检索结果-内蒙古大学图书馆

亚热带农业研究 2015年第2期11卷 73-79页

作者：陈孝丑郑仁华施季森福建省林业科技试验中心福建南靖363600 福建省林业科学研究院国家林业局南方山地用材林培育重点实验室福建福州350012 南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室江苏南京210037

利用杉木第2代种子园10个速生优良无性系作为杂交亲本,开展双列杂交及子代测定,研究不同林龄家系生长性状和材性遗传变异规律,并开展优良家系及单株选择。结果表明,不同林龄家系间均存在较大的遗传变异,树高、胸径和单株材积等生长性状... 详细信息

利用杉木第2代种子园10个速生优良无性系作为杂交亲本,开展双列杂交及子代测定,研究不同林龄家系生长性状和材性遗传变异规律,并开展优良家系及单株选择。结果表明,不同林龄家系间均存在较大的遗传变异,树高、胸径和单株材积等生长性状均达极显著差异水平。14年生木材的红心率、偏心率、树皮率和基本密度等材质指标的变异系数均较大,家系间存在较大的遗传变异,木材材质也随着林龄增大不断提高。选出单株材积遗传增益最大的5个速生优良家系,与对照相比,单株材积平均遗传增益为6.08%;选出木材基本密度遗传增益最大的5个材性优良家系,与对照相比,木材基本密度平均遗传增益为3.85%。速生和材质两类优良家系可作为杉木高世代种子园建园材料进行推广利用。在优良家系选择的基础上还选出12个优良个体,与对照相比,单株材积遗传增益达38.24%,增产效果明显,不仅是高世代育种的理想材料,而且可以通过无性繁殖加以利用。

关键词：杉木杂交生长性状材性遗传变异选择

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利用大配子体构建马尾松遗传图谱

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分子植物育种 2014年第3期12卷 421-431页

作者：何卫龙张逢凯潘婷季孔庶林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室、南京林业大学南京210037

本研究以单株马尾松的142个大配子体为作图群体,利用筛选的55对SSR引物和142对SRAP引物获得502个标记,构建了一张包含237个标记、18个连锁群的马尾松遗传连锁图谱。马尾松连锁图谱总图距为1 462.1 cM,最大连锁群图距为136.4 cM,最小连... 详细信息

本研究以单株马尾松的142个大配子体为作图群体,利用筛选的55对SSR引物和142对SRAP引物获得502个标记,构建了一张包含237个标记、18个连锁群的马尾松遗传连锁图谱。马尾松连锁图谱总图距为1 462.1 cM,最大连锁群图距为136.4 cM,最小连锁群图距为36.7 cM,平均每个连锁群长度为81.2 cM,标记之间平均图距为6.2 cM。此外,利用L16(45)正交试验表对影响PCR结果的Mg2+、dNTP、模板DNA、引物浓度、Taq DNA聚合酶进行试验,建立了适合马尾松SSR-PCR和SRAP-PCR的反应体系。

关键词：马尾松 SSR SRAP 体系优化遗传连锁图谱

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松属编码区微卫星特征和相应基因功能分析（英文）

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南京林业大学学报(自然科学版) 2014年第2期38卷 47-51页

作者：孔凡明王小龙陈赢男李淑娴徐进尹佟明南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室

从GenBank下载453 892条松属EST序列,序列组装后得到20 886条contig。用Sputnik软件从这些contig中查找了2 678个微卫星,其中3碱基重复微卫星占的比例最高,为59.2%,而其他重复长度的微卫星都相对较低,比例分别为:2碱基重复微卫星占12.0... 详细信息

从GenBank下载453 892条松属EST序列,序列组装后得到20 886条contig。用Sputnik软件从这些contig中查找了2 678个微卫星,其中3碱基重复微卫星占的比例最高,为59.2%,而其他重复长度的微卫星都相对较低,比例分别为:2碱基重复微卫星占12.0%,4碱基重复微卫星占13.3%,5碱基重复微卫星占15.5%。3碱基重复微卫星变化引起的基因读码框改变最小,松属树种基因区3碱基重复微卫星的富集显示了强烈的密码子选择效应。此次研究还对查找到的微卫星进行了引物设计和扩增分析。实验结果显示,设计的微卫星引物在云南松中的扩增成功率是72.9%。从扩增成功的引物中进一步选取了155对引物,对14个松属树种和1个黄杉属树种进行了引物通用性实验分析,结果显示155对引物在14个松属树种间的通用性在71.0%以上,而在黄杉属树种中的通用性只有25.2%。对松属树种中含有微卫星的基因进行了功能分类研究,结果显示基因在是否保留微卫星序列方面有显著分化,微卫星参与了如细胞成分分类的共质体组成、病毒颗粒及病毒颗粒组成、生物节律调控,以及生长素转运蛋白等生物学过程。

