则以(AAT)n最多;除六碱基微卫星外,二至五碱基微卫星均表现为不同微卫星重复单元的丰度随着微卫星碱基长度增加而减少。在转录组序列中,除六碱基微卫星之外,不同微卫星单元重复数的变异与重复单元长度呈负相关,推测二碱基微卫星理论多态性最高,而五碱基微卫星理论多态性最低;对在无冗余独立基因各区域中的微卫星进行统计,显示分布比例依次为3'UTR>CDS>5'UTR,在相同区域内比较,UTR区域中二碱基微卫星占总数量比例最大,CDS区域内三碱基微卫星的比例最高,此外5'UTR区域的三碱基微卫星的分布比例均高于3'UTR,初步推断5'UTR区域的微卫星相对3'UTR要保守些。

关键词：山茶属 454高通量测序微卫星

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百合尖孢镰刀菌鳞茎腐烂病研究进展

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江苏农业科学 2013年第6期41卷 1-5页

作者：吴祝华詹德智施季森席梦利南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037

由尖孢镰刀菌引起的百合鳞茎腐烂病是百合生产中危害最严重的病害之一,对百合切花生产影响很大。本文综述了该病的发生规律、防治方法及病原菌的鉴定方法,总结了不同百合品系对病原菌的抗性,介绍了百合抗鳞茎腐烂病育种研究现状,并对百... 详细信息

由尖孢镰刀菌引起的百合鳞茎腐烂病是百合生产中危害最严重的病害之一,对百合切花生产影响很大。本文综述了该病的发生规律、防治方法及病原菌的鉴定方法,总结了不同百合品系对病原菌的抗性,介绍了百合抗鳞茎腐烂病育种研究现状,并对百合抗病育种的前景进行了展望。

关键词：百合鳞茎腐烂病尖孢镰刀菌抗性抗性育种

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休哈塔假丝酵母转化木糖和葡萄糖为乙醇的发酵转录谱

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微生物学报 2013年第4期53卷 338-345页

作者：熊许洁蔡鹏徐勇勇强余世袁南京林业大学化工学院江苏省生物质绿色燃料与化学品重点实验室林木遗传与生物技术教育部重点实验室南京210037

【目的】探究木糖发酵典型菌株休哈塔假丝酵母在己糖和戊糖发酵中的转录谱及差异,筛选出与木糖利用和乙醇发酵代谢途径及调控相关的关键性酶和功能蛋白质基因。【方法】应用新一代高通量测序技术454 GS FLX Titanium分别构建了休哈塔假... 详细信息

【目的】探究木糖发酵典型菌株休哈塔假丝酵母在己糖和戊糖发酵中的转录谱及差异,筛选出与木糖利用和乙醇发酵代谢途径及调控相关的关键性酶和功能蛋白质基因。【方法】应用新一代高通量测序技术454 GS FLX Titanium分别构建了休哈塔假丝酵母木糖、葡萄糖发酵的cDNA文库,并进行De novo转录组的表达序列标签大规模测序和序列比较分析,进而挖掘出该酵母中参与木糖代谢和乙醇发酵的相关基因。【结果】分别对木糖和葡萄糖发酵样本进行二分之一RUN测序并各自得到60万条reads,序列平均长度400 bp。共拼接得到7250条(木糖)和7168条(葡萄糖)contigs,并利用BLAST对木糖样品和葡萄糖样品中的2421个基因(contig)和2456个基因(contig)进行了功能注释和GO分类。通过两个文库间的序列对比分析,共发现158个基因属于差异表达状态(P<0.05)。基于经典的糖酵解及乙醇发酵途径筛选出与木糖乙醇发酵相关的候选基因,并且比较分析其转录水平的差异。【结论】基于大规模转录谱测序和比较分析首次筛选出休哈塔假丝酵母中参与木糖代谢和乙醇发酵的基因群,可为后续的分子生物学及代谢调控研究提供基础数据。

关键词：休哈塔假丝酵母木糖代谢乙醇发酵转录谱表达序列标签

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