关键词：表达序列标签序列组装微卫星松属

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马尾松CAD基因的克隆及其编码蛋白质的结构预测

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分子植物育种 2014年第4期12卷 638-645页

作者：张逢凯潘婷盛璐季孔庶林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室(南京林业大学) 南京210037

肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcoholdehy drogenase,CAD)在木质素合成过程中起关键作用。本研究利用CODEHOP设计简并引物,采用RT-PCR和RACE技术,从马尾松中克隆得到CAD基因的cDNA全长(GenBank登入号:KF419291)。此cDNA全长1 450 bp,包括1 074 bp完整的ORF,编码357个氨基酸的蛋白,相对分子质量与等电点分别为38945.1u和5.8。利用ClustalX、DNAMAN、ANTHEPROT软件分析其序列和编码的氨基酸序列。采用RT-PCR方法对CAD基因在根、侧枝、叶、芽四种组织中表达的特异性分析,结果显示,CAD基因在马尾松侧枝中表达量最高,在叶、根和芽中亦有低水平表达。

关键词：马尾松肉桂醇脱氢酶基因克隆序列分析蛋白质的结构预测组织特异性表达

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蔷薇科6个属植物EST-SSR特征分析

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植物研究 2014年第6期34卷 810-815页

作者：张得芳李淑娴夏涛南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学森林资源与环境学院南京210037

EST-SSR是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,具有较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用。本研究通过下载公共数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST序列,运用生... 详细信息

EST-SSR是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,具有较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用。本研究通过下载公共数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST序列,运用生物信息学的方法,调查6个属中SSR的分布规律及特点。结果表明6个属间SSR分布频率差别较大,从悬钩子属的10.94%到梨属的43.49%。二碱基和三碱基重复类型在6个属中占据优势,其中二碱基重复类型主要为AG/CT、GA/TC及AT/TA,而三碱基重复类型在6个属中差异较大,优势类型为AGA/TCT、GAA/TTC和AAG/CTT及CAC/GTG和ACA/TGT等,显示出较好的属间特异性。该结果对于研究蔷薇科植物的分子系统发育与进化,种质资源鉴定,遗传多样性以及遗传作图提供了研究平台。

关键词：蔷薇科 SSR EST

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WinNC2:因子交配设计遗传分析软件

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林业科学 2014年第1期50卷 55-62页

作者：童春发蒋安纳杨立委施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学信息科学技术学院南京210037

因子交配设计在林木遗传育种研究中已经得到广泛应用,然而有关该设计的遗传参数和统计量计算还存在不少问题,这在数据不平衡情况下尤为突出。WinNC2是一个新开发的用于计算因子交配设计遗传模型参数的Windows软件,不但可以处理平衡数据... 详细信息

因子交配设计在林木遗传育种研究中已经得到广泛应用,然而有关该设计的遗传参数和统计量计算还存在不少问题,这在数据不平衡情况下尤为突出。WinNC2是一个新开发的用于计算因子交配设计遗传模型参数的Windows软件,不但可以处理平衡数据,而且还可以处理不平衡数据。针对3种不同的因子交配设计遗传统计模型,该软件使用线性约束模型理论计算一般配合力和特殊配合力以及其他固定效应,使用方差分量模型计算遗传方差和协方差进而估算遗传力。对于每一个参数估计,WinNC2还给出其标准误和显著性检验统计量;对于多性状数据,WinNC2可以计算父本、母本以及父母本交互水平上2个性状的遗传相关系数及其标准误。WinNC2为林木遗传育种工作者分析因子交配设计试验数据提供了一个界面友好、易于使用的计算工具。

关键词：因子交配设计配合力方差分量遗传力

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异源三倍体为父本的百合杂交后代倍性调查及FISH分析

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分子植物育种 2014年第1期12卷 138-143页

作者：房磊杨斌张伟娜辛昊阳高婷婷施季森郭佳席梦利南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

本研究通过调查异源三倍体为父本的百合杂交后代倍性及其追踪染色体来源,来探讨异源三倍体的遗传规律。采用核型分析方法,对以雄性不育的二倍体亚洲百合GHC-01为母本,以Longiflorum×Asiatic系列的异源三倍体百合‘Ceb Dazzle’为... 详细信息

本研究通过调查异源三倍体为父本的百合杂交后代倍性及其追踪染色体来源,来探讨异源三倍体的遗传规律。采用核型分析方法,对以雄性不育的二倍体亚洲百合GHC-01为母本,以Longiflorum×Asiatic系列的异源三倍体百合‘Ceb Dazzle’为父本杂交获得的30个杂交后代及其父母本进行了染色体数目的统计,同时利用45S rDNA荧光原位杂交技术,对父母本以及4个杂交后代进行了45S rDNA荧光原位杂交分析。核型分析结果表明,GHC-01和‘Ceb Dazzle’的染色体数目分别为24(2n=2x=24)和36(2n=3x=36),30个杂交后代中染色体数目为24、25、26、35、36的分别有13、10、4、2、1个基因型的杂交后代;荧光原位杂交结果表明,GHC-01和‘Ceb Dazzle’分别有11个和14个45S rDNA荧光原位杂交位点,4个所研究的杂交后代中均有不同数目的典型父本染色体。基于倍性统计和荧光原位杂交结果,对杂交后代的早期鉴定以及异源三倍体在育种中的作用进行了讨论。

关键词：百合异源三倍体倍性统计荧光原位杂交

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植物磷酸化蛋白质组研究进展

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基因组学与应用生物学 2014年第6期33卷 1405-1414页

作者：甄艳李春映陆叶施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

蛋白质磷酸化是蛋白质翻译后修饰研究最深入的领域之一,蛋白质磷酸化也是信号转导的关键调控因子。磷酸化修饰可精细地协调激酶和磷酸化酶网络,进而调控细胞生长、增殖及胞内外生物刺激应急反应等。但是由于蛋白质磷酸化短暂性、高动态... 详细信息

蛋白质磷酸化是蛋白质翻译后修饰研究最深入的领域之一,蛋白质磷酸化也是信号转导的关键调控因子。磷酸化修饰可精细地协调激酶和磷酸化酶网络,进而调控细胞生长、增殖及胞内外生物刺激应急反应等。但是由于蛋白质磷酸化短暂性、高动态性及低丰度的特点,使得磷酸化蛋白质组研究具有挑战性。本文从基于2-DE的植物磷酸化蛋白质组、植物磷酸化肽富集、基于质谱植物磷酸化肽鉴定及位点分析、基于质谱植物磷酸化肽定量分析、植物磷酸化蛋白质数据库等方面综述植物磷酸化蛋白质组研究进展、策略、相应技术的优缺点及展望了未来发展的方向。

关键词：植物磷酸化磷酸化蛋白组磷酸肽质谱

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磷酸化蛋白质组定量研究策略

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分子植物育种 2014年第3期12卷 577-583页

作者：甄艳李春映施季森南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

蛋白质磷酸化修饰是调控多样种生物过程的一种重要的翻译后修饰,定量分析内部和外部因子作用下磷酸化蛋白质的分子调控机制对理解生物功能非常重要。早期磷酸化蛋白质组研究的重点是定性检测、鉴定磷酸化蛋白质及磷酸化位点的定位。近年... 详细信息

蛋白质磷酸化修饰是调控多样种生物过程的一种重要的翻译后修饰,定量分析内部和外部因子作用下磷酸化蛋白质的分子调控机制对理解生物功能非常重要。早期磷酸化蛋白质组研究的重点是定性检测、鉴定磷酸化蛋白质及磷酸化位点的定位。近年来,随着质谱技术的快速发展使得定量磷酸化蛋白质组研究有了很大的发展。利用磷酸化蛋白质组的定量分析监测蛋白质磷酸化的动态变化有助于阐明生物过程及其功能的实现机制。本文综述了磷酸化蛋白质组定量分析策略:基于2-DE的磷酸化蛋白质组定量策略,基于无胶的质谱磷酸化蛋白质组标记定量策略及无标记定量分析策略。磷酸化蛋白质组的定量分析将有助于更好的阐明生物的信号传导机制。

关键词：翻译后修饰磷酸化蛋白质组质谱双向电泳

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马褂木种源在南京的适应性评价

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林业科技开发 2014年第4期28卷 72-75页

作者：周琦徐立安王章荣惠利省南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037

利用栽培在南京林业大学树木园的13个地理种源马褂木植株,经连续5年的观测,研究各种源的适应竞争与生长表现。结果表明,各种源植株的保存率存在极显著差异,贵州黎平种源表现出较强的适应性,其保存率达72%,而福建柘荣种源适应性最差,保... 详细信息

利用栽培在南京林业大学树木园的13个地理种源马褂木植株,经连续5年的观测,研究各种源的适应竞争与生长表现。结果表明,各种源植株的保存率存在极显著差异,贵州黎平种源表现出较强的适应性,其保存率达72%,而福建柘荣种源适应性最差,保存率仅为8%。生长表现方面,种源间树高、胸径及年均树高生长量均存在极显著差异。对各种源的保存率和生长量进行综合比较,以贵州黎平、湖北鹤峰及浙江松阳3个种源表现较好,可作为南京地区的优良种源推广;而江西庐山、陕西汉中和云南金平3个种源则表现较差,不适宜在南京地区引种栽培。其中,福建柘荣种源在试验过程中个体大量死亡,原因在于该种源主要来于近交群体,近交衰退可能是存活率较低的主要原因。

关键词：马褂木种源试验保存率生长量适应性引种

